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- EMDB-29647: Body1 of G4 RNA-mediated PRC2 dimer from multibody refinement -

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基本情報

登録情報
データベース: EMDB / ID: EMD-29647
タイトルBody1 of G4 RNA-mediated PRC2 dimer from multibody refinement
マップデータ
試料
  • 複合体: G4 RNA-mediated dimer of polycomb repressive complex 2
    • タンパク質・ペプチド: Polycomb protein SUZ12ポリコーム群タンパク質
    • タンパク質・ペプチド: Polycomb protein EED
    • タンパク質・ペプチド: Histone-binding protein RBBP4
    • タンパク質・ペプチド: Histone-lysine N-methyltransferase EZH2
    • タンパク質・ペプチド: protein Jumonji isoform X3
    • タンパク質・ペプチド: Zinc finger protein AEBP2ジンクフィンガー
    • RNA: G4 RNA
キーワードPRC2 (PRC2) / G-quadruplex RNA / RNP complex / chromatin modifier / GENE REGULATION (遺伝子発現の調節)
生物種Homo sapiens (ヒト)
手法単粒子再構成法 / クライオ電子顕微鏡法 / 解像度: 3.3 Å
データ登録者Jiarui JS / Vignesh VK
資金援助 米国, 2件
OrganizationGrant number国
Howard Hughes Medical Institute (HHMI) 米国
National Institutes of Health/National Institute of General Medical Sciences (NIH/NIGMS)R00GM132544 米国
引用ジャーナル: Science / 年: 2023
タイトル: Structural basis for inactivation of PRC2 by G-quadruplex RNA.
著者: Jiarui Song / Anne R Gooding / Wayne O Hemphill / Brittney D Love / Anne Robertson / Liqi Yao / Leonard I Zon / Trista E North / Vignesh Kasinath / Thomas R Cech /
要旨: Polycomb repressive complex 2 (PRC2) silences genes through trimethylation of histone H3K27. PRC2 associates with numerous precursor messenger RNAs (pre-mRNAs) and long noncoding RNAs (lncRNAs) with ...Polycomb repressive complex 2 (PRC2) silences genes through trimethylation of histone H3K27. PRC2 associates with numerous precursor messenger RNAs (pre-mRNAs) and long noncoding RNAs (lncRNAs) with a binding preference for G-quadruplex RNA. In this work, we present a 3.3-Å-resolution cryo-electron microscopy structure of PRC2 bound to a G-quadruplex RNA. Notably, RNA mediates the dimerization of PRC2 by binding both protomers and inducing a protein interface composed of two copies of the catalytic subunit EZH2, thereby blocking nucleosome DNA interaction and histone H3 tail accessibility. Furthermore, an RNA-binding loop of EZH2 facilitates the handoff between RNA and DNA, another activity implicated in PRC2 regulation by RNA. We identified a gain-of-function mutation in this loop that activates PRC2 in zebrafish. Our results reveal mechanisms for RNA-mediated regulation of a chromatin-modifying enzyme.
履歴
登録2023年1月31日-
ヘッダ(付随情報) 公開2023年10月4日-
マップ公開2023年10月4日-
更新2023年10月4日-
現状2023年10月4日処理サイト: RCSB / 状態: 公開

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構造の表示

添付画像

emd_29647.png

ダウンロードとリンク

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マップ

ファイルダウンロード / ファイル: emd_29647.map.gz / 形式: CCP4 / 大きさ: 103 MB / タイプ: IMAGE STORED AS FLOATING POINT NUMBER (4 BYTES)
ボクセルのサイズX=Y=Z: 1.06344 Å
密度
表面レベル登録者による: 0.015
最小 - 最大-0.016353995 - 0.05215779
平均 (標準偏差)0.00022294959 (±0.0018041022)
対称性空間群: 1
詳細

EMDB XML:

マップ形状
Axis orderXYZ
Origin000
サイズ300300300
Spacing300300300
セルA=B=C: 319.03198 Å
α=β=γ: 90.0 °

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添付データ

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マスク #1

ファイルemd_29647_msk_1.map
投影像・断面図
軸ZYX

投影像

断面 (1/2)
密度ヒストグラム

ヒストグラム

ヒストグラム (対数)

