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- EMDB-61076: KU13-bond Mycobacterium tuberculosis 70S ribosome -

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基本情報

登録情報
データベース: EMDB / ID: EMD-61076
タイトルKU13-bond Mycobacterium tuberculosis 70S ribosome
マップデータ
試料
  • 複合体: KU13-bond Mycobacterium tuberculosis 70S ribosome
    • タンパク質・ペプチド: x 48種
    • RNA: x 4種
  • リガンド: x 3種
キーワードribosome / macrolide / ANTIBIOTIC / RIBOSOME-ANTIBIOTIC complex
機能・相同性
機能・相同性情報


large ribosomal subunit / transferase activity / ribosomal small subunit biogenesis / ribosomal small subunit assembly / small ribosomal subunit / small ribosomal subunit rRNA binding / 5S rRNA binding / ribosomal large subunit assembly / cytosolic small ribosomal subunit / large ribosomal subunit rRNA binding ...large ribosomal subunit / transferase activity / ribosomal small subunit biogenesis / ribosomal small subunit assembly / small ribosomal subunit / small ribosomal subunit rRNA binding / 5S rRNA binding / ribosomal large subunit assembly / cytosolic small ribosomal subunit / large ribosomal subunit rRNA binding / cytosolic large ribosomal subunit / cytoplasmic translation / tRNA binding / negative regulation of translation / rRNA binding / structural constituent of ribosome / ribosome / translation / ribonucleoprotein complex / mRNA binding / RNA binding / zinc ion binding / cytosol / cytoplasm
類似検索 - 分子機能
Ribosomal protein L25, long-form / Ribosomal protein L25, beta domain / Ribosomal protein L25, C-terminal / Ribosomal protein TL5, C-terminal domain / Ribosomal protein S14, type Z / : / Ribosomal protein S16, conserved site / Ribosomal protein S16 signature. / Ribosomal protein L16 signature 1. / Ribosomal protein L21, conserved site ...Ribosomal protein L25, long-form / Ribosomal protein L25, beta domain / Ribosomal protein L25, C-terminal / Ribosomal protein TL5, C-terminal domain / Ribosomal protein S14, type Z / : / Ribosomal protein S16, conserved site / Ribosomal protein S16 signature. / Ribosomal protein L16 signature 1. / Ribosomal protein L21, conserved site / Ribosomal protein L21 signature. / Ribosomal protein L16 signature 2. / Ribosomal protein L16, conserved site / Ribosomal protein L6, conserved site / Ribosomal protein L6 signature 1. / : / Ribosomal protein L9 signature. / Ribosomal protein L9, bacteria/chloroplast / Ribosomal protein L9, C-terminal / Ribosomal protein L9, C-terminal domain / Ribosomal protein L9, C-terminal domain superfamily / Ribosomal protein L17 signature. / Ribosomal L25p family / Ribosomal protein L25 / Ribosomal protein L36 signature. / Ribosomal protein L25/Gln-tRNA synthetase, N-terminal / Ribosomal protein L25/Gln-tRNA synthetase, anti-codon-binding domain superfamily / Ribosomal protein L9, N-terminal domain superfamily / Ribosomal protein L9 / Ribosomal protein L9, N-terminal / Ribosomal protein L9, N-terminal domain / : / Ribosomal protein L33, conserved site / Ribosomal protein L33 signature. / Ribosomal protein L35, conserved site / Ribosomal protein L35 signature. / Ribosomal protein L35, non-mitochondrial / Ribosomal protein L18, bacterial-type / : / Ribosomal protein S19, bacterial-type / Ribosomal protein S3, bacterial-type / Ribosomal protein L6, bacterial-type / Ribosomal protein S13, bacterial-type / Ribosomal protein S6, conserved site / Ribosomal protein S6 signature. / Ribosomal protein S7, bacterial/organellar-type / Ribosomal protein L5, bacterial-type / Ribosomal protein L9/RNase H1, N-terminal / Ribosomal protein S11, bacterial-type / Ribosomal protein S20 / Ribosomal protein S20 superfamily / Ribosomal protein S20 / Ribosomal protein S4, bacterial-type / Ribosomal protein S14/S29 / Ribosomal protein L36 / Ribosomal protein L36 superfamily / Ribosomal protein L36 / 30S ribosomal protein S17 / Ribosomal protein S5, bacterial-type / Ribosomal protein L19, conserved site / Ribosomal protein L19 signature. / Ribosomal protein L27, conserved site / Ribosomal protein L27 signature. / Ribosomal protein S6, plastid/chloroplast / Ribosomal protein L20 signature. / Ribosomal protein L22, bacterial/chloroplast-type / Ribosomal protein L14P, bacterial-type / Ribosomal protein L34, conserved site / Ribosomal protein L34 signature. / Ribosomal protein L2, bacterial/organellar-type / Ribosomal protein L35 / Ribosomal protein L35 superfamily / Ribosomal protein L35 / Ribosomal protein L33 / Ribosomal protein L33 / Ribosomal protein S9, bacterial/plastid / Ribosomal protein L18 / Ribosomal L18 of archaea, bacteria, mitoch. and chloroplast / Ribosomal protein L33 superfamily / Ribosomal protein S18, conserved site / Ribosomal protein S18 signature. / Ribosomal protein L16 / Ribosomal protein S16 / Ribosomal protein S16 domain superfamily / Ribosomal protein S16 / Ribosomal protein L30, bacterial-type / Ribosomal protein S15, bacterial-type / : / Ribosomal protein S6 / Ribosomal protein S6 / Ribosomal protein S6 superfamily / Ribosomal protein L27 / Ribosomal L27 protein / Ribosomal protein S12, bacterial-type / Ribosomal protein L20 / Ribosomal L32p protein family / Ribosomal protein L19 / Ribosomal protein L19 / Ribosomal protein L20 / Ribosomal protein L20, C-terminal
類似検索 - ドメイン・相同性
Large ribosomal subunit protein bL34 / Small ribosomal subunit protein uS17 / Large ribosomal subunit protein bL25 / Large ribosomal subunit protein bL21 / Large ribosomal subunit protein uL13 / : / : / Small ribosomal subunit protein bS6 / Small ribosomal subunit protein bS18A / Large ribosomal subunit protein bL9 ...Large ribosomal subunit protein bL34 / Small ribosomal subunit protein uS17 / Large ribosomal subunit protein bL25 / Large ribosomal subunit protein bL21 / Large ribosomal subunit protein uL13 / : / : / Small ribosomal subunit protein bS6 / Small ribosomal subunit protein bS18A / Large ribosomal subunit protein bL9 / Large ribosomal subunit protein bL33A / Small ribosomal subunit protein uS12 / Small ribosomal subunit protein uS7 / Small ribosomal subunit protein uS10 / Large ribosomal subunit protein uL3 / Large ribosomal subunit protein uL4 / Large ribosomal subunit protein uL23 / Large ribosomal subunit protein uL2 / Small ribosomal subunit protein uS19 / Large ribosomal subunit protein uL22 / Small ribosomal subunit protein uS3 / Large ribosomal subunit protein uL16 / Large ribosomal subunit protein uL29 / Large ribosomal subunit protein uL14 / Large ribosomal subunit protein uL24 / Large ribosomal subunit protein uL5 / Small ribosomal subunit protein uS14B / Small ribosomal subunit protein uS8 / Large ribosomal subunit protein uL6 / Large ribosomal subunit protein uL18 / Small ribosomal subunit protein uS5 / Large ribosomal subunit protein uL30 / Large ribosomal subunit protein uL15 / Large ribosomal subunit protein bL32 / Large ribosomal subunit protein bL35 / Large ribosomal subunit protein bL20 / Small ribosomal subunit protein bS20 / Large ribosomal subunit protein bL27 / Small ribosomal subunit protein uS15 / Large ribosomal subunit protein bL19 / Small ribosomal subunit protein bS16 / Small ribosomal subunit protein uS9 / Large ribosomal subunit protein bL17 / Small ribosomal subunit protein uS4 / Small ribosomal subunit protein uS11 / Small ribosomal subunit protein uS13 / Large ribosomal subunit protein bL36
類似検索 - 構成要素
生物種Mycobacterium tuberculosis variant bovis BCG str. Pasteur 1173P2 (結核菌)
手法単粒子再構成法 / クライオ電子顕微鏡法 / 解像度: 2.33 Å
データ登録者Nishihara D / Fujino M / Tanaka Y / Yokoyama T
資金援助 日本, 1件
OrganizationGrant number国
Other private 日本
引用ジャーナル: Sci Adv / 年: 2025
タイトル: Creation of a macrolide antibiotic against non-tuberculous using late-stage boron-mediated aglycon delivery.
著者: Yuka Isozaki / Takumi Makikawa / Kosuke Kimura / Daiki Nishihara / Maho Fujino / Yoshikazu Tanaka / Chigusa Hayashi / Yoshimasa Ishizaki / Masayuki Igarashi / Takeshi Yokoyama / Kazunobu ...著者: Yuka Isozaki / Takumi Makikawa / Kosuke Kimura / Daiki Nishihara / Maho Fujino / Yoshikazu Tanaka / Chigusa Hayashi / Yoshimasa Ishizaki / Masayuki Igarashi / Takeshi Yokoyama / Kazunobu Toshima / Daisuke Takahashi /
要旨: Non-tuberculous mycobacteria (NTM) is gaining clinical recognition as a recently emerging pulmonary pathogen. complex (MAC), the most common NTM, is the cause of pulmonary MAC disease. Currently, ...Non-tuberculous mycobacteria (NTM) is gaining clinical recognition as a recently emerging pulmonary pathogen. complex (MAC), the most common NTM, is the cause of pulmonary MAC disease. Currently, the macrolide azithromycin (AZM) is the standard first-line antibiotic for treatment of the disease. However, the rise of drug-resistant MAC necessitates the development of alternative therapeutics. Here, we present a late-stage boron-mediated aglycon delivery strategy for selective modification of AZM, generating a library of potential anti-MAC drugs designated to . Screening of to revealed that exhibited enhanced antimicrobial activity against wild-type and macrolide-resistant MAC compared to AZM. Cryo-electron microscopy analysis indicated that the inserted tercyclic moiety of formed a robust anchor on the bacterial ribosome, creating a binding pocket with base flipping of U2847, potentially bypassing the standard mechanism of macrolide resistance. These results position as a promising lead for therapeutics against macrolide-resistant MAC.
履歴
登録2024年8月5日-
ヘッダ(付随情報) 公開2025年3月19日-
マップ公開2025年3月19日-
更新2025年3月19日-
現状2025年3月19日処理サイト: PDBj / 状態: 公開

