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- EMDB-60139: Human 26S immunoproteasome -

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基本情報

登録情報
データベース: EMDB / ID: EMD-60139
タイトルHuman 26S immunoproteasome
マップデータLocally filtered, globally sharpened map using a local resolution estimation computed from the half-maps.
試料
  • 複合体: Human 26S immunoproteasome
    • タンパク質・ペプチド: x 33種
キーワードproteasome / immunoproteasome / HYDROLASE
生物種Homo sapiens (ヒト)
手法単粒子再構成法 / クライオ電子顕微鏡法 / 解像度: 3.6 Å
データ登録者Saratov GA / Baymukhametov TN / Konevega AL / Kudriaeva AA / Belogurov AA
資金援助 ロシア, 1件
OrganizationGrant number国
Russian Science Foundation23-74-00053 ロシア
引用ジャーナル: Russ.J.Bioorganic Chem. / 年: 2024
タイトル: The 3.6 Angstroms cryo-EM structure of the outer heptameric alpha-ring of human 26S immunoproteasome in the preactivation state.
著者: Saratov GA / Baymukhametov TN / Konevega AL / Kudriaeva AA / Belogurov AA
履歴
登録2024年5月14日-
ヘッダ(付随情報) 公開2024年6月19日-
マップ公開2024年6月19日-
更新2024年6月19日-
現状2024年6月19日処理サイト: PDBj / 状態: 公開

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構造の表示

添付画像

emd_60139.png

ダウンロードとリンク

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マップ

ファイルダウンロード / ファイル: emd_60139.map.gz / 形式: CCP4 / 大きさ: 244.1 MB / タイプ: IMAGE STORED AS FLOATING POINT NUMBER (4 BYTES)
注釈Locally filtered, globally sharpened map using a local resolution estimation computed from the half-maps.
ボクセルのサイズX=Y=Z: 1.8 Å
密度
表面レベル登録者による: 0.08
最小 - 最大-0.17556575 - 0.4256472
平均 (標準偏差)0.00067605195 (±0.008018609)
対称性空間群: 1
詳細

EMDB XML:

マップ形状
Axis orderXYZ
Origin000
サイズ400400400
Spacing400400400
セルA=B=C: 720.0 Å
α=β=γ: 90.0 °

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添付データ

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マスク #1

ファイルemd_60139_msk_1.map
投影像・断面図
軸ZYX

投影像

断面 (1/2)
密度ヒストグラム

ヒストグラム

ヒストグラム (対数)

-
追加マップ: The map post-processed by deepEMhancer using a default...

ファイルemd_60139_additional_1.map
注釈The map post-processed by deepEMhancer using a default deep learning model 'tightTarget' (with mask).
投影像・断面図
軸ZYX

投影像

断面 (1/2)
密度ヒストグラム

ヒストグラム

ヒストグラム (対数)

-
追加マップ: The map post-processed by deepEMhancer using a default...

ファイルemd_60139_additional_2.map
注釈The map post-processed by deepEMhancer using a default deep learning model 'tightTarget' (without mask).
投影像・断面図
軸ZYX

投影像

断面 (1/2)
密度ヒストグラム

ヒストグラム

ヒストグラム (対数)

-
追加マップ: Unfiltered and unsharpened map obtained using cryoSPARC's 3D...

ファイルemd_60139_additional_3.map
注釈Unfiltered and unsharpened map obtained using cryoSPARC's 3D flexible refinement.
投影像・断面図
軸ZYX

投影像

断面 (1/2)
密度ヒストグラム

ヒストグラム

ヒストグラム (対数)

-
ハーフマップ: The half-map masked by a relatively wide (15...

ファイルemd_60139_half_map_1.map
注釈The half-map masked by a relatively wide (15 angstrom dilation in a 256 px box) solvent soft mask due to the peculiarities of the cryoSPARC's 3D Flex Reconstruct procedure.
投影像・断面図
軸ZYX

投影像

断面 (1/2)
密度ヒストグラム

ヒストグラム

ヒストグラム (対数)

-
ハーフマップ: The half-map masked by a relatively wide (15...

ファイルemd_60139_half_map_2.map
注釈The half-map masked by a relatively wide (15 angstrom dilation in a 256 px box) solvent soft mask due to the peculiarities of the cryoSPARC's 3D Flex Reconstruct procedure.
投影像・断面図
軸ZYX

投影像

断面 (1/2)
密度ヒストグラム

ヒストグラム

ヒストグラム (対数)

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試料の構成要素

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全体 : Human 26S immunoproteasome

全体名称: Human 26S immunoproteasome
要素
  • 複合体: Human 26S immunoproteasome
    • タンパク質・ペプチド: Proteasome subunit alpha type-1
    • タンパク質・ペプチド: Proteasome subunit alpha type-2
    • タンパク質・ペプチド: Proteasome subunit alpha type-3
    • タンパク質・ペプチド: Proteasome subunit alpha type-4
    • タンパク質・ペプチド: Proteasome subunit alpha type-5
    • タンパク質・ペプチド: Proteasome subunit alpha type-6
    • タンパク質・ペプチド: Proteasome subunit alpha type-7
    • タンパク質・ペプチド: Proteasome subunit beta type-1
    • タンパク質・ペプチド: Proteasome subunit beta type-2
    • タンパク質・ペプチド: Proteasome subunit beta type-3
    • タンパク質・ペプチド: Proteasome subunit beta type-4
    • タンパク質・ペプチド: Proteasome subunit beta type-8
    • タンパク質・ペプチド: Proteasome subunit beta type-9
    • タンパク質・ペプチド: Proteasome subunit beta type-10
    • タンパク質・ペプチド: 26S proteasome regulatory subunit 4
    • タンパク質・ペプチド: 26S proteasome regulatory subunit 6A
    • タンパク質・ペプチド: 26S proteasome regulatory subunit 6B
    • タンパク質・ペプチド: 26S proteasome regulatory subunit 7
    • タンパク質・ペプチド: 26S proteasome regulatory subunit 8
    • タンパク質・ペプチド: 26S proteasome regulatory subunit 10B
    • タンパク質・ペプチド: 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 1
    • タンパク質・ペプチド: 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 2
    • タンパク質・ペプチド: 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 3
    • タンパク質・ペプチド: 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 4
    • タンパク質・ペプチド: 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 6
    • タンパク質・ペプチド: 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 7
    • タンパク質・ペプチド: 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 8
    • タンパク質・ペプチド: 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 9
    • タンパク質・ペプチド: 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 11
    • タンパク質・ペプチド: 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 12
    • タンパク質・ペプチド: 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 13
    • タンパク質・ペプチド: 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 14 (His)x6 TEV protease site
    • タンパク質・ペプチド: Proteasomal ubiquitin receptor ADRM1

+
超分子 #1: Human 26S immunoproteasome

超分子名称: Human 26S immunoproteasome / タイプ: complex / ID: 1 / 親要素: 0 / 含まれる分子: all
由来(天然)生物種: Homo sapiens (ヒト) / 株: HeLa / 器官: Cervix
分子量理論値: 2.5 MDa