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追加マップ: #1

ファイルemd_29647_additional_1.map
投影像・断面図
軸ZYX

投影像

断面 (1/2)
密度ヒストグラム

ヒストグラム

ヒストグラム (対数)

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ハーフマップ: #1

ファイルemd_29647_half_map_1.map
投影像・断面図
軸ZYX

投影像

断面 (1/2)
密度ヒストグラム

ヒストグラム

ヒストグラム (対数)

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ハーフマップ: #2

ファイルemd_29647_half_map_2.map
投影像・断面図
軸ZYX

投影像

断面 (1/2)
密度ヒストグラム

ヒストグラム

ヒストグラム (対数)

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試料の構成要素

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全体 : G4 RNA-mediated dimer of polycomb repressive complex 2

全体名称: G4 RNA-mediated dimer of polycomb repressive complex 2
要素
  • 複合体: G4 RNA-mediated dimer of polycomb repressive complex 2
    • タンパク質・ペプチド: Polycomb protein SUZ12ポリコーム群タンパク質
    • タンパク質・ペプチド: Polycomb protein EED
    • タンパク質・ペプチド: Histone-binding protein RBBP4
    • タンパク質・ペプチド: Histone-lysine N-methyltransferase EZH2
    • タンパク質・ペプチド: protein Jumonji isoform X3
    • タンパク質・ペプチド: Zinc finger protein AEBP2ジンクフィンガー
    • RNA: G4 RNA

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超分子 #1: G4 RNA-mediated dimer of polycomb repressive complex 2

超分子名称: G4 RNA-mediated dimer of polycomb repressive complex 2
タイプ: complex / ID: 1 / 親要素: 0 / 含まれる分子: all
由来(天然)生物種: Homo sapiens (ヒト)

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分子 #1: Polycomb protein SUZ12

分子名称: Polycomb protein SUZ12 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Homo sapiens (ヒト)
配列文字列: MAPQKHGGGG GGGSGPSAGS GGGGFGGSAA VAAATASGGK SGGGSCGGGG SYSASSSSSA AAAAGAAVLP VKKPKMEHVQ ADHELFLQA FEKPTQIYRF LRTRNLIAPI FLHRTLTYMS HRNSRTNIKR KTFKVDDMLS KVEKMKGEQE SHSLSAHLQL T FTGFFHKN ...文字列:
MAPQKHGGGG GGGSGPSAGS GGGGFGGSAA VAAATASGGK SGGGSCGGGG SYSASSSSSA AAAAGAAVLP VKKPKMEHVQ ADHELFLQA FEKPTQIYRF LRTRNLIAPI FLHRTLTYMS HRNSRTNIKR KTFKVDDMLS KVEKMKGEQE SHSLSAHLQL T FTGFFHKN DKPSPNSENE QNSVTLEVLL VKVCHKKRKD VSCPIRQVPT GKKQVPLNPD LNQTKPGNFP SLAVSSNEFE PS NSHMVKS YSLLFRVTRP GRREFNGMIN GETNENIDVN EELPARRKRN REDGEKTFVA QMTVFDKNRR LQLLDGEYEV AMQ EMEECP ISKKRATWET ILDGKRLPPF ETFSQGPTLQ FTLRWTGETN DKSTAPIAKP LATRNSESLH QENKPGSVKP TQTI AVKES LTTDLQTRKE KDTPNENRQK LRIFYQFLYN NNTRQQTEAR DDLHCPWCTL NCRKLYSLLK HLKLCHSRFI FNYVY HPKG ARIDVSINEC YDGSYAGNPQ DIHRQPGFAF SRNGPVKRTP ITHILVCRPK RTKASMSEFL ESEDGEVEQQ RTYSSG HNR LYFHSDTCLP LRPQEMEVDS EDEKDPEWLR EKTITQIEEF SDVNEGEKEV MKLWNLHVMK HGFIADNQMN HACMLFV EN YGQKIIKKNL CRNFMLHLVS MHDFNLISIM SIDKAVTKLR EMQQKLEKGE SASPANEEIT EEQNGTANGF SEINSKEK A LETDSVSGVS KQSKKQKL