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emd_61076.png

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マップ

ファイルダウンロード / ファイル: emd_61076.map.gz / 形式: CCP4 / 大きさ: 512 MB / タイプ: IMAGE STORED AS FLOATING POINT NUMBER (4 BYTES)
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軸Z (Sec.)Y (Row.)X (Col.)
0.79 Å/pix.
x 512 pix.
= 403.456 Å		0.79 Å/pix.
x 512 pix.
= 403.456 Å		0.79 Å/pix.
x 512 pix.
= 403.456 Å

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投影像

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断面 (1/2)

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ボクセルのサイズX=Y=Z: 0.788 Å
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ヒストグラム

ヒストグラム (対数)
表面レベル登録者による: 0.0085
最小 - 最大-0.021826182 - 0.08317836
平均 (標準偏差)0.00013378965 (±0.0025128794)
対称性空間群: 1
詳細

EMDB XML:

マップ形状
Axis orderXYZ
Origin000
サイズ512512512
Spacing512512512
セルA=B=C: 403.456 Å
α=β=γ: 90.0 °

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添付データ

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ハーフマップ: #2

ファイルemd_61076_half_map_1.map
投影像・断面図
軸ZYX

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断面 (1/2)
密度ヒストグラム

ヒストグラム

ヒストグラム (対数)

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ハーフマップ: #1

ファイルemd_61076_half_map_2.map
投影像・断面図
軸ZYX

投影像

断面 (1/2)
密度ヒストグラム

ヒストグラム

ヒストグラム (対数)

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試料の構成要素

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全体 : KU13-bond Mycobacterium tuberculosis 70S ribosome

全体名称: KU13-bond Mycobacterium tuberculosis 70S ribosome
要素
  • 複合体: KU13-bond Mycobacterium tuberculosis 70S ribosome
    • タンパク質・ペプチド: Large ribosomal subunit protein bL32
    • タンパク質・ペプチド: Large ribosomal subunit protein bL33A
    • タンパク質・ペプチド: Large ribosomal subunit protein bL34
    • タンパク質・ペプチド: Large ribosomal subunit protein bL35
    • タンパク質・ペプチド: Large ribosomal subunit protein bL36
    • タンパク質・ペプチド: 30S ribosomal protein THX
    • RNA: 23S rRNA
    • RNA: 5S rRNA
    • タンパク質・ペプチド: Large ribosomal subunit protein uL2
    • タンパク質・ペプチド: Large ribosomal subunit protein uL3
    • タンパク質・ペプチド: Large ribosomal subunit protein uL4
    • タンパク質・ペプチド: Large ribosomal subunit protein uL5
    • タンパク質・ペプチド: Large ribosomal subunit protein uL6
    • タンパク質・ペプチド: Large ribosomal subunit protein bL9
    • タンパク質・ペプチド: Large ribosomal subunit protein uL13
    • タンパク質・ペプチド: Large ribosomal subunit protein uL14
    • タンパク質・ペプチド: Large ribosomal subunit protein uL15
    • タンパク質・ペプチド: Large ribosomal subunit protein uL16
    • タンパク質・ペプチド: Large ribosomal subunit protein bL17
    • タンパク質・ペプチド: Large ribosomal subunit protein uL18
    • タンパク質・ペプチド: Large ribosomal subunit protein bL19
    • タンパク質・ペプチド: Large ribosomal subunit protein bL20
    • タンパク質・ペプチド: Large ribosomal subunit protein bL21
    • タンパク質・ペプチド: Large ribosomal subunit protein uL22
    • タンパク質・ペプチド: Large ribosomal subunit protein uL23
    • タンパク質・ペプチド: Large ribosomal subunit protein uL24
    • タンパク質・ペプチド: Large ribosomal subunit protein bL25
    • タンパク質・ペプチド: Large ribosomal subunit protein bL27
    • タンパク質・ペプチド: Large ribosomal subunit protein bL28
    • タンパク質・ペプチド: Large ribosomal subunit protein uL29
    • タンパク質・ペプチド: Large ribosomal subunit protein uL30
    • RNA: 16S rRNA
    • タンパク質・ペプチド: Small ribosomal subunit protein uS3
    • タンパク質・ペプチド: Small ribosomal subunit protein uS4
    • タンパク質・ペプチド: Small ribosomal subunit protein uS5
    • タンパク質・ペプチド: Small ribosomal subunit protein bS6
    • タンパク質・ペプチド: Small ribosomal subunit protein uS7
    • タンパク質・ペプチド: Small ribosomal subunit protein uS8
    • タンパク質・ペプチド: Small ribosomal subunit protein uS9
    • タンパク質・ペプチド: Small ribosomal subunit protein uS10
    • タンパク質・ペプチド: Small ribosomal subunit protein uS11
    • タンパク質・ペプチド: Small ribosomal subunit protein uS12
    • タンパク質・ペプチド: Small ribosomal subunit protein uS13
    • タンパク質・ペプチド: Small ribosomal subunit protein uS14B
    • タンパク質・ペプチド: Small ribosomal subunit protein uS15
    • タンパク質・ペプチド: Small ribosomal subunit protein bS16
    • タンパク質・ペプチド: Small ribosomal subunit protein uS17
    • タンパク質・ペプチド: Small ribosomal subunit protein bS18A
    • タンパク質・ペプチド: Small ribosomal subunit protein uS19
    • タンパク質・ペプチド: Small ribosomal subunit protein bS20
    • タンパク質・ペプチド: Mitochondrial domain of uncharacterised function (DUF1713)
    • RNA: tRNA
  • リガンド: ZINC ION
  • リガンド: MAGNESIUM ION
  • リガンド: (2~{R},3~{R},4~{R},5~{R},8~{R},10~{R},11~{R},12~{S},13~{S},14~{R})-11-[(2~{S},3~{R},4~{S},6~{R})-4-(dimethylamino)-6-methyl-3-oxidanyl-oxan-2-yl]oxy-2-ethyl-4-[(2~{R},3~{R},4~{R},5~{S},6~{R})-6-(hydroxymethyl)-3,4-bis(oxidanyl)-5-[[4-(4-pyridin-4-yl-1,2,3-triazol-1-yl)phenyl]methoxy]oxan-2-yl]oxy-13-[(2~{R},4~{R},5~{S},6~{S})-4-methoxy-4,6-dimethyl-5-oxidanyl-oxan-2-yl]oxy-3,5,6,8,10,12,14-heptamethyl-3,10-bis(oxidanyl)-1-oxa-6-azacyclopentadecan-15-one

+
超分子 #1: KU13-bond Mycobacterium tuberculosis 70S ribosome

超分子名称: KU13-bond Mycobacterium tuberculosis 70S ribosome / タイプ: complex / ID: 1 / 親要素: 0 / 含まれる分子: #1-#52
由来(天然)生物種: Mycobacterium tuberculosis variant bovis BCG str. Pasteur 1173P2 (結核菌)

+
分子 #1: Large ribosomal subunit protein bL32

分子名称: Large ribosomal subunit protein bL32 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 1 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Mycobacterium tuberculosis variant bovis BCG str. Pasteur 1173P2 (結核菌)
株: Mycobacterium tuberculosis variant bovis BCG str. Pasteur 1173P2
分子量理論値: 6.525757 KDa
配列文字列:
MAVPKRRKSR SNTRSRRSQW KAAKTELVGV TVAGHAHKVP RRLLKAARLG LIDFDKR

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein bL32

+
分子 #2: Large ribosomal subunit protein bL33A

分子名称: Large ribosomal subunit protein bL33A / タイプ: protein_or_peptide / ID: 2 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Mycobacterium tuberculosis variant bovis BCG str. Pasteur 1173P2 (結核菌)
株: Mycobacterium tuberculosis variant bovis BCG str. Pasteur 1173P2
分子量理論値: 6.512581 KDa
配列文字列:
MASSTDVRPK ITLACEVCKH RNYITKKNRR NDPDRLELKK FCPNCGKHQA HRETR

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein bL33A

+
分子 #3: Large ribosomal subunit protein bL34

分子名称: Large ribosomal subunit protein bL34 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 3 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Mycobacterium tuberculosis variant bovis BCG str. Pasteur 1173P2 (結核菌)
株: Mycobacterium tuberculosis variant bovis BCG str. Pasteur 1173P2
分子量理論値: 5.643697 KDa
配列文字列:
MTKGKRTFQP NNRRRARVHG FRLRMRTRAG RSIVSSRRRK GRRTLSA

