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万見
- EMDB-51138: C3 reconstruction of extended phiCD508 needle -

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基本情報

登録情報
データベース: EMDB / ID: EMD-51138
タイトルC3 reconstruction of extended phiCD508 needle
マップデータExtended phiCD508 needle sharpened map (Bfactor = -103.9A)
試料
  • 複合体: Extended phiCD508 needle complex
    • タンパク質・ペプチド: Baseplate J family protein
    • タンパク質・ペプチド: XkdT-related protein
    • タンパク質・ペプチド: Peptidoglycan-binding LysM protein
    • タンパク質・ペプチド: XkdM-related protein
    • タンパク質・ペプチド: Tail sheath
    • タンパク質・ペプチド: XkdS-related protein
    • タンパク質・ペプチド: Phage protein
    • タンパク質・ペプチド: XkdQ-related protein
    • タンパク質・ペプチド: Tail tape measure
  • リガンド: FE (II) ION
キーワードBacteriophage / virus / needle / baseplate
機能・相同性
機能・相同性情報


virus tail, sheath / symbiont genome ejection through host cell envelope, contractile tail mechanism / viral tail assembly / membrane
類似検索 - 分子機能
Phage tail tape measure protein / Phage-related minor tail protein / YQBQ-like / Bacteriophage Mu-like, Gp48 / : / Bacteriophage Mu-like, Gp48 / : / Protein of unknown function DUF2634 / Contractile injection system sheath initiator / Phage tail tube protein ...Phage tail tape measure protein / Phage-related minor tail protein / YQBQ-like / Bacteriophage Mu-like, Gp48 / : / Bacteriophage Mu-like, Gp48 / : / Protein of unknown function DUF2634 / Contractile injection system sheath initiator / Phage tail tube protein / XkdM-like superfamily / Phage tail tube protein / Phage tail sheath protein, beta-sandwich domain / Phage tail sheath protein beta-sandwich domain / Baseplate protein J-like / Baseplate J-like protein / Tail sheath protein, subtilisin-like domain / Phage tail sheath protein subtilisin-like domain / Tail sheath protein, C-terminal domain / Phage tail sheath C-terminal domain / LysM domain superfamily / LysM domain / LysM domain profile. / LysM domain / Prokaryotic membrane lipoprotein lipid attachment site profile.
類似検索 - ドメイン・相同性
Phage protein / XkdQ-related protein / XkdM-related protein / Peptidoglycan-binding LysM protein / XkdT-related protein / Tail sheath / Baseplate J family protein / Tail tape measure / XkdS-related protein
類似検索 - 構成要素
生物種Clostridioides difficile (バクテリア) / Clostridioides phage phiCD508 (ファージ)
手法単粒子再構成法 / クライオ電子顕微鏡法 / 解像度: 3.96 Å
データ登録者Wilson JS / Fagan RP / Bullough PA
資金援助 英国, 1件
OrganizationGrant number国
Biotechnology and Biological Sciences Research Council (BBSRC)BB/P02002X/1 英国
引用ジャーナル: Life Sci Alliance / 年: 2025
タイトル: Molecular mechanism of bacteriophage contraction structure of an S-layer-penetrating bacteriophage.
著者: Jason S Wilson / Louis-Charles Fortier / Robert P Fagan / Per A Bullough /
要旨: The molecular details of phage tail contraction and bacterial cell envelope penetration remain poorly understood and are completely unknown for phages infecting bacteria enveloped by proteinaceous S- ...The molecular details of phage tail contraction and bacterial cell envelope penetration remain poorly understood and are completely unknown for phages infecting bacteria enveloped by proteinaceous S-layers. Here, we reveal the extended and contracted atomic structures of an intact contractile-tailed phage (φCD508) that binds to and penetrates the protective S-layer of the Gram-positive human pathogen The tail is unusually long (225 nm), and it is also notable that the tail contracts less than those studied in related contractile injection systems such as the model phage T4 (∼20% compared with ∼50%). Surprisingly, we find no evidence of auxiliary enzymatic domains that other phages exploit in cell wall penetration, suggesting that sufficient energy is released upon tail contraction to penetrate the S-layer and the thick cell wall without enzymatic activity. Instead, the unusually long tail length, which becomes more flexible upon contraction, likely contributes toward the required free energy release for envelope penetration.
履歴
登録2024年7月23日-
ヘッダ(付随情報) 公開2025年4月9日-
マップ公開2025年4月9日-
更新2025年4月9日-
現状2025年4月9日処理サイト: PDBe / 状態: 公開