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分子 #2: Polycomb protein EED

分子名称: Polycomb protein EED / タイプ: protein_or_peptide / ID: 2 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Homo sapiens (ヒト)
配列文字列: MSEREVSTAP AGTDMPAAKK QKLSSDENSN PDLSGDENDD AVSIESGTNT ERPDTPTNTP NAPGRKSWGK GKWKSKKCKY SFKCVNSLK EDHNQPLFGV QFNWHSKEGD PLVFATVGSN RVTLYECHSQ GEIRLLQSYV DADADENFYT CAWTYDSNTS H PLLAVAGS ...文字列:
MSEREVSTAP AGTDMPAAKK QKLSSDENSN PDLSGDENDD AVSIESGTNT ERPDTPTNTP NAPGRKSWGK GKWKSKKCKY SFKCVNSLK EDHNQPLFGV QFNWHSKEGD PLVFATVGSN RVTLYECHSQ GEIRLLQSYV DADADENFYT CAWTYDSNTS H PLLAVAGS RGIIRIINPI TMQCIKHYVG HGNAINELKF HPRDPNLLLS VSKDHALRLW NIQTDTLVAI FGGVEGHRDE VL SADYDLL GEKIMSCGMD HSLKLWRINS KRMMNAIKES YDYNPNKTNR PFISQKIHFP DFSTRDIHRN YVDCVRWLGD LIL SKSCEN AIVCWKPGKM EDDIDKIKPS ESNVTILGRF DYSQCDIWYM RFSMDFWQKM LALGNQVGKL YVWDLEVEDP HKAK CTTLT HHKCGAAIRQ TSFSRDSSIL IAVCDDASIW RWDRLR

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分子 #3: Histone-binding protein RBBP4

分子名称: Histone-binding protein RBBP4 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 3 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Homo sapiens (ヒト)
配列文字列: MADKEAAFDD AVEERVINEE YKIWKKNTPF LYDLVMTHAL EWPSLTAQWL PDVTRPEGKD FSIHRLVLGT HTSDEQNHLV IASVQLPND DAQFDASHYD SEKGEFGGFG SVSGKIEIEI KINHEGEVNR ARYMPQNPCI IATKTPSSDV LVFDYTKHPS K PDPSGECN ...文字列:
MADKEAAFDD AVEERVINEE YKIWKKNTPF LYDLVMTHAL EWPSLTAQWL PDVTRPEGKD FSIHRLVLGT HTSDEQNHLV IASVQLPND DAQFDASHYD SEKGEFGGFG SVSGKIEIEI KINHEGEVNR ARYMPQNPCI IATKTPSSDV LVFDYTKHPS K PDPSGECN PDLRLRGHQK EGYGLSWNPN LSGHLLSASD DHTICLWDIS AVPKEGKVVD AKTIFTGHTA VVEDVSWHLL HE SLFGSVA DDQKLMIWDT RSNNTSKPSH SVDAHTAEVN CLSFNPYSEF ILATGSADKT VALWDLRNLK LKLHSFESHK DEI FQVQWS PHNETILASS GTDRRLNVWD LSKIGEEQSP EDAEDGPPEL LFIHGGHTAK ISDFSWNPNE PWVICSVSED NIMQ VWQMA ENIYNDEDPE GSVDPEGQGS

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分子 #4: Histone-lysine N-methyltransferase EZH2