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein bL34

+
分子 #4: Large ribosomal subunit protein bL35

分子名称: Large ribosomal subunit protein bL35 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 4 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Mycobacterium tuberculosis variant bovis BCG str. Pasteur 1173P2 (結核菌)
株: Mycobacterium tuberculosis variant bovis BCG str. Pasteur 1173P2
分子量理論値: 7.24143 KDa
配列文字列:
MPKAKTHSGA SKRFRRTGTG KIVRQKANRR HLLEHKPSTR TRRLDGRTVV AANDTKRVTS LLNG

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein bL35

+
分子 #5: Large ribosomal subunit protein bL36

分子名称: Large ribosomal subunit protein bL36 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 5 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Mycobacterium tuberculosis variant bovis BCG str. Pasteur 1173P2 (結核菌)
株: Mycobacterium tuberculosis variant bovis BCG str. Pasteur 1173P2
分子量理論値: 4.355305 KDa
配列文字列:
MKVNPSVKPI CDKCRLIRRH GRVMVICSDP RHKQRQG

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein bL36

+
分子 #6: 30S ribosomal protein THX

分子名称: 30S ribosomal protein THX / タイプ: protein_or_peptide / ID: 6 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Mycobacterium tuberculosis variant bovis BCG str. Pasteur 1173P2 (結核菌)
株: Mycobacterium tuberculosis variant bovis BCG str. Pasteur 1173P2
分子量理論値: 2.882402 KDa
配列文字列:
MAKRGRKKRD RKYSKANHGK RPNS

UniProtKB: UNIPROTKB: A0AAE8WR80

+
分子 #9: Large ribosomal subunit protein uL2

分子名称: Large ribosomal subunit protein uL2 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 9 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Mycobacterium tuberculosis variant bovis BCG str. Pasteur 1173P2 (結核菌)
株: Mycobacterium tuberculosis variant bovis BCG str. Pasteur 1173P2
分子量理論値: 30.644002 KDa
配列文字列: MAIRKYKPTT PGRRGASVSD FAEITRSTPE KSLVRPLHGR GGRNAHGRIT TRHKGGGHKR AYRMIDFRRN DKDGVNAKVA HIEYDPNRT ARIALLHYLD GEKRYIIAPN GLSQGDVVES GANADIKPGN NLPLRNIPAG TLIHAVELRP GGGAKLARSA G SSIQLLGK ...文字列:
MAIRKYKPTT PGRRGASVSD FAEITRSTPE KSLVRPLHGR GGRNAHGRIT TRHKGGGHKR AYRMIDFRRN DKDGVNAKVA HIEYDPNRT ARIALLHYLD GEKRYIIAPN GLSQGDVVES GANADIKPGN NLPLRNIPAG TLIHAVELRP GGGAKLARSA G SSIQLLGK EASYASLRMP SGEIRRVDVR CRATVGEVGN AEQANINWGK AGRMRWKGKR PSVRGVVMNP VDHPHGGGEG KT SGGRHPV SPWGKPEGRT RNANKSSNKF IVRRRRTGKK HSR

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein uL2

+
分子 #10: Large ribosomal subunit protein uL3

分子名称: Large ribosomal subunit protein uL3 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 10 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Mycobacterium tuberculosis variant bovis BCG str. Pasteur 1173P2 (結核菌)
株: Mycobacterium tuberculosis variant bovis BCG str. Pasteur 1173P2
分子量理論値: 23.127533 KDa
配列文字列: MARKGILGTK LGMTQVFDES NRVVPVTVVK AGPNVVTRIR TPERDGYSAV QLAYGEISPR KVNKPLTGQY TAAGVNPRRY LAELRLDDS DAATEYQVGQ ELTAEIFADG SYVDVTGTSK GKGFAGTMKR HGFRGQGASH GAQAVHRRPG SIGGCATPAR V FKGTRMAG ...文字列:
MARKGILGTK LGMTQVFDES NRVVPVTVVK AGPNVVTRIR TPERDGYSAV QLAYGEISPR KVNKPLTGQY TAAGVNPRRY LAELRLDDS DAATEYQVGQ ELTAEIFADG SYVDVTGTSK GKGFAGTMKR HGFRGQGASH GAQAVHRRPG SIGGCATPAR V FKGTRMAG RMGNDRVTVL NLLVHKVDAE NGVLLIKGAV PGRTGGLVMV RSAIKRGEK

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein uL3

+
分子 #11: Large ribosomal subunit protein uL4

分子名称: Large ribosomal subunit protein uL4 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 11 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Mycobacterium tuberculosis variant bovis BCG str. Pasteur 1173P2 (結核菌)
株: Mycobacterium tuberculosis variant bovis BCG str. Pasteur 1173P2
分子量理論値: 23.779936 KDa
配列文字列: MAAQEQKTLK IDVKTPAGKV DGAIELPAEL FDVPANIALM HQVVTAQRAA ARQGTHSTKT RGEVSGGGRK PYRQKGTGRA RQGSTRAPQ FTGGGVVHGP KPRDYSQRTP KKMIAAALRG ALSDRARNGR IHAITELVEG QNPSTKSARA FLASLTERKQ V LVVIGRSD ...文字列:
MAAQEQKTLK IDVKTPAGKV DGAIELPAEL FDVPANIALM HQVVTAQRAA ARQGTHSTKT RGEVSGGGRK PYRQKGTGRA RQGSTRAPQ FTGGGVVHGP KPRDYSQRTP KKMIAAALRG ALSDRARNGR IHAITELVEG QNPSTKSARA FLASLTERKQ V LVVIGRSD EAGAKSVRNL PGVHILAPDQ LNTYDVLRAD DVVFSVEALN AYIAANTTTS EEVSA

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein uL4

+
分子 #12: Large ribosomal subunit protein uL5

分子名称: Large ribosomal subunit protein uL5 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 12 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Mycobacterium tuberculosis variant bovis BCG str. Pasteur 1173P2 (結核菌)
株: Mycobacterium tuberculosis variant bovis BCG str. Pasteur 1173P2
分子量理論値: 21.052303 KDa
配列文字列:
MTTAQKVQPR LKERYRSEIR DALRKQFGYG NVMQIPTVTK VVVNMGVGEA ARDAKLINGA VNDLALITGQ KPEVRRARKS IAQFKLREG MPVGVRVTLR GDRMWEFLDR LTSIALPRIR DFRGLSPKQF DGVGNYTFGL AEQAVFHEVD VDKIDRVRGM D INVVTSAA TDDEGRALLR ALGFPFKEN

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein uL5

+
分子 #13: Large ribosomal subunit protein uL6

分子名称: Large ribosomal subunit protein uL6 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 13 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Mycobacterium tuberculosis variant bovis BCG str. Pasteur 1173P2 (結核菌)
株: Mycobacterium tuberculosis variant bovis BCG str. Pasteur 1173P2
分子量理論値: 19.408363 KDa
配列文字列:
MSRIGKQPIP VPAGVDVTIE GQSISVKGPK GTLGLTVAEP IKVARNDDGA IVVTRPDDER RNRSLHGLSR TLVSNLVTGV TQGYTTKME IFGVGYRVQL KGSNLEFALG YSHPVVIEAP EGITFAVQAP TKFTVSGIDK QKVGQIAANI RRLRRPDPYK G KGVRYEGE QIRRKVGKTG K

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein uL6

+
分子 #14: Large ribosomal subunit protein bL9

分子名称: Large ribosomal subunit protein bL9 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 14 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Mycobacterium tuberculosis variant bovis BCG str. Pasteur 1173P2 (結核菌)
株: Mycobacterium tuberculosis variant bovis BCG str. Pasteur 1173P2
分子量理論値: 16.196654 KDa
配列文字列:
MKLILTADVD HLGSIGDTVE VKDGYGRNFL LPRGLAIVAS RGAQKQADEI RRARETKSVR DLEHANEIKA AIEALGPIAL PVKTSADSG KLFGSVTAAD VVAAIKKAGG PNLDKRIVRL PKTHIKAVGT HFVSVHLHPE IDVEVSLDVV AQS

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein bL9

+
分子 #15: Large ribosomal subunit protein uL13

分子名称: Large ribosomal subunit protein uL13 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 15 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Mycobacterium tuberculosis variant bovis BCG str. Pasteur 1173P2 (結核菌)
株: Mycobacterium tuberculosis variant bovis BCG str. Pasteur 1173P2
分子量理論値: 21.646121 KDa
配列文字列: MLVGKLLGWR AVRRDLGSMS VAETNPPFTP DRRPGHPGIH PREKKVSAVP TYAPKAGDTT RSWYVIDATD VVLGRLAVAA ANLLRGKHK PTFAPNVDGG DFVIVINADK VAISGDKLQH KMVYRHSGYP GGLHKRTIGE LMQRHPDRVV EKAILGMLPK N RLSRQIQR ...文字列:
MLVGKLLGWR AVRRDLGSMS VAETNPPFTP DRRPGHPGIH PREKKVSAVP TYAPKAGDTT RSWYVIDATD VVLGRLAVAA ANLLRGKHK PTFAPNVDGG DFVIVINADK VAISGDKLQH KMVYRHSGYP GGLHKRTIGE LMQRHPDRVV EKAILGMLPK N RLSRQIQR KLRVYAGPEH PHSAQQPVPY ELKQVAQ