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構造の表示

添付画像

emd_51138.png

ダウンロードとリンク

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マップ

ファイルダウンロード / ファイル: emd_51138.map.gz / 形式: CCP4 / 大きさ: 476.8 MB / タイプ: IMAGE STORED AS FLOATING POINT NUMBER (4 BYTES)
注釈Extended phiCD508 needle sharpened map (Bfactor = -103.9A)
投影像・断面図

画像のコントロール

大きさ
明度
コントラスト
その他
軸Z (Sec.)Y (Row.)X (Col.)
1.06 Å/pix.
x 500 pix.
= 530. Å		1.06 Å/pix.
x 500 pix.
= 530. Å		1.06 Å/pix.
x 500 pix.
= 530. Å

表面

投影像

断面 (1/3)

断面 (1/2)

断面 (2/3)

画像は Spider により作成

ボクセルのサイズX=Y=Z: 1.06 Å
密度

ヒストグラム

ヒストグラム (対数)
表面レベル登録者による: 0.0231
最小 - 最大-0.051235296 - 0.118146166
平均 (標準偏差)0.00041253964 (±0.0039125504)
対称性空間群: 1
詳細

EMDB XML:

マップ形状
Axis orderXYZ
Origin000
サイズ500500500
Spacing500500500
セルA=B=C: 530.0 Å
α=β=γ: 90.0 °

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添付データ

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ハーフマップ: extended phiCD508 needle Half map A

ファイルemd_51138_half_map_1.map
注釈extended phiCD508 needle Half map A
投影像・断面図
軸ZYX

投影像

断面 (1/2)
密度ヒストグラム

ヒストグラム

ヒストグラム (対数)

-
ハーフマップ: extended phiCD508 needle Half map B

ファイルemd_51138_half_map_2.map
注釈extended phiCD508 needle Half map B
投影像・断面図
軸ZYX

投影像

断面 (1/2)
密度ヒストグラム

ヒストグラム

ヒストグラム (対数)

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試料の構成要素

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全体 : Extended phiCD508 needle complex

全体名称: Extended phiCD508 needle complex
要素
  • 複合体: Extended phiCD508 needle complex
    • タンパク質・ペプチド: Baseplate J family protein
    • タンパク質・ペプチド: XkdT-related protein
    • タンパク質・ペプチド: Peptidoglycan-binding LysM protein
    • タンパク質・ペプチド: XkdM-related protein
    • タンパク質・ペプチド: Tail sheath
    • タンパク質・ペプチド: XkdS-related protein
    • タンパク質・ペプチド: Phage protein
    • タンパク質・ペプチド: XkdQ-related protein
    • タンパク質・ペプチド: Tail tape measure
  • リガンド: FE (II) ION

+
超分子 #1: Extended phiCD508 needle complex

超分子名称: Extended phiCD508 needle complex / タイプ: complex / ID: 1 / 親要素: 0 / 含まれる分子: #1-#9
由来(天然)生物種: Clostridioides difficile (バクテリア) / 株: CD117

+
分子 #1: Baseplate J family protein

分子名称: Baseplate J family protein / タイプ: protein_or_peptide / ID: 1 / コピー数: 12 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Clostridioides phage phiCD508 (ファージ)
分子量理論値: 41.502496 KDa
組換発現生物種: Clostridioides difficile (バクテリア)
配列文字列: MERELPIPVF LTEDEDSVHE RMLSNFQDVS TLEGDFIYDA TRPTAEQIAE LKQLGLQNNL KIAFPQTSYG TYLEWLGECK GVFKNQPTK ATGVITFTGV QGTIITKGTI VTTIATDEKQ SIEFELLETK TIGENETVDI KAESRIVGTI GNVSKGSISV L LGSISGVK ...文字列:
MERELPIPVF LTEDEDSVHE RMLSNFQDVS TLEGDFIYDA TRPTAEQIAE LKQLGLQNNL KIAFPQTSYG TYLEWLGECK GVFKNQPTK ATGVITFTGV QGTIITKGTI VTTIATDEKQ SIEFELLETK TIGENETVDI KAESRIVGTI GNVSKGSISV L LGSISGVK SITNKEDFRG GTDIEDEEHF RERVLVAEQE DKLSGASSDY IRWAKEVDGV GYAYVVSEWA GAGTVKVLIL DK NRKAATQ ELIDKVQEYI YPLNISEGEN RDGKAPIGAL VTVVTPDTLL INVKASFIFS NGFSEETVLN NLKTKIDKYL DKI DLGGTV SYNAIQAIVG SMMLTDEGIE DFSNLTINDV KENIKLQDQV VGIGEIVNEV VG

UniProtKB: Baseplate J family protein

+
分子 #2: XkdT-related protein

分子名称: XkdT-related protein / タイプ: protein_or_peptide / ID: 2 / コピー数: 6 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Clostridioides phage phiCD508 (ファージ)
分子量理論値: 18.034832 KDa
組換発現生物種: Clostridioides difficile (バクテリア)
配列文字列:
MIASKKGKEM LLTLSPIYEQ SIIMQSLYEA IGSEFDNLEL LDEEIELQLF PQSATWGLGF WENRVGLITN LDEDMETRRR KVIAKLQSK YIMTPKRMSM ILQSYTGANI KINENISPYT FGVELTSTQG FPKDLEDLYK RVNVIKPSHL AVSYKLVS

UniProtKB: XkdT-related protein

+
分子 #3: Peptidoglycan-binding LysM protein

分子名称: Peptidoglycan-binding LysM protein / タイプ: protein_or_peptide / ID: 3 / コピー数: 6 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Clostridioides phage phiCD508 (ファージ)
分子量理論値: 25.89983 KDa
組換発現生物種: Clostridioides difficile (バクテリア)
配列文字列: MVIDIYLKNE KEKIDFHFPV NPQDSLSIKK EKRFETVDIV NLGEFDIKKE GEKIREISFK TFLPNLYDAS YCRYSELKNP IEVVAMLEK WVDQAEPLRL IITGFGYNGL VTISSFSNTQ TAGREEDRDI EITFRTYREL KIETLKKDTK SNTKTDLKDN R PNTQTKSK ...文字列:
MVIDIYLKNE KEKIDFHFPV NPQDSLSIKK EKRFETVDIV NLGEFDIKKE GEKIREISFK TFLPNLYDAS YCRYSELKNP IEVVAMLEK WVDQAEPLRL IITGFGYNGL VTISSFSNTQ TAGREEDRDI EITFRTYREL KIETLKKDTK SNTKTDLKDN R PNTQTKSK IYTVKASDTL YKIAKNLLGK GSRWPEIYNI PENKKVIGKN PNIIKKGQKL VIPSK

UniProtKB: Peptidoglycan-binding LysM protein

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分子 #4: XkdM-related protein

分子名称: XkdM-related protein / タイプ: protein_or_peptide / ID: 4 / コピー数: 6 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Clostridioides phage phiCD508 (ファージ)
分子量理論値: 14.657557 KDa
組換発現生物種: Clostridioides difficile (バクテリア)
配列文字列:
EEASFLNGSD VVILIDGVEE LYMEEIKADF EQDEQSIKLL GCQNEISRVG TTKGSFSLNG YKTDSKFAKL GFRSFEIIYN LSNSETLGY ESIRLKNCRL KKLPLINSKA GEIVKIEVEG SFRGYDLLNE L

