登録情報 | データベース: EMDB / ID: EMD-41596 |
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タイトル | KDL bound, nucleotide-free MsbA in open, outward-facing conformation |
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マップデータ | sharpened map |
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試料 | - 複合体: E. coli MsbA incubated with ATP for 6 hours
- タンパク質・ペプチド: ATP-binding transport protein MsbA
- リガンド: PENTAETHYLENE GLYCOL MONODECYL ETHER
- リガンド: (2~{R},4~{R},5~{R},6~{R})-6-[(1~{R})-1,2-bis(oxidanyl)ethyl]-2-[(2~{R},4~{R},5~{R},6~{R})-6-[(1~{R})-1,2-bis(oxidanyl)ethyl]-2-carboxy-2-[[(2~{R},3~{S},4~{R},5~{R},6~{R})-5-[[(3~{R})-3-dodecanoyloxytetradecanoyl]amino]-6-[[(2~{R},3~{S},4~{R},5~{R},6~{R})-3-oxidanyl-5-[[(3~{R})-3-oxidanyltetradecanoyl]amino]-4-[(3~{R})-3-oxidanyltetradecanoyl]oxy-6-phosphonooxy-oxan-2-yl]methoxy]-3-phosphonooxy-4-[(3~{R})-3-tetradecanoyloxytetradecanoyl]oxy-oxan-2-yl]methoxy]-5-oxidanyl-oxan-4-yl]oxy-4,5-bis(oxidanyl)oxane-2-carboxylic acid
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キーワード | ABC transporter / TRANSPORT PROTEIN |
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機能・相同性 | 機能・相同性情報
加水分解酵素; 酸無水物に作用; 酸無水物に作用・物質の膜輸送を触媒する / ATPase-coupled lipid transmembrane transporter activity / ABC-type transporter activity / ATP hydrolysis activity / ATP binding / membrane類似検索 - 分子機能 ABC transporter, lipid A-core flippase, MsbA / Type 1 protein exporter / ABC transporter transmembrane region / ABC transporter type 1, transmembrane domain / ABC transporter integral membrane type-1 fused domain profile. / ABC transporter type 1, transmembrane domain superfamily / ABC transporter-like, conserved site / ABC transporters family signature. / ABC transporter / ABC transporter-like, ATP-binding domain ...ABC transporter, lipid A-core flippase, MsbA / Type 1 protein exporter / ABC transporter transmembrane region / ABC transporter type 1, transmembrane domain / ABC transporter integral membrane type-1 fused domain profile. / ABC transporter type 1, transmembrane domain superfamily / ABC transporter-like, conserved site / ABC transporters family signature. / ABC transporter / ABC transporter-like, ATP-binding domain / ATP-binding cassette, ABC transporter-type domain profile. / ATPases associated with a variety of cellular activities / AAA+ ATPase domain / P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolase類似検索 - ドメイン・相同性 |
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生物種 | Escherichia coli (大腸菌) |
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手法 | 単粒子再構成法 / クライオ電子顕微鏡法 / 解像度: 2.68 Å |
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データ登録者 | Yang B / Zhang T / Lyu J / Laganowsky AD / Zhao M |
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資金援助 | 米国, 5件 Organization | Grant number | 国 |
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National Institutes of Health/National Institute of General Medical Sciences (NIH/NIGMS) | GM121751 | 米国 | National Institutes of Health/National Institute of General Medical Sciences (NIH/NIGMS) | GM139876 | 米国 | National Institutes of Health/National Institute of General Medical Sciences (NIH/NIGMS) | GM138863 | 米国 | National Institutes of Health/National Institute of General Medical Sciences (NIH/NIGMS) | GM145416 | 米国 | National Institutes of Health/National Institute of General Medical Sciences (NIH/NIGMS) | GM143052 | 米国 |
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引用 | ジャーナル: To Be Published タイトル: Native mass spectrometry captures snapshots of the MsbA transport cycle 著者: Zhang T / Lyu J / Yang B / Zhao M / Laganowsky AD |
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履歴 | 登録 | 2023年8月11日 | - |
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ヘッダ(付随情報) 公開 | 2024年6月19日 | - |
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マップ公開 | 2024年6月19日 | - |
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更新 | 2024年6月19日 | - |
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現状 | 2024年6月19日 | 処理サイト: RCSB / 状態: 公開 |
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