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基本情報
登録情報 | ![]() | |||||||||
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タイトル | Tau PHF subtomogram average relating to CS7 extended data Figure 9f | |||||||||
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![]() | Amyloid / Filament / Alzheimer's / helical / PROTEIN FIBRIL | |||||||||
生物種 | ![]() | |||||||||
手法 | サブトモグラム平均法 / クライオ電子顕微鏡法 / 解像度: 25.0 Å | |||||||||
![]() | Jenkins J | |||||||||
資金援助 | ![]()
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![]() | ![]() タイトル: CryoET of beta-amyloid and tau within post-mortem Alzheimer's disease brain 著者: Gilbert MAG / Fatima N / Jenkins J / O'Sullivan TJ / Schertel A / Halfon Y / Wilkinson M / Morrema THJ / Geibel M / Read RJ / Ranson NA / Radford SE / Hoozemans JJM / Frank RAW | |||||||||
履歴 |
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構造の表示
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ダウンロードとリンク
-EMDBアーカイブ
マップデータ | ![]() | |||
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ヘッダ (付随情報) | ![]() | |||
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-検証レポート
文書・要旨 | ![]() | 741.9 KB | 表示 | ![]() |
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文書・詳細版 | ![]() | 741.5 KB | 表示 | |
XML形式データ | ![]() | 9.3 KB | 表示 | |
CIF形式データ | ![]() | 12.1 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-関連構造データ
関連構造データ | ![]() 50148 ![]() 50152 ![]() 50153 ![]() 50155 ![]() 50156 ![]() 50157 ![]() 50160 ![]() 50161 ![]() 50162 C: 同じ文献を引用 ( |
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リンク
EMDBのページ | ![]() ![]() |
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マップ
ファイル | ![]() | ||||||||||||||||||||
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ボクセルのサイズ | X=Y=Z: 2.38 Å | ||||||||||||||||||||
密度 |
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対称性 | 空間群: 1 | ||||||||||||||||||||
詳細 | EMDB XML:
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-添付データ
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試料の構成要素
-全体 : Microtubule-associated protein tau
全体 | 名称: Microtubule-associated protein tau |
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要素 |
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-超分子 #1: Microtubule-associated protein tau
超分子 | 名称: Microtubule-associated protein tau / タイプ: tissue / ID: 1 / 親要素: 0 / 含まれる分子: all |
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由来(天然) | 生物種: ![]() |
-分子 #1: Microtubule-associated protein tau
分子 | 名称: Microtubule-associated protein tau / タイプ: protein_or_peptide / ID: 1 / 光学異性体: LEVO |
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由来(天然) | 生物種: ![]() |
配列 | 文字列: MAEPRQEFEV MEDHAGTYGL GDRKDQGGYT MHQDQEGDTD AGLKESPLQT PTEDGSEEPG SETSDAKST PTAEDVTAPL VDEGAPGKQA AAQPHTEIPE GTTAEEAGIG DTPSLEDEAA G HVTQEPES GKVVQEGFLR EPGPPGLSHQ LMSGMPGAPL LPEGPREATR ...文字列: MAEPRQEFEV MEDHAGTYGL GDRKDQGGYT MHQDQEGDTD AGLKESPLQT PTEDGSEEPG SETSDAKST PTAEDVTAPL VDEGAPGKQA AAQPHTEIPE GTTAEEAGIG DTPSLEDEAA G HVTQEPES GKVVQEGFLR EPGPPGLSHQ LMSGMPGAPL LPEGPREATR QPSGTGPEDT EG GRHAPEL LKHQLLGDLH QEGPPLKGAG GKERPGSKEE VDEDRDVDES SPQDSPPSKA SPA QDGRPP QTAAREATSI PGFPAEGAIP LPVDFLSKVS TEIPASEPDG PSVGRAKGQD APLE FTFHV EITPNVQKEQ AHSEEHLGRA AFPGAPGEGP EARGPSLGED TKEADLPEPS EKQPA AAPR GKPVSRVPQL KARMVSKSKD GTGSDDKKAK TSTRSSAKTL KNRPCLSPKH PTPGSS DPL IQPSSPAVCP EPPSSPKYVS SVTSRTGSSG AKEMKLKGAD GKTKIATPRG AAPPGQK GQ ANATRIPAKT PPAPKTPPSS GEPPKSGDRS GYSSPGSPGT PGSRSRTPSL PTPPTREP K KVAVVRTPPK SPSSAKSRLQ TAPVPMPDLK NVKSKIGSTE NLKHQPGGGK VQIINKKLD LSNVQSKCGS KDNIKHVPGG GSVQIVYKPV DLSKVTSKCG SLGNIHHKPG GGQVEVKSEK LDFKDRVQS KIGSLDNITH VPGGGNKKIE THKLTFRENA KAKTDHGAEI VYKSPVVSGD T SPRHLSNV SSTGSIDMVD SPQLATLADE VSASLAKQGL |
-実験情報
-構造解析
手法 | クライオ電子顕微鏡法 |
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![]() | サブトモグラム平均法 |
試料の集合状態 | tissue |
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試料調製
緩衝液 | pH: 7.4 |
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凍結 | 凍結剤: ETHANE |
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電子顕微鏡法
顕微鏡 | FEI TITAN KRIOS |
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撮影 | フィルム・検出器のモデル: FEI FALCON IV (4k x 4k) 平均電子線量: 2.0 e/Å2 |
電子線 | 加速電圧: 300 kV / 電子線源: ![]() |
電子光学系 | 照射モード: FLOOD BEAM / 撮影モード: BRIGHT FIELD / Cs: 2.7 mm / 最大 デフォーカス(公称値): 6.5 µm / 最小 デフォーカス(公称値): 5.0 µm / 倍率(公称値): 53000 |
試料ステージ | 試料ホルダーモデル: FEI TITAN KRIOS AUTOGRID HOLDER |
実験機器 | ![]() モデル: Titan Krios / 画像提供: FEI Company |
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画像解析
最終 再構成 | 想定した対称性 - らせんパラメータ - Δz: 4.72 Å 想定した対称性 - らせんパラメータ - ΔΦ: -0.57 ° 想定した対称性 - らせんパラメータ - 軸対称性: C1 (非対称) 解像度のタイプ: BY AUTHOR / 解像度: 25.0 Å / 解像度の算出法: FSC 0.143 CUT-OFF / ソフトウェア - 名称: RELION (ver. 4.0) / 使用したサブトモグラム数: 2747 |
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抽出 | トモグラム数: 1 / 使用した粒子像数: 13956 |
最終 角度割当 | タイプ: MAXIMUM LIKELIHOOD |