PDB-1acw: SOLUTION NMR STRUCTURE OF P01, A NATURAL SCORPION PEPTIDE STRUCTU...

IDまたはキーワード:

登録情報

データベース: PDB / ID: 1acw

タイトル

SOLUTION NMR STRUCTURE OF P01, A NATURAL SCORPION PEPTIDE STRUCTURALLY ANALOGOUS TO SCORPION TOXINS SPECIFIC FOR APAMIN-SENSITIVE POTASSIUM CHANNEL, 25 STRUCTURES

要素

NATURAL SCORPION PEPTIDE P01

キーワード

TOXIN / SCORPION TOXIN / ANDROCTONUS MAURETANICUS MAURETANICUS / POTASSIUM CHANNEL / P01 / NEUROTOXIN

機能・相同性

Short scorpion toxin, potassium channel inhibitor alpha-KTx 8/9 / BmTXKS1/BmP02 toxin family / Knottin, scorpion toxin-like superfamily / ion channel inhibitor activity / potassium channel regulator activity / toxin activity / extracellular region / Potassium channel toxin alpha-KTx 8.1

機能・相同性情報

生物種

Androctonus mauretanicus mauretanicus (サソリ)

手法

溶液NMR / DISTANCE GEOMETRY, ENERGY MINIMIZATION

データ登録者

Blanc, E. / Fremont, V. / Sizun, P. / Meunier, S. / Van Rietschoten, J. / Thevand, A. / Bernassau, J.M. / Darbon, H.

引用

ジャーナル: Proteins / 年: 1996
タイトル: Solution structure of P01, a natural scorpion peptide structurally analogous to scorpion toxins specific for apamin-sensitive potassium channel.
著者: Blanc, E. / Fremont, V. / Sizun, P. / Meunier, S. / Van Rietschoten, J. / Thevand, A. / Bernassau, J.M. / Darbon, H.

履歴

登録	1997年2月10日	処理サイト: BNL
改定 1.0	1997年4月1日	Provider: repository / タイプ: Initial release
改定 1.1	2008年3月24日	Group: Version format compliance
改定 1.2	2011年7月13日	Group: Version format compliance
改定 1.3	2022年2月16日	Group: Database references / Derived calculations / Other カテゴリ: database_2 / pdbx_database_status ...database_2 / pdbx_database_status / pdbx_struct_assembly / pdbx_struct_oper_list Item: _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession / _pdbx_database_status.process_site
改定 1.4	2024年11月20日	Group: Data collection / Structure summary カテゴリ: chem_comp_atom / chem_comp_bond ...chem_comp_atom / chem_comp_bond / pdbx_entry_details / pdbx_modification_feature

構造ビューア	分子: MolmilJmol/JSmol

-
ダウンロード

PDBx/mmCIF形式	1acw.cif.gz	203.5 KB	表示	PDBx/mmCIF形式
PDB形式	pdb1acw.ent.gz	170 KB	表示	PDB形式
PDBx/mmJSON形式	1acw.json.gz		ツリー表示	PDBx/mmJSON形式
その他	その他のダウンロード

-
検証レポート

文書・要旨	1acw_validation.pdf.gz	341.1 KB	表示	wwPDB検証レポート
文書・詳細版	1acw_full_validation.pdf.gz	487.1 KB	表示
XML形式データ	1acw_validation.xml.gz	13.3 KB	表示
CIF形式データ	1acw_validation.cif.gz	22 KB	表示
アーカイブディレクトリ	https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/ac/1acw ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/ac/1acw	HTTPS FTP

-
関連構造データ

類似構造データ	5kwx-d 1b1v-d 4efx-3 1t8j-d 2jvx-d 1yp8-d 2cbh-d 2djc-d Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) 類似検索 - 機能・相同性F&H 検索類似検索 - 機能F&H 検索類似検索 - 相同性F&H 検索

-
リンク

PDBのページ	PDBj / wwPDB / NCBI
「今月の分子」の関連する項目	#38 - 2003年2月カリウムチャネル (Potassium Channels) 類似性 (2) #199 - 2016年7月モネリン (Monellin) 類似性 (1)

登録構造単位

A: NATURAL SCORPION PEPTIDE P01

3.19 kDa, 1 ポリマー
Omokage検索でこの集合体の類似形状データを探す (詳細)

1

登録構造と同一
登録者が定義した集合体

NMR アンサンブル

	データ	基準
コンフォーマー数 (登録 / 計算)	25 / 25	OVERALL ENERGY
代表モデル

#1: タンパク質・ペプチド	NATURAL SCORPION PEPTIDE P01 分子量: 3188.587 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 組換発現由来: (組換発現) Androctonus mauretanicus mauretanicus (サソリ) 生物種: Androctonus mauretanicus / 株: mauretanicus / 参照: UniProt: P56215
Has protein modification	Y

-
実験

実験

手法: 溶液NMR

NMR実験

Conditions-ID	Experiment-ID	Solution-ID	タイプ
1	1	1	COSY
1	2	1	TOCSY
1	3	1	NOESY

-
試料調製

試料状態	pH: 3 / 温度: 300 K
結晶化	*PLUS 手法: other / 詳細: NMR

-
NMR測定

NMRスペクトロメーター

タイプ	製造業者	モデル	磁場強度 (MHz)	Spectrometer-ID
Bruker AMX500	Bruker	AMX500	500	1
Bruker AMX400	Bruker	AMX400	500	2

-
解析

ソフトウェア

名称	バージョン	分類
X-PLOR	3.1	モデル構築
X-PLOR	3.1	精密化
X-PLOR	3.1	位相決定

NMR software

名称	バージョン	開発者	分類
X-PLOR	3.1	BRUNGER	精密化
DIANA			構造決定
XPLOR			構造決定

精密化

手法: DISTANCE GEOMETRY, ENERGY MINIMIZATION / ソフトェア番号: 1
詳細: THE STRUCTURES WERE CALCULATED WITH THE DISTANCE GEOMETRY SOFTWARE DIANA-1.1 AND THEN MINIMIZED USING THE POWELL ALGORITHM OF THE X-PLOR SOFTWARE.

NMRアンサンブル

コンフォーマー選択の基準: OVERALL ENERGY / 計算したコンフォーマーの数: 25 / 登録したコンフォーマーの数: 25

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関連情報:EMDBヘッダ

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