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein uL13

+
分子 #16: Large ribosomal subunit protein uL14

分子名称: Large ribosomal subunit protein uL14 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 16 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Mycobacterium tuberculosis variant bovis BCG str. Pasteur 1173P2 (結核菌)
株: Mycobacterium tuberculosis variant bovis BCG str. Pasteur 1173P2
分子量理論値: 13.451714 KDa
配列文字列:
MIQQESRLKV ADNTGAKEIL CIRVLGGSSR RYAGIGDVIV ATVKDAIPGG NVKRGDVVKA VVVRTVKERR RPDGSYIKFD ENAAVIIKP DNDPRGTRIF GPVGRELREK RFMKIISLAP EVL

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein uL14

+
分子 #17: Large ribosomal subunit protein uL15

分子名称: Large ribosomal subunit protein uL15 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 17 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Mycobacterium tuberculosis variant bovis BCG str. Pasteur 1173P2 (結核菌)
株: Mycobacterium tuberculosis variant bovis BCG str. Pasteur 1173P2
分子量理論値: 15.554073 KDa
配列文字列:
MTLKLHDLRP ARGSKTARTR VGRGDGSKGK TAGRGTKGTR ARKQVPVTFE GGQMPIHMRL PKLKGFRNRF RTEYEIVNVG DINRLFPQG GAVGVDDLVA KGAVRKNALV KVLGDGKLTA KVDVSAHKFS GSARAKITAA GGSATEL

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein uL15

+
分子 #18: Large ribosomal subunit protein uL16

分子名称: Large ribosomal subunit protein uL16 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 18 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Mycobacterium tuberculosis variant bovis BCG str. Pasteur 1173P2 (結核菌)
株: Mycobacterium tuberculosis variant bovis BCG str. Pasteur 1173P2
分子量理論値: 15.724277 KDa
配列文字列:
MLIPRKVKHR KQHHPRQRGI ASGGTTVNFG DYGIQALEHA YVTNRQIESA RIAINRHIKR GGKVWINIFP DRPLTKKPAE TRMGSGKGS PEWWVANVKP GRVLFELSYP NEGVARAALT RAIHKLPIKA RIITREEQF

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein uL16

+
分子 #19: Large ribosomal subunit protein bL17

分子名称: Large ribosomal subunit protein bL17 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 19 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Mycobacterium tuberculosis variant bovis BCG str. Pasteur 1173P2 (結核菌)
株: Mycobacterium tuberculosis variant bovis BCG str. Pasteur 1173P2
分子量理論値: 19.512273 KDa
配列文字列:
MPKPTKGPRL GGSSSHQKAI LANLATSLFE HGRITTTEPK ARALRPYAEK LITHAKKGAL HNRREVLKKL RDKDVVHTLF AEIGPFFAD RDGGYTRIIK IEARKGDNAP MAVIELVREK TVTSEANRAR RVAAAQAKAK KAAAMPTEES EAKPAEEGDV V GASEPDAK APEEPPAEAP EN

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein bL17

+
分子 #20: Large ribosomal subunit protein uL18

分子名称: Large ribosomal subunit protein uL18 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 20 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Mycobacterium tuberculosis variant bovis BCG str. Pasteur 1173P2 (結核菌)
株: Mycobacterium tuberculosis variant bovis BCG str. Pasteur 1173P2
分子量理論値: 13.211122 KDa
配列文字列:
MAQSVSATRR ISRLRRHTRL RKKLSGTAER PRLVVHRSAR HIHVQLVNDL NGTTVAAASS IEADVRGVPG DKKARSVRVG QLIAERAKA AGIDTVVFDR GGYTYGGRIA ALADAARENG LSF

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein uL18

+
分子 #21: Large ribosomal subunit protein bL19

分子名称: Large ribosomal subunit protein bL19 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 21 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Mycobacterium tuberculosis variant bovis BCG str. Pasteur 1173P2 (結核菌)
株: Mycobacterium tuberculosis variant bovis BCG str. Pasteur 1173P2
分子量理論値: 13.041126 KDa
配列文字列:
MNRLDFVDKP SLRDDIPAFN PGDTINVHVK VIEGAKERLQ VFKGVVIRRQ GGGIRETFTV RKESYGVGVE RTFPVHSPNI DHIEVVTRG DVRRAKLYYL RELRGKKAKI KEKR

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein bL19

+
分子 #22: Large ribosomal subunit protein bL20

分子名称: Large ribosomal subunit protein bL20 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 22 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Mycobacterium tuberculosis variant bovis BCG str. Pasteur 1173P2 (結核菌)
株: Mycobacterium tuberculosis variant bovis BCG str. Pasteur 1173P2
分子量理論値: 14.557777 KDa
配列文字列:
MARVKRAVNA HKKRRSILKA SRGYRGQRSR LYRKAKEQQL HSLNYAYRDR RARKGEFRKL WIARINAAAR LNDITYNRLI QGLKAAGVE VDRKNLADIA ISDPAAFTAL VDVARAALPE DVNAPSGEAA

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein bL20

+
分子 #23: Large ribosomal subunit protein bL21

分子名称: Large ribosomal subunit protein bL21 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 23 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Mycobacterium tuberculosis variant bovis BCG str. Pasteur 1173P2 (結核菌)
株: Mycobacterium tuberculosis variant bovis BCG str. Pasteur 1173P2
分子量理論値: 11.173147 KDa
配列文字列:
MMATYAIVKT GGKQYKVAVG DVVKVEKLES EQGEKVSLPV ALVVDGATVT TDAKALAKVA VTGEVLGHTK GPKIRIHKFK NKTGYHKRQ GHRQQLTVLK VTGIA

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein bL21

+
分子 #24: Large ribosomal subunit protein uL22

分子名称: Large ribosomal subunit protein uL22 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 24 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Mycobacterium tuberculosis variant bovis BCG str. Pasteur 1173P2 (結核菌)
株: Mycobacterium tuberculosis variant bovis BCG str. Pasteur 1173P2
分子量理論値: 20.424594 KDa
配列文字列: MTAATKATEY PSAVAKARFV RVSPRKARRV IDLVRGRSVS DALDILRWAP QAASGPVAKV IASAAANAQN NGGLDPATLV VATVYADQG PTAKRIRPRA QGRAFRIRRR TSHITVVVES RPAKDQRSAK SSRARRTEAS KAASKVGATA PAKKAAAKAP A KKAPASSG ...文字列:
MTAATKATEY PSAVAKARFV RVSPRKARRV IDLVRGRSVS DALDILRWAP QAASGPVAKV IASAAANAQN NGGLDPATLV VATVYADQG PTAKRIRPRA QGRAFRIRRR TSHITVVVES RPAKDQRSAK SSRARRTEAS KAASKVGATA PAKKAAAKAP A KKAPASSG VKKTPAKKAP AKKAPAKASE TSAAKGGSD

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein uL22

+
分子 #25: Large ribosomal subunit protein uL23

分子名称: Large ribosomal subunit protein uL23 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 25 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Mycobacterium tuberculosis variant bovis BCG str. Pasteur 1173P2 (結核菌)
株: Mycobacterium tuberculosis variant bovis BCG str. Pasteur 1173P2
分子量理論値: 10.976785 KDa
配列文字列:
MATLADPRDI ILAPVISEKS YGLLDDNVYT FLVRPDSNKT QIKIAVEKIF AVKVASVNTA NRQGKRKRTR TGYGKRKSTK RAIVTLAPG SRPIDLFGAP A

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein uL23

+
分子 #26: Large ribosomal subunit protein uL24

分子名称: Large ribosomal subunit protein uL24 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 26 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Mycobacterium tuberculosis variant bovis BCG str. Pasteur 1173P2 (結核菌)
株: Mycobacterium tuberculosis variant bovis BCG str. Pasteur 1173P2
分子量理論値: 11.500274 KDa
配列文字列:
MKVHKGDTVL VISGKDKGAK GKVLQAYPDR NRVLVEGVNR IKKHTAISTT QRGARSGGIV TQEAPIHVSN VMVVDSDGKP TRIGYRVDE ETGKRVRISK RNGKDI

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein uL24

+
分子 #27: Large ribosomal subunit protein bL25

分子名称: Large ribosomal subunit protein bL25 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 27 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Mycobacterium tuberculosis variant bovis BCG str. Pasteur 1173P2 (結核菌)
株: Mycobacterium tuberculosis variant bovis BCG str. Pasteur 1173P2
分子量理論値: 22.466166 KDa
配列文字列: MAKSASNQLR VTVRTETGKG ASRRARRAGK IPAVLYGHGA EPQHLELPGH DYAAVLRHSG TNAVLTLDIA GKEQLALTKA LHIHPIRRT IQHADLLVVR RGEKVVVEVS VVVEGQAGPD TLVTQETNSI EIEAEALSIP EQLTVSIEGA EPGTQLTAGQ I ALPAGVSL ...文字列:
MAKSASNQLR VTVRTETGKG ASRRARRAGK IPAVLYGHGA EPQHLELPGH DYAAVLRHSG TNAVLTLDIA GKEQLALTKA LHIHPIRRT IQHADLLVVR RGEKVVVEVS VVVEGQAGPD TLVTQETNSI EIEAEALSIP EQLTVSIEGA EPGTQLTAGQ I ALPAGVSL ISDPDLLVVN VVKAPTAEEL EGEVAGAEEA EEAAVEAGEA EAAGESE