+
分子 #1: Proteasome subunit alpha type-1

分子名称: Proteasome subunit alpha type-1 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Homo sapiens (ヒト)
配列文字列: MFRNQYDNDV TVWSPQGRIH QIEYAMEAVK QGSATVGLKS KTHAVLVALK RAQSELAAHQ KKILHVDNHI GISIAGLTAD ARLLCNFMRQ ECLDSRFVFD RPLPVSRLVS LIGSKTQIPT QRYGRRPYGV GLLIAGYDDM GPHIFQTCPS ANYFDCRAMS IGARSQSART ...文字列:
MFRNQYDNDV TVWSPQGRIH QIEYAMEAVK QGSATVGLKS KTHAVLVALK RAQSELAAHQ KKILHVDNHI GISIAGLTAD ARLLCNFMRQ ECLDSRFVFD RPLPVSRLVS LIGSKTQIPT QRYGRRPYGV GLLIAGYDDM GPHIFQTCPS ANYFDCRAMS IGARSQSART YLERHMSEFM ECNLNELVKH GLRALRETLP AEQDLTTKNV SIGIVGKDLE FTIYDDDDVS PFLEGLEERP QRKAQPAQPA DEPAEKADEP MEH

+
分子 #2: Proteasome subunit alpha type-2

分子名称: Proteasome subunit alpha type-2 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 2 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Homo sapiens (ヒト)
配列文字列: MAERGYSFSL TTFSPSGKLV QIEYALAAVA GGAPSVGIKA ANGVVLATEK KQKSILYDER SVHKVEPITK HIGLVYSGMG PDYRVLVHRA RKLAQQYYLV YQEPIPTAQL VQRVASVMQE YTQSGGVRPF GVSLLICGWN EGRPYLFQSD PSGAYFAWKA TAMGKNYVNG ...文字列:
MAERGYSFSL TTFSPSGKLV QIEYALAAVA GGAPSVGIKA ANGVVLATEK KQKSILYDER SVHKVEPITK HIGLVYSGMG PDYRVLVHRA RKLAQQYYLV YQEPIPTAQL VQRVASVMQE YTQSGGVRPF GVSLLICGWN EGRPYLFQSD PSGAYFAWKA TAMGKNYVNG KTFLEKRYNE DLELEDAIHT AILTLKESFE GQMTEDNIEV GICNEAGFRR LTPTEVKDYL AAIA

+
分子 #3: Proteasome subunit alpha type-3

分子名称: Proteasome subunit alpha type-3 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 3 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Homo sapiens (ヒト)
配列文字列: MSSIGTGYDL SASTFSPDGR VFQVEYAMKA VENSSTAIGI RCKDGVVFGV EKLVLSKLYE EGSNKRLFNV DRHVGMAVAG LLADARSLAD IAREEASNFR SNFGYNIPLK HLADRVAMYV HAYTLYSAVR PFGCSFMLGS YSVNDGAQLY MIDPSGVSYG YWGCAIGKAR ...文字列:
MSSIGTGYDL SASTFSPDGR VFQVEYAMKA VENSSTAIGI RCKDGVVFGV EKLVLSKLYE EGSNKRLFNV DRHVGMAVAG LLADARSLAD IAREEASNFR SNFGYNIPLK HLADRVAMYV HAYTLYSAVR PFGCSFMLGS YSVNDGAQLY MIDPSGVSYG YWGCAIGKAR QAAKTEIEKL QMKEMTCRDI VKEVAKIIYI VHDEVKDKAF ELELSWVGEL TNGRHEIVPK DIREEAEKYA KESLKEEDES DDDNM

+
分子 #4: Proteasome subunit alpha type-4

分子名称: Proteasome subunit alpha type-4 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 4 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Homo sapiens (ヒト)
配列文字列: MSRRYDSRTT IFSPEGRLYQ VEYAMEAIGH AGTCLGILAN DGVLLAAERR NIHKLLDEVF FSEKIYKLNE DMACSVAGIT SDANVLTNEL RLIAQRYLLQ YQEPIPCEQL VTALCDIKQA YTQFGGKRPF GVSLLYIGWD KHYGFQLYQS DPSGNYGGWK ATCIGNNSAA ...文字列:
MSRRYDSRTT IFSPEGRLYQ VEYAMEAIGH AGTCLGILAN DGVLLAAERR NIHKLLDEVF FSEKIYKLNE DMACSVAGIT SDANVLTNEL RLIAQRYLLQ YQEPIPCEQL VTALCDIKQA YTQFGGKRPF GVSLLYIGWD KHYGFQLYQS DPSGNYGGWK ATCIGNNSAA AVSMLKQDYK EGEMTLKSAL ALAIKVLNKT MDVSKLSAEK VEIATLTREN GKTVIRVLKQ KEVEQLIKKH EEEEAKAERE KKEKEQKEKD K

+
分子 #5: Proteasome subunit alpha type-5

分子名称: Proteasome subunit alpha type-5 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 5 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Homo sapiens (ヒト)
配列文字列: MFLTRSEYDR GVNTFSPEGR LFQVEYAIEA IKLGSTAIGI QTSEGVCLAV EKRITSPLME PSSIEKIVEI DAHIGCAMSG LIADAKTLID KARVETQNHW FTYNETMTVE SVTQAVSNLA LQFGEEDADP GAMSRPFGVA LLFGGVDEKG PQLFHMDPSG TFVQCDARAI ...文字列:
MFLTRSEYDR GVNTFSPEGR LFQVEYAIEA IKLGSTAIGI QTSEGVCLAV EKRITSPLME PSSIEKIVEI DAHIGCAMSG LIADAKTLID KARVETQNHW FTYNETMTVE SVTQAVSNLA LQFGEEDADP GAMSRPFGVA LLFGGVDEKG PQLFHMDPSG TFVQCDARAI GSASEGAQSS LQEVYHKSMT LKEAIKSSLI ILKQVMEEKL NATNIELATV QPGQNFHMFT KEELEEVIKD I

+
分子 #6: Proteasome subunit alpha type-6

分子名称: Proteasome subunit alpha type-6 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 6 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Homo sapiens (ヒト)
配列文字列: MSRGSSAGFD RHITIFSPEG RLYQVEYAFK AINQGGLTSV AVRGKDCAVI VTQKKVPDKL LDSSTVTHLF KITENIGCVM TGMTADSRSQ VQRARYEAAN WKYKYGYEIP VDMLCKRIAD ISQVYTQNAE MRPLGCCMIL IGIDEEQGPQ VYKCDPAGYY CGFKATAAGV ...文字列:
MSRGSSAGFD RHITIFSPEG RLYQVEYAFK AINQGGLTSV AVRGKDCAVI VTQKKVPDKL LDSSTVTHLF KITENIGCVM TGMTADSRSQ VQRARYEAAN WKYKYGYEIP VDMLCKRIAD ISQVYTQNAE MRPLGCCMIL IGIDEEQGPQ VYKCDPAGYY CGFKATAAGV KQTESTSFLE KKVKKKFDWT FEQTVETAIT CLSTVLSIDF KPSEIEVGVV TVENPKFRIL TEAEIDAHLV ALAERD

