+
データを開く
-
基本情報
登録情報 | データベース: EMDB / ID: EMD-30365 | |||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
タイトル | Cryo-electron tomography of an inhibitory synapse in cultured rat hippocampal neurons | |||||||||
![]() | ||||||||||
![]() |
| |||||||||
生物種 | ![]() ![]() | |||||||||
手法 | 電子線トモグラフィー法 / クライオ電子顕微鏡法 | |||||||||
![]() | Tao C-L / Liu Y-T / Sun R / Zhang B / Qi L / Shivakoti S / Tian C-L / Zhang P / Lau P-M / Zhou ZH / Bi G-Q | |||||||||
資金援助 | ![]()
| |||||||||
![]() | ![]() タイトル: Differentiation and Characterization of Excitatory and Inhibitory Synapses by Cryo-electron Tomography and Correlative Microscopy. 著者: Tao CL / Liu YT / Sun R / Zhang B / Qi L / Shivakoti S / Tian CL / Zhang P / Lau PM / Zhou ZH / Bi GQ | |||||||||
履歴 |
|
-
構造の表示
ムービー |
![]() |
---|---|
添付画像 |
-
ダウンロードとリンク
-EMDBアーカイブ
マップデータ | ![]() | 70.9 MB | ![]() | |
---|---|---|---|---|
ヘッダ (付随情報) | ![]() ![]() | 8.7 KB 8.7 KB | 表示 表示 | ![]() |
画像 | ![]() | 242.1 KB | ||
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-検証レポート
文書・要旨 | ![]() | 293.3 KB | 表示 | ![]() |
---|---|---|---|---|
文書・詳細版 | ![]() | 292.8 KB | 表示 | |
XML形式データ | ![]() | 4.5 KB | 表示 | |
CIF形式データ | ![]() | 5.4 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-
リンク
EMDBのページ | ![]() ![]() |
---|
-
マップ
ファイル | ![]() | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
ボクセルのサイズ | X=Y=Z: 26.1 Å | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
密度 |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
対称性 | 空間群: 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
詳細 | EMDB XML:
CCP4マップ ヘッダ情報:
|
-添付データ
-
試料の構成要素
-全体 : hippocampal neuronal synapse
全体 | 名称: hippocampal neuronal synapse |
---|---|
要素 |
|
-超分子 #1: hippocampal neuronal synapse
超分子 | 名称: hippocampal neuronal synapse / タイプ: cell / ID: 1 / 親要素: 0 詳細: excitatory synapse in cultured rat hippocampal neurons |
---|---|
由来(天然) | 生物種: ![]() ![]() |
-実験情報
-構造解析
手法 | クライオ電子顕微鏡法 |
---|---|
![]() | 電子線トモグラフィー法 |
試料の集合状態 | cell |
-
試料調製
緩衝液 | pH: 7.3 |
---|---|
凍結 | 凍結剤: ETHANE |
切片作成 | その他: NO SECTIONING |
位置合わせマーカー | Manufacturer: Center for Molecular Medicine | University Medical Center Utrecht 直径: 15 nm |
-
電子顕微鏡法
顕微鏡 | FEI TITAN KRIOS |
---|---|
撮影 | フィルム・検出器のモデル: GATAN K2 QUANTUM (4k x 4k) 検出モード: COUNTING / 平均電子線量: 2.5 e/Å2 |
電子線 | 加速電圧: 300 kV / 電子線源: ![]() |
電子光学系 | C2レンズ絞り径: 70.0 µm / 照射モード: FLOOD BEAM / 撮影モード: BRIGHT FIELD / Cs: 2.7 mm / 最大 デフォーカス(公称値): 1.0 µm / 最小 デフォーカス(公称値): 0.5 µm |
試料ステージ | 試料ホルダーモデル: FEI TITAN KRIOS AUTOGRID HOLDER ホルダー冷却材: NITROGEN |
実験機器 | ![]() モデル: Titan Krios / 画像提供: FEI Company |
-
画像解析
最終 再構成 | アルゴリズム: SIMULTANEOUS ITERATIVE (SIRT) / ソフトウェア - 名称: ![]() |
---|