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基本情報
登録情報 | ![]() | |||||||||
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タイトル | Prefusion spike of BA.2.3 with all-RBD-down conformation | |||||||||
![]() | Prefusion Spike of BA.2.3 with all RBD down conformation | |||||||||
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![]() | Cryo-ET / Subtomogram averaging / Omicron / prefusion spike / VIRAL PROTEIN | |||||||||
生物種 | ![]() ![]() | |||||||||
手法 | サブトモグラム平均法 / クライオ電子顕微鏡法 / 解像度: 7.3 Å | |||||||||
![]() | Gao YZ / Ma XY / Liu Z | |||||||||
資金援助 | ![]()
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![]() | ![]() タイトル: Prefusion Spike Protein of SARS-CoV-2 sublineage BA.1.1 in RBD down conformation 著者: Gao YZ / Ma XY / Liu Z | |||||||||
履歴 |
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構造の表示
添付画像 |
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ダウンロードとリンク
-EMDBアーカイブ
マップデータ | ![]() | 3.2 MB | ![]() | |
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ヘッダ (付随情報) | ![]() ![]() | 11.8 KB 11.8 KB | 表示 表示 | ![]() |
FSC (解像度算出) | ![]() | 3.5 KB | 表示 | ![]() |
画像 | ![]() | 33.5 KB | ||
その他 | ![]() ![]() | 2.4 MB 2.4 MB | ||
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-検証レポート
文書・要旨 | ![]() | 916.4 KB | 表示 | ![]() |
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文書・詳細版 | ![]() | 916 KB | 表示 | |
XML形式データ | ![]() | 9.5 KB | 表示 | |
CIF形式データ | ![]() | 11.9 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-関連構造データ
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リンク
EMDBのページ | ![]() ![]() |
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マップ
ファイル | ![]() | ||||||||||||||||||||
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注釈 | Prefusion Spike of BA.2.3 with all RBD down conformation | ||||||||||||||||||||
ボクセルのサイズ | X=Y=Z: 2.66 Å | ||||||||||||||||||||
密度 |
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対称性 | 空間群: 1 | ||||||||||||||||||||
詳細 | EMDB XML:
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-添付データ
-ハーフマップ: Prefusion Spike of BA.2.3 with all RBD down conformation, half map
ファイル | emd_34343_half_map_1.map | ||||||||||||
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注釈 | Prefusion Spike of BA.2.3 with all RBD down conformation, half map | ||||||||||||
投影像・断面図 |
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密度ヒストグラム |
-ハーフマップ: Prefusion Spike of BA.2.3 with all RBD down conformation, half map
ファイル | emd_34343_half_map_2.map | ||||||||||||
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注釈 | Prefusion Spike of BA.2.3 with all RBD down conformation, half map | ||||||||||||
投影像・断面図 |
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密度ヒストグラム |
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試料の構成要素
-全体 : Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2
全体 | 名称: ![]() ![]() |
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要素 |
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-超分子 #1: Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2
超分子 | 名称: Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 / タイプ: complex / ID: 1 / 親要素: 0 |
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由来(天然) | 生物種: ![]() ![]() 株: BA.1.1 |
-実験情報
-構造解析
手法 | クライオ電子顕微鏡法 |
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![]() | サブトモグラム平均法 |
試料の集合状態 | particle |
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試料調製
緩衝液 | pH: 7.4 |
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凍結 | 凍結剤: ETHANE |
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電子顕微鏡法
顕微鏡 | FEI TITAN KRIOS |
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撮影 | フィルム・検出器のモデル: GATAN K3 BIOQUANTUM (6k x 4k) 平均電子線量: 3.0 e/Å2 |
電子線 | 加速電圧: 300 kV / 電子線源: ![]() |
電子光学系 | 照射モード: FLOOD BEAM / 撮影モード: BRIGHT FIELD / Cs: 2.7 mm / 最大 デフォーカス(公称値): 5.0 µm / 最小 デフォーカス(公称値): 3.0 µm |
試料ステージ | 試料ホルダーモデル: FEI TITAN KRIOS AUTOGRID HOLDER ホルダー冷却材: NITROGEN |
実験機器 | ![]() モデル: Titan Krios / 画像提供: FEI Company |