RESTRAINT ENERGY VIOLATION WITHIN 30% OF THE CONFORMER OF LOWER ENERGY VIOLATION. 28 CONFORMERS SATISFIED THE CRITERIA, ONLY 10 ARE SHOWN.
代表モデル
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要素
#1: タンパク質
SACY
分子量: 6365.466 Da / 分子数: 2 / 断片: RNA BINDING DOMAIN, RESIDUES 1 - 55 / 由来タイプ: 組換発現 詳細: N TERMINAL REGION OF THE SACY PROTEIN. THE STRUCTURE IS A SYMMETRIC DIMER IN SOLUTION 由来: (組換発現) Bacillus subtilis (枯草菌) / 細胞株: BL21 / プラスミド: PGEX-2T / 生物種 (発現宿主): Escherichia coli / 発現宿主: Escherichia coli BL21(DE3) (大腸菌) / 株 (発現宿主): BL21 (DE3) / 参照: UniProt: P15401
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実験情報
-
実験
実験
手法: 溶液NMR
NMR実験
Conditions-ID
Experiment-ID
Solution-ID
タイプ
1
1
1
NOESY
1
2
1
TOCSY
1
3
1
COSY
1
4
1
HSQC
-
試料調製
試料状態
pH: 6 / 温度: 297 K
結晶化
*PLUS
手法: other / 詳細: NMR
-
NMR測定
NMRスペクトロメーター
タイプ: Bruker AMX600 / 製造業者: Bruker / モデル: AMX600 / 磁場強度: 600 MHz
-
解析
ソフトウェア
名称
バージョン
分類
X-PLOR
3.1
モデル構築
X-PLOR
3.1
精密化
X-PLOR
3.1
位相決定
NMR software
名称
バージョン
開発者
分類
X-PLOR
3.1
BRUNGER
精密化
X-PLOR
3.1
構造決定
精密化
手法: simulated annealing / ソフトェア番号: 1 詳細: THE MONOMERIC UNIT WAS MODELLED FIRST USING SAFE NOE WITH THE DG-SA PROTOCOL PROVIDED WITH X-PLOR. THE DIMER WAS THEN GENERATED BY ADDING EXTRA INTERMOLECULAR CONSTRAINTS PLUS A LIST OF ...詳細: THE MONOMERIC UNIT WAS MODELLED FIRST USING SAFE NOE WITH THE DG-SA PROTOCOL PROVIDED WITH X-PLOR. THE DIMER WAS THEN GENERATED BY ADDING EXTRA INTERMOLECULAR CONSTRAINTS PLUS A LIST OF AMBIGUOUS (INTER OR INTRA MOLECULAR) RESTRAINTS USING THE PROTOCOL DESCRIBED IN NILGES (1993), PROTEINS 17, 297-309.
NMRアンサンブル
コンフォーマー選択の基準: RESTRAINT ENERGY VIOLATION WITHIN 30% OF THE CONFORMER OF LOWER ENERGY VIOLATION. 28 CONFORMERS SATISFIED THE CRITERIA, ONLY 10 ARE SHOWN. 計算したコンフォーマーの数: 40 / 登録したコンフォーマーの数: 10