+
分子 #7: Proteasome subunit alpha type-7

分子名称: Proteasome subunit alpha type-7 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 7 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Homo sapiens (ヒト)
配列文字列: MSYDRAITVF SPDGHLFQVE YAQEAVKKGS TAVGVRGRDI VVLGVEKKSV AKLQDERTVR KICALDDNVC MAFAGLTADA RIVINRARVE CQSHRLTVED PVTVEYITRY IASLKQRYTQ SNGRRPFGIS ALIVGFDFDG TPRLYQTDPS GTYHAWKANA IGRGAKSVRE ...文字列:
MSYDRAITVF SPDGHLFQVE YAQEAVKKGS TAVGVRGRDI VVLGVEKKSV AKLQDERTVR KICALDDNVC MAFAGLTADA RIVINRARVE CQSHRLTVED PVTVEYITRY IASLKQRYTQ SNGRRPFGIS ALIVGFDFDG TPRLYQTDPS GTYHAWKANA IGRGAKSVRE FLEKNYTDEA IETDDLTIKL VIKALLEVVQ SGGKNIELAV MRRDQSLKIL NPEEIEKYVA EIEKEKEENE KKKQKKAS

+
分子 #8: Proteasome subunit beta type-1

分子名称: Proteasome subunit beta type-1 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 8 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Homo sapiens (ヒト)
配列文字列: MLSSTAMYSA PGRDLGMEPH RAAGPLQLRF SPYVFNGGTI LAIAGEDFAI VASDTRLSEG FSIHTRDSPK CYKLTDKTVI GCSGFHGDCL TLTKIIEARL KMYKHSNNKA MTTGAIAAML STILYSRRFF PYYVYNIIGG LDEEGKGAVY SFDPVGSYQR DSFKAGGSAS ...文字列:
MLSSTAMYSA PGRDLGMEPH RAAGPLQLRF SPYVFNGGTI LAIAGEDFAI VASDTRLSEG FSIHTRDSPK CYKLTDKTVI GCSGFHGDCL TLTKIIEARL KMYKHSNNKA MTTGAIAAML STILYSRRFF PYYVYNIIGG LDEEGKGAVY SFDPVGSYQR DSFKAGGSAS AMLQPLLDNQ VGFKNMQNVE HVPLSLDRAM RLVKDVFISA AERDVYTGDA LRICIVTKEG IREETVSLRK D

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分子 #9: Proteasome subunit beta type-2

分子名称: Proteasome subunit beta type-2 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 9 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Homo sapiens (ヒト)
配列文字列: MEYLIGIQGP DYVLVASDRV AASNIVQMKD DHDKMFKMSE KILLLCVGEA GDTVQFAEYI QKNVQLYKMR NGYELSPTAA ANFTRRNLAD CLRSRTPYHV NLLLAGYDEH EGPALYYMDY LAALAKAPFA AHGYGAFLTL SILDRYYTPT ISRERAVELL RKCLEELQKR ...文字列:
MEYLIGIQGP DYVLVASDRV AASNIVQMKD DHDKMFKMSE KILLLCVGEA GDTVQFAEYI QKNVQLYKMR NGYELSPTAA ANFTRRNLAD CLRSRTPYHV NLLLAGYDEH EGPALYYMDY LAALAKAPFA AHGYGAFLTL SILDRYYTPT ISRERAVELL RKCLEELQKR FILNLPTFSV RIIDKNGIHD LDNISFPKQG S

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分子 #10: Proteasome subunit beta type-3

分子名称: Proteasome subunit beta type-3 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 10 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Homo sapiens (ヒト)
配列文字列: MSIMSYNGGA VMAMKGKNCV AIAADRRFGI QAQMVTTDFQ KIFPMGDRLY IGLAGLATDV QTVAQRLKFR LNLYELKEGR QIKPYTLMSM VANLLYEKRF GPYYTEPVIA GLDPKTFKPF ICSLDLIGCP MVTDDFVVSG TCAEQMYGMC ESLWEPNMDP DHLFETISQA ...文字列:
MSIMSYNGGA VMAMKGKNCV AIAADRRFGI QAQMVTTDFQ KIFPMGDRLY IGLAGLATDV QTVAQRLKFR LNLYELKEGR QIKPYTLMSM VANLLYEKRF GPYYTEPVIA GLDPKTFKPF ICSLDLIGCP MVTDDFVVSG TCAEQMYGMC ESLWEPNMDP DHLFETISQA MLNAVDRDAV SGMGVIVHII EKDKITTRTL KARMD

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分子 #11: Proteasome subunit beta type-4

分子名称: Proteasome subunit beta type-4 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 11 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Homo sapiens (ヒト)
配列文字列: MEAFLGSRSG LWAGGPAPGQ FYRIPSTPDS FMDPASALYR GPITRTQNPM VTGTSVLGVK FEGGVVIAAD MLGSYGSLAR FRNISRIMRV NNSTMLGASG DYADFQYLKQ VLGQMVIDEE LLGDGHSYSP RAIHSWLTRA MYSRRSKMNP LWNTMVIGGY ADGESFLGYV ...文字列:
MEAFLGSRSG LWAGGPAPGQ FYRIPSTPDS FMDPASALYR GPITRTQNPM VTGTSVLGVK FEGGVVIAAD MLGSYGSLAR FRNISRIMRV NNSTMLGASG DYADFQYLKQ VLGQMVIDEE LLGDGHSYSP RAIHSWLTRA MYSRRSKMNP LWNTMVIGGY ADGESFLGYV DMLGVAYEAP SLATGYGAYL AQPLLREVLE KQPVLSQTEA RDLVERCMRV LYYRDARSYN RFQIATVTEK GVEIEGPLST ETNWDIAHMI SGFE

+
分子 #12: Proteasome subunit beta type-8

分子名称: Proteasome subunit beta type-8 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 12 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Homo sapiens (ヒト)
配列文字列: MALLDVCGAP RGQRPESALP VAGSGRRSDP GHYSFSMRSP ELALPRGMQP TEFFQSLGGD GERNVQIEMA HGTTTLAFKF QHGVIAAVDS RASAGSYISA LRVNKVIEIN PYLLGTMSGC AADCQYWERL LAKECRLYYL RNGERISVSA ASKLLSNMMC QYRGMGLSMG ...文字列:
MALLDVCGAP RGQRPESALP VAGSGRRSDP GHYSFSMRSP ELALPRGMQP TEFFQSLGGD GERNVQIEMA HGTTTLAFKF QHGVIAAVDS RASAGSYISA LRVNKVIEIN PYLLGTMSGC AADCQYWERL LAKECRLYYL RNGERISVSA ASKLLSNMMC QYRGMGLSMG SMICGWDKKG PGLYYVDEHG TRLSGNMFST GSGNTYAYGV MDSGYRPNLS PEEAYDLGRR AIAYATHRDS YSGGVVNMYH MKEDGWVKVE STDVSDLLHQ YREANQ

+
分子 #13: Proteasome subunit beta type-9

分子名称: Proteasome subunit beta type-9 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 13 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Homo sapiens (ヒト)
配列文字列: MLRAGAPTGD LPRAGEVHTG TTIMAVEFDG GVVMGSDSRV SAGEAVVNRV FDKLSPLHER IYCALSGSAA DAQAVADMAA YQLELHGIEL EEPPLVLAAA NVVRNISYKY REDLSAHLMV AGWDQREGGQ VYGTLGGMLT RQPFAIGGSG STFIYGYVDA AYKPGMSPEE ...文字列:
MLRAGAPTGD LPRAGEVHTG TTIMAVEFDG GVVMGSDSRV SAGEAVVNRV FDKLSPLHER IYCALSGSAA DAQAVADMAA YQLELHGIEL EEPPLVLAAA NVVRNISYKY REDLSAHLMV AGWDQREGGQ VYGTLGGMLT RQPFAIGGSG STFIYGYVDA AYKPGMSPEE CRRFTTDAIA LAMSRDGSSG GVIYLVTITA AGVDHRVILG NELPKFYDE

+
分子 #14: Proteasome subunit beta type-10

分子名称: Proteasome subunit beta type-10 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 14 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Homo sapiens (ヒト)
配列文字列: MLKPALEPRG GFSFENCQRN ASLERVLPGL KVPHARKTGT TIAGLVFQDG VILGADTRAT NDSVVADKSC EKIHFIAPKI YCCGAGVAAD AEMTTRMVAS KMELHALSTG REPRVATVTR ILRQTLFRYQ GHVGASLIVG GVDLTGPQLY GVHPHGSYSR LPFTALGSGQ ...文字列:
MLKPALEPRG GFSFENCQRN ASLERVLPGL KVPHARKTGT TIAGLVFQDG VILGADTRAT NDSVVADKSC EKIHFIAPKI YCCGAGVAAD AEMTTRMVAS KMELHALSTG REPRVATVTR ILRQTLFRYQ GHVGASLIVG GVDLTGPQLY GVHPHGSYSR LPFTALGSGQ DAALAVLEDR FQPNMTLEAA QGLLVEAVTA GILGDLGSGG NVDACVITKT GAKLLRTLSS PTEPVKRSGR YHFVPGTTAV LTQTVKPLTL ELVEETVQAM EVE

+
分子 #15: 26S proteasome regulatory subunit 4

分子名称: 26S proteasome regulatory subunit 4 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 15 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Homo sapiens (ヒト)
配列文字列: MGQSQSGGHG PGGGKKDDKD KKKKYEPPVP TRVGKKKKKT KGPDAASKLP LVTPHTQCRL KLLKLERIKD YLLMEEEFIR NQEQMKPLEE KQEEERSKVD DLRGTPMSVG TLEEIIDDNH AIVSTSVGSE HYVSILSFVD KDLLEPGCSV LLNHKVHAVI GVLMDDTDPL ...文字列:
MGQSQSGGHG PGGGKKDDKD KKKKYEPPVP TRVGKKKKKT KGPDAASKLP LVTPHTQCRL KLLKLERIKD YLLMEEEFIR NQEQMKPLEE KQEEERSKVD DLRGTPMSVG TLEEIIDDNH AIVSTSVGSE HYVSILSFVD KDLLEPGCSV LLNHKVHAVI GVLMDDTDPL VTVMKVEKAP QETYADIGGL DNQIQEIKES VELPLTHPEY YEEMGIKPPK GVILYGPPGT GKTLLAKAVA NQTSATFLRV VGSELIQKYL GDGPKLVREL FRVAEEHAPS IVFIDEIDAI GTKRYDSNSG GEREIQRTML ELLNQLDGFD SRGDVKVIMA TNRIETLDPA LIRPGRIDRK IEFPLPDEKT KKRIFQIHTS RMTLADDVTL DDLIMAKDDL SGADIKAICT EAGLMALRER RMKVTNEDFK KSKENVLYKK QEGTPEGLYL

+
分子 #16: 26S proteasome regulatory subunit 6A

分子名称: 26S proteasome regulatory subunit 6A / タイプ: protein_or_peptide / ID: 16 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Homo sapiens (ヒト)
配列文字列: MNLLPNIESP VTRQEKMATV WDEAEQDGIG EEVLKMSTEE IIQRTRLLDS EIKIMKSEVL RVTHELQAMK DKIKENSEKI KVNKTLPYLV SNVIELLDVD PNDQEEDGAN IDLDSQRKGK CAVIKTSTRQ TYFLPVIGLV DAEKLKPGDL VGVNKDSYLI LETLPTEYDS ...文字列:
MNLLPNIESP VTRQEKMATV WDEAEQDGIG EEVLKMSTEE IIQRTRLLDS EIKIMKSEVL RVTHELQAMK DKIKENSEKI KVNKTLPYLV SNVIELLDVD PNDQEEDGAN IDLDSQRKGK CAVIKTSTRQ TYFLPVIGLV DAEKLKPGDL VGVNKDSYLI LETLPTEYDS RVKAMEVDER PTEQYSDIGG LDKQIQELVE AIVLPMNHKE KFENLGIQPP KGVLMYGPPG TGKTLLARAC AAQTKATFLK LAGPQLVQMF IGDGAKLVRD AFALAKEKAP SIIFIDELDA IGTKRFDSEK AGDREVQRTM LELLNQLDGF QPNTQVKVIA ATNRVDILDP ALLRSGRLDR KIEFPMPNEE ARARIMQIHS RKMNVSPDVN YEELARCTDD FNGAQCKAVC VEAGMIALRR GATELTHEDY MEGILEVQAK KKANLQYYA

+
分子 #17: 26S proteasome regulatory subunit 6B

分子名称: 26S proteasome regulatory subunit 6B / タイプ: protein_or_peptide / ID: 17 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Homo sapiens (ヒト)
配列文字列: MEEIGILVEK AQDEIPALSV SRPQTGLSFL GPEPEDLEDL YSRYKKLQQE LEFLEVQEEY IKDEQKNLKK EFLHAQEEVK RIQSIPLVIG QFLEAVDQNT AIVGSTTGSN YYVRILSTID RELLKPNASV ALHKHSNALV DVLPPEADSS IMMLTSDQKP DVMYADIGGM ...文字列:
MEEIGILVEK AQDEIPALSV SRPQTGLSFL GPEPEDLEDL YSRYKKLQQE LEFLEVQEEY IKDEQKNLKK EFLHAQEEVK RIQSIPLVIG QFLEAVDQNT AIVGSTTGSN YYVRILSTID RELLKPNASV ALHKHSNALV DVLPPEADSS IMMLTSDQKP DVMYADIGGM DIQKQEVREA VELPLTHFEL YKQIGIDPPR GVLMYGPPGC GKTMLAKAVA HHTTAAFIRV VGSEFVQKYL GEGPRMVRDV FRLAKENAPA IIFIDEIDAI ATKRFDAQTG ADREVQRILL ELLNQMDGFD QNVNVKVIMA TNRADTLDPA LLRPGRLDRK IEFPLPDRRQ KRLIFSTITS KMNLSEEVDL EDYVARPDKI SGADINSICQ ESGMLAVREN RYIVLAKDFE KAYKTVIKKD EQEHEFYK

+
分子 #18: 26S proteasome regulatory subunit 7

分子名称: 26S proteasome regulatory subunit 7 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 18 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Homo sapiens (ヒト)
配列文字列: MPDYLGADQR KTKEDEKDDK PIRALDEGDI ALLKTYGQST YSRQIKQVED DIQQLLKKIN ELTGIKESDT GLAPPALWDL AADKQTLQSE QPLQVARCTK IINADSEDPK YIINVKQFAK FVVDLSDQVA PTDIEEGMRV GVDRNKYQIH IPLPPKIDPT VTMMQVEEKP ...文字列:
MPDYLGADQR KTKEDEKDDK PIRALDEGDI ALLKTYGQST YSRQIKQVED DIQQLLKKIN ELTGIKESDT GLAPPALWDL AADKQTLQSE QPLQVARCTK IINADSEDPK YIINVKQFAK FVVDLSDQVA PTDIEEGMRV GVDRNKYQIH IPLPPKIDPT VTMMQVEEKP DVTYSDVGGC KEQIEKLREV VETPLLHPER FVNLGIEPPK GVLLFGPPGT GKTLCARAVA NRTDACFIRV IGSELVQKYV GEGARMVREL FEMARTKKAC LIFFDEIDAI GGARFDDGAG GDNEVQRTML ELINQLDGFD PRGNIKVLMA TNRPDTLDPA LMRPGRLDRK IEFSLPDLEG RTHIFKIHAR SMSVERDIRF ELLARLCPNS TGAEIRSVCT EAGMFAIRAR RKIATEKDFL EAVNKVIKSY AKFSATPRYM TYN

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分子 #19: 26S proteasome regulatory subunit 8

分子名称: 26S proteasome regulatory subunit 8 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 19 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Homo sapiens (ヒト)
配列文字列: MALDGPEQME LEEGKAGSGL RQYYLSKIEE LQLIVNDKSQ NLRRLQAQRN ELNAKVRLLR EELQLLQEQG SYVGEVVRAM DKKKVLVKVH PEGKFVVDVD KNIDINDVTP NCRVALRNDS YTLHKILPNK VDPLVSLMMV EKVPDSTYEM IGGLDKQIKE IKEVIELPVK ...文字列:
MALDGPEQME LEEGKAGSGL RQYYLSKIEE LQLIVNDKSQ NLRRLQAQRN ELNAKVRLLR EELQLLQEQG SYVGEVVRAM DKKKVLVKVH PEGKFVVDVD KNIDINDVTP NCRVALRNDS YTLHKILPNK VDPLVSLMMV EKVPDSTYEM IGGLDKQIKE IKEVIELPVK HPELFEALGI AQPKGVLLYG PPGTGKTLLA RAVAHHTDCT FIRVSGSELV QKFIGEGARM VRELFVMARE HAPSIIFMDE IDSIGSSRLE GGSGGDSEVQ RTMLELLNQL DGFEATKNIK VIMATNRIDI LDSALLRPGR IDRKIEFPPP NEEARLDILK IHSRKMNLTR GINLRKIAEL MPGASGAEVK GVCTEAGMYA LRERRVHVTQ EDFEMAVAKV MQKDSEKNMS IKKLWK

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分子 #20: 26S proteasome regulatory subunit 10B

分子名称: 26S proteasome regulatory subunit 10B / タイプ: protein_or_peptide / ID: 20 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Homo sapiens (ヒト)
配列文字列: MADPRDKALQ DYRKKLLEHK EIDGRLKELR EQLKELTKQY EKSENDLKAL QSVGQIVGEV LKQLTEEKFI VKATNGPRYV VGCRRQLDKS KLKPGTRVAL DMTTLTIMRY LPREVDPLVY NMSHEDPGNV SYSEIGGLSE QIRELREVIE LPLTNPELFQ RVGIIPPKGC ...文字列:
MADPRDKALQ DYRKKLLEHK EIDGRLKELR EQLKELTKQY EKSENDLKAL QSVGQIVGEV LKQLTEEKFI VKATNGPRYV VGCRRQLDKS KLKPGTRVAL DMTTLTIMRY LPREVDPLVY NMSHEDPGNV SYSEIGGLSE QIRELREVIE LPLTNPELFQ RVGIIPPKGC LLYGPPGTGK TLLARAVASQ LDCNFLKVVS SSIVDKYIGE SARLIREMFN YARDHQPCII FMDEIDAIGG RRFSEGTSAD REIQRTLMEL LNQMDGFDTL HRVKMIMATN RPDTLDPALL RPGRLDRKIH IDLPNEQARL DILKIHAGPI TKHGEIDYEA IVKLSDGFNG ADLRNVCTEA GMFAIRADHD FVVQEDFMKA VRKVADSKKL ESKLDYKPV

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分子 #21: 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 1

分子名称: 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 1 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 21 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Homo sapiens (ヒト)
配列文字列: MITSAAGIIS LLDEDEPQLK EFALHKLNAV VNDFWAEISE SVDKIEVLYE DEGFRSRQFA ALVASKVFYH LGAFEESLNY ALGAGDLFNV NDNSEYVETI IAKCIDHYTK QCVENADLPE GEKKPIDQRL EGIVNKMFQR CLDDHKYKQA IGIALETRRL DVFEKTILES ...文字列:
MITSAAGIIS LLDEDEPQLK EFALHKLNAV VNDFWAEISE SVDKIEVLYE DEGFRSRQFA ALVASKVFYH LGAFEESLNY ALGAGDLFNV NDNSEYVETI IAKCIDHYTK QCVENADLPE GEKKPIDQRL EGIVNKMFQR CLDDHKYKQA IGIALETRRL DVFEKTILES NDVPGMLAYS LKLCMSLMQN KQFRNKVLRV LVKIYMNLEK PDFINVCQCL IFLDDPQAVS DILEKLVKED NLLMAYQICF DLYESASQQF LSSVIQNLRT VGTPIASVPG STNTGTVPGS EKDSDSMETE EKTSSAFVGK TPEASPEPKD QTLKMIKILS GEMAIELHLQ FLIRNNNTDL MILKNTKDAV RNSVCHTATV IANSFMHCGT TSDQFLRDNL EWLARATNWA KFTATASLGV IHKGHEKEAL QLMATYLPKD TSPGSAYQEG GGLYALGLIH ANHGGDIIDY LLNQLKNASN DIVRHGGSLG LGLAAMGTAR QDVYDLLKTN LYQDDAVTGE AAGLALGLVM LGSKNAQAIE DMVGYAQETQ HEKILRGLAV GIALVMYGRM EEADALIESL CRDKDPILRR SGMYTVAMAY CGSGNNKAIR RLLHVAVSDV NDDVRRAAVE SLGFILFRTP EQCPSVVSLL SESYNPHVRY GAAMALGICC AGTGNKEAIN LLEPMTNDPV NYVRQGALIA SALIMIQQTE ITCPKVNQFR QLYSKVINDK HDDVMAKFGA ILAQGILDAG GHNVTISLQS RTGHTHMPSV VGVLVFTQFW FWFPLSHFLS LAYTPTCVIG LNKDLKMPKV QYKSNCKPST FAYPAPLEVP KEKEKEKVST AVLSITAKAK KKEKEKEKKE EEKMEVDEAE KKEEKEKKKE PEPNFQLLDN PARVMPAQLK VLTMPETCRY QPFKPLSIGG IIILKDTSED IEELVEPVAA HGPKIEEEEQ EPEPPEPFEY IDD

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分子 #22: 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 2

分子名称: 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 2 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 22 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Homo sapiens (ヒト)
配列文字列: MEEGGRDKAP VQPQQSPAAA PGGTDEKPSG KERRDAGDKD KEQELSEEDK QLQDELEMLV ERLGEKDTSL YRPALEELRR QIRSSTTSMT SVPKPLKFLR PHYGKLKEIY ENMAPGENKR FAADIISVLA MTMSGERECL KYRLVGSQEE LASWGHEYVR HLAGEVAKEW ...文字列:
MEEGGRDKAP VQPQQSPAAA PGGTDEKPSG KERRDAGDKD KEQELSEEDK QLQDELEMLV ERLGEKDTSL YRPALEELRR QIRSSTTSMT SVPKPLKFLR PHYGKLKEIY ENMAPGENKR FAADIISVLA MTMSGERECL KYRLVGSQEE LASWGHEYVR HLAGEVAKEW QELDDAEKVQ REPLLTLVKE IVPYNMAHNA EHEACDLLME IEQVDMLEKD IDENAYAKVC LYLTSCVNYV PEPENSALLR CALGVFRKFS RFPEALRLAL MLNDMELVED IFTSCKDVVV QKQMAFMLGR HGVFLELSED VEEYEDLTEI MSNVQLNSNF LALARELDIM EPKVPDDIYK THLENNRFGG SGSQVDSARM NLASSFVNGF VNAAFGQDKL LTDDGNKWLY KNKDHGMLSA AASLGMILLW DVDGGLTQID KYLYSSEDYI KSGALLACGI VNSGVRNECD PALALLSDYV LHNSNTMRLG SIFGLGLAYA GSNREDVLTL LLPVMGDSKS SMEVAGVTAL ACGMIAVGSC NGDVTSTILQ TIMEKSETEL KDTYARWLPL GLGLNHLGKG EAIEAILAAL EVVSEPFRSF ANTLVDVCAY AGSGNVLKVQ QLLHICSEHF DSKEKEEDKD KKEKKDKDKK EAPADMGAHQ GVAVLGIALI AMGEEIGAEM ALRTFGHLLR YGEPTLRRAV PLALALISVS NPRLNILDTL SKFSHDADPE VSYNSIFAMG MVGSGTNNAR LAAMLRQLAQ YHAKDPNNLF MVRLAQGLTH LGKGTLTLCP YHSDRQLMSQ VAVAGLLTVL VSFLDVRNII LGKSHYVLYG LVAAMQPRML VTFDEELRPL PVSVRVGQAV DVVGQAGKPK TITGFQTHTT PVLLAHGERA ELATEEFLPV TPILEGFVIL RKNPNYDL

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分子 #23: 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 3

分子名称: 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 3 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 23 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Homo sapiens (ヒト)
配列文字列: MKQEGSARRR GADKAKPPPG GGEQEPPPPP APQDVEMKEE AATGGGSTGE ADGKTAAAAA EHSQRELDTV TLEDIKEHVK QLEKAVSGKE PRFVLRALRM LPSTSRRLNH YVLYKAVQGF FTSNNATRDF LLPFLEEPMD TEADLQFRPR TGKAASTPLL PEVEAYLQLL ...文字列:
MKQEGSARRR GADKAKPPPG GGEQEPPPPP APQDVEMKEE AATGGGSTGE ADGKTAAAAA EHSQRELDTV TLEDIKEHVK QLEKAVSGKE PRFVLRALRM LPSTSRRLNH YVLYKAVQGF FTSNNATRDF LLPFLEEPMD TEADLQFRPR TGKAASTPLL PEVEAYLQLL VVIFMMNSKR YKEAQKISDD LMQKISTQNR RALDLVAAKC YYYHARVYEF LDKLDVVRSF LHARLRTATL RHDADGQATL LNLLLRNYLH YSLYDQAEKL VSKSVFPEQA NNNEWARYLY YTGRIKAIQL EYSEARRTMT NALRKAPQHT AVGFKQTVHK LLIVVELLLG EIPDRLQFRQ PSLKRSLMPY FLLTQAVRTG NLAKFNQVLD QFGEKFQADG TYTLIIRLRH NVIKTGVRMI SLSYSRISLA DIAQKLQLDS PEDAEFIVAK AIRDGVIEAS INHEKGYVQS KEMIDIYSTR EPQLAFHQRI SFCLDIHNMS VKAMRFPPKS YNKDLESAEE RREREQQDLE FAKEMAEDDD DSFP

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分子 #24: 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 4

分子名称: 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 4 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 24 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Homo sapiens (ヒト)
配列文字列: MVLESTMVCV DNSEYMRNGD FLPTRLQAQQ DAVNIVCHSK TRSNPENNVG LITLANDCEV LTTLTPDTGR ILSKLHTVQP KGKITFCTGI RVAHLALKHR QGKNHKMRII AFVGSPVEDN EKDLVKLAKR LKKEKVNVDI INFGEEEVNT EKLTAFVNTL NGKDGTGSHL ...文字列:
MVLESTMVCV DNSEYMRNGD FLPTRLQAQQ DAVNIVCHSK TRSNPENNVG LITLANDCEV LTTLTPDTGR ILSKLHTVQP KGKITFCTGI RVAHLALKHR QGKNHKMRII AFVGSPVEDN EKDLVKLAKR LKKEKVNVDI INFGEEEVNT EKLTAFVNTL NGKDGTGSHL VTVPPGPSLA DALISSPILA GEGGAMLGLG ASDFEFGVDP SADPELALAL RVSMEEQRQR QEEEARRAAA ASAAEAGIAT TGTEDSDDAL LKMTISQQEF GRTGLPDLSS MTEEEQIAYA MQMSLQGAEF GQAESADIDA SSAMDTSEPA KEEDDYDVMQ DPEFLQSVLE NLPGVDPNNE AIRNAMGSLA SQATKDGKKD KKEEDKK

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分子 #25: 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 6

分子名称: 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 6 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 25 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Homo sapiens (ヒト)
配列文字列: MPLENLEEEG LPKNPDLRIA QLRFLLSLPE HRGDAAVRDE LMAAVRDNNM APYYEALCKS LDWQIDVDLL NKMKKANEDE LKRLDEELED AEKNLGESEI RDAMMAKAEY LCRIGDKEGA LTAFRKTYDK TVALGHRLDI VFYLLRIGLF YMDNDLITRN TEKAKSLIEE ...文字列:
MPLENLEEEG LPKNPDLRIA QLRFLLSLPE HRGDAAVRDE LMAAVRDNNM APYYEALCKS LDWQIDVDLL NKMKKANEDE LKRLDEELED AEKNLGESEI RDAMMAKAEY LCRIGDKEGA LTAFRKTYDK TVALGHRLDI VFYLLRIGLF YMDNDLITRN TEKAKSLIEE GGDWDRRNRL KVYQGLYCVA IRDFKQAAEL FLDTVSTFTS YELMDYKTFV TYTVYVSMIA LERPDLREKV IKGAEILEVL HSLPAVRQYL FSLYECRYSV FFQSLAVVEQ EMKKDWLFAP HYRYYVREMR IHAYSQLLES YRSLTLGYMA EAFGVGVEFI DQELSRFIAA GRLHCKIDKV NEIVETNRPD SKNWQYQETI KKGDLLLNRV QKLSRVINM

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分子 #26: 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 7

分子名称: 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 7 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 26 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Homo sapiens (ヒト)
配列文字列: MPELAVQKVV VHPLVLLSVV DHFNRIGKVG NQKRVVGVLL GSWQKKVLDV SNSFAVPFDE DDKDDSVWFL DHDYLENMYG MFKKVNARER IVGWYHTGPK LHKNDIAINE LMKRYCPNSV LVIIDVKPKD LGLPTEAYIS VEEVHDDGTP TSKTFEHVTS EIGAEEAEEV ...文字列:
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分子 #27: 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 8

分子名称: 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 8 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 27 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Homo sapiens (ヒト)
配列文字列: MFIKGRAPRA PPRERRRATR GGLRQVVAPP RALGSTSRPH FRRASVCRRR CRKSGGLLAA SRKMAAAAVN GAAGFSSSGP AATSGAVLQA ATGMYEQLKG EWNRKSPNLS KCGEELGRLK LVLLELNFLP TTGTKLTKQQ LILARDILEI GAQWSILRKD IPSFERYMAQ ...文字列:
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分子 #28: 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 9

分子名称: 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 9 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 28 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Homo sapiens (ヒト)
配列文字列: MSDEEARQSG GSSQAGVVTV SDVQELMRRK EEIEAQIKAN YDVLESQKGI GMNEPLVDCE GYPRSDVDLY QVRTARHNII CLQNDHKAVM KQVEEALHQL HARDKEKQAR DMAEAHKEAM SRKLGQSESQ GPPRAFAKVN SISPGSPASI AGLQVDDEIV EFGSVNTQNF ...文字列:
MSDEEARQSG GSSQAGVVTV SDVQELMRRK EEIEAQIKAN YDVLESQKGI GMNEPLVDCE GYPRSDVDLY QVRTARHNII CLQNDHKAVM KQVEEALHQL HARDKEKQAR DMAEAHKEAM SRKLGQSESQ GPPRAFAKVN SISPGSPASI AGLQVDDEIV EFGSVNTQNF QSLHNIGSVV QHSEGKPLNV TVIRRGEKHQ LRLVPTRWAG KGLLGCNIIP LQR

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分子 #29: 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 11

分子名称: 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 11 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 29 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Homo sapiens (ヒト)
配列文字列: MAAAAVVEFQ RAQSLLSTDR EASIDILHSI VKRDIQENDE EAVQVKEQSI LELGSLLAKT GQAAELGGLL KYVRPFLNSI SKAKAARLVR SLLDLFLDME AATGQEVELC LECIEWAKSE KRTFLRQALE ARLVSLYFDT KRYQEALHLG SQLLRELKKM DDKALLVEVQ ...文字列:
MAAAAVVEFQ RAQSLLSTDR EASIDILHSI VKRDIQENDE EAVQVKEQSI LELGSLLAKT GQAAELGGLL KYVRPFLNSI SKAKAARLVR SLLDLFLDME AATGQEVELC LECIEWAKSE KRTFLRQALE ARLVSLYFDT KRYQEALHLG SQLLRELKKM DDKALLVEVQ LLESKTYHAL SNLPKARAAL TSARTTANAI YCPPKLQATL DMQSGIIHAA EEKDWKTAYS YFYEAFEGYD SIDSPKAITS LKYMLLCKIM LNTPEDVQAL VSGKLALRYA GRQTEALKCV AQASKNRSLA DFEKALTDYR AELRDDPIIS THLAKLYDNL LEQNLIRVIE PFSRVQIEHI SSLIKLSKAD VERKLSQMIL DKKFHGILDQ GEGVLIIFDE PPVDKTYEAA LETIQNMSKV VDSLYNKAKK LT

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分子 #30: 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 12

分子名称: 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 12 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 30 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Homo sapiens (ヒト)
配列文字列: MADGGSERAD GRIVKMEVDY SATVDQRLPE CAKLAKEGRL QEVIETLLSL EKQTRTASDM VSTSRILVAV VKMCYEAKEW DLLNENIMLL SKRRSQLKQA VAKMVQQCCT YVEEITDLPI KLRLIDTLRM VTEGKIYVEI ERARLTKTLA TIKEQNGDVK EAASILQELQ ...文字列:
MADGGSERAD GRIVKMEVDY SATVDQRLPE CAKLAKEGRL QEVIETLLSL EKQTRTASDM VSTSRILVAV VKMCYEAKEW DLLNENIMLL SKRRSQLKQA VAKMVQQCCT YVEEITDLPI KLRLIDTLRM VTEGKIYVEI ERARLTKTLA TIKEQNGDVK EAASILQELQ VETYGSMEKK ERVEFILEQM RLCLAVKDYI RTQIISKKIN TKFFQEENTE KLKLKYYNLM IQLDQHEGSY LSICKHYRAI YDTPCIQAES EKWQQALKSV VLYVILAPFD NEQSDLVHRI SGDKKLEEIP KYKDLLKLFT TMELMRWSTL VEDYGMELRK GSLESPATDV FGSTEEGEKR WKDLKNRVVE HNIRIMAKYY TRITMKRMAQ LLDLSVDESE AFLSNLVVNK TIFAKVDRLA GIINFQRPKD PNNLLNDWSQ KLNSLMSLVN KTTHLIAKEE MIHNLQ

+
分子 #31: 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 13

分子名称: 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 13 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 31 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Homo sapiens (ヒト)
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MKDVPGFLQQ SQNSGPGQPA VWHRLEELYT KKLWHQLTLQ VLDFVQDPCF AQGDGLIKLY ENFISEFEHR VNPLSLVEII LHVVRQMTDP NVALTFLEKT REKVKSSDEA VILCKTAIGA LKLNIGDLQV TKETIEDVEE MLNNLPGVTS VHSRFYDLSS KYYQTIGNHA SYYKDALRFL GCVDIKDLPV SEQQERAFTL GLAGLLGEGV FNFGELLMHP VLESLRNTDR QWLIDTLYAF NSGNVERFQT LKTAWGQQPD LAANEAQLLR KIQLLCLMEM TFTRPANHRQ LTFEEIAKSA KITVNEVELL VMKALSVGLV KGSIDEVDKR VHMTWVQPRV LDLQQIKGMK DRLEFWCTDV KSMEMLVEHQ AHDILT

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分子 #32: 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 14 (His)x6 TEV prote...