UniProtKB: XkdM-related protein

+
分子 #5: Tail sheath

分子名称: Tail sheath / タイプ: protein_or_peptide / ID: 5 / コピー数: 6 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Clostridioides phage phiCD508 (ファージ)
分子量理論値: 51.405023 KDa
組換発現生物種: Clostridioides difficile (バクテリア)
配列文字列: EIPGFYNRFK AQAEKAAATG LKGRLAMPIR ANWGDVGKVV TIKNDLRQLK NLFGDDMNYS AFKLGKLALL GNVKELLLYR LVDGNQKKG TLTLKDTTEN SAKDVIKLET KYPTARNFNV TIKSNLVDSD KKDFIFFENT KQLFSSSIKG TIDEIVLEIN S NLDNEYVI ...文字列:
EIPGFYNRFK AQAEKAAATG LKGRLAMPIR ANWGDVGKVV TIKNDLRQLK NLFGDDMNYS AFKLGKLALL GNVKELLLYR LVDGNQKKG TLTLKDTTEN SAKDVIKLET KYPTARNFNV TIKSNLVDSD KKDFIFFENT KQLFSSSIKG TIDEIVLEIN S NLDNEYVI ATKVADSDTI LANVVNQALE GGNDGCTSIT NESYLKALEE FERYSFDSFV LDGVADEALQ ETTKAWVAKN KE LGKDILL FLGGKTEDNI KQINDKSKSF NDENIVNVGS SAYYENIKYT PSEVAVYIAA LSVSKGITGS ICNAKTIFEE VEP RLSQSE VKECLKSGTL VLDFDDGDVI IVDDVNTFKK YVDDKNEAMG YISNIMFINT INKDTSLKRK EFVGKIFNDA TGQT TVICA LKKYFEELMS QGIISEFNVD IDTELQATAK ADEFYWKWDA VKVDVMKKIY GTGYL

UniProtKB: Tail sheath

+
分子 #6: XkdS-related protein

分子名称: XkdS-related protein / タイプ: protein_or_peptide / ID: 6 / コピー数: 6 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Clostridioides phage phiCD508 (ファージ)
分子量理論値: 14.454414 KDa
組換発現生物種: Clostridioides difficile (バクテリア)
配列文字列:
LDLKGSFLFD FEKGEFVKNA DGTLKKCDKV QAYKQWCQKA ILTPRYKKAA YTNIYGSEIK DLIASNLSQS AKELEITRLI KETILVHPY TKEVGEFSFN WLENSRLVEY EFDVLTIDDE NIVIDG

UniProtKB: XkdS-related protein

+
分子 #7: Phage protein

分子名称: Phage protein / タイプ: protein_or_peptide / ID: 7 / コピー数: 3 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Clostridioides phage phiCD508 (ファージ)
分子量理論値: 12.476309 KDa
組換発現生物種: Clostridioides difficile (バクテリア)
配列文字列:
FNGIARILKE NMNKSVANGT FGMGCELAEI TANGLKVNGY KDEIQDYLVL ENLTLKEDYF TFSDEALSGE YRHKHKIETP KELKPLRIG DNVLVAVMGA EFVVIGRVVN AKP

UniProtKB: Phage protein

+
分子 #8: XkdQ-related protein

分子名称: XkdQ-related protein / タイプ: protein_or_peptide / ID: 8 / コピー数: 3 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Clostridioides phage phiCD508 (ファージ)
分子量理論値: 36.291719 KDa
組換発現生物種: Clostridioides difficile (バクテリア)
配列文字列: KIILNGKYDI ANFNEGITLS EAIDGVAYKM DVSLVEPKQL KDINIKKGDK IILIDIAYES KKEETIFDGV VWETRRSEKS KKLTLSCRE RTVYMEESEE QYQFKENTAT QRIEYYCKQW NIPYYNLANT GKKLAKVIHK TNILDMIKKD LKETATKGGD L FRVRMDNK ...文字列:
KIILNGKYDI ANFNEGITLS EAIDGVAYKM DVSLVEPKQL KDINIKKGDK IILIDIAYES KKEETIFDGV VWETRRSEKS KKLTLSCRE RTVYMEESEE QYQFKENTAT QRIEYYCKQW NIPYYNLANT GKKLAKVIHK TNILDMIKKD LKETATKGGD L FRVRMDNK LKLFKLGTNA NVYKLDSILE DANFTSSFND AVTSVKVLGK SKDENTKAPI IGTYKKDADK FGTLQKIKQD EK IKNAKEA KKAAEAMFNS GEETISVDCA VDINRIRAGD KVSLKSKEYY VIDVTHTLDS RPKMKLNIGS LEYIRRKFY

