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基本情報
登録情報 | ![]() | |||||||||
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タイトル | Structure of C. albicans FAS in in an inhibited state. | |||||||||
![]() | FAS in in an inhibited state | |||||||||
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機能・相同性 | ![]() mitotic nuclear membrane biogenesis / palmitic acid biosynthetic process / : / fatty-acyl-CoA synthase system / : / ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() 類似検索 - 分子機能 | |||||||||
生物種 | ![]() ![]() | |||||||||
手法 | ![]() ![]() | |||||||||
![]() | Lou JW / Mazhab-Jafari MT | |||||||||
資金援助 | ![]()
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![]() | ![]() タイトル: Structure of C. albicans FAS in an inhibited state. 著者: Mazhab-Jafari MT / Lou JW | |||||||||
履歴 |
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構造の表示
添付画像 |
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ダウンロードとリンク
-EMDBアーカイブ
マップデータ | ![]() | 122.4 MB | ![]() | |
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ヘッダ (付随情報) | ![]() ![]() | 15.7 KB 15.7 KB | 表示 表示 | ![]() |
画像 | ![]() | 111.5 KB | ||
Filedesc metadata | ![]() | 7.7 KB | ||
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-関連構造データ
関連構造データ | ![]() 7tuiMC M: このマップから作成された原子モデル C: 同じ文献を引用 ( |
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類似構造データ | 類似検索 - 機能・相同性 ![]() |
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リンク
EMDBのページ | ![]() ![]() |
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「今月の分子」の関連する項目 |
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マップ
ファイル | ![]() | ||||||||||||||||||||
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注釈 | FAS in in an inhibited state | ||||||||||||||||||||
ボクセルのサイズ | X=Y=Z: 1.03 Å | ||||||||||||||||||||
密度 |
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対称性 | 空間群: 1 | ||||||||||||||||||||
詳細 | EMDB XML:
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-添付データ
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試料の構成要素
-全体 : fatty acid synthase
全体 | 名称: fatty acid synthase![]() |
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要素 |
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-超分子 #1: fatty acid synthase
超分子 | 名称: fatty acid synthase / タイプ: complex / ID: 1 / 親要素: 0 / 含まれる分子: #1 |
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由来(天然) | 生物種: ![]() ![]() |
分子量 | 理論値: 2.6 MDa |
-分子 #1: Fatty acid synthase subunit alpha
分子 | 名称: Fatty acid synthase subunit alpha / タイプ: protein_or_peptide / ID: 1 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO / EC番号: fatty-acyl-CoA synthase system |
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由来(天然) | 生物種: ![]() ![]() |
分子量 | 理論値: 207.703453 KDa |
配列 | 文字列: MKPEIEQELS HTLLTELLAY QFASPVRWIE TQDVFLKQHN TERIIEIGPS PTLAGMANRT IKAKYESYDA ALSLQRQVLC YSKDAKEIY YKPDPADLAP KETPKQEEST PSAPAAATPT PAAAAAPTPA PAPASAGPVE SIPDEPVKAN LLIHVLVAQK L KKPLDAVP ...文字列: MKPEIEQELS HTLLTELLAY QFASPVRWIE TQDVFLKQHN TERIIEIGPS PTLAGMANRT IKAKYESYDA ALSLQRQVLC YSKDAKEIY YKPDPADLAP KETPKQEEST PSAPAAATPT PAAAAAPTPA PAPASAGPVE SIPDEPVKAN LLIHVLVAQK L KKPLDAVP MTKAIKDLVN GKSTVQNEIL GDLGKEFGST PEKPEDTPLE ELAEQFQDSF SGQLGKTSTS LIGRLMSSKM PG GFSITTA RKYLESRFGL GAGRQDSVLL MALTNEPANR LGSEADAKTF FDGIAQKYAS SAGISLSSGA GSGAGAANSG GAV VDSAAL DALTAENKKL AKQQLEVLAR YLQVDLNKGS AKSFIKEKEA SAVLQKELDL WEAEHGEFYA KGIQPTFSAL KSRT YDSYW NWARQDVLSM YFDIIFGKLT SVDRETINQC IQIMNRANPT LIKFMQYHID HCPEYKGETY KLAKRLGQQL IDNCK QVLT EDPVYKDVSR ITGPKTKVSA KGNIEYEETQ KDSVRKFEQY VYEMAQGGAM TKVSQPTIQE DLARVYKAIS KQASKD SKL ELQRVYEDLL KVVESSKEIE TEQLTKDILQ AATVPTTPTE EVDDPCTPSS DDEIASLPDK TSIIQPVSST IPSQTIP FL HIQKKTKDGW EYNKKLSSLY LDGLESAAIN GLTFKDKYVL VTGAGAGSIG AEILQGLISG GAKVIVTTSR FSKKVTEY Y QNMYARYGAA GSTLIVVPFN QGSKQDVDAL VQYIYDEPKK GGLGWDLDAI IPFAAIPENG NGLDNIDSKS EFAHRIMLT NLLRLLGAVK SKKTTDTRPA QCILPLSPNH GTFGFDGLYS ESKISLETLF NRWYSEDWGS KLTVCGAVIG WTRGTGLMSA NNIIAEGIE KLGVRTFSQK EMAFNILGLL TPEIVQLCQE EPVMADLNGG LQFIDNLKDF TSKLRTDLLE TADIRRAVSI E SAIEQKVV NGDNVDANYS KVMVEPRANM KFDFPTLKSY DEIKQIAPEL EGMLDLENVV VVTGFAEVGP WGNSRTRWEM EA YGEFSLE GAIEMAWIMG FIKYHNGNLK GKPYSGWVDA KTQTPIDEKD IKSKYEEEIL EHSGIRLIEP ELFNGYDPKK KQM IQEVVV QHDLEPFECS KETAEQYKHE HGEKCEIFEI EESGEYTVRI LKGATLYVPK ALRFDRLVAG QIPTGWDART YGIP EDTIS QVDPITLYVL VATVEALLSA GITDPYEFYK YVHVSEVGNC SGSGMGGVSA LRGMFKDRYA DKPVQNDILQ ESFIN TMSA WