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万見
- EMDB-62766: hDEK-nucleosome complex (conformation 2) -

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基本情報

登録情報
データベース: EMDB / ID: EMD-62766
タイトルhDEK-nucleosome complex (conformation 2)
マップデータ
試料
  • 複合体: hDEK-NCP complex
    • タンパク質・ペプチド: Histone H3.3
    • タンパク質・ペプチド: Histone H4
    • タンパク質・ペプチド: Histone H2A type 1-B/E
    • タンパク質・ペプチド: Histone H2B type 1-J
    • DNA: 601 DNA_R (189-MER)
    • DNA: 601 DNA (189-MER)
    • タンパク質・ペプチド: Protein DEK
  • リガンド: UNKNOWN ATOM OR ION
キーワードnucleosome complex / GENE REGULATION
機能・相同性
機能・相同性情報


contractile muscle fiber / regulation of double-strand break repair via nonhomologous end joining / Transcriptional regulation by the AP-2 (TFAP2) family of transcription factors / negative regulation of chromosome condensation / Barr body / : / B-WICH complex / inner kinetochore / pericentric heterochromatin formation / regulation of double-strand break repair ...contractile muscle fiber / regulation of double-strand break repair via nonhomologous end joining / Transcriptional regulation by the AP-2 (TFAP2) family of transcription factors / negative regulation of chromosome condensation / Barr body / : / B-WICH complex / inner kinetochore / pericentric heterochromatin formation / regulation of double-strand break repair / muscle cell differentiation / oocyte maturation / positive regulation of transcription by RNA polymerase III / nucleosomal DNA binding / nucleus organization / positive regulation of transcription by RNA polymerase I / spermatid development / negative regulation of tumor necrosis factor-mediated signaling pathway / single fertilization / subtelomeric heterochromatin formation / negative regulation of megakaryocyte differentiation / RNA polymerase II core promoter sequence-specific DNA binding / protein localization to CENP-A containing chromatin / Replacement of protamines by nucleosomes in the male pronucleus / CENP-A containing nucleosome / Packaging Of Telomere Ends / Recognition and association of DNA glycosylase with site containing an affected purine / Cleavage of the damaged purine / Deposition of new CENPA-containing nucleosomes at the centromere / Recognition and association of DNA glycosylase with site containing an affected pyrimidine / Cleavage of the damaged pyrimidine / embryo implantation / telomere organization / Inhibition of DNA recombination at telomere / RNA Polymerase I Promoter Opening / Meiotic synapsis / Assembly of the ORC complex at the origin of replication / Regulation of endogenous retroelements by the Human Silencing Hub (HUSH) complex / SUMOylation of chromatin organization proteins / viral genome replication / DNA methylation / Condensation of Prophase Chromosomes / Chromatin modifications during the maternal to zygotic transition (MZT) / SIRT1 negatively regulates rRNA expression / HCMV Late Events / ERCC6 (CSB) and EHMT2 (G9a) positively regulate rRNA expression / innate immune response in mucosa / PRC2 methylates histones and DNA / Regulation of endogenous retroelements by KRAB-ZFP proteins / Defective pyroptosis / HDMs demethylate histones / Regulation of endogenous retroelements by Piwi-interacting RNAs (piRNAs) / HDACs deacetylate histones / RNA Polymerase I Promoter Escape / Nonhomologous End-Joining (NHEJ) / lipopolysaccharide binding / Transcriptional regulation by small RNAs / Formation of the beta-catenin:TCF transactivating complex / RUNX1 regulates genes involved in megakaryocyte differentiation and platelet function / Activated PKN1 stimulates transcription of AR (androgen receptor) regulated genes KLK2 and KLK3 / G2/M DNA damage checkpoint / Metalloprotease DUBs / NoRC negatively regulates rRNA expression / DNA Damage/Telomere Stress Induced Senescence / B-WICH complex positively regulates rRNA expression / PKMTs methylate histone lysines / Meiotic recombination / Pre-NOTCH Transcription and Translation / RMTs methylate histone arginines / Activation of anterior HOX genes in hindbrain development during early embryogenesis / multicellular organism growth / male gonad development / Transcriptional regulation of granulopoiesis / UCH proteinases / HCMV Early Events / antimicrobial humoral immune response mediated by antimicrobial peptide / osteoblast differentiation / structural constituent of chromatin / antibacterial humoral response / E3 ubiquitin ligases ubiquitinate target proteins / Recruitment and ATM-mediated phosphorylation of repair and signaling proteins at DNA double strand breaks / nucleosome / heterochromatin formation / RUNX1 regulates transcription of genes involved in differentiation of HSCs / nucleosome assembly / Processing of DNA double-strand break ends / HATs acetylate histones / Senescence-Associated Secretory Phenotype (SASP) / Factors involved in megakaryocyte development and platelet production / chromatin organization / MLL4 and MLL3 complexes regulate expression of PPARG target genes in adipogenesis and hepatic steatosis / positive regulation of cell growth / Oxidative Stress Induced Senescence / histone binding / defense response to Gram-negative bacterium / Estrogen-dependent gene expression / killing of cells of another organism / transcription by RNA polymerase II / chromosome, telomeric region / cell population proliferation
類似検索 - 分子機能
Protein DEK / DEK C terminal domain / DEK, C-terminal / DEK C-terminal (DEK-C) domain profile. / SAP domain / Putative DNA-binding (bihelical) motif predicted to be involved in chromosomal organisation / SAP domain / : / Histone H2B signature. / Histone H2A conserved site ...Protein DEK / DEK C terminal domain / DEK, C-terminal / DEK C-terminal (DEK-C) domain profile. / SAP domain / Putative DNA-binding (bihelical) motif predicted to be involved in chromosomal organisation / SAP domain / : / Histone H2B signature. / Histone H2A conserved site / Histone H2A signature. / Histone H2B / Histone H2B / Histone H2A, C-terminal domain / C-terminus of histone H2A / Histone 2A / Histone H2A / TATA box binding protein associated factor / TATA box binding protein associated factor (TAF), histone-like fold domain / Histone H4, conserved site / Histone H4 signature. / Histone H4 / Histone H4 / CENP-T/Histone H4, histone fold / Centromere kinetochore component CENP-T histone fold / Histone H3 signature 1. / Histone H3 signature 2. / Histone H3 / Histone H3/CENP-A / Histone H2A/H2B/H3 / Core histone H2A/H2B/H3/H4 / Histone-fold
類似検索 - ドメイン・相同性
Histone H2A type 1-B/E / Histone H2B type 1-J / Protein DEK / Histone H4 / Histone H3.3
類似検索 - 構成要素
生物種Homo sapiens (ヒト)
手法単粒子再構成法 / クライオ電子顕微鏡法 / 解像度: 3.0 Å
データ登録者Liu Y / Wang C / Huang H
資金援助 中国, 1件
OrganizationGrant number国
National Natural Science Foundation of China (NSFC)32171206 中国
引用ジャーナル: Nat Struct Mol Biol / 年: 2025
タイトル: DEK-nucleosome structure shows DEK modulates H3K27me3 and stem cell fate.
著者: Yunfan Shen / Yanhong Liu / Maochao Guo / Song Mao / Rui Chen / Mengran Wang / Zhengbo Li / Yue Li / Wan Chen / Fang Chen / Baixing Wu / Chongyuan Wang / Wei Chen / Huanhuan Cui / Kai Yuan / Hongda Huang /
要旨: DEK is a highly conserved chromatin-associated oncoprotein that has important roles in regulating chromatin dynamics and stem cell fate. Dysregulation of DEK is associated with stem cell dysfunction ...DEK is a highly conserved chromatin-associated oncoprotein that has important roles in regulating chromatin dynamics and stem cell fate. Dysregulation of DEK is associated with stem cell dysfunction and cancers, including acute myeloid leukemia. Despite its importance in chromatin regulation, the structural mechanisms underlying DEK's interaction with chromatin and its influence on gene regulation remain poorly understood. Here we combined cryogenic electron microscopy (cryo-EM), biochemical and cellular approaches to investigate the molecular mechanisms and functional importance of DEK's interaction with chromatin. Our cryo-EM structures reveal the structural basis of the DEK-nucleosome interaction. Biochemical and cellular results demonstrate that this interaction is crucial for DEK deposition onto chromatin. Furthermore, our results reveal that DEK safeguards mouse embryonic stem cells from acquiring primitive endoderm fates by modulating the repressive histone mark H3K27me3. Together, our study provides crucial molecular insights into the structure and function of DEK, establishing a framework for understanding its roles in chromatin biology and cell fate determination.
履歴
登録2024年12月16日-
ヘッダ(付随情報) 公開2025年5月7日-
マップ公開2025年5月7日-
更新2025年7月23日-
現状2025年7月23日処理サイト: PDBj / 状態: 公開