UniProtKB: XkdQ-related protein

+
分子 #9: Tail tape measure

分子名称: Tail tape measure / タイプ: protein_or_peptide / ID: 9 / コピー数: 3 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Clostridioides phage phiCD508 (ファージ)
分子量理論値: 150.075156 KDa
組換発現生物種: Clostridioides difficile (バクテリア)
配列文字列: MREIAKKEMY HIDVVISAKG DGETKSKLSA MEKYMKQTEK RMQTLNRIKV NPAIKATDKA SSVVNRVNNN MNKAKKTVTA RIKATDNAS PVANRASNNV NKAKKTVTAR LKATDNASST VNKVNNKIKE VAKPVPPVII RGQDESSSII DKVKAKIQNL K ADTIIKIK ...文字列:
MREIAKKEMY HIDVVISAKG DGETKSKLSA MEKYMKQTEK RMQTLNRIKV NPAIKATDKA SSVVNRVNNN MNKAKKTVTA RIKATDNAS PVANRASNNV NKAKKTVTAR LKATDNASST VNKVNNKIKE VAKPVPPVII RGQDESSSII DKVKAKIQNL K ADTIIKIK SQADEAINTI SRTKNKLQEF VSKRYEAAVK IRDEASSALR GLTGKIDSFV SGAISKFARL ATTAGALIGG IG VGSAVKG FATFEQSMKN TQAVSGATGK EMEALTAKAR QLGRETSFTA KDAGDAMYYM GMAGWKSEQM IKAIPDVLNL AAA GGTDLA LTSDIVTDGL TALGMTANDT TEFVDVMAAT ITNSNTSVEL MGETFKYVGS MGGALGVSMK DLSLATGLMA SASV KGSMA GTSLRGGLVR LIKPPEEAAS AIKKYGIELK KNKNGSLDLA GTIGSLREKL GGLKDVEKGV AISSIFGRTA MAGWA AVVN ASESDFNKLT TAIAESEGEA KRIADMKLDT LSGQFEILKS AIDDVRISVG QRLGPMTRGF VEDLIKKMPQ IGDAIV GVV EKFVNNFDKI KAGFQVLLPA IGSVIASVMV LKATFAFGGA IKSLSLLAST FGTAKLVAFG LTVGIGAIVI AFAGMTV AI SNNKTAMMDL QTRFGSFGEY VTTIMETVGG VIKLTLGNLL IMLGGIGKGI GILLSDKSWD EKASSLKNLF GKTTAEIK T NTKEALSDIN GETSNATALL KKSTSKELQG VTKAFSTAFD QSKNVTEKKS SDIARALTNG LKGLDDQSLT MMRGLNDNM AIILSGVTAD MKPSDKVNKI TKNLDDAFKA GKLSAQEYRS SIQETLNFIS KYSADSSNNL KQGMSDAFNA FKEGTNIGGL KDGVTGMLN SLKATGPQAL ETLKGLGGKA SEIFKGVDFN SSIDAQKTKV LQNLNSLGLE GTQAIDTLRT IFSQASSALD T TNLKQGLS NTFNSFKEGF NSGGIKNAIN SMLGTINQAG PQMQQALGKM DGKMGQVFAN VDFSTPIETQ ASKVLENLNN LG IEGPKAL ETVRSIFAQA SSQIQGSASQ TAQQANQEVA NALTQGNPAV QQAGQQLGTD LTNGVVNGVQ AGVPVVQQKS NEL ATATQN GVTNAVNSAT PQIDNSNLTS GIDTAFNQAT ATVQQGASSM YNGAKQSFTQ LAQIGREAGS SLYNGATTSF NMLA TNVRV ACSSMYNGAR TSFTSLSSSA ISAISAMCSS VVSQVSAMSS QIISYWNSVR ATVSAPITAS FNVKTTQTTV KRTVN ESSG GILGNILDRF ADGGVATRTS ICGENGAEMV IPLTNTRRSR AIELYEQTGK MLGLGSTPSQ KVGNSNIVNN VRQFPL ANV LDTDNKEYKE ATPNSVNSSN NTINLGGISI NVQNSDNKEE MIQELLSQVE SGIREALQDI G

