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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 1bd1 | ||||||||||||||||||
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タイトル | CRYSTALLOGRAPHIC STUDY OF ONE TURN OF G/C-RICH B-DNA | ||||||||||||||||||
![]() | DNA (5'-D(*![]() DNA / B-DNA / DOUBLE HELIX | 機能・相同性 | TRIETHYLAMMONIUM ION / DNA | ![]() 手法 | ![]() ![]() Heinemann, U. | ![]() ![]() タイトル: Crystallographic study of one turn of G/C-rich B-DNA. 著者: Heinemann, U. / Alings, C. #1: ![]() タイトル: Structural Features of G/C-Rich DNA Going A or B 著者: Heinemann, U. / Alings, C. / Lauble, H. #2: ![]() タイトル: X-Ray Studies of DNA Aiming at Elucidating the Sequence-Structure Code 著者: Heinemann, U. / Alings, C. / Lauble, H. 履歴 |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 17.1 KB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 9.5 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
文書・要旨 | ![]() | 378.3 KB | 表示 | ![]() |
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文書・詳細版 | ![]() | 384.8 KB | 表示 | |
XML形式データ | ![]() | 4.3 KB | 表示 | |
CIF形式データ | ![]() | 5.1 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-関連構造データ
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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1 | ![]()
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単位格子 |
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Components on special symmetry positions |
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要素
#1: DNA鎖 | 分子量: 3045.992 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 合成 | ||
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#2: 化合物 | #3: 水 | ChemComp-HOH / | |
-実験情報
-実験
実験 | 手法: ![]() |
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試料調製
結晶 | マシュー密度: 2.09 Å3/Da / 溶媒含有率: 41.21 % | ||||||||||||||||||||||||
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結晶化 | 温度: 277 K / 手法: microdialysis / 詳細: MICRODIALYSIS, temperature 277.00K | ||||||||||||||||||||||||
溶液の組成 |
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-データ収集
回折 | Ambient temp details: ROOM TEMPERATURE |
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放射光源 | 由来: SEALED TUBE |
検出器 | 検出器: DIFFRACTOMETER |
放射 | 散乱光タイプ: x-ray |
放射波長 | 相対比: 1 |
反射 | 最高解像度: 1.4 Å / Num. obs: 3062 |
反射 | *PLUS 最高解像度: 1.4 Å / 最低解像度: 1.6 Å / Rmerge(I) obs: 0.038 |
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解析
ソフトウェア | 名称: NUCLSQ / 分類: 精密化 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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精密化 | 解像度: 1.6→10 Å / σ(F): 3 /
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Refine Biso |
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精密化ステップ | サイクル: LAST / 解像度: 1.6→10 Å
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拘束条件 |
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精密化 | *PLUS 最高解像度: 1.6 Å / 最低解像度: 10 Å / σ(F): 3 / Rfactor obs: 0.16 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
溶媒の処理 | *PLUS | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
原子変位パラメータ | *PLUS |