分子名称: Histone-lysine N-methyltransferase EZH2 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 4 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Homo sapiens (ヒト)
配列文字列: MGQTGKKSEK GPVCWRKRVK SEYMRLRQLK RFRRADEVKS MFSSNRQKIL ERTEILNQEW KQRRIQPVHI LTSVSSLRGT RECSVTSDL DFPTQVIPLK TLNAVASVPI MYSWSPLQQN FMVEDETVLH NIPYMGDEVL DQDGTFIEEL IKNYDGKVHG D RECGFIND ...文字列:
MGQTGKKSEK GPVCWRKRVK SEYMRLRQLK RFRRADEVKS MFSSNRQKIL ERTEILNQEW KQRRIQPVHI LTSVSSLRGT RECSVTSDL DFPTQVIPLK TLNAVASVPI MYSWSPLQQN FMVEDETVLH NIPYMGDEVL DQDGTFIEEL IKNYDGKVHG D RECGFIND EIFVELVNAL GQYNDDDDDD DGDDPEEREE KQKDLEDHRD DKESRPPRKF PSDKIFEAIS SMFPDKGTAE EL KEKYKEL TEQQLPGALP PECTPNIDGP NAKSVQREQS LHSFHTLFCR RCFKYDCFLH RKCNYSFHAT PNTYKRKNTE TAL DNKPCG PQCYQHLEGA KEFAAALTAE RIKTPPKRPG GRRRGRLPNN SSRPSTPTIN VLESKDTDSD REAGTETGGE NNDK EEEEK KDETSSSSEA NSRCQTPIKM KPNIEPPENV EWSGAEASMF RVLIGTYYDN FCAIARLIGT KTCRQVYEFR VKESS IIAP APAEDVDTPP RKKKRKHRLW AAHCRKIQLK KDGSSNHVYN YQPCDHPRQP CDSSCPCVIA QNFCEKFCQC SSECQN RFP GCRCKAQCNT KQCPCYLAVR ECDPDLCLTC GAADHWDSKN VSCKNCSIQR GSKKHLLLAP SDVAGWGIFI KDPVQKN EF ISEYCGEIIS QDEADRRGKV YDKYMCSFLF NLNNDFVVDA TRKGNKIRFA NHSVNPNCYA KVMMVNGDHR IGIFAKRA I QTGEELFFDY RYSQADALKY VGIEREMEIP

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分子 #5: protein Jumonji isoform X3

分子名称: protein Jumonji isoform X3 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 5 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Homo sapiens (ヒト)
配列文字列: MSKERPKRNI IQKKYDDSDG IPWSEERVVR KVLYLSLKEF KNAQKRQHGE GIAGSLKSVN GLLGNDQSKA LGPASEQSEN EKDDASQVS STSNDVSSSD FEEGPSRKRP RLQAQRKFAQ SQPNSPSTTP VKTVEPLLPP PATQISDLSK RKPKTEDFLT F LCLRGSPA ...文字列:
MSKERPKRNI IQKKYDDSDG IPWSEERVVR KVLYLSLKEF KNAQKRQHGE GIAGSLKSVN GLLGNDQSKA LGPASEQSEN EKDDASQVS STSNDVSSSD FEEGPSRKRP RLQAQRKFAQ SQPNSPSTTP VKTVEPLLPP PATQISDLSK RKPKTEDFLT F LCLRGSPA LPSSMVYFGS SQDEEDVEEE DDETEDVKTA NNNASSSCQS TPRKGKTHKH VHNGHVFNGS NRSTREKEPA QK HKSKETT PAKEKHIDHR ADSRREPASV AQPTATPSAG SLAKGLPANH QPPPPHRSAQ DLRKQVTLHV SKVNGVTRMS SLG AGTTSA KKIREVRPSP SKTVKYTATV TKGTVTYTKA KRELVKETKP THHKPSSAVN HTISGKTESS NAKTRKQVLS LGGA STSTG PAASGLKASS RLNPKSCTKE VGGRQLREGL RNSKRRLEEA QQVDKPQSPP KKMKGAAGIA EAPGKKASAA SAEKS LLNG HVKKEVPERS LERNRPKRAT AGKNMPGKQA HGKAEGTPCE NRSTSQPESS HKPHDPQGKP EKGIGKSGWT AMDEIP VLR PSAKEFHDPL IYIESVRAQV EKYGMCRVIP PPDWRPECKL NDEMRFVTQI QHIHKLGRRW GPNVQRLACI KKHLRSQ GI TMDELPLIGG CELDLACFFR LINEMGGMQQ VTDLKKWNKL ADMLRIPKTA QDRLAKLQEA YCQYLLSYDS LSPEEHRR L EKEVLMEKEI LEKRKGPLEG HTENDHHKFH SLPRFEPKNG LIHGVTPRNG FRSKLKEVGQ APLKTGRRRL FAQEKEVVK EEEEDKGVLN DFHKCIYKGR SVSLTTFYRT ARNIMNMCFS KEPAPAEIEQ EYWRLVEEKD CHVAVHCGKV DTNTHGSGFP VGKSEPFSR HGWNLTVLPN NTGSILRHLG AVPGVTIPWL NIGMVFSTSC WSRDQNHLPY IDYLHTGADC IWYCIPAEEE N KLEDVVHT LLQANGTPGL QMLESNVMIS PEVLCKEGIK VHRTVQQSGQ FVVCFPGSFV SKVCCGYSVS ETVHFATTQW TS MGFETAK EMKRRHIAKP FSMEKLLYQI AQAEAKKENG PTLSTISALL DELRDTELRQ RRQLFEAGLH SSARYGSHDG NST VADGKK KPRKWLQLET SERRCQICQH LCYLSMVVQE NENVVFCLEC ALRHVEKQKS CRGLKLMYRY DEEQIISLVN QICG KVSGK HGGIENCLNK PTPKRGPRKR ATVDVPPSRL PSS