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein bL25

+
分子 #28: Large ribosomal subunit protein bL27

分子名称: Large ribosomal subunit protein bL27 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 28 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Mycobacterium tuberculosis variant bovis BCG str. Pasteur 1173P2 (結核菌)
株: Mycobacterium tuberculosis variant bovis BCG str. Pasteur 1173P2
分子量理論値: 8.987272 KDa
配列文字列:
MAHKKGASSS RNGRDSAAQR LGVKRYGGQV VKAGEILVRQ RGTKFHPGVN VGRGGDDTLF AKTAGAVEFG IKRGRKTVSI VGSTTA

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein bL27

+
分子 #29: Large ribosomal subunit protein bL28

分子名称: Large ribosomal subunit protein bL28 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 29 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Mycobacterium tuberculosis variant bovis BCG str. Pasteur 1173P2 (結核菌)
株: Mycobacterium tuberculosis variant bovis BCG str. Pasteur 1173P2
分子量理論値: 6.920075 KDa
配列文字列:
MAAVCDICGK GPGFGKSVSH SHRRTSRRWD PNIQTVHAVT RPGGNKKRLN VCTSCIKAGK ITRG

UniProtKB: UNIPROTKB: A0AAE8WTM0

+
分子 #30: Large ribosomal subunit protein uL29

分子名称: Large ribosomal subunit protein uL29 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 30 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Mycobacterium tuberculosis variant bovis BCG str. Pasteur 1173P2 (結核菌)
株: Mycobacterium tuberculosis variant bovis BCG str. Pasteur 1173P2
分子量理論値: 8.872015 KDa
配列文字列:
MAVGVSPGEL RELTDEELAE RLRESKEELF NLRFQMATGQ LNNNRRLRTV RQEIARIYTV LRERELGLAT GPDGKES

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein uL29

+
分子 #31: Large ribosomal subunit protein uL30

分子名称: Large ribosomal subunit protein uL30 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 31 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Mycobacterium tuberculosis variant bovis BCG str. Pasteur 1173P2 (結核菌)
株: Mycobacterium tuberculosis variant bovis BCG str. Pasteur 1173P2
分子量理論値: 7.361569 KDa
配列文字列:
MSQLKITQVR STIGARWKQR ESLRTLGLRR IRHSVIREDN AATRGLIAVV RHLVEVEPAQ TGGKT

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein uL30

+
分子 #33: Small ribosomal subunit protein uS3

分子名称: Small ribosomal subunit protein uS3 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 33 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Mycobacterium tuberculosis variant bovis BCG str. Pasteur 1173P2 (結核菌)
株: Mycobacterium tuberculosis variant bovis BCG str. Pasteur 1173P2
分子量理論値: 30.071018 KDa
配列文字列: MGQKINPHGF RLGITTDWKS RWYADKQYAE YVKEDVAIRR LLSSGLERAG IADVEIERTR DRVRVDIHTA RPGIVIGRRG TEADRIRAD LEKLTGKQVQ LNILEVKNPE SQAQLVAQGV AEQLSNRVAF RRAMRKAIQS AMRQPNVKGI RVQCSGRLGG A EMSRSEFY ...文字列:
MGQKINPHGF RLGITTDWKS RWYADKQYAE YVKEDVAIRR LLSSGLERAG IADVEIERTR DRVRVDIHTA RPGIVIGRRG TEADRIRAD LEKLTGKQVQ LNILEVKNPE SQAQLVAQGV AEQLSNRVAF RRAMRKAIQS AMRQPNVKGI RVQCSGRLGG A EMSRSEFY REGRVPLHTL RADIDYGLYE AKTTFGRIGV KVWIYKGDIV GGKRELAAAA PAGADRPRRE RPSGTRPRRS GA SGTTATG TDAGRAAGGE EAAPDAAAPV EAQSTES

UniProtKB: Small ribosomal subunit protein uS3

+
分子 #34: Small ribosomal subunit protein uS4

分子名称: Small ribosomal subunit protein uS4 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 34 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Mycobacterium tuberculosis variant bovis BCG str. Pasteur 1173P2 (結核菌)
株: Mycobacterium tuberculosis variant bovis BCG str. Pasteur 1173P2
分子量理論値: 23.515898 KDa
配列文字列: MARYTGPVTR KSRRLRTDLV GGDQAFEKRP YPPGQHGRAR IKESEYLLQL QEKQKARFTY GVMEKQFRRY YEEAVRQPGK TGEELLKIL ESRLDNVIYR AGLARTRRMA RQLVSHGHFN VNGVHVNVPS YRVSQYDIVD VRDKSLNTVP FQIARETAGE R PIPSWLQV ...文字列:
MARYTGPVTR KSRRLRTDLV GGDQAFEKRP YPPGQHGRAR IKESEYLLQL QEKQKARFTY GVMEKQFRRY YEEAVRQPGK TGEELLKIL ESRLDNVIYR AGLARTRRMA RQLVSHGHFN VNGVHVNVPS YRVSQYDIVD VRDKSLNTVP FQIARETAGE R PIPSWLQV VGERQRVLIH QLPERAQIDV PLTEQLIVEY YSK

UniProtKB: Small ribosomal subunit protein uS4

+
分子 #35: Small ribosomal subunit protein uS5

分子名称: Small ribosomal subunit protein uS5 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 35 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Mycobacterium tuberculosis variant bovis BCG str. Pasteur 1173P2 (結核菌)
株: Mycobacterium tuberculosis variant bovis BCG str. Pasteur 1173P2
分子量理論値: 22.925242 KDa
配列文字列: MAEQPAGQAG TTDNRDARGD REGRRRDSGR GSRERDGEKS NYLERVVAIN RVSKVVKGGR RFSFTALVIV GDGNGMVGVG YGKAKEVPA AIAKGVEEAR KSFFRVPLIG GTITHPVQGE AAAGVVLLRP ASPGTGVIAG GAARAVLECA GVHDILAKSL G SDNAINVV ...文字列:
MAEQPAGQAG TTDNRDARGD REGRRRDSGR GSRERDGEKS NYLERVVAIN RVSKVVKGGR RFSFTALVIV GDGNGMVGVG YGKAKEVPA AIAKGVEEAR KSFFRVPLIG GTITHPVQGE AAAGVVLLRP ASPGTGVIAG GAARAVLECA GVHDILAKSL G SDNAINVV HATVAALKLL QRPEEVAARR GLPIEDVAPA GMLKARRKSE ALAASVLPDR TI

UniProtKB: Small ribosomal subunit protein uS5

+
分子 #36: Small ribosomal subunit protein bS6

分子名称: Small ribosomal subunit protein bS6 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 36 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Mycobacterium tuberculosis variant bovis BCG str. Pasteur 1173P2 (結核菌)
株: Mycobacterium tuberculosis variant bovis BCG str. Pasteur 1173P2
分子量理論値: 10.952728 KDa
配列文字列:
MRPYEIMVIL DPTLDERTVA PSLETFLNVV RKDGGKVEKV DIWGKRRLAY EIAKHAEGIY VVIDVKAAPA TVSELDRQLS LNESVLRTK VMRTDKH

UniProtKB: Small ribosomal subunit protein bS6

+
分子 #37: Small ribosomal subunit protein uS7

分子名称: Small ribosomal subunit protein uS7 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 37 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Mycobacterium tuberculosis variant bovis BCG str. Pasteur 1173P2 (結核菌)
株: Mycobacterium tuberculosis variant bovis BCG str. Pasteur 1173P2
分子量理論値: 17.633418 KDa
配列文字列:
MPRKGPAPKR PLVNDPVYGS QLVTQLVNKV LLKGKKSLAE RIVYGALEQA RDKTGTDPVI TLKRALDNVK PALEVRSRRV GGATYQVPV EVRPDRSTTL ALRWLVGYSR QRREKTMIER LANEILDASN GLGASVKRRE DTHKMAEANR AFAHYRW

UniProtKB: Small ribosomal subunit protein uS7

+
分子 #38: Small ribosomal subunit protein uS8

分子名称: Small ribosomal subunit protein uS8 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 38 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Mycobacterium tuberculosis variant bovis BCG str. Pasteur 1173P2 (結核菌)
株: Mycobacterium tuberculosis variant bovis BCG str. Pasteur 1173P2
分子量理論値: 14.432563 KDa
配列文字列:
MTMTDPIADF LTRLRNANSA YHDEVSLPHS KLKANIAQIL KNEGYISDFR TEDARVGKSL VIQLKYGPSR ERSIAGLRRV SKPGLRVYA KSTNLPRVLG GLGVAIISTS SGLLTDRQAA RQGVGGEVLA YVW

UniProtKB: Small ribosomal subunit protein uS8

+
分子 #39: Small ribosomal subunit protein uS9

分子名称: Small ribosomal subunit protein uS9 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 39 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Mycobacterium tuberculosis variant bovis BCG str. Pasteur 1173P2 (結核菌)
株: Mycobacterium tuberculosis variant bovis BCG str. Pasteur 1173P2
分子量理論値: 16.465061 KDa
配列文字列:
MTETTPAPQT PAAPAGPAQS FVLERPIQTV GRRKEAVVRV RLVPGTGKFD LNGRSLEDYF PNKVHQQLIK APLVTVDRVE SFDIFAHLG GGGPSGQAGA LRLGIARALI LVSPEDRPAL KKAGFLTRDP RATERKKYGL KKARKAPQYS KR

