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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 1b8z | ||||||
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タイトル | HU FROM THERMOTOGA MARITIMA | ||||||
![]() | PROTEIN (HISTONELIKE PROTEIN HU) | ||||||
![]() | DNA BINDING PROTEIN / THERMOTOGA MARITIMA / THERMOSTABLE DNA BINDING PROTEIN | ||||||
機能・相同性 | ![]() | ||||||
生物種 | ![]() ![]() | ||||||
手法 | ![]() ![]() ![]() | ||||||
![]() | Christodoulou, E. / Rypniewski, W.R. / Vorgias, C.E. | ||||||
![]() | ![]() タイトル: Cloning, overproduction, purification and crystallization of the DNA binding protein HU from the hyperthermophilic eubacterium Thermotoga maritima. 著者: Christodoulou, E. / Vorgias, C.E. | ||||||
履歴 |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 37.8 KB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 26.8 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
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-関連構造データ
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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1 |
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単位格子 |
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要素
#1: タンパク質 | 分子量: 10018.101 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 組換発現 由来: (組換発現) ![]() ![]() 発現宿主: ![]() ![]() #2: 水 | ChemComp-HOH / | |
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-実験情報
-実験
実験 | 手法: ![]() |
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試料調製
結晶 | マシュー密度: 2.3 Å3/Da / 溶媒含有率: 46 % | ||||||||||||||||||||
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結晶化 | pH: 4.6 / 詳細: pH 4.6 | ||||||||||||||||||||
結晶化 | *PLUS pH: 7 / 手法: 蒸気拡散法, ハンギングドロップ法 | ||||||||||||||||||||
溶液の組成 | *PLUS
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-データ収集
回折 | 平均測定温度: 277 K |
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放射光源 | 由来: ![]() ![]() ![]() |
検出器 | タイプ: MAR scanner 345 mm plate / 検出器: IMAGE PLATE / 詳細: MIRROR |
放射 | モノクロメーター: SI(111) / プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray |
放射波長 | 波長: 0.8833 Å / 相対比: 1 |
反射 | 解像度: 1.6→20 Å / Num. obs: 21552 / % possible obs: 99.9 % / 冗長度: 5.9 % / Biso Wilson estimate: 19.82 Å2 / Rsym value: 5.6 / Net I/σ(I): 19.1 |
反射 シェル | 解像度: 1.6→1.63 Å / Mean I/σ(I) obs: 2.7 / Rsym value: 59 / % possible all: 100 |
反射 | *PLUS Rmerge(I) obs: 0.056 |
反射 シェル | *PLUS % possible obs: 100 % / Rmerge(I) obs: 0.59 |
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解析
ソフトウェア |
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精密化 | 構造決定の手法: ![]()
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原子変位パラメータ | Biso mean: 27.04 Å2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
精密化ステップ | サイクル: LAST / 解像度: 1.6→15 Å
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拘束条件 |
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