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基本情報
登録情報 | ![]() | |||||||||
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タイトル | Icosahedral head of Acinetobacter baumannii phage Mystique: combined particles | |||||||||
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![]() | Mystique / Acinetobacter / phage / bacteriophage / VIRUS | |||||||||
生物種 | ![]() | |||||||||
手法 | 単粒子再構成法 / クライオ電子顕微鏡法 / 解像度: 4.15 Å | |||||||||
![]() | Alseth EO / Roush C / Irby I / Kopylov M / Bobe D / Diggs M / Nguyen K / Xu H / Schmidt-Krey I / Bryksin AV / Rather PN | |||||||||
資金援助 | ![]()
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![]() | ![]() タイトル: Icosahedral head of Acinetobacter baumannii phage Mystique: combined particles 著者: Alseth EO / Roush C / Irby I / Kopylov M / Bobe D / Diggs M / Nguyen K / Xu H / Schmidt-Krey I / Bryksin AV / Rather PN | |||||||||
履歴 |
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構造の表示
添付画像 |
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ダウンロードとリンク
-EMDBアーカイブ
マップデータ | ![]() | 492.3 MB | ![]() | |
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ヘッダ (付随情報) | ![]() ![]() | 17.4 KB 17.4 KB | 表示 表示 | ![]() |
FSC (解像度算出) | ![]() | 21.1 KB | 表示 | ![]() |
画像 | ![]() | 132.6 KB | ||
マスクデータ | ![]() | 1000 MB | ![]() | |
Filedesc metadata | ![]() | 4.7 KB | ||
その他 | ![]() ![]() ![]() | 942.9 MB 928.2 MB 928.2 MB | ||
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-検証レポート
文書・要旨 | ![]() | 1.2 MB | 表示 | ![]() |
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文書・詳細版 | ![]() | 1.2 MB | 表示 | |
XML形式データ | ![]() | 31 KB | 表示 | |
CIF形式データ | ![]() | 41.8 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
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リンク
EMDBのページ | ![]() ![]() |
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マップ
ファイル | ![]() | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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投影像・断面図 | 画像のコントロール
画像は Spider により作成 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
ボクセルのサイズ | X=Y=Z: 1.7328 Å | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
密度 |
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対称性 | 空間群: 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
詳細 | EMDB XML:
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-添付データ
-マスク #1
ファイル | ![]() | ||||||||||||
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投影像・断面図 |
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密度ヒストグラム |
-追加マップ: #1
ファイル | emd_49107_additional_1.map | ||||||||||||
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投影像・断面図 |
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密度ヒストグラム |
-ハーフマップ: #2
ファイル | emd_49107_half_map_1.map | ||||||||||||
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投影像・断面図 |
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密度ヒストグラム |
-ハーフマップ: #1
ファイル | emd_49107_half_map_2.map | ||||||||||||
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投影像・断面図 |
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密度ヒストグラム |
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試料の構成要素
-全体 : Mystique
全体 | 名称: ![]() |
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要素 |
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-超分子 #1: Mystique
超分子 | 名称: Mystique / タイプ: virus / ID: 1 / 親要素: 0 / 含まれる分子: all / NCBI-ID: 38018 / 生物種: Mystique / ウイルスタイプ: VIRION / ウイルス・単離状態: SPECIES / ウイルス・エンベロープ: No / ウイルス・中空状態: No |
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宿主 | 生物種: ![]() |
-分子 #1: Icosahedral head of Acinetobacter baumannii phage Mystique: combi...
分子 | 名称: Icosahedral head of Acinetobacter baumannii phage Mystique: combined particles タイプ: protein_or_peptide / ID: 1 / 光学異性体: LEVO |
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配列 | 文字列: MSKFQLLKPT GPKLKANELV AALTQGEREA QLRAASNLVQ DAGLLGCNVE AALAMYVEGG NGLNGLEATF QALNIPVNHQ GNEVAMACFA AATGTFMTNE GLRVLLPSLI NNLLRAVERT PIIERVDDLI FGTRMVKSNV MQKEITWDKA TNDSFKTHRI AEGANIPRRT ...文字列: MSKFQLLKPT GPKLKANELV AALTQGEREA QLRAASNLVQ DAGLLGCNVE AALAMYVEGG NGLNGLEATF QALNIPVNHQ GNEVAMACFA AATGTFMTNE GLRVLLPSLI NNLLRAVERT PIIERVDDLI FGTRMVKSNV MQKEITWDKA TNDSFKTHRI AEGANIPRRT LKATQTGVNF FKTGHAIEMS YEFASNVTPD VLVPYAARIE FERSQDEHSL AVETIVNGES QDPNSINGPI KEVNLDTLDG KAGKPLRERA EGFMQWIINQ ARKGLQFDTL LVGWDTLMEL QLMFPVTNAN NTPAAGVGGI TGSGTQMASL AVKVANGVNF NLTLVITSQL TGHKLIGFRK GETLERLIKT NSQIAESERN IGNQTILYTN TIISGFTLAY GDTRTLLKWT QS |
-実験情報
-構造解析
手法 | クライオ電子顕微鏡法 |
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![]() | 単粒子再構成法 |
試料の集合状態 | particle |
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試料調製
緩衝液 | pH: 7.6 |
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凍結 | 凍結剤: ETHANE |
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電子顕微鏡法
顕微鏡 | TFS KRIOS |
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特殊光学系 | エネルギーフィルター - 名称: GIF Bioquantum / エネルギーフィルター - スリット幅: 20 eV |
撮影 | フィルム・検出器のモデル: GATAN K3 BIOQUANTUM (6k x 4k) 平均電子線量: 50.17 e/Å2 |
電子線 | 加速電圧: 300 kV / 電子線源: ![]() |
電子光学系 | 照射モード: FLOOD BEAM / 撮影モード: BRIGHT FIELD / 最大 デフォーカス(公称値): 2.0 µm / 最小 デフォーカス(公称値): 1.0 µm |
実験機器 | ![]() モデル: Titan Krios / 画像提供: FEI Company |