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基本情報
登録情報 | ![]() | |||||||||
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タイトル | Respiratory supercomplex I+III2+IV open state | |||||||||
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![]() | electron transporter / heart / respiratory supercomplex / ELECTRON TRANSPORT | |||||||||
機能・相同性 | ![]() Complex IV assembly / Cytoprotection by HMOX1 / TP53 Regulates Metabolic Genes / Complex III assembly / subthalamus development / pons development / cerebellar Purkinje cell layer development / Mitochondrial protein import / : / respiratory chain complex IV assembly ...Complex IV assembly / Cytoprotection by HMOX1 / TP53 Regulates Metabolic Genes / Complex III assembly / subthalamus development / pons development / cerebellar Purkinje cell layer development / Mitochondrial protein import / : / respiratory chain complex IV assembly / RHOG GTPase cycle / mitochondrial respirasome assembly / pyramidal neuron development / Complex I biogenesis / thalamus development / mitochondrial respiratory chain complex III assembly / Respiratory electron transport / Neutrophil degranulation / Mitochondrial protein degradation / respiratory chain complex IV / respiratory chain complex / cytochrome-c oxidase / respiratory chain complex III / oxidative phosphorylation / cardiac muscle tissue development / oxidoreductase activity, acting on NAD(P)H / mitochondrial electron transport, cytochrome c to oxygen / quinol-cytochrome-c reductase activity / cytochrome-c oxidase activity / mitochondrial electron transport, ubiquinol to cytochrome c / hypothalamus development / midbrain development / ubiquinone binding / electron transport coupled proton transport / NADH:ubiquinone reductase (H+-translocating) / mitochondrial respiratory chain complex I assembly / mitochondrial electron transport, NADH to ubiquinone / NADH dehydrogenase activity / respiratory chain complex I / NADH dehydrogenase (ubiquinone) activity / quinone binding / ATP synthesis coupled electron transport / enzyme regulator activity / reactive oxygen species metabolic process / aerobic respiration / central nervous system development / hippocampus development / respiratory electron transport chain / electron transport chain / mitochondrial intermembrane space / metalloendopeptidase activity / 2 iron, 2 sulfur cluster binding / NAD binding / fatty acid biosynthetic process / FMN binding / nervous system development / 4 iron, 4 sulfur cluster binding / electron transfer activity / mitochondrial inner membrane / oxidoreductase activity / nuclear body / mitochondrial matrix / copper ion binding / heme binding / mitochondrion / proteolysis / nucleoplasm / metal ion binding / membrane 類似検索 - 分子機能 | |||||||||
生物種 | ![]() ![]() | |||||||||
手法 | 単粒子再構成法 / クライオ電子顕微鏡法 / 解像度: 3.41 Å | |||||||||
![]() | Zhang Z / Maharjan R / Tringides M | |||||||||
資金援助 | ![]()
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![]() | ![]() タイトル: Respiratory supercomplex I+III2+IV open state 著者: Zhang Z / Maharjan R / Tringides M | |||||||||
履歴 |
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構造の表示
添付画像 |
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ダウンロードとリンク
-EMDBアーカイブ
マップデータ | ![]() | 241.1 MB | ![]() | |
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ヘッダ (付随情報) | ![]() ![]() | 81.6 KB 81.6 KB | 表示 表示 | ![]() |
画像 | ![]() | 102.4 KB | ||
Filedesc metadata | ![]() | 17.5 KB | ||
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-検証レポート
文書・要旨 | ![]() | 651.2 KB | 表示 | ![]() |
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文書・詳細版 | ![]() | 650.7 KB | 表示 | |
XML形式データ | ![]() | 7.6 KB | 表示 | |
CIF形式データ | ![]() | 9 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-関連構造データ
関連構造データ | ![]() 9ce2MC ![]() 45480 ![]() 45481 ![]() 45482 ![]() 45483 M: このマップから作成された原子モデル C: 同じ文献を引用 ( |
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類似構造データ | 類似検索 - 機能・相同性 ![]() |
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リンク
EMDBのページ | ![]() ![]() |
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「今月の分子」の関連する項目 |
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マップ
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投影像・断面図 | 画像のコントロール
画像は Spider により作成 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
ボクセルのサイズ | X=Y=Z: 1.07 Å | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
密度 |
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対称性 | 空間群: 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
詳細 | EMDB XML:
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-添付データ
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試料の構成要素
+全体 : Cryo-EM structure of respiratory supercomplex I+III2
+超分子 #1: Cryo-EM structure of respiratory supercomplex I+III2
+分子 #1: Cytochrome b-c1 complex subunit 6, mitochondrial
+分子 #2: Ubiquinol-cytochrome c reductase complex 7.2 kDa protein
+分子 #3: Ubiquinol-cytochrome c reductase, Rieske iron-sulfur polypeptide 1
+分子 #4: Cytochrome b-c1 complex subunit 10
+分子 #5: Cytochrome b-c1 complex subunit 2, mitochondrial
+分子 #6: Cytochrome b
+分子 #7: Cytochrome c1
+分子 #8: Cytochrome b-c1 complex subunit 7
+分子 #9: Cytochrome c oxidase subunit 6C
+分子 #10: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 5, mito...