分子名称: 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 14 (His)x6 TEV protease site
タイプ: protein_or_peptide / ID: 32 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Homo sapiens (ヒト)
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分子 #33: Proteasomal ubiquitin receptor ADRM1

分子名称: Proteasomal ubiquitin receptor ADRM1 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 33 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Homo sapiens (ヒト)
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MTTSGALFPS LVPGSRGASN KYLVEFRAGK MSLKGTTVTP DKRKGLVYIQ QTDDSLIHFC WKDRTSGNVE DDLIIFPDDC EFKRVPQCPS GRVYVLKFKA GSKRLFFWMQ EPKTDQDEEH CRKVNEYLNN PPMPGALGAS GSSGHELSAL GGEGGLQSLL GNMSHSQLMQ LIGPAGLGGL GGLGALTGPG LASLLGSSGP PGSSSSSSSR SQSAAVTPSS TTSSTRATPA PSAPAAASAT SPSPAPSSGN GASTAASPTQ PIQLSDLQSI LATMNVPAGP AGGQQVDLAS VLTPEIMAPI LANADVQERL LPYLPSGESL PQTADEIQNT LTSPQFQQAL GMFSAALASG QLGPLMCQFG LPAEAVEAAN KGDVEAFAKA MQNNAKPEQK EGDTKDKKDE EEDMSLD

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実験情報

-
構造解析

手法クライオ電子顕微鏡法
解析単粒子再構成法
試料の集合状態particle

-
試料調製

濃度0.9 mg/mL
緩衝液pH: 7.5 / 詳細: 30mM Tris-HCl, 5mM MgCl2, 1mM ATP, 1mM TCEP
グリッドモデル: Quantifoil R1.2/1.3 / 材質: GRAPHENE OXIDE / メッシュ: 400 / 支持フィルム - 材質: GRAPHENE OXIDE / 支持フィルム - トポロジー: HOLEY ARRAY / 詳細: The grid was not pretreated.
凍結凍結剤: ETHANE / チャンバー内湿度: 100 % / チャンバー内温度: 277 K / 装置: FEI VITROBOT MARK IV

-
電子顕微鏡法

顕微鏡FEI TITAN KRIOS
特殊光学系球面収差補正装置: Microscope was modified with a Cs corrector (CEOS GmbH, Germany).
詳細Preliminary grid screening was performed manually.
撮影フィルム・検出器のモデル: FEI FALCON II (4k x 4k)
検出モード: INTEGRATING / デジタル化 - サイズ - 横: 4096 pixel / デジタル化 - サイズ - 縦: 4096 pixel / デジタル化 - 画像ごとのフレーム数: 1-20 / 撮影したグリッド数: 1 / 実像数: 1130 / 平均露光時間: 3.0 sec. / 平均電子線量: 60.0 e/Å2
詳細: Images were collected in movie-mode at 20 frames per second.
電子線加速電圧: 300 kV / 電子線源: FIELD EMISSION GUN
電子光学系C2レンズ絞り径: 100.0 µm / 倍率（補正後）: 77778 / 照射モード: FLOOD BEAM / 撮影モード: BRIGHT FIELD / Cs: 0.01 mm / 最大 デフォーカス（公称値）: 2.5 µm / 最小 デフォーカス（公称値）: 0.8 µm / 倍率（公称値）: 37000
試料ステージ試料ホルダーモデル: FEI TITAN KRIOS AUTOGRID HOLDER
ホルダー冷却材: NITROGEN
実験機器
モデル: Titan Krios / 画像提供: FEI Company

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画像解析

粒子像選択選択した数: 146134
初期モデルモデルのタイプ: OTHER / 詳細: Ab-initio reconstruction was performed.
最終 再構成想定した対称性 - 点群: C1 (非対称) / 解像度のタイプ: BY AUTHOR / 解像度: 3.6 Å / 解像度の算出法: FSC 0.143 CUT-OFF / ソフトウェア - 名称: cryoSPARC (ver. 4.2.1) / 使用した粒子像数: 45782
初期 角度割当タイプ: MAXIMUM LIKELIHOOD / ソフトウェア - 名称: cryoSPARC (ver. 4.2.1)
詳細: Heterogeneous Refinement was performed for the initial angular assignment of 20S, 26S and 30S particles.
最終 角度割当タイプ: OTHER / ソフトウェア - 名称: cryoSPARC (ver. 4.2.1)
詳細: 3D Flexible Refinement was performed for final reconstruction of 26S proteasome.
FSC曲線 (解像度の算出)

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万見について

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お知らせ

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2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

  • EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
  • これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

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2020年8月12日: 新型コロナ情報

新型コロナ情報

URL: https://pdbjlvh1.pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

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2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

新型コロナウイルスの構造データ

関連情報:万見生物種 / 2020年8月12日: 新型コロナ情報

外部リンク:COVID-19特集ページ - PDBj / 今月の分子2020年2月：コロナウイルスプロテーアーゼ

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2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

EMDBのIDの桁数の変更

  • EMDBエントリに付与されているアクセスコード(EMDB-ID)は4桁の数字(例、EMD-1234)でしたが、間もなく枯渇します。これまでの4桁のID番号は4桁のまま変更されませんが、4桁の数字を使い切った後に発行されるIDは5桁以上の数字(例、EMD-12345)になります。5桁のIDは2019年の春頃から発行される見通しです。
  • EM Navigator/万見では、接頭語「EMD-」は省略されています。

関連情報:Q: 「EMD」とは何ですか？ / 万見/EM NavigatorにおけるID/アクセスコードの表記

外部リンク:EMDB Accession Codes are Changing Soon! / PDBjへお問い合わせ

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2017年7月12日: PDB大規模アップデート

PDB大規模アップデート

  • 新バージョンのPDBx/mmCIF辞書形式に基づくデータがリリースされました。
  • 今回の更新はバージョン番号が4から5になる大規模なもので、全エントリデータの書き換えが行われる「Remediation」というアップデートに該当します。
  • このバージョンアップで、電子顕微鏡の実験手法に関する多くの項目の書式が改定されました(例：em_softwareなど)。
  • EM NavigatorとYorodumiでも、この改定に基づいた表示内容になります。

外部リンク:wwPDB Remediation / OneDepデータ基準に準拠した、より強化された内容のモデル構造ファイルが、PDBアーカイブで公開されました。

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万見 (Yorodumi)

幾万の構造データを、幾万の視点から

  • 万見(Yorodumi)は、EMDB/PDB/SASBDBなどの構造データを閲覧するためのページです。
  • EM Navigatorの詳細ページの後継、Omokage検索のフロントエンドも兼ねています。

関連情報:EMDB / PDB / SASBDB / 3つのデータバンクの比較 / 万見検索 / 2016年8月31日: 新しいEM Navigatorと万見 / 万見文献 / Jmol/JSmol / 機能・相同性情報 / 新しいEM Navigatorと万見の変更点

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