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基本情報
登録情報 | ![]() | |||||||||
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タイトル | Cryo-EM structure of Saccharomyces cerevisiae Succinyl-CoA:acetate CoA-transferase (Ach1p) | |||||||||
![]() | map sharp | |||||||||
![]() |
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![]() | Ach1p / Succinyl-CoA / acetate CoA-transferase / TRANSFERASE | |||||||||
機能・相同性 | ![]() acetyl-CoA hydrolase / propionate metabolic process, methylcitrate cycle / acetyl-CoA hydrolase activity / acetate CoA-transferase activity / acetate metabolic process / mitochondrion / cytosol 類似検索 - 分子機能 | |||||||||
生物種 | ![]() ![]() | |||||||||
手法 | 単粒子再構成法 / クライオ電子顕微鏡法 / 解像度: 2.99 Å | |||||||||
![]() | Godoy AS / Song Y / Cheruvara H / Quigley A / Oliva G | |||||||||
資金援助 | ![]()
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![]() | ![]() タイトル: Cryo-EM structure of Saccharomyces cerevisiae cytochrome c oxidase (Complex IV) extracted in lipid nanodiscs 著者: Godoy AS / Song Y / Cheruvara H / Quigley A / Oliva G | |||||||||
履歴 |
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構造の表示
添付画像 |
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ダウンロードとリンク
-EMDBアーカイブ
マップデータ | ![]() | 229.9 MB | ![]() | |
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ヘッダ (付随情報) | ![]() ![]() | 15.3 KB 15.3 KB | 表示 表示 | ![]() |
FSC (解像度算出) | ![]() | 13.2 KB | 表示 | ![]() |
画像 | ![]() | 83.9 KB | ||
マスクデータ | ![]() | 244.1 MB | ![]() | |
Filedesc metadata | ![]() | 5.2 KB | ||
その他 | ![]() ![]() ![]() | 122 MB 226.2 MB 226.2 MB | ||
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-検証レポート
文書・要旨 | ![]() | 1.1 MB | 表示 | ![]() |
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文書・詳細版 | ![]() | 1.1 MB | 表示 | |
XML形式データ | ![]() | 21.8 KB | 表示 | |
CIF形式データ | ![]() | 27.6 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-関連構造データ
関連構造データ | ![]() 8dh7MC ![]() 8dh6C M: このマップから作成された原子モデル C: 同じ文献を引用 ( |
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類似構造データ | 類似検索 - 機能・相同性 ![]() |
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リンク
EMDBのページ | ![]() ![]() |
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マップ
ファイル | ![]() | ||||||||||||||||||||
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注釈 | map sharp | ||||||||||||||||||||
ボクセルのサイズ | X=Y=Z: 0.831 Å | ||||||||||||||||||||
密度 |
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対称性 | 空間群: 1 | ||||||||||||||||||||
詳細 | EMDB XML:
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-添付データ
-マスク #1
ファイル | ![]() | ||||||||||||
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投影像・断面図 |
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密度ヒストグラム |
-追加マップ: map
ファイル | emd_27431_additional_1.map | ||||||||||||
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注釈 | map | ||||||||||||
投影像・断面図 |
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密度ヒストグラム |
-ハーフマップ: halfA
ファイル | emd_27431_half_map_1.map | ||||||||||||
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注釈 | halfA | ||||||||||||
投影像・断面図 |
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密度ヒストグラム |
-ハーフマップ: #1
ファイル | emd_27431_half_map_2.map | ||||||||||||
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投影像・断面図 |
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密度ヒストグラム |
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試料の構成要素
-全体 : Succinyl-CoA:acetate CoA-transferase
全体 | 名称: Succinyl-CoA:acetate CoA-transferase |
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要素 |
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-超分子 #1: Succinyl-CoA:acetate CoA-transferase
超分子 | 名称: Succinyl-CoA:acetate CoA-transferase / タイプ: complex / ID: 1 / 親要素: 0 / 含まれる分子: all |
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由来(天然) | 生物種: ![]() ![]() |
-分子 #1: Acetyl-CoA hydrolase
分子 | 名称: Acetyl-CoA hydrolase / タイプ: protein_or_peptide / ID: 1 / コピー数: 2 / 光学異性体: LEVO / EC番号: acetyl-CoA hydrolase |
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由来(天然) | 生物種: ![]() ![]() |
分子量 | 理論値: 58.791785 KDa |
配列 | 文字列: MTISNLLKQR VRYAPYLKKV KEAHELIPLF KNGQYLGWSG FTGVGTPKAV PEALIDHVEK NNLQGKLRFN LFVGASAGPE ENRWAEHDM IIKRAPHQVG KPIAKAINQG RIEFFDKHLS MFPQDLTYGF YTRERKDNKI LDYTIIEATA IKEDGSIVPG P SVGGSPEF ...文字列: MTISNLLKQR VRYAPYLKKV KEAHELIPLF KNGQYLGWSG FTGVGTPKAV PEALIDHVEK NNLQGKLRFN LFVGASAGPE ENRWAEHDM IIKRAPHQVG KPIAKAINQG RIEFFDKHLS MFPQDLTYGF YTRERKDNKI LDYTIIEATA IKEDGSIVPG P SVGGSPEF ITVSDKVIIE VNTATPSFEG IHDIDMPVNP PFRKPYPYLK VDDKCGVDSI PVDPEKVVAI VESTMRDQVP PN TPSDDMS RAIAGHLVEF FRNEVKHGRL PENLLPLQSG IGNIANAVIE GLAGAQFKHL TVWTEVLQDS FLDLFENGSL DYA TATSVR LTEKGFDRAF ANWENFKHRL CLRSQVVSNN PEMIRRLGVI AMNTPVEVDI YAHANSTNVN GSRMLNGLGG SADF LRNAK LSIMHAPSAR PTKVDPTGIS TIVPMASHVD QTEHDLDILV TDQGLADLRG LSPKERAREI INKCAHPDYQ ALLTD YLDR AEHYAKKHNC LHEPHMLKNA FKFHTNLAEK GTMKVDSWEP VD UniProtKB: Acetyl-CoA hydrolase |
-実験情報
-構造解析
手法 | クライオ電子顕微鏡法 |
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![]() | 単粒子再構成法 |
試料の集合状態 | particle |
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試料調製
緩衝液 | pH: 7 |
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凍結 | 凍結剤: ETHANE |
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電子顕微鏡法
顕微鏡 | FEI TITAN KRIOS |
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撮影 | フィルム・検出器のモデル: GATAN K3 BIOQUANTUM (6k x 4k) 平均電子線量: 0.989314222 e/Å2 |
電子線 | 加速電圧: 300 kV / 電子線源: ![]() |
電子光学系 | 照射モード: FLOOD BEAM / 撮影モード: BRIGHT FIELD / 最大 デフォーカス(公称値): 3.1 µm / 最小 デフォーカス(公称値): 1.0 µm |
実験機器 | ![]() モデル: Titan Krios / 画像提供: FEI Company |