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構造の表示

添付画像

emd_62766.png

ダウンロードとリンク

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マップ

ファイルダウンロード / ファイル: emd_62766.map.gz / 形式: CCP4 / 大きさ: 178 MB / タイプ: IMAGE STORED AS FLOATING POINT NUMBER (4 BYTES)
投影像・断面図

画像のコントロール

大きさ
明度
コントラスト
その他
軸Z (Sec.)Y (Row.)X (Col.)
0.84 Å/pix.
x 360 pix.
= 303.12 Å		0.84 Å/pix.
x 360 pix.
= 303.12 Å		0.84 Å/pix.
x 360 pix.
= 303.12 Å

表面

投影像

断面 (1/3)

断面 (1/2)

断面 (2/3)

画像は Spider により作成

ボクセルのサイズX=Y=Z: 0.842 Å
密度

ヒストグラム

ヒストグラム (対数)
表面レベル登録者による: 0.293
最小 - 最大-2.0936594 - 4.114754
平均 (標準偏差)0.0019410317 (±0.11145057)
対称性空間群: 1
詳細

EMDB XML:

マップ形状
Axis orderXYZ
Origin000
サイズ360360360
Spacing360360360
セルA=B=C: 303.12 Å
α=β=γ: 90.0 °

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添付データ

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ハーフマップ: #1

ファイルemd_62766_half_map_1.map
投影像・断面図
軸ZYX

投影像

断面 (1/2)
密度ヒストグラム

ヒストグラム

ヒストグラム (対数)

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ハーフマップ: #2

ファイルemd_62766_half_map_2.map
投影像・断面図
軸ZYX

投影像

断面 (1/2)
密度ヒストグラム

ヒストグラム

ヒストグラム (対数)

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試料の構成要素

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全体 : hDEK-NCP complex

全体名称: hDEK-NCP complex
要素
  • 複合体: hDEK-NCP complex
    • タンパク質・ペプチド: Histone H3.3
    • タンパク質・ペプチド: Histone H4
    • タンパク質・ペプチド: Histone H2A type 1-B/E
    • タンパク質・ペプチド: Histone H2B type 1-J
    • DNA: 601 DNA_R (189-MER)
    • DNA: 601 DNA (189-MER)
    • タンパク質・ペプチド: Protein DEK
  • リガンド: UNKNOWN ATOM OR ION

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超分子 #1: hDEK-NCP complex

超分子名称: hDEK-NCP complex / タイプ: complex / ID: 1 / 親要素: 0 / 含まれる分子: #1-#7
由来(天然)生物種: Homo sapiens (ヒト)

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分子 #1: Histone H3.3

分子名称: Histone H3.3 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 1 / コピー数: 2 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Homo sapiens (ヒト)
分子量理論値: 15.229787 KDa
組換発現生物種: Escherichia coli (大腸菌)
配列文字列:
ARTKQTARKS TGGKAPRKQL ATKAARKSAP STGGVKKPHR YRPGTVALRE IRRYQKSTEL LIRKLPFQRL VREIAQDFKT DLRFQSAAI GALQEASEAY LVGLFEDTNL CAIHAKRVTI MPKDIQLARR IRGERA

UniProtKB: Histone H3.3

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分子 #2: Histone H4

分子名称: Histone H4 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 2 / コピー数: 2 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Homo sapiens (ヒト)
分子量理論値: 11.263231 KDa
組換発現生物種: Escherichia coli (大腸菌)
配列文字列:
SGRGKGGKGL GKGGAKRHRK VLRDNIQGIT KPAIRRLARR GGVKRISGLI YEETRGVLKV FLENVIRDAV TYTEHAKRKT VTAMDVVYA LKRQGRTLYG FGG