UniProtKB: Tail tape measure

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分子 #10: FE (II) ION

分子名称: FE (II) ION / タイプ: ligand / ID: 10 / コピー数: 1 / 式: FE2
分子量理論値: 55.845 Da

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実験情報

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構造解析

手法クライオ電子顕微鏡法
解析単粒子再構成法
試料の集合状態particle

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試料調製

緩衝液pH: 7.4
グリッドモデル: Quantifoil R2/2 / 材質: COPPER / 前処理 - タイプ: GLOW DISCHARGE / 前処理 - 時間: 60 sec.
凍結凍結剤: ETHANE

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電子顕微鏡法

顕微鏡TFS KRIOS
撮影フィルム・検出器のモデル: GATAN K3 (6k x 4k) / 平均電子線量: 42.0 e/Å2
電子線加速電圧: 300 kV / 電子線源: FIELD EMISSION GUN
電子光学系照射モード: FLOOD BEAM / 撮影モード: BRIGHT FIELD / 最大 デフォーカス（公称値）: 3.0 µm / 最小 デフォーカス（公称値）: 1.5 µm / 倍率（公称値）: 81000
実験機器
モデル: Titan Krios / 画像提供: FEI Company

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画像解析

初期モデルモデルのタイプ: INSILICO MODEL
最終 再構成想定した対称性 - 点群: C3 (3回回転対称) / 解像度のタイプ: BY AUTHOR / 解像度: 3.96 Å / 解像度の算出法: FSC 0.143 CUT-OFF / 使用した粒子像数: 17759
初期 角度割当タイプ: MAXIMUM LIKELIHOOD
最終 角度割当タイプ: MAXIMUM LIKELIHOOD

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万見について

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お知らせ

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2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

  • EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
  • これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

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2020年8月12日: 新型コロナ情報

新型コロナ情報

URL: https://pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

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2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

新型コロナウイルスの構造データ

関連情報:万見生物種 / 2020年8月12日: 新型コロナ情報

外部リンク:COVID-19特集ページ - PDBj / 今月の分子2020年2月：コロナウイルスプロテーアーゼ

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2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

EMDBのIDの桁数の変更

  • EMDBエントリに付与されているアクセスコード(EMDB-ID)は4桁の数字(例、EMD-1234)でしたが、間もなく枯渇します。これまでの4桁のID番号は4桁のまま変更されませんが、4桁の数字を使い切った後に発行されるIDは5桁以上の数字(例、EMD-12345)になります。5桁のIDは2019年の春頃から発行される見通しです。
  • EM Navigator/万見では、接頭語「EMD-」は省略されています。

関連情報:Q: 「EMD」とは何ですか？ / 万見/EM NavigatorにおけるID/アクセスコードの表記

外部リンク:EMDB Accession Codes are Changing Soon! / PDBjへお問い合わせ

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2017年7月12日: PDB大規模アップデート

PDB大規模アップデート

  • 新バージョンのPDBx/mmCIF辞書形式に基づくデータがリリースされました。
  • 今回の更新はバージョン番号が4から5になる大規模なもので、全エントリデータの書き換えが行われる「Remediation」というアップデートに該当します。
  • このバージョンアップで、電子顕微鏡の実験手法に関する多くの項目の書式が改定されました(例：em_softwareなど)。
  • EM NavigatorとYorodumiでも、この改定に基づいた表示内容になります。

外部リンク:wwPDB Remediation / OneDepデータ基準に準拠した、より強化された内容のモデル構造ファイルが、PDBアーカイブで公開されました。

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万見 (Yorodumi)

幾万の構造データを、幾万の視点から

  • 万見(Yorodumi)は、EMDB/PDB/SASBDBなどの構造データを閲覧するためのページです。
  • EM Navigatorの詳細ページの後継、Omokage検索のフロントエンドも兼ねています。

関連情報:EMDB / PDB / SASBDB / 3つのデータバンクの比較 / 万見検索 / 2016年8月31日: 新しいEM Navigatorと万見 / 万見文献 / Jmol/JSmol / 機能・相同性情報 / 新しいEM Navigatorと万見の変更点

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