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基本情報
登録情報 | ![]() | |||||||||||||||
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タイトル | Structure of the Junin virus glycoprotein complex | |||||||||||||||
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![]() | fusogen / glycoprotein / membrane / complex / VIRAL PROTEIN | |||||||||||||||
機能・相同性 | ![]() host cell Golgi membrane / receptor-mediated endocytosis of virus by host cell / host cell endoplasmic reticulum membrane / fusion of virus membrane with host endosome membrane / viral envelope / virion attachment to host cell / host cell plasma membrane / virion membrane / metal ion binding / membrane 類似検索 - 分子機能 | |||||||||||||||
生物種 | ![]() | |||||||||||||||
手法 | 単粒子再構成法 / クライオ電子顕微鏡法 / 解像度: 3.0 Å | |||||||||||||||
![]() | Mann CJ / Abraham J | |||||||||||||||
資金援助 | ![]()
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![]() | ![]() タイトル: Structure of the Junin virus glycoprotein complex 著者: Mann CJ / Abraham J | |||||||||||||||
履歴 |
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構造の表示
添付画像 |
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ダウンロードとリンク
-EMDBアーカイブ
マップデータ | ![]() | 372.3 MB | ![]() | |
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ヘッダ (付随情報) | ![]() ![]() | 17.8 KB 17.8 KB | 表示 表示 | ![]() |
FSC (解像度算出) | ![]() | 17 KB | 表示 | ![]() |
画像 | ![]() | 114.6 KB | ||
Filedesc metadata | ![]() | 5.8 KB | ||
その他 | ![]() ![]() | 338.2 MB 338.2 MB | ||
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-検証レポート
文書・要旨 | ![]() | 710.6 KB | 表示 | ![]() |
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文書・詳細版 | ![]() | 710 KB | 表示 | |
XML形式データ | ![]() | 24.2 KB | 表示 | |
CIF形式データ | ![]() | 31.6 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-関連構造データ
関連構造データ | ![]() 9mt6MC M: このマップから作成された原子モデル C: 同じ文献を引用 ( |
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類似構造データ | 類似検索 - 機能・相同性 ![]() |
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リンク
EMDBのページ | ![]() ![]() |
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マップ
ファイル | ![]() | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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投影像・断面図 | 画像のコントロール
画像は Spider により作成 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
ボクセルのサイズ | X=Y=Z: 0.83 Å | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
密度 |
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対称性 | 空間群: 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
詳細 | EMDB XML:
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-添付データ
-ハーフマップ: #2
ファイル | emd_48601_half_map_1.map | ||||||||||||
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投影像・断面図 |
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密度ヒストグラム |
-ハーフマップ: #1
ファイル | emd_48601_half_map_2.map | ||||||||||||
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投影像・断面図 |
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密度ヒストグラム |
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試料の構成要素
-全体 : Glycoprotein complex from Junin virus
全体 | 名称: Glycoprotein complex from Junin virus |
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要素 |
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-超分子 #1: Glycoprotein complex from Junin virus