UniProtKB: Histone H4

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分子 #3: Histone H2A type 1-B/E

分子名称: Histone H2A type 1-B/E / タイプ: protein_or_peptide / ID: 3 / コピー数: 2 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Homo sapiens (ヒト)
分子量理論値: 14.034355 KDa
組換発現生物種: Escherichia coli (大腸菌)
配列文字列:
SGRGKQGGKA RAKAKTRSSR AGLQFPVGRV HRLLRKGNYS ERVGAGAPVY LAAVLEYLTA EILELAGNAA RDNKKTRIIP RHLQLAIRN DEELNKLLGR VTIAQGGVLP NIQAVLLPKK TESHHKAKGK

UniProtKB: Histone H2A type 1-B/E

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分子 #4: Histone H2B type 1-J

分子名称: Histone H2B type 1-J / タイプ: protein_or_peptide / ID: 4 / コピー数: 2 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Homo sapiens (ヒト)
分子量理論値: 13.804045 KDa
組換発現生物種: Escherichia coli (大腸菌)
配列文字列:
PEPAKSAPAP KKGSKKAVTK AQKKDGKKRK RSRKESYSIY VYKVLKQVHP DTGISSKAMG IMNSFVNDIF ERIAGEASRL AHYNKRSTI TSREIQTAVR LLLPGELAKH AVSEGTKAVT KYTSAK

UniProtKB: Histone H2B type 1-J

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分子 #7: Protein DEK

分子名称: Protein DEK / タイプ: protein_or_peptide / ID: 7 / コピー数: 2 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Homo sapiens (ヒト)
分子量理論値: 42.759449 KDa
組換発現生物種: Escherichia coli (大腸菌)
配列文字列: MSASAPAAEG EGTPTQPASE KEPEMPGPRE ESEEEEDEDD EEEEEEEKEK SLIVEGKREK KKVERLTMQV SSLQREPFTI AQGKGQKLC EIERIHFFLS KKKTDELRNL HKLLYNRPGT VSSLKKNVGQ FSGFPFEKGS VQYKKKEEML KKFRNAMLKS I CEVLDLER ...文字列:
MSASAPAAEG EGTPTQPASE KEPEMPGPRE ESEEEEDEDD EEEEEEEKEK SLIVEGKREK KKVERLTMQV SSLQREPFTI AQGKGQKLC EIERIHFFLS KKKTDELRNL HKLLYNRPGT VSSLKKNVGQ FSGFPFEKGS VQYKKKEEML KKFRNAMLKS I CEVLDLER SGVNSELVKR ILNFLMHPKP SGKPLPKSKK TCSKGSKKER NSSGMARKAK RTKCPEILSD ESSSDEDEKK NK EESSDDE DKESEEEPPK KTAKREKPKQ KATSKSKKSV KSANVKKADS STTKKNQNSS KKESESEDSS DDEPLIKKLK KPP TDEELK ETIKKLLASA NLEEVTMKQI CKKVYENYPT YDLTERKDFI KTTVKELIS

UniProtKB: Protein DEK

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分子 #5: 601 DNA_R (189-MER)