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分子 #6: Zinc finger protein AEBP2

分子名称: Zinc finger protein AEBP2 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 6 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Homo sapiens (ヒト)
配列文字列: MAAAITDMAD LEELSRLSPL PPGSPGSAAR GRAEPPEEEE EEEEEEEEAE AEAVAALLLN GGSGGGGGGG GGGVGGGEAE TMSEPSPES ASQAGEDEDE EEDDEEEEDE SSSSGGGEEE SSAESLVGSS GGSSSDETRS LSPGAASSSS GDGDGKEGLE E PKGPRGSQ ...文字列:
MAAAITDMAD LEELSRLSPL PPGSPGSAAR GRAEPPEEEE EEEEEEEEAE AEAVAALLLN GGSGGGGGGG GGGVGGGEAE TMSEPSPES ASQAGEDEDE EEDDEEEEDE SSSSGGGEEE SSAESLVGSS GGSSSDETRS LSPGAASSSS GDGDGKEGLE E PKGPRGSQ GGGGGGSSSS SVVSSGGDEG YGTGGGGSSA TSGGRRGSLE MSSDGEPLSR MDSEDSISST IMDVDSTISS GR STPAMMN GQGSTTSSSK NIAYNCCWDQ CQACFNSSPD LADHIRSIHV DGQRGGVFVC LWKGCKVYNT PSTSQSWLQR HML THSGDK PFKCVVGGCN ASFASQGGLA RHVPTHFSQQ NSSKVSSQPK AKEESPSKAG MNKRRKLKNK RRRSLPRPHD FFDA QTLDA IRHRAICFNL SAHIESLGKG HSVVFHSTVI AKRKEDSGKI KLLLHWMPED ILPDVWVNES ERHQLKTKVV HLSKL PKDT ALLLDPNIYR TMPQKRLKRT LIRKVFNLYL SKQ

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分子 #7: G4 RNA

分子名称: G4 RNA / タイプ: rna / ID: 7
由来(天然)生物種: Homo sapiens (ヒト)
配列文字列:
GGGUAAGGGU AAGGGUAAGG GUAA

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実験情報

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構造解析

手法クライオ電子顕微鏡法
解析単粒子再構成法
試料の集合状態particle

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試料調製

緩衝液pH: 7.9
詳細: RNP complex buffer (25 mM HEPES pH 7.9, 50 mM KCl, 2 mM MgCl2, 10% glycerol, and 1mM TCEP) EM preparation buffer I (25 mM HEPES pH 7.9, 50 mM KCl, 2.5% glycerol, and 1mM TCEP) EM preparation ...詳細: RNP complex buffer (25 mM HEPES pH 7.9, 50 mM KCl, 2 mM MgCl2, 10% glycerol, and 1mM TCEP) EM preparation buffer I (25 mM HEPES pH 7.9, 50 mM KCl, 2.5% glycerol, and 1mM TCEP) EM preparation buffer II (25 mM HEPES pH 7.9, 50 mM KCl, 2.5% glycerol, 0.01%NP-40, and 1mM TCEP).
グリッドモデル: Quantifoil R2/1 / 材質: GOLD / メッシュ: 300
凍結凍結剤: ETHANE / チャンバー内湿度: 90 % / チャンバー内温度: 281 K / 装置: LEICA PLUNGER / 詳細: 3s of single side blotting.
詳細We used streptavidin-affinity grid preparation method with biotin-labeled RNA at 100 nM concentration. PRC2 was applied in excess at 600 nM.

