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基本情報
登録情報 | ![]() | |||||||||
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タイトル | MAVS fibrils surrounding the mitochondria | |||||||||
![]() | representative tomogram of 293T mCherry-MAVS overexpression sample | |||||||||
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![]() | innate immunity / fibrils / IMMUNE SYSTEM | |||||||||
生物種 | ![]() | |||||||||
手法 | 電子線トモグラフィー法 / クライオ電子顕微鏡法 | |||||||||
![]() | Wang P / Guo Q | |||||||||
資金援助 | ![]()
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![]() | ![]() タイトル: MAVS fibrils surrounding the mitochondria 著者: Wang P / Guo Q | |||||||||
履歴 |
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構造の表示
添付画像 |
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ダウンロードとリンク
-EMDBアーカイブ
マップデータ | ![]() | 154.3 MB | ![]() | |
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ヘッダ (付随情報) | ![]() ![]() | 9.1 KB 9.1 KB | 表示 表示 | ![]() |
画像 | ![]() | 240.7 KB | ||
Filedesc metadata | ![]() | 3.4 KB | ||
その他 | ![]() | 131.4 MB | ||
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-検証レポート
文書・要旨 | ![]() | 589.3 KB | 表示 | ![]() |
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文書・詳細版 | ![]() | 588.9 KB | 表示 | |
XML形式データ | ![]() | 5 KB | 表示 | |
CIF形式データ | ![]() | 5.6 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
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リンク
EMDBのページ | ![]() ![]() |
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マップ
ファイル | ![]() | ||||||||||||||||||||
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注釈 | representative tomogram of 293T mCherry-MAVS overexpression sample | ||||||||||||||||||||
ボクセルのサイズ | X=Y=Z: 27.488 Å | ||||||||||||||||||||
密度 |
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対称性 | 空間群: 1 | ||||||||||||||||||||
詳細 | EMDB XML:
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-添付データ
-追加マップ: representative tomogram of 293T mCherry-MAVS-KI sample
ファイル | emd_35019_additional_1.map | ||||||||||||
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注釈 | representative tomogram of 293T mCherry-MAVS-KI sample | ||||||||||||
投影像・断面図 |
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密度ヒストグラム |
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試料の構成要素
-全体 : MAVS fibrils in situ
全体 | 名称: MAVS fibrils in situ |
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要素 |
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-超分子 #1: MAVS fibrils in situ
超分子 | 名称: MAVS fibrils in situ / タイプ: cell / ID: 1 / 親要素: 0 |
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由来(天然) | 生物種: ![]() |
-実験情報
-構造解析
手法 | クライオ電子顕微鏡法 |
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![]() | 電子線トモグラフィー法 |
試料の集合状態 | cell |
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試料調製
緩衝液 | pH: 7.4 |
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凍結 | 凍結剤: ETHANE |
切片作成 | 集束イオンビーム - 装置: OTHER / 集束イオンビーム - イオン: OTHER / 集束イオンビーム - 電圧: 30 / 集束イオンビーム - 電流: 1 / 集束イオンビーム - 時間: 0.5 / 集束イオンビーム - 温度: 83 K / 集束イオンビーム - Initial thickness: 10000 / 集束イオンビーム - 最終 厚さ: 200 集束イオンビーム - 詳細: The value given for _em_focused_ion_beam.instrument is Aquilos 2. This is not in a list of allowed values {'OTHER', 'DB235'} so OTHER is written into the XML file. |
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電子顕微鏡法
顕微鏡 | FEI TITAN KRIOS |
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撮影 | フィルム・検出器のモデル: GATAN K3 (6k x 4k) / 平均電子線量: 110.0 e/Å2 |
電子線 | 加速電圧: 300 kV / 電子線源: ![]() |
電子光学系 | 照射モード: OTHER / 撮影モード: BRIGHT FIELD / 最大 デフォーカス(公称値): 7.0 µm / 最小 デフォーカス(公称値): 5.0 µm |
実験機器 | ![]() モデル: Titan Krios / 画像提供: FEI Company |
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画像解析
最終 再構成 | 使用した粒子像数: 60 |
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