分子名称: 601 DNA_R (189-MER) / タイプ: dna / ID: 5 / コピー数: 1 / 分類: DNA
由来(天然)生物種: Homo sapiens (ヒト)
分子量理論値: 58.551277 KDa
配列文字列: (DA)(DT)(DC)(DA)(DG)(DC)(DG)(DA)(DC)(DA) (DC)(DC)(DG)(DG)(DC)(DA)(DC)(DT)(DG)(DG) (DA)(DA)(DT)(DC)(DG)(DG)(DA)(DT)(DG) (DT)(DA)(DT)(DA)(DT)(DA)(DT)(DC)(DT)(DG) (DA) (DC)(DA)(DC)(DG)(DT) ...文字列:
(DA)(DT)(DC)(DA)(DG)(DC)(DG)(DA)(DC)(DA) (DC)(DC)(DG)(DG)(DC)(DA)(DC)(DT)(DG)(DG) (DA)(DA)(DT)(DC)(DG)(DG)(DA)(DT)(DG) (DT)(DA)(DT)(DA)(DT)(DA)(DT)(DC)(DT)(DG) (DA) (DC)(DA)(DC)(DG)(DT)(DG)(DC)(DC) (DT)(DG)(DG)(DA)(DG)(DA)(DC)(DT)(DA)(DG) (DG)(DG) (DA)(DG)(DT)(DA)(DA)(DT)(DC) (DC)(DC)(DC)(DT)(DT)(DG)(DG)(DC)(DG)(DG) (DT)(DT)(DA) (DA)(DA)(DA)(DC)(DG)(DC) (DG)(DG)(DG)(DG)(DG)(DA)(DC)(DA)(DG)(DC) (DG)(DC)(DG)(DT) (DA)(DC)(DG)(DT)(DG) (DC)(DG)(DT)(DT)(DT)(DA)(DA)(DG)(DC)(DG) (DG)(DT)(DG)(DC)(DT) (DA)(DG)(DA)(DG) (DC)(DT)(DG)(DT)(DC)(DT)(DA)(DC)(DG)(DA) (DC)(DC)(DA)(DA)(DT)(DT) (DG)(DA)(DG) (DC)(DG)(DG)(DC)(DC)(DT)(DC)(DG)(DG)(DC) (DA)(DC)(DC)(DG)(DG)(DG)(DA) (DT)(DT) (DC)(DT)(DC)(DG)(DA)(DT)(DG)(DG)(DC)(DA) (DT)(DC)(DC)(DG)(DG)(DC)(DA)(DT) (DC) (DA)(DC)(DC)(DC)(DG)(DG)(DA)(DT)

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分子 #6: 601 DNA (189-MER)

分子名称: 601 DNA (189-MER) / タイプ: dna / ID: 6 / コピー数: 1 / 分類: DNA
由来(天然)生物種: Homo sapiens (ヒト)
分子量理論値: 58.154988 KDa
配列文字列: (DA)(DT)(DC)(DC)(DG)(DG)(DG)(DT)(DG)(DA) (DT)(DG)(DC)(DC)(DG)(DG)(DA)(DT)(DG)(DC) (DC)(DA)(DT)(DC)(DG)(DA)(DG)(DA)(DA) (DT)(DC)(DC)(DC)(DG)(DG)(DT)(DG)(DC)(DC) (DG) (DA)(DG)(DG)(DC)(DC) ...文字列:
(DA)(DT)(DC)(DC)(DG)(DG)(DG)(DT)(DG)(DA) (DT)(DG)(DC)(DC)(DG)(DG)(DA)(DT)(DG)(DC) (DC)(DA)(DT)(DC)(DG)(DA)(DG)(DA)(DA) (DT)(DC)(DC)(DC)(DG)(DG)(DT)(DG)(DC)(DC) (DG) (DA)(DG)(DG)(DC)(DC)(DG)(DC)(DT) (DC)(DA)(DA)(DT)(DT)(DG)(DG)(DT)(DC)(DG) (DT)(DA) (DG)(DA)(DC)(DA)(DG)(DC)(DT) (DC)(DT)(DA)(DG)(DC)(DA)(DC)(DC)(DG)(DC) (DT)(DT)(DA) (DA)(DA)(DC)(DG)(DC)(DA) (DC)(DG)(DT)(DA)(DC)(DG)(DC)(DG)(DC)(DT) (DG)(DT)(DC)(DC) (DC)(DC)(DC)(DG)(DC) (DG)(DT)(DT)(DT)(DT)(DA)(DA)(DC)(DC)(DG) (DC)(DC)(DA)(DA)(DG) (DG)(DG)(DG)(DA) (DT)(DT)(DA)(DC)(DT)(DC)(DC)(DC)(DT)(DA) (DG)(DT)(DC)(DT)(DC)(DC) (DA)(DG)(DG) (DC)(DA)(DC)(DG)(DT)(DG)(DT)(DC)(DA)(DG) (DA)(DT)(DA)(DT)(DA)(DT)(DA) (DC)(DA) (DT)(DC)(DC)(DG)(DA)(DT)(DT)(DC)(DC)(DA) (DG)(DT)(DG)(DC)(DC)(DG)(DG)(DT) (DG) (DT)(DC)(DG)(DC)(DT)(DG)(DA)(DT)