+分子 #11: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 6
+分子 #12: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 8, mito...
+分子 #13: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 10
+分子 #14: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 11, mit...
+分子 #15: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 subunit C1, mitochondrial
+分子 #16: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 subunit C2
+分子 #17: NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 5
+分子 #18: NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 2
+分子 #19: NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 3
+分子 #20: NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L
+分子 #21: NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 6
+分子 #22: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 1
+分子 #23: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 4
+分子 #24: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 9
+分子 #25: NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4
+分子 #26: NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 1
+分子 #27: NADH dehydrogenase [ubiquinone] flavoprotein 1, mitochondrial
+分子 #28: NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 2, mitochondrial
+分子 #29: NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 3, mitochondrial
+分子 #30: NADH dehydrogenase [ubiquinone] flavoprotein 2, mitochondrial
+分子 #31: NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 6, mitochondrial
+分子 #32: NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 8, mitochondrial
+分子 #33: NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 7, mitochondrial
+分子 #34: NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 4, mitochondrial
+分子 #35: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 12
+分子 #36: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 5 isof...
+分子 #37: Acyl carrier protein
+分子 #38: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 2
+分子 #39: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 6
+分子 #40: NADH dehydrogenase [ubiquinone] flavoprotein 3, mitochondrial
+分子 #41: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 1
+分子 #42: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 3
+分子 #43: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 10, mi...
+分子 #44: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 11
+分子 #45: NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit A13
+分子 #46: NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit B2
+分子 #47: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 3
+分子 #48: NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 5
+分子 #49: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 8
+分子 #50: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 7
+分子 #51: Cytochrome b-c1 complex subunit 1, mitochondrial
+分子 #52: Cytochrome b-c1 complex subunit 8
+分子 #53: Cytochrome c oxidase subunit 8
+分子 #54: Cytochrome c oxidase subunit 7A1, mitochondrial
+分子 #55: Cytochrome c oxidase subunit 7B
+分子 #56: Cytochrome c oxidase subunit 7C, mitochondrial
+分子 #57: Cytochrome c oxidase subunit 1
+分子 #58: Cytochrome c oxidase subunit 2
+分子 #59: Cytochrome c oxidase subunit 3
+分子 #60: Cytochrome c oxidase subunit 4
+分子 #61: Cytochrome c oxidase subunit 5A, mitochondrial
+分子 #62: Cytochrome c oxidase subunit 5B, mitochondrial
+分子 #63: Cytochrome c oxidase subunit 6A2
+分子 #64: Cytochrome c oxidase subunit
+分子 #65: NADH-ubiquinone oxidoreductase 75 kDa subunit, mitochondrial
+分子 #66: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 9, mit...
+分子 #67: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 7
+分子 #68: FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER
+分子 #69: PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE
+分子 #70: HEME C
+分子 #71: FLAVIN MONONUCLEOTIDE
+分子 #72: IRON/SULFUR CLUSTER
+分子 #73: S-[2-({N-[(2S)-2-hydroxy-3,3-dimethyl-4-(phosphonooxy)butanoyl]-b...
+分子 #74: HEME-A
+分子 #75: NADPH DIHYDRO-NICOTINAMIDE-ADENINE-DINUCLEOTIDE PHOSPHATE
-実験情報
-構造解析
手法 | クライオ電子顕微鏡法 |
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![]() | 単粒子再構成法 |
試料の集合状態 | particle |
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試料調製
緩衝液 | pH: 7.5 |
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凍結 | 凍結剤: ETHANE |
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電子顕微鏡法
顕微鏡 | FEI TITAN KRIOS |
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撮影 | フィルム・検出器のモデル: GATAN K3 BIOQUANTUM (6k x 4k) 平均電子線量: 50.0 e/Å2 |
電子線 | 加速電圧: 300 kV / 電子線源: ![]() |
電子光学系 | 照射モード: FLOOD BEAM / 撮影モード: BRIGHT FIELD / 最大 デフォーカス(公称値): 1.5 µm / 最小 デフォーカス(公称値): 0.8 µm / 倍率(公称値): 81000 |
実験機器 | ![]() モデル: Titan Krios / 画像提供: FEI Company |