UniProtKB: Small ribosomal subunit protein uS9

+
分子 #40: Small ribosomal subunit protein uS10

分子名称: Small ribosomal subunit protein uS10 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 40 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Mycobacterium tuberculosis variant bovis BCG str. Pasteur 1173P2 (結核菌)
株: Mycobacterium tuberculosis variant bovis BCG str. Pasteur 1173P2
分子量理論値: 11.45234 KDa
配列文字列:
MAGQKIRIRL KAYDHEAIDA SARKIVETVV RTGASVVGPV PLPTEKNVYC VIRSPHKYKD SREHFEMRTH KRLIDIIDPT PKTVDALMR IDLPASVDVN IQ

UniProtKB: Small ribosomal subunit protein uS10

+
分子 #41: Small ribosomal subunit protein uS11

分子名称: Small ribosomal subunit protein uS11 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 41 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Mycobacterium tuberculosis variant bovis BCG str. Pasteur 1173P2 (結核菌)
株: Mycobacterium tuberculosis variant bovis BCG str. Pasteur 1173P2
分子量理論値: 14.80084 KDa
配列文字列:
MPPAKKGPAT SARKGQKTRR REKKNVPHGA AHIKSTFNNT IVTITDPQGN VIAWASSGHV GFKGSRKSTP FAAQLAAENA ARKAQDHGV RKVDVFVKGP GSGRETAIRS LQAAGLEVGA ISDVTPQPHN GVRPPNRRRV

UniProtKB: Small ribosomal subunit protein uS11

+
分子 #42: Small ribosomal subunit protein uS12

分子名称: Small ribosomal subunit protein uS12 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 42 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Mycobacterium tuberculosis variant bovis BCG str. Pasteur 1173P2 (結核菌)
株: Mycobacterium tuberculosis variant bovis BCG str. Pasteur 1173P2
分子量理論値: 13.882341 KDa
配列文字列:
MPTIQQLVRK GRRDKISKVK TAALKGSPQR RGVCTRVYTT TPKKPNSALR KVARVKLTSQ VEVTAYIPGE GHNLQEHSMV LVRGGRVKD LPGVRYKIIR GSLDTQGVKN RKQARSRYGA KKEKG

UniProtKB: Small ribosomal subunit protein uS12

+
分子 #43: Small ribosomal subunit protein uS13

分子名称: Small ribosomal subunit protein uS13 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 43 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Mycobacterium tuberculosis variant bovis BCG str. Pasteur 1173P2 (結核菌)
株: Mycobacterium tuberculosis variant bovis BCG str. Pasteur 1173P2
分子量理論値: 14.383779 KDa
配列文字列:
MARLVGVDLP RDKRMEVALT YIFGIGRTRS NEILAATGID RDLRTRDLTE EQLIHLRDYI EANLKVEGDL RREVQADIRR KIEIGCYQG LRHRRGMPVR GQRTKTNART RKGPKRTIAG KKKAR

UniProtKB: Small ribosomal subunit protein uS13

+
分子 #44: Small ribosomal subunit protein uS14B

分子名称: Small ribosomal subunit protein uS14B / タイプ: protein_or_peptide / ID: 44 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Mycobacterium tuberculosis variant bovis BCG str. Pasteur 1173P2 (結核菌)
株: Mycobacterium tuberculosis variant bovis BCG str. Pasteur 1173P2
分子量理論値: 6.841249 KDa
配列文字列:
MAKKALVNKA AGKPRFAVRA YTRCSKCGRP RAVYRKFGLC RICLREMAHA GELPGVQKSS W

UniProtKB: Small ribosomal subunit protein uS14B

+
分子 #45: Small ribosomal subunit protein uS15

分子名称: Small ribosomal subunit protein uS15 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 45 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Mycobacterium tuberculosis variant bovis BCG str. Pasteur 1173P2 (結核菌)
株: Mycobacterium tuberculosis variant bovis BCG str. Pasteur 1173P2
分子量理論値: 10.500277 KDa
配列文字列:
MALTAEQKKE ILRSYGLHET DTGSPEAQIA LLTKRIADLT EHLKVHKHDH HSRRGLLLLV GRRRRLIKYI SQIDVERYRS LIERLGLRR

UniProtKB: Small ribosomal subunit protein uS15

+
分子 #46: Small ribosomal subunit protein bS16

分子名称: Small ribosomal subunit protein bS16 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 46 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Mycobacterium tuberculosis variant bovis BCG str. Pasteur 1173P2 (結核菌)
株: Mycobacterium tuberculosis variant bovis BCG str. Pasteur 1173P2
分子量理論値: 17.4661 KDa
配列文字列:
MAVKIKLTRL GKIRNPQYRV AVADARTRRD GRAIEVIGRY HPKEEPSLIE INSERAQYWL SVGAQPTEPV LKLLKITGDW QKFKGLPGA QGRLKVAAPK PSKLEVFNAA LAAADGGPTT EATKPKKKSP AKKAAKAAEP APQPEQPDTP ALGGEQAELT A ES

UniProtKB: Small ribosomal subunit protein bS16

+
分子 #47: Small ribosomal subunit protein uS17

分子名称: Small ribosomal subunit protein uS17 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 47 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Mycobacterium tuberculosis variant bovis BCG str. Pasteur 1173P2 (結核菌)
株: Mycobacterium tuberculosis variant bovis BCG str. Pasteur 1173P2
分子量理論値: 14.776373 KDa
配列文字列:
MAEAKTGAKA APRVAKAAKA APKKAAPNDA EAIGAANAAN VKGPKHTPRT PKPRGRRKTR IGYVVSDKMQ KTIVVELEDR MRHPLYGKI IRTTKKVKAH DEDSVAGIGD RVSLMETRPL SATKRWRLVE ILEKAK

UniProtKB: Small ribosomal subunit protein uS17

+
分子 #48: Small ribosomal subunit protein bS18A

分子名称: Small ribosomal subunit protein bS18A / タイプ: protein_or_peptide / ID: 48 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Mycobacterium tuberculosis variant bovis BCG str. Pasteur 1173P2 (結核菌)
株: Mycobacterium tuberculosis variant bovis BCG str. Pasteur 1173P2
分子量理論値: 9.565279 KDa
配列文字列:
MAKSSKRRPA PEKPVKTRKC VFCAKKDQAI DYKDTALLRT YISERGKIRA RRVTGNCVQH QRDIALAVKN AREVALLPFT SSVR

UniProtKB: Small ribosomal subunit protein bS18A

+
分子 #49: Small ribosomal subunit protein uS19

分子名称: Small ribosomal subunit protein uS19 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 49 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Mycobacterium tuberculosis variant bovis BCG str. Pasteur 1173P2 (結核菌)
株: Mycobacterium tuberculosis variant bovis BCG str. Pasteur 1173P2
分子量理論値: 10.830629 KDa
配列文字列:
MPRSLKKGPF VDEHLLKKVD VQNEKNTKQV IKTWSRRSTI IPDFIGHTFA VHDGRKHVPV FVTESMVGHK LGEFAPTRTF KGHIKDDRK SKRR

UniProtKB: Small ribosomal subunit protein uS19

+
分子 #50: Small ribosomal subunit protein bS20

分子名称: Small ribosomal subunit protein bS20 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 50 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Mycobacterium tuberculosis variant bovis BCG str. Pasteur 1173P2 (結核菌)
株: Mycobacterium tuberculosis variant bovis BCG str. Pasteur 1173P2
分子量理論値: 9.428941 KDa
配列文字列:
MANIKSQQKR NRTNERARLR NKAVKSSLRT AVRAFREAAH AGDKAKAAEL LASTNRKLDK AASKGVIHKN QAANKKSALA QALNKL

UniProtKB: Small ribosomal subunit protein bS20

+
分子 #51: Mitochondrial domain of uncharacterised function (DUF1713)

分子名称: Mitochondrial domain of uncharacterised function (DUF1713)
タイプ: protein_or_peptide / ID: 51 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Mycobacterium tuberculosis variant bovis BCG str. Pasteur 1173P2 (結核菌)
分子量理論値: 8.310584 KDa
配列文字列:
MGSVIKKRRK RMSKKKHRKL LRRTRVQRRK LGKMGSVIKK RRKRMSKKKH RKLLRRTRVQ RRKLGK