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分子 #8: UNKNOWN ATOM OR ION

分子名称: UNKNOWN ATOM OR ION / タイプ: ligand / ID: 8 / コピー数: 2 / 式: UNX

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実験情報

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構造解析

手法クライオ電子顕微鏡法
解析単粒子再構成法
試料の集合状態particle

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試料調製

緩衝液pH: 7.5
凍結凍結剤: ETHANE

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電子顕微鏡法

顕微鏡TFS KRIOS
撮影フィルム・検出器のモデル: GATAN K2 SUMMIT (4k x 4k)
検出モード: SUPER-RESOLUTION / 平均電子線量: 50.0 e/Å2
電子線加速電圧: 300 kV / 電子線源: FIELD EMISSION GUN
電子光学系照射モード: FLOOD BEAM / 撮影モード: DARK FIELD / 最大 デフォーカス（公称値）: 2.5 µm / 最小 デフォーカス（公称値）: 1.5 µm
実験機器
モデル: Titan Krios / 画像提供: FEI Company

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画像解析

CTF補正タイプ: NONE
初期モデルモデルのタイプ: NONE
最終 再構成解像度のタイプ: BY AUTHOR / 解像度: 3.0 Å / 解像度の算出法: FSC 0.143 CUT-OFF / 使用した粒子像数: 31824
初期 角度割当タイプ: PROJECTION MATCHING
最終 角度割当タイプ: MAXIMUM LIKELIHOOD

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万見について

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お知らせ

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2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

  • EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
  • これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

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2020年8月12日: 新型コロナ情報

新型コロナ情報

URL: https://pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

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2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

新型コロナウイルスの構造データ

関連情報:万見生物種 / 2020年8月12日: 新型コロナ情報

外部リンク:COVID-19特集ページ - PDBj / 今月の分子2020年2月：コロナウイルスプロテーアーゼ

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2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

EMDBのIDの桁数の変更

  • EMDBエントリに付与されているアクセスコード(EMDB-ID)は4桁の数字(例、EMD-1234)でしたが、間もなく枯渇します。これまでの4桁のID番号は4桁のまま変更されませんが、4桁の数字を使い切った後に発行されるIDは5桁以上の数字(例、EMD-12345)になります。5桁のIDは2019年の春頃から発行される見通しです。
  • EM Navigator/万見では、接頭語「EMD-」は省略されています。

関連情報:Q: 「EMD」とは何ですか？ / 万見/EM NavigatorにおけるID/アクセスコードの表記

外部リンク:EMDB Accession Codes are Changing Soon! / PDBjへお問い合わせ

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2017年7月12日: PDB大規模アップデート

PDB大規模アップデート

  • 新バージョンのPDBx/mmCIF辞書形式に基づくデータがリリースされました。
  • 今回の更新はバージョン番号が4から5になる大規模なもので、全エントリデータの書き換えが行われる「Remediation」というアップデートに該当します。
  • このバージョンアップで、電子顕微鏡の実験手法に関する多くの項目の書式が改定されました(例：em_softwareなど)。
  • EM NavigatorとYorodumiでも、この改定に基づいた表示内容になります。

外部リンク:wwPDB Remediation / OneDepデータ基準に準拠した、より強化された内容のモデル構造ファイルが、PDBアーカイブで公開されました。

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万見 (Yorodumi)

幾万の構造データを、幾万の視点から

  • 万見(Yorodumi)は、EMDB/PDB/SASBDBなどの構造データを閲覧するためのページです。
  • EM Navigatorの詳細ページの後継、Omokage検索のフロントエンドも兼ねています。

関連情報:EMDB / PDB / SASBDB / 3つのデータバンクの比較 / 万見検索 / 2016年8月31日: 新しいEM Navigatorと万見 / 万見文献 / Jmol/JSmol / 機能・相同性情報 / 新しいEM Navigatorと万見の変更点

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