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基本情報
登録情報 | ![]() | |||||||||
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タイトル | Human SLC26A3 in the apo state | |||||||||
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![]() | Transporter / MEMBRANE PROTEIN | |||||||||
機能・相同性 | ![]() Defective SLC26A3 causes congenital secretory chloride diarrhea 1 (DIAR1) / Multifunctional anion exchangers / sulfate transmembrane transporter activity / secondary active sulfate transmembrane transporter activity / oxalate transmembrane transporter activity / intracellular pH elevation / chloride:bicarbonate antiporter activity / solute:inorganic anion antiporter activity / membrane hyperpolarization / bicarbonate transmembrane transporter activity ...Defective SLC26A3 causes congenital secretory chloride diarrhea 1 (DIAR1) / Multifunctional anion exchangers / sulfate transmembrane transporter activity / secondary active sulfate transmembrane transporter activity / oxalate transmembrane transporter activity / intracellular pH elevation / chloride:bicarbonate antiporter activity / solute:inorganic anion antiporter activity / membrane hyperpolarization / bicarbonate transmembrane transporter activity / monoatomic anion transport / chloride transmembrane transporter activity / sperm capacitation / monoatomic ion transport / cellular response to cAMP / sperm midpiece / brush border membrane / apical plasma membrane / membrane / plasma membrane 類似検索 - 分子機能 | |||||||||
生物種 | ![]() | |||||||||
手法 | 単粒子再構成法 / クライオ電子顕微鏡法 / 解像度: 3.5 Å | |||||||||
![]() | Li XR / Chi XM / Zhang YY / Zhou Q | |||||||||
資金援助 | ![]()
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![]() | ![]() タイトル: Human SLC26A3 in the apo state 著者: Li XR / Chi XM / Zhang YY / Zhou Q | |||||||||
履歴 |
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構造の表示
添付画像 |
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ダウンロードとリンク
-EMDBアーカイブ
マップデータ | ![]() | 28.5 MB | ![]() | |
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ヘッダ (付随情報) | ![]() ![]() | 13 KB 13 KB | 表示 表示 | ![]() |
画像 | ![]() | 51.9 KB | ||
Filedesc metadata | ![]() | 5.3 KB | ||
その他 | ![]() ![]() | 22.3 MB 22.3 MB | ||
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-関連構造データ
関連構造データ | ![]() 8ietMC M: このマップから作成された原子モデル C: 同じ文献を引用 ( |
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類似構造データ | 類似検索 - 機能・相同性 ![]() |
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リンク
EMDBのページ | ![]() ![]() |
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「今月の分子」の関連する項目 |
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マップ
ファイル | ![]() | ||||||||||||||||||||
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ボクセルのサイズ | X=Y=Z: 1.077 Å | ||||||||||||||||||||
密度 |
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対称性 | 空間群: 1 | ||||||||||||||||||||
詳細 | EMDB XML:
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-添付データ
-ハーフマップ: #1
ファイル | emd_35393_half_map_1.map | ||||||||||||
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投影像・断面図 |
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密度ヒストグラム |
-ハーフマップ: #2
ファイル | emd_35393_half_map_2.map | ||||||||||||
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投影像・断面図 |
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密度ヒストグラム |
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試料の構成要素
-全体 : Human SLC26A3 in the apo state
全体 | 名称: Human SLC26A3 in the apo state |
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要素 |
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-超分子 #1: Human SLC26A3 in the apo state
超分子 | 名称: Human SLC26A3 in the apo state / タイプ: cell / ID: 1 / 親要素: 0 / 含まれる分子: all |
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由来(天然) | 生物種: ![]() |
-分子 #1: Chloride anion exchanger
分子 | 名称: Chloride anion exchanger / タイプ: protein_or_peptide / ID: 1 / コピー数: 2 / 光学異性体: LEVO |
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由来(天然) | 生物種: ![]() |
分子量 | 理論値: 84.591523 KDa |
組換発現 | 生物種: ![]() |
配列 | 文字列: MIEPFGNQYI VARPVYSTNA FEENHKKTGR HHKTFLDHLK VCCSCSPQKA KRIVLSLFPI ASWLPAYRLK EWLLSDIVSG ISTGIVAVL QGLAFALLVD IPPVYGLYAS FFPAIIYLFF GTSRHISVGP FPILSMMVGL AVSGAVSKAV PDRNATTLGL P NNSNNSSL ...文字列: MIEPFGNQYI VARPVYSTNA FEENHKKTGR HHKTFLDHLK VCCSCSPQKA KRIVLSLFPI ASWLPAYRLK EWLLSDIVSG ISTGIVAVL QGLAFALLVD IPPVYGLYAS FFPAIIYLFF GTSRHISVGP FPILSMMVGL AVSGAVSKAV PDRNATTLGL P NNSNNSSL LDDERVRVAA AASVTVLSGI IQLAFGILRI GFVVIYLSES LISGFTTAAA VHVLVSQLKF IFQLTVPSHT DP VSIFKVL YSVFSQIEKT NIADLVTALI VLLVVSIVKE INQRFKDKLP VPIPIEFIMT VIAAGVSYGC DFKNRFKVAV VGD MNPGFQ PPITPDVETF QNTVGDCFGI AMVAFAVAFS VASVYSLKYD YPLDGNQELI ALGLGNIVCG VFRGFAGSTA LSRS AVQES TGGKTQIAGL IGAIIVLIVV LAIGFLLAPL QKSVLAALAL GNLKGMLMQF AEIGRLWRKD KYDCLIWIMT FIFTI VLGL GLGLAASVAF QLLTIVFRTQ FPKCSTLANI GRTNIYKNKK DYYDMYEPEG VKIFRCPSPI YFANIGFFRR KLIDAV GFS PLRILRKRNK ALRKIRKLQK QGLLQVTPKG FICTVDTIKD SDEELDNNQI EVLDQPINTT DLPFHIDWND DLPLNIE VP KISLHSLILD FSAVSFLDVS SVRGLKSILQ EFIRIKVDVY IVGTDDDFIE KLNRYEFFDG EVKSSIFFLT IHDAVLHI L MKKDYSTSKF NPSQEKDGKI DFTINTNGGL RNRVYEVPVE TKF UniProtKB: Chloride anion exchanger |
-実験情報
-構造解析
手法 | クライオ電子顕微鏡法 |
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![]() | 単粒子再構成法 |
試料の集合状態 | particle |
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試料調製
緩衝液 | pH: 7.4 |
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凍結 | 凍結剤: ETHANE |
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電子顕微鏡法
顕微鏡 | FEI TITAN KRIOS |
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撮影 | フィルム・検出器のモデル: GATAN K3 (6k x 4k) / 平均電子線量: 50.0 e/Å2 |
電子線 | 加速電圧: 300 kV / 電子線源: ![]() |
電子光学系 | 照射モード: FLOOD BEAM / 撮影モード: BRIGHT FIELD / 最大 デフォーカス(公称値): 2.2 µm / 最小 デフォーカス(公称値): 1.2 µm |
実験機器 | ![]() モデル: Titan Krios / 画像提供: FEI Company |
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画像解析
初期モデル | モデルのタイプ: NONE |
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最終 再構成 | 解像度のタイプ: BY AUTHOR / 解像度: 3.5 Å / 解像度の算出法: FSC 0.143 CUT-OFF / ソフトウェア - 名称: RELION / 使用した粒子像数: 142727 |
初期 角度割当 | タイプ: ANGULAR RECONSTITUTION |
最終 角度割当 | タイプ: MAXIMUM LIKELIHOOD |