超分子 | 名称: Glycoprotein complex from Junin virus / タイプ: complex / ID: 1 / 親要素: 0 / 含まれる分子: #1-#3 |
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由来(天然) | 生物種: ![]() |
-分子 #1: JUNV GP1
分子 | 名称: JUNV GP1 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 1 / コピー数: 3 / 光学異性体: LEVO |
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由来(天然) | 生物種: ![]() |
分子量 | 理論値: 22.311578 KDa |
組換発現 | 生物種: ![]() |
配列 | 文字列: EEAFKIGLHT EFQTVSFSMV GLFSNNPHDL PLLCTLNKSH LYIKGGNASF KISFDDIAVL LPEYDVIIQH PADMSWCSKS DDQIWLSQW FMNAVGHDWY LDPPFLCRNR TKTEGFIFQV NTSKTGINEN YAKKFKTGMH HLYREYPDSC LDGKLCLMKA Q PTSWPLQC ...文字列: EEAFKIGLHT EFQTVSFSMV GLFSNNPHDL PLLCTLNKSH LYIKGGNASF KISFDDIAVL LPEYDVIIQH PADMSWCSKS DDQIWLSQW FMNAVGHDWY LDPPFLCRNR TKTEGFIFQV NTSKTGINEN YAKKFKTGMH HLYREYPDSC LDGKLCLMKA Q PTSWPLQC PLDHVNTLHF LTRGKNIQLP RRSLK UniProtKB: Pre-glycoprotein polyprotein GP complex |
-分子 #2: Pre-glycoprotein polyprotein GP complex
分子 | 名称: Pre-glycoprotein polyprotein GP complex / タイプ: protein_or_peptide / ID: 2 / コピー数: 3 / 光学異性体: LEVO |
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由来(天然) | 生物種: ![]() |
分子量 | 理論値: 6.31551 KDa |
組換発現 | 生物種: ![]() |
配列 | 文字列: MGQFISFMQE IPTFLQEALN IALVAVSLIA IIAGVVNLYK SGLFQFFVFL ALAGRSCT UniProtKB: Pre-glycoprotein polyprotein GP complex |
-分子 #3: JUNV GP2
分子 | 名称: JUNV GP2 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 3 / コピー数: 3 / 光学異性体: LEVO |
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由来(天然) | 生物種: ![]() |
分子量 | 理論値: 27.026191 KDa |
組換発現 | 生物種: ![]() |
配列 | 文字列: AFFSWSLTDS SGKDTPGGYC LEEWMLVAAK MKCFGNTAVA KCNLNHDSEF CDMLRLFDYN KNAIKTLNDE TKKQVNLMGQ TINALISDN LLMKNKIREL MSVPYCNYTK FWYVNHTLSG QHSLPRCWLI KNNSYLNISD FRNDWILESD FLISEMLSKE Y SDRQGKTP ...文字列: AFFSWSLTDS SGKDTPGGYC LEEWMLVAAK MKCFGNTAVA KCNLNHDSEF CDMLRLFDYN KNAIKTLNDE TKKQVNLMGQ TINALISDN LLMKNKIREL MSVPYCNYTK FWYVNHTLSG QHSLPRCWLI KNNSYLNISD FRNDWILESD FLISEMLSKE Y SDRQGKTP LTLVDICFWS TVFFTASLFL HLVGIPTHRH IRGEACPLPH RLNSLGGCRC GKYPNLKKPT VWRRGH UniProtKB: Pre-glycoprotein polyprotein GP complex |
-分子 #5: 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose
分子 | 名称: 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose / タイプ: ligand / ID: 5 / コピー数: 7 / 式: NAG |
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分子量 | 理論値: 221.208 Da |
Chemical component information | ![]() ChemComp-NAG: |
-分子 #6: ZINC ION
分子 | 名称: ZINC ION / タイプ: ligand / ID: 6 / コピー数: 6 / 式: ZN |
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分子量 | 理論値: 65.409 Da |
-実験情報
-構造解析
手法 | クライオ電子顕微鏡法 |
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![]() | 単粒子再構成法 |
試料の集合状態 | particle |
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試料調製
緩衝液 | pH: 8 |
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凍結 | 凍結剤: ETHANE |
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電子顕微鏡法
顕微鏡 | TFS KRIOS |
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撮影 | フィルム・検出器のモデル: FEI FALCON IV (4k x 4k) 平均電子線量: 50.03 e/Å2 |
電子線 | 加速電圧: 300 kV / 電子線源: ![]() |
電子光学系 | 照射モード: FLOOD BEAM / 撮影モード: BRIGHT FIELD / 最大 デフォーカス(公称値): 2.0 µm / 最小 デフォーカス(公称値): 0.8 µm |
実験機器 | ![]() モデル: Titan Krios / 画像提供: FEI Company |