+
分子 #7: 23S rRNA

分子名称: 23S rRNA / タイプ: rna / ID: 7 / コピー数: 1
由来(天然)生物種: Mycobacterium tuberculosis variant bovis BCG str. Pasteur 1173P2 (結核菌)
株: Mycobacterium tuberculosis variant bovis BCG str. Pasteur 1173P2
分子量理論値: 1.017834562 MDa
配列文字列: UUGUAAGUGU CUAAGGGCGC AUGGUGGAUG CCUUGGCAUC GAGAGCCGAU GAAGGACGUG GGAGGCUGCG AUAUGCCUCG GGGAGCUGU CAACCGAGCG UGGAUCCGAG GAUUUCCGAA UGGGGAAACC CAGCACGAGU GAUGUCGUGC UACCCGCAUC U GAAUAUAU ...文字列:
UUGUAAGUGU CUAAGGGCGC AUGGUGGAUG CCUUGGCAUC GAGAGCCGAU GAAGGACGUG GGAGGCUGCG AUAUGCCUCG GGGAGCUGU CAACCGAGCG UGGAUCCGAG GAUUUCCGAA UGGGGAAACC CAGCACGAGU GAUGUCGUGC UACCCGCAUC U GAAUAUAU AGGGUGCGGG AGGGAACGCG GGGAAGUGAA ACAUCUCAGU ACCCGUAGGA GGAGAAAACA AUUGUGAUUC CG CAAGUAG UGGCGAGCGA ACGCGGAACA GGCUAAACCG CACGCAUGGG UAACCGGGUA GGGGUUGUGU GUGCGGGGUU GUG GGAGGA UAUGUCUCAG CGCUACCCGG CUGAGAGGCA GUCAGAAAGU GUCGUGGUUA GCGGAAGUGG CCUGGGAUGG UCUG CCGUA GACGGUGAGA GCCCGGUACG CGAAAACCCG GCACCUGCCU AGUAUCAAUU CCCGAGUAGC AGCGGGCCCG UGGAA UCCG CUGUGAAUCC GCCGGGACCA CCCGGUAAGC CUAAAUACUC CUCGAUGACC GAUAGCGGAU UAGUACCGUG AGGGAA UGG UGAAAAGUAC CCCGGGAGGG GAGUGAAAGA GUACCUGAAA CCGUGUGCCU ACAAUCCGUC AGAGCCUCCU UUUCCUC UC CGGAGGAGGG UGGUGAUGGC GUGCCUUUUG AAGAAUGAGC CUGCGAGUCA GGGACAUGUC GCAAGGUUAA CCCGUGUG G GGUAGCCGCA GCGAAAGCGA GUCUGAAUAG GGCGACCCAC ACGCGCAUAC GCGCGUGUGA AUAGUGGCGU GUUCUGGAC CCGAAGCGGA GUGAUCUACC CAUGGCCAGG GUGAAGCGCG GGUAAGACCG CGUGGAGGCC CGAACCCACU UAGGUUGAAG ACUGAGGGG AUGAGCUGUG GGUAGGGGUG AAAGGCCAAU CAAACUCCGU GAUAGCUGGU UCUCCCCGAA AUGCAUUUAG G UGCAGCGU UGCGUGGUUC ACCGCGGAGG UAGAGCUACU GGAUGGCCGA UGGGCCCUAC UAGGUUACUG ACGUCAGCCA AA CUCCGAA UGCCGUGGUG UAAAGCGUGG CAGUGAGACG GCGGGGGAUA AGCUCCGUAC GUCGAAAGGG AAACAGCCCA GAU CGCCGG CUAAGGCCCC CAAGCGUGUG CUAAGUGGGA AAGGAUGUGC AGUCGCAAAG ACAACCAGGA GGUUGGCUUA GAAG CAGCC ACCCUUGAAA GAGUGCGUAA UAGCUCACUG GUCAAGUGAU UGUGCGCCGA UAAUGUAGCG GGGCUCAAGC ACACC GCCG AAGCCGCGGC ACAUCCACCU UGUGGUGGGU GUGGGUAGGG GAGCGUCCCU CAUUCAGCGA AGCCACCGGG UGACCG GUG GUGGAGGGUG GGGGAGUGAG AAUGCAGGCA UGAGUAGCGA CAAGGCAAGU GAGAACCUUG CCCGCCGAAA GACCAAG GG UUCCUGGGCC AGGCCAGUCC GCCCAGGGUG AGUCGGGACC UAAGGCGAGG CCGACAGGCG UAGUCGAUGG ACAACGGG U UGAUAUUCCC GUACCCGUGU GUGGGCGCCC GUGACGAAUC AGCGGUACUA ACCACCCAAA ACCGGAUCGA UCACUCCCC UUCGGGGGUG UGGAGUUCUG GGGCUGCGUG GGAACUUCGC UGGUAGUAGU CAAGCGAAGG GGUGACGCAG GAAGGUAGCC GUACCAGUC AGUGGUAACA CUGGGGCAAG CCGGUAGGGA GAGCGAUAGG CAAAUCCGUC GCUCACUAAU CCUGAGAGGU G ACGCAUAG CCGGUUGAGG CGAAUUCGGU GAUCCUCUGC UGCCAAGAAA AGCCUCUAGC GAGCACACAC ACGGCCCGUA CC CCAAACC GACACAGGUG GUCAGGUAGA GCAUACCAAG GCGUACGAGA UAACUAUGGU UAAGGAACUC GGCAAAAUGC CCC CGUAAC UUCGGGAGAA GGGGGACCGG AAUAUCGUGA ACACCCUUGC GGUGGGAGCG GGAUCCGGUC GCAGAAACCA GUGA GGAGC GACUGUUUAC UAAAAACACA GGUCCGUGCG AAGUCGCAAG ACGAUGUAUA CGGACUGACG CCUGCCCGGU GCUGG AAGG UUAAGAGGAC CCGUUAACCC GCAAGGGUGA AGCGGAGAAU UUAAGCCCCA GUAAACGGCG GUGGUAACUA UAACCA UCC UAAGGUAGCG AAA(5MU)UCCUUG UCGGGUAAGU UCCGACCUGC ACGAAUGGCG UAACGACUUC UCAACUGUCU CAA CCAUAG ACUCGGCGAA AUUGCACUAC GAGUAAAGAU GCUCGUUACG CGCGGCAGGA CGAAAAGACC CCGGGACCUU CACU ACAAC UUGGUAUUGA UGUUCGGUAC GGUUUGUGUA GGAUAGGUGG GAGACUGUGA AACCUCGACG CCAGUUGGGG CGGAG UCGU UGUUGAAAUA CCACUCUGAU CGUAUUGGGC AUCUAACCUC GAACCCUGAA UCGGGUUUAG GGACAGUGCC UGGCGG GUA GUUUAACUG(OMG) GGCGGUUGCC UCCUAAAAUG UAACGGAGGC GCCCAAAGGU UCCCUCAACC UGGACGGCAA UCA GGUGGC GAGUGUAAAU GCACAAGGGA GCUUGACUGC GAGACUUACA AGUCAAGCAG GGACGAAAGU CGGGAUUAGU GAUC CGGCA CCCCCGAGUG GAAGGGGUGU CGCUCAACGG AUAAAAGGUA CCCCGGGGAU AACAGGCUGA UCUUCCCCAA GAGUC CAUA UCGACGGGAU GGUUUGGCAC CUCGAUGUCG GCUCGUCGCA UCCUGGGGCU GGAGCAGGUC CCAAGGGUUG GGCU (OMG)UUCG CCCAUUAAAG CGGCACGCGA GCUGGGUUUA GAACGUCGUG AGACAGUUCG GUCUCUAUCC GCCGCGCGCG U CAGAAACU UGAGGAAACC UGUCCCUAGU ACGAGAGGAC CGGGACGGAC GAACCUCUGG UGCACCAGUU GUCCCGCCAG GG GCACCGC UGGAUAGCCA CGUUCGGUCA GGAUAACCGC UGAAAGCAUC UAAGCGGGAA ACCUUCUCCA AGAUCAGGUU UCU CACCCA CUUGGUGGGA UAAGGCCCCC CGCAGAACAC GGGUUCAAUA GGUCAGACCU GGAAGCUCAG UAAUGGGUGU AGGG AACUG GUGCUAACCG GCCGAAAACU UACAACA

GENBANK: GENBANK: CP033310.1

+
分子 #8: 5S rRNA

分子名称: 5S rRNA / タイプ: rna / ID: 8 / コピー数: 1
由来(天然)生物種: Mycobacterium tuberculosis variant bovis BCG str. Pasteur 1173P2 (結核菌)
株: Mycobacterium tuberculosis variant bovis BCG str. Pasteur 1173P2
分子量理論値: 37.097238 KDa
配列文字列:
UUACGGCGGC CACAGCGGCA GGGAAACGCC CGGUCCCAUU CCGAACCCGG AAGCUAAGCC UGCCAGCGCC GAUGAUACUG CCCCUCCGG GUGGAAAAGU AGGACACCGC CGAACA

