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基本情報
登録情報 | ![]() | |||||||||
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タイトル | Cryo-EM structure of Cryptococcus neoformans trehalose-6-phosphate synthase homotetramer in apo form | |||||||||
![]() | Cryptococcus neoformans trehalose-6-phosphate synthase (Tps1) homotetramer in the apo form | |||||||||
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![]() | Glycosyltransferase / complex / transferase | |||||||||
機能・相同性 | ![]() trehalose metabolism in response to stress / alpha,alpha-trehalose-phosphate synthase complex (UDP-forming) / trehalose-phosphatase activity / trehalose biosynthetic process / hexosyltransferase activity / cellular response to heat / cytosol 類似検索 - 分子機能 | |||||||||
生物種 | ![]() | |||||||||
手法 | 単粒子再構成法 / クライオ電子顕微鏡法 / 解像度: 3.3 Å | |||||||||
![]() | Washington EJ / Brennan RG | |||||||||
資金援助 | ![]()
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![]() | ![]() タイトル: Cryo-EM structure of Cryptococcus neoformans trehalose-6-phosphate synthase homotetramer in apo form 著者: Washington EJ / Brennan RG | |||||||||
履歴 |
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構造の表示
添付画像 |
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ダウンロードとリンク
-EMDBアーカイブ
マップデータ | ![]() | 117.6 MB | ![]() | |
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ヘッダ (付随情報) | ![]() ![]() | 13.5 KB 13.5 KB | 表示 表示 | ![]() |
FSC (解像度算出) | ![]() | 11.4 KB | 表示 | ![]() |
画像 | ![]() | 111 KB | ||
Filedesc metadata | ![]() | 5.4 KB | ||
その他 | ![]() ![]() | 115.9 MB 115.9 MB | ||
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-関連構造データ
関連構造データ | ![]() 8fo1MC M: このマップから作成された原子モデル C: 同じ文献を引用 ( |
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類似構造データ | 類似検索 - 機能・相同性 ![]() |
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リンク
EMDBのページ | ![]() ![]() |
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マップ
ファイル | ![]() | ||||||||||||||||||||
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注釈 | Cryptococcus neoformans trehalose-6-phosphate synthase (Tps1) homotetramer in the apo form | ||||||||||||||||||||
ボクセルのサイズ | X=Y=Z: 0.65 Å | ||||||||||||||||||||
密度 |
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対称性 | 空間群: 1 | ||||||||||||||||||||
詳細 | EMDB XML:
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-添付データ
-ハーフマップ: Cryptococcus neoformans trehalose-6-phosphate synthase (Tps1) homotetramer in the...
ファイル | emd_29338_half_map_1.map | ||||||||||||
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注釈 | Cryptococcus neoformans trehalose-6-phosphate synthase (Tps1) homotetramer in the apo half map A | ||||||||||||
投影像・断面図 |
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密度ヒストグラム |
-ハーフマップ: Cryptococcus neoformans trehalose-6-phosphate synthase (Tps1) homotetramer in the...
ファイル | emd_29338_half_map_2.map | ||||||||||||
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注釈 | Cryptococcus neoformans trehalose-6-phosphate synthase (Tps1) homotetramer in the apo half map B | ||||||||||||
投影像・断面図 |
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密度ヒストグラム |
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試料の構成要素
-全体 : trehalose-6-phosphate synthase homotetramer in apo form
全体 | 名称: trehalose-6-phosphate synthase homotetramer in apo form |
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要素 |
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-超分子 #1: trehalose-6-phosphate synthase homotetramer in apo form
超分子 | 名称: trehalose-6-phosphate synthase homotetramer in apo form タイプ: complex / ID: 1 / 親要素: 0 / 含まれる分子: all |
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由来(天然) | 生物種: ![]() |
分子量 | 理論値: 307 KDa |
-分子 #1: Alpha,alpha-trehalose-phosphate synthase (UDP-forming)
分子 | 名称: Alpha,alpha-trehalose-phosphate synthase (UDP-forming) タイプ: protein_or_peptide / ID: 1 / コピー数: 4 / 光学異性体: LEVO |
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由来(天然) | 生物種: ![]() |
分子量 | 理論値: 76.8155 KDa |
組換発現 | 生物種: ![]() ![]() |
配列 | 文字列: MHHHHHHSSG VDLGTENLYF QSNAMTTMSN DIPNSPTSTS FTGTFSPAAT AANTAANART SDAPSPTTSS SGPKLETSKE QRLIVVSNR LPVTISKDDN GEYHFKMSSG GLVSALSGCK KTMSFTWIGW PGKDIPMQDR ETVNRRLLDE YNCYPVYLSD E LADSHYNG ...文字列: MHHHHHHSSG VDLGTENLYF QSNAMTTMSN DIPNSPTSTS FTGTFSPAAT AANTAANART SDAPSPTTSS SGPKLETSKE QRLIVVSNR LPVTISKDDN GEYHFKMSSG GLVSALSGCK KTMSFTWIGW PGKDIPMQDR ETVNRRLLDE YNCYPVYLSD E LADSHYNG FSNSILWPLF HYHPGEMNFD AAHWLAYREA NMRFADVVSS LVQAGDMVWV QDYHLMLLPM LLRSMITGES AQ GEMVRQE LGRVKEGVDD TVVKEVLKMG PGVAQAEDEG VEMLDDVEEE GGEMDVKSSP KRPHYARGMS TFQKQELVAK EKG KEGIRI GFFLHTPFPS SEIYRILPVR REILLGVLQC DLIGFHTYDY ARHFLSSCTR ILGLETQPNG IEFDGRYCQV GTFP IGIDP NQFIEGLQKE SIVKRLRSLE ARFEGVKVII GVDRLDYIKG IPQKLQALET FLTQHPEWIG KVVLVQLAIP SRQDV EEYQ DLRACVNELV GRINGRFGTV ESVPIHYMHK SVPFEELTAM YALADACLVT STRDGMNLVA YEYISSQAER HGSMIL SEF AGAAQSFNGS LLINPWDVQS TADAINQALT LSPQQRKTNW QKLFNYVSKY TAEAWGVSFV NELNRLSGQR PSGPTGL AG RRKSGSLSRT SSKASIQRRK SSQSGIVTGL GAAAGAAVNW AQAQVQGGSQ T UniProtKB: Alpha,alpha-trehalose-phosphate synthase (UDP-forming) |
-実験情報
-構造解析
手法 | クライオ電子顕微鏡法 |
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![]() | 単粒子再構成法 |
試料の集合状態 | particle |
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試料調製
緩衝液 | pH: 7.5 |
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凍結 | 凍結剤: ETHANE |
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電子顕微鏡法
顕微鏡 | FEI TITAN KRIOS |
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撮影 | フィルム・検出器のモデル: GATAN K3 BIOQUANTUM (6k x 4k) 平均電子線量: 60.0 e/Å2 |
電子線 | 加速電圧: 300 kV / 電子線源: ![]() |
電子光学系 | 照射モード: OTHER / 撮影モード: BRIGHT FIELD / 最大 デフォーカス(公称値): 2.5 µm / 最小 デフォーカス(公称値): 0.8 µm |
実験機器 | ![]() モデル: Titan Krios / 画像提供: FEI Company |