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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 1ado | ||||||
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タイトル | FRUCTOSE 1,6-BISPHOSPHATE ALDOLASE FROM RABBIT MUSCLE | ||||||
![]() | ALDOLASE![]() | ||||||
![]() | ![]() ![]() ![]() ![]() | ||||||
機能・相同性 | ![]() negative regulation of Arp2/3 complex-mediated actin nucleation / ![]() ![]() ![]() ![]() 類似検索 - 分子機能 | ||||||
生物種 | ![]() ![]() ![]() | ||||||
手法 | ![]() ![]() | ||||||
![]() | Blom, N.S. / Sygusch, J. | ||||||
![]() | ![]() タイトル: Product binding and role of the C-terminal region in class I D-fructose 1,6-bisphosphate aldolase. 著者: Blom, N. / Sygusch, J. #1: ![]() タイトル: Enhanced Electron Density Envelopes by Extended Solvent Definition 著者: Blom, N.S. / Sygusch, J. | ||||||
履歴 |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 417.8 KB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 335.6 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
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-関連構造データ
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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1 |
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単位格子 |
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要素
#1: タンパク質 | ![]() 分子量: 39253.637 Da / 分子数: 4 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() #2: 化合物 | ![]() #3: 化合物 | ![]() #4: 水 | ChemComp-HOH / | ![]() |
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-実験情報
-実験
実験 | 手法: ![]() |
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試料調製
結晶 | マシュー密度: 2.49 Å3/Da / 溶媒含有率: 50.54 % | |||||||||||||||||||||||||
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結晶化![]() | pH: 7.5 詳細: RABBIT MUSCLE ALDOLASE WAS CRYSTALLIZED FROM A 42% SATURATED AMMONIUM SULFATE SOLUTION, pH 7.5 | |||||||||||||||||||||||||
結晶化 | *PLUS pH: 7.3 / 手法: unknown / 詳細: Eagles, P. A., (1969) J. Mol. Biol., 45, 533-544 | |||||||||||||||||||||||||
溶液の組成 | *PLUS
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-データ収集
回折 | 平均測定温度: 298 K |
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放射光源 | 波長: 1.5418 |
検出器 | タイプ: SIEMENS / 検出器: AREA DETECTOR / 日付: 1991年10月1日 |
放射 | モノクロメーター: GRAPHITE(002) / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray |
放射波長 | 波長![]() |
反射 | 解像度: 1.9→12 Å / Num. obs: 103662 / % possible obs: 85.2 % / Observed criterion σ(I): 1 / Rsym value: 0.056 / Net I/σ(I): 14.5 |
反射 シェル | 解像度: 1.9→2 Å / Mean I/σ(I) obs: 1.9 / Rsym value: 0.286 |
反射 | *PLUS Rmerge(I) obs: 0.056 |
反射 シェル | *PLUS Rmerge(I) obs: 0.286 |
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解析
ソフトウェア |
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精密化 | 構造決定の手法![]() ![]() 開始モデル: STRUCTURE TO 2.7 ANGSTROM RESOLUTION 解像度: 1.9→12 Å / Data cutoff high absF: 100000 / Data cutoff low absF: 0.1 / Isotropic thermal model: RESTRAINED / 交差検証法: THROUGHOUT / σ(F): 1
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原子変位パラメータ | Biso mean: 29.1 Å2
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精密化ステップ | サイクル: LAST / 解像度: 1.9→12 Å
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拘束条件 |
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LS精密化 シェル | 解像度: 1.9→1.99 Å / Total num. of bins used: 8
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Xplor file |
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ソフトウェア | *PLUS 名称: ![]() | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
精密化 | *PLUS | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
溶媒の処理 | *PLUS | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
原子変位パラメータ | *PLUS | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
拘束条件 | *PLUS
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LS精密化 シェル | *PLUS Rfactor obs: 0.262 |