GENBANK: GENBANK: CP033310.1

+
分子 #32: 16S rRNA

分子名称: 16S rRNA / タイプ: rna / ID: 32 / コピー数: 1
由来(天然)生物種: Mycobacterium tuberculosis variant bovis BCG str. Pasteur 1173P2 (結核菌)
株: Mycobacterium tuberculosis variant bovis BCG str. Pasteur 1173P2
分子量理論値: 498.40175 KDa
配列文字列: UUUUGUUUGG AGAGUUUGAU CCUGGCUCAG GACGAACGCU GGCGGCGUGC UUAACACAUG CAAGUCGAAC GGAAAGGUCU CUUCGGAGA UACUCGAGUG GCGAACGGGU GAGUAACACG UGGGUGAUCU GCCCUGCACU UCGGGAUAAG CCUGGGAAAC U GGGUCUAA ...文字列:
UUUUGUUUGG AGAGUUUGAU CCUGGCUCAG GACGAACGCU GGCGGCGUGC UUAACACAUG CAAGUCGAAC GGAAAGGUCU CUUCGGAGA UACUCGAGUG GCGAACGGGU GAGUAACACG UGGGUGAUCU GCCCUGCACU UCGGGAUAAG CCUGGGAAAC U GGGUCUAA UACCGGAUAG GACCACGGGA UGCAUGUCUU GUGGUGGAAA GCGCUUUAGC GGUGUGGGAU GAGCCCGCGG CC UAUCAGC UUGUUGGUGG GGUGACGGCC UACCAAGGCG ACGACGGGUA GCCGGCCUGA GAGGGUGUCC GGCCACACUG GGA CUGAGA UACGGCCCAG ACUCCUACGG GAGGCAGCAG UGGGGAAUAU UGCACAAUGG GCGCAAGCCU GAUGCAGCGA CGCC GCGUG GGGGAUGACG GCCUUCGGGU UGUAAACCUC UUUCACCAUC GACGAAGGUC CGGGUUCUCU CGGAUUGACG GUAGG UGGA GAAGAAGCAC CGGCCAACUA CGUGCCAGCA GCC(G7M)CGGUAA UACGUAGGGU GCGAGCGUUG UCCGGAAUUA CU GGGCGUA AAGAGCUCGU AGGUGGUUUG UCGCGUUGUU CGUGAAAUCU CACGGCUUAA CUGUGAGCGU GCGGGCGAUA CGG GCAGAC UAGAGUACUG CAGGGGAGAC UGGAAUUCCU GGUGUAGCGG UGGAAUGCGC AGAUAUCAGG AGGAACACCG GUGG CGAAG GCGGGUCUCU GGGCAGUAAC UGACGCUGAG GAGCGAAAGC GUGGGGAGCG AACAGGAUUA GAUACCCUGG UAGUC CACG CCGUAAACGG UGGGUACUAG GUGUGGGUUU CCUUCCUUGG GAUCCGUGCC GUAGCUAACG CAUUAAGUAC CCCGCC UGG GGAGUACGGC CGCAAGGCUA AAACUCAAAG GAAUUGACGG GGGCCCGCAC AAGCGGCGGA GCAUGUGGAU UAAUUCG AU (2MG)(5MC)AACGCGAA GAACCUUACC UGGGUUUGAC AUGCACAGGA CGCGUCUAGA GAUAGGCGUU CCCUUGUGGC CUGUGUGCA GGUGGUGCAU GGCUGUCGUC AGCUCGUGUC GUGAGAUGUU GGGUUAAGUC CCGCAACGAG CGCAACCCUU G UCUCAUGU UGCCAGCACG UAAUGGUGGG GACUCGUGAG AGACUGCCGG GGUCAACUCG GAGGAAGGUG GGGAUGACGU CA AGUCAUC AUGCCCCUUA UGUCCAGGGC UUCACACAUG CUACAAUGGC CGGUACAAAG GGCUGCGAUG CCGCGAGGUU AAG CGAAUC CUUAAAAGCC GGUCUCAGUU CGGAUCGGGG UCUGCAACUC GACCCCGUGA AGUCGGAGUC GCUAGUAAUC GCAG AUCAG CAACGCUGCG GUGAAUACGU UCCCGGGCCU UGUACACACC G(4OC)CCGUCACG UCAUGAAAGU CGGUAACACC C GAAGCCAG UGGCCUAACC CUCGGGAGGG AGCUGUCGAA GGUGGGAUCG GCGAUUGGGA CGAAGUCG(UR3)A ACAAGGUA G CCGUACCGG(MA6) (MA6)GGUGCGGCU GGAUCACCUC CUUUCU

GENBANK: GENBANK: CP033311.1

+
分子 #52: tRNA

分子名称: tRNA / タイプ: rna / ID: 52 / コピー数: 1
由来(天然)生物種: Mycobacterium tuberculosis variant bovis BCG str. Pasteur 1173P2 (結核菌)
分子量理論値: 894.612 Da
配列文字列:
CCA

+
分子 #53: ZINC ION

分子名称: ZINC ION / タイプ: ligand / ID: 53 / コピー数: 5 / 式: ZN
分子量理論値: 65.409 Da

+
分子 #54: MAGNESIUM ION

分子名称: MAGNESIUM ION / タイプ: ligand / ID: 54 / コピー数: 441 / 式: MG
分子量理論値: 24.305 Da

+
分子 #55: (2~{R},3~{R},4~{R},5~{R},8~{R},10~{R},11~{R},12~{S},13~{S},14~{R}...

分子名称: (2~{R},3~{R},4~{R},5~{R},8~{R},10~{R},11~{R},12~{S},13~{S},14~{R})-11-[(2~{S},3~{R},4~{S},6~{R})-4-(dimethylamino)-6-methyl-3-oxidanyl-oxan-2-yl]oxy-2-ethyl-4-[(2~{R},3~{R},4~{R},5~{S},6~{R})- ...名称: (2~{R},3~{R},4~{R},5~{R},8~{R},10~{R},11~{R},12~{S},13~{S},14~{R})-11-[(2~{S},3~{R},4~{S},6~{R})-4-(dimethylamino)-6-methyl-3-oxidanyl-oxan-2-yl]oxy-2-ethyl-4-[(2~{R},3~{R},4~{R},5~{S},6~{R})-6-(hydroxymethyl)-3,4-bis(oxidanyl)-5-[[4-(4-pyridin-4-yl-1,2,3-triazol-1-yl)phenyl]methoxy]oxan-2-yl]oxy-13-[(2~{R},4~{R},5~{S},6~{S})-4-methoxy-4,6-dimethyl-5-oxidanyl-oxan-2-yl]oxy-3,5,6,8,10,12,14-heptamethyl-3,10-bis(oxidanyl)-1-oxa-6-azacyclopentadecan-15-one
タイプ: ligand / ID: 55 / コピー数: 1 / 式: A1L32
分子量理論値: 1.145381 KDa

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実験情報

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構造解析

手法クライオ電子顕微鏡法
解析単粒子再構成法
試料の集合状態particle

-
試料調製

緩衝液pH: 7.6
糖包埋材質: vitrified ice
グリッドモデル: Quantifoil R1.2/1.3 / 材質: COPPER / メッシュ: 200 / 支持フィルム - 材質: CARBON / 支持フィルム - トポロジー: CONTINUOUS / 前処理 - タイプ: GLOW DISCHARGE / 前処理 - 時間: 10 sec.
凍結凍結剤: ETHANE / チャンバー内湿度: 100 % / チャンバー内温度: 277 K / 装置: FEI VITROBOT MARK IV

-
電子顕微鏡法

顕微鏡JEOL CRYO ARM 300
撮影フィルム・検出器のモデル: GATAN K3 (6k x 4k) / 平均電子線量: 40.0 e/Å2
電子線加速電圧: 300 kV / 電子線源: FIELD EMISSION GUN
電子光学系照射モード: FLOOD BEAM / 撮影モード: BRIGHT FIELD / 最大 デフォーカス（公称値）: 2.2 µm / 最小 デフォーカス（公称値）: 0.5 µm / 倍率（公称値）: 60000
試料ステージ試料ホルダーモデル: JEOL CRYOSPECPORTER / ホルダー冷却材: NITROGEN

+
画像解析

粒子像選択選択した数: 515051
初期モデルモデルのタイプ: NONE
最終 再構成解像度のタイプ: BY AUTHOR / 解像度: 2.33 Å / 解像度の算出法: FSC 0.143 CUT-OFF / ソフトウェア - 名称: RELION (ver. 4.0.1) / 使用した粒子像数: 205461
初期 角度割当タイプ: MAXIMUM LIKELIHOOD / ソフトウェア - 名称: RELION (ver. 4.0.1)
最終 角度割当タイプ: MAXIMUM LIKELIHOOD / ソフトウェア - 名称: RELION (ver. 4.0.1)
最終 3次元分類ソフトウェア - 名称: RELION (ver. 4.0.1)
FSC曲線 (解像度の算出)

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万見について

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お知らせ

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2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

  • EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
  • これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

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2020年8月12日: 新型コロナ情報

新型コロナ情報

URL: https://pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

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2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

新型コロナウイルスの構造データ

関連情報:万見生物種 / 2020年8月12日: 新型コロナ情報

外部リンク:COVID-19特集ページ - PDBj / 今月の分子2020年2月：コロナウイルスプロテーアーゼ

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2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

EMDBのIDの桁数の変更

  • EMDBエントリに付与されているアクセスコード(EMDB-ID)は4桁の数字(例、EMD-1234)でしたが、間もなく枯渇します。これまでの4桁のID番号は4桁のまま変更されませんが、4桁の数字を使い切った後に発行されるIDは5桁以上の数字(例、EMD-12345)になります。5桁のIDは2019年の春頃から発行される見通しです。
  • EM Navigator/万見では、接頭語「EMD-」は省略されています。

関連情報:Q: 「EMD」とは何ですか？ / 万見/EM NavigatorにおけるID/アクセスコードの表記

外部リンク:EMDB Accession Codes are Changing Soon! / PDBjへお問い合わせ

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2017年7月12日: PDB大規模アップデート

PDB大規模アップデート

  • 新バージョンのPDBx/mmCIF辞書形式に基づくデータがリリースされました。
  • 今回の更新はバージョン番号が4から5になる大規模なもので、全エントリデータの書き換えが行われる「Remediation」というアップデートに該当します。
  • このバージョンアップで、電子顕微鏡の実験手法に関する多くの項目の書式が改定されました(例：em_softwareなど)。
  • EM NavigatorとYorodumiでも、この改定に基づいた表示内容になります。

外部リンク:wwPDB Remediation / OneDepデータ基準に準拠した、より強化された内容のモデル構造ファイルが、PDBアーカイブで公開されました。

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万見 (Yorodumi)

幾万の構造データを、幾万の視点から

  • 万見(Yorodumi)は、EMDB/PDB/SASBDBなどの構造データを閲覧するためのページです。
  • EM Navigatorの詳細ページの後継、Omokage検索のフロントエンドも兼ねています。

関連情報:EMDB / PDB / SASBDB / 3つのデータバンクの比較 / 万見検索 / 2016年8月31日: 新しいEM Navigatorと万見 / 万見文献 / Jmol/JSmol / 機能・相同性情報 / 新しいEM Navigatorと万見の変更点

他の情報も見る