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データを開く
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基本情報
登録情報 | ![]() | |||||||||
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タイトル | Subtomogram average of T4SS of Coxiella burnetii at pH 7 | |||||||||
![]() | T4SS of Coxiella burnetii at pH 7 | |||||||||
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![]() | Bacterial secretion system / MEMBRANE PROTEIN | |||||||||
生物種 | ![]() | |||||||||
手法 | サブトモグラム平均法 / クライオ電子顕微鏡法 / 解像度: 44.0 Å | |||||||||
![]() | Kaplan M / Shepherd DC / Vankadari N / Kim KW / Larson CL / Przemyslaw D / Beare PA / Krzymowski E / Heinzen RA / Jensen GJ / Ghosal D | |||||||||
資金援助 | ![]() ![]()
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![]() | ![]() タイトル: Subtomogram average of T4SS of Coxiella burnetii at pH 7 著者: Kaplan M / Shepherd DC / Vankadari N / Kim KW / Larson CL / Przemyslaw D / Beare PA / Krzymowski E / Heinzen RA / Jensen GJ / Ghosal D | |||||||||
履歴 |
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構造の表示
添付画像 |
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ダウンロードとリンク
-EMDBアーカイブ
マップデータ | ![]() | 578.5 KB | ![]() | |
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ヘッダ (付随情報) | ![]() ![]() | 12.1 KB 12.1 KB | 表示 表示 | ![]() |
画像 | ![]() | 53.4 KB | ||
Filedesc metadata | ![]() | 3.7 KB | ||
その他 | ![]() ![]() | 559 KB 895.8 KB | ||
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-検証レポート
文書・要旨 | ![]() | 564.8 KB | 表示 | ![]() |
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文書・詳細版 | ![]() | 564.4 KB | 表示 | |
XML形式データ | ![]() | 8.3 KB | 表示 | |
CIF形式データ | ![]() | 9.6 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
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リンク
EMDBのページ | ![]() ![]() |
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マップ
ファイル | ![]() | ||||||||||||||||||||
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注釈 | T4SS of Coxiella burnetii at pH 7 | ||||||||||||||||||||
ボクセルのサイズ | X=Y=Z: 8.073 Å | ||||||||||||||||||||
密度 |
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対称性 | 空間群: 1 | ||||||||||||||||||||
詳細 | EMDB XML:
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-添付データ
-ハーフマップ: Even half map
ファイル | emd_28282_half_map_1.map | ||||||||||||
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注釈 | Even half map | ||||||||||||
投影像・断面図 |
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密度ヒストグラム |
-ハーフマップ: Odd half map
ファイル | emd_28282_half_map_2.map | ||||||||||||
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注釈 | Odd half map | ||||||||||||
投影像・断面図 |
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密度ヒストグラム |
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試料の構成要素
-全体 : T4SS of Coxiella burnetii at pH 7
全体 | 名称: T4SS of Coxiella burnetii at pH 7 |
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要素 |
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-超分子 #1: T4SS of Coxiella burnetii at pH 7
超分子 | 名称: T4SS of Coxiella burnetii at pH 7 / タイプ: cell / ID: 1 / 親要素: 0 |
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由来(天然) | 生物種: ![]() |
-実験情報
-構造解析
手法 | クライオ電子顕微鏡法 |
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![]() | サブトモグラム平均法 |
試料の集合状態 | cell |
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試料調製
緩衝液 | pH: 7 |
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凍結 | 凍結剤: ETHANE-PROPANE |
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電子顕微鏡法
顕微鏡 | FEI POLARA 300 |
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撮影 | フィルム・検出器のモデル: GATAN K2 SUMMIT (4k x 4k) 平均電子線量: 1.625 e/Å2 |
電子線 | 加速電圧: 300 kV / 電子線源: ![]() |
電子光学系 | 照射モード: FLOOD BEAM / 撮影モード: BRIGHT FIELD / 最大 デフォーカス(公称値): 8.0 µm / 最小 デフォーカス(公称値): 6.0 µm |
実験機器 | ![]() モデル: Tecnai Polara / 画像提供: FEI Company |
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画像解析
最終 再構成 | 想定した対称性 - 点群: C13 (13回回転対称) / 解像度のタイプ: BY AUTHOR / 解像度: 44.0 Å / 解像度の算出法: FSC 0.143 CUT-OFF / 使用したサブトモグラム数: 726 |
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抽出 | トモグラム数: 88 / 使用した粒子像数: 726 |
最終 角度割当 | タイプ: NOT APPLICABLE |