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電子顕微鏡法

顕微鏡FEI TITAN KRIOS
電子線加速電圧: 300 kV / 電子線源: FIELD EMISSION GUN
電子光学系倍率（補正後）: 81000 / 照射モード: FLOOD BEAM / 撮影モード: BRIGHT FIELDBright-field microscopy / Cs: 0.01 mm / 最大 デフォーカス（公称値）: 2.0 µm / 最小 デフォーカス（公称値）: 0.6 µm
特殊光学系エネルギーフィルター - スリット幅: 20 eV
試料ステージ試料ホルダーモデル: FEI TITAN KRIOS AUTOGRID HOLDER
ホルダー冷却材: NITROGEN
撮影フィルム・検出器のモデル: GATAN K3 (6k x 4k) / 撮影したグリッド数: 1 / 実像数: 18632 / 平均電子線量: 60.0 e/Å2 / 詳細: 60 frames per movie
実験機器
モデル: Titan Krios / 画像提供: FEI Company

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画像解析

粒子像選択選択した数: 3885383
初期モデルモデルのタイプ: OTHER / 詳細: Negative staining model
初期 角度割当タイプ: MAXIMUM LIKELIHOOD / ソフトウェア - 名称: RELION
最終 角度割当タイプ: MAXIMUM LIKELIHOOD / ソフトウェア - 名称: RELION
最終 再構成解像度のタイプ: BY AUTHOR / 解像度: 3.3 Å / 解像度の算出法: FSC 0.143 CUT-OFF / ソフトウェア - 名称: RELION / 使用した粒子像数: 217196
FSC曲線 (解像度の算出)

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万見について

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お知らせ

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2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

  • EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
  • これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

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2020年8月12日: 新型コロナ情報

新型コロナ情報

URL: https://pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

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2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

新型コロナウイルスの構造データ

関連情報:万見生物種 / 2020年8月12日: 新型コロナ情報

外部リンク:COVID-19特集ページ - PDBj / 今月の分子2020年2月：コロナウイルスプロテーアーゼ

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2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

EMDBのIDの桁数の変更

  • EMDBエントリに付与されているアクセスコード(EMDB-ID)は4桁の数字(例、EMD-1234)でしたが、間もなく枯渇します。これまでの4桁のID番号は4桁のまま変更されませんが、4桁の数字を使い切った後に発行されるIDは5桁以上の数字(例、EMD-12345)になります。5桁のIDは2019年の春頃から発行される見通しです。
  • EM Navigator/万見では、接頭語「EMD-」は省略されています。

関連情報:Q: 「EMD」とは何ですか？ / 万見/EM NavigatorにおけるID/アクセスコードの表記

外部リンク:EMDB Accession Codes are Changing Soon! / PDBjへお問い合わせ

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2017年7月12日: PDB大規模アップデート

PDB大規模アップデート

  • 新バージョンのPDBx/mmCIF辞書形式に基づくデータがリリースされました。
  • 今回の更新はバージョン番号が4から5になる大規模なもので、全エントリデータの書き換えが行われる「Remediation」というアップデートに該当します。
  • このバージョンアップで、電子顕微鏡の実験手法に関する多くの項目の書式が改定されました(例：em_softwareなど)。
  • EM NavigatorとYorodumiでも、この改定に基づいた表示内容になります。

外部リンク:wwPDB Remediation / OneDepデータ基準に準拠した、より強化された内容のモデル構造ファイルが、PDBアーカイブで公開されました。

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万見 (Yorodumi)

幾万の構造データを、幾万の視点から

  • 万見(Yorodumi)は、EMDB/PDB/SASBDBなどの構造データを閲覧するためのページです。
  • EM Navigatorの詳細ページの後継、Omokage検索のフロントエンドも兼ねています。

関連情報:EMDB / PDB / SASBDB / 3つのデータバンクの比較 / 万見検索 / 2016年8月31日: 新しいEM Navigatorと万見 / 万見文献 / Jmol/JSmol / 機能・相同性情報 / 新しいEM Navigatorと万見の変更点

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