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-基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 1bhp | ||||||
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タイトル | STRUCTURE OF BETA-PUROTHIONIN AT ROOM TEMPERATURE AND 1.7 ANGSTROMS RESOLUTION | ||||||
要素 | BETA-PUROTHIONIN | ||||||
キーワード | PLANT TOXIN / THIONINS | ||||||
機能・相同性 | 機能・相同性情報 | ||||||
生物種 | Triticum aestivum (コムギ) | ||||||
手法 | X線回折 / 解像度: 1.7 Å | ||||||
データ登録者 | Teeter, M.M. / Stec, B. / Rao, U. | ||||||
引用 | ジャーナル: Acta Crystallogr.,Sect.D / 年: 1995 タイトル: Refinement of purothionins reveals solute particles important for lattice formation and toxicity. Part 2: structure of beta-purothionin at 1.7 A resolution. 著者: Stec, B. / Rao, U. / Teeter, M.M. | ||||||
履歴 |
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-構造の表示
構造ビューア | 分子: MolmilJmol/JSmol |
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-ダウンロードとリンク
-ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | 1bhp.cif.gz | 21.9 KB | 表示 | PDBx/mmCIF形式 |
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PDB形式 | pdb1bhp.ent.gz | 13.8 KB | 表示 | PDB形式 |
PDBx/mmJSON形式 | 1bhp.json.gz | ツリー表示 | PDBx/mmJSON形式 | |
その他 | その他のダウンロード |
-検証レポート
文書・要旨 | 1bhp_validation.pdf.gz | 433.9 KB | 表示 | wwPDB検証レポート |
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文書・詳細版 | 1bhp_full_validation.pdf.gz | 435.6 KB | 表示 | |
XML形式データ | 1bhp_validation.xml.gz | 5.9 KB | 表示 | |
CIF形式データ | 1bhp_validation.cif.gz | 7.1 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/bh/1bhp ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/bh/1bhp | HTTPS FTP |
-関連構造データ
類似構造データ |
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-リンク
-集合体
登録構造単位 |
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1 |
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単位格子 |
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Components on special symmetry positions |
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-要素
#1: タンパク質・ペプチド | 分子量: 4936.940 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) Triticum aestivum (コムギ) / 組織: GRAIN / 参照: UniProt: P01543 | ||||
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#2: 化合物 | ChemComp-PO4 / | ||||
#3: 化合物 | #4: 化合物 | #5: 水 | ChemComp-HOH / | |
-実験情報
-実験
実験 | 手法: X線回折 |
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-試料調製
結晶 | マシュー密度: 2.68 Å3/Da / 溶媒含有率: 54.08 % | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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結晶化 | *PLUS pH: 5.9 / 手法: 蒸気拡散法 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
溶液の組成 | *PLUS
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-データ収集
放射光源 | 波長: 1.5418 |
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検出器 | タイプ: XUONG-HAMLIN MULTIWIRE / 検出器: AREA DETECTOR / 日付: 1992 |
放射 | 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray |
放射波長 | 波長: 1.5418 Å / 相対比: 1 |
反射 | Num. obs: 5160 / % possible obs: 87.1 % / Observed criterion σ(I): 0 / 冗長度: 3 % / Rmerge(I) obs: 0.096 |
反射 | *PLUS Rmerge(I) obs: 0.096 |
-解析
ソフトウェア |
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精密化 | 解像度: 1.7→10 Å / σ(F): 2.5 /
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精密化ステップ | サイクル: LAST / 解像度: 1.7→10 Å
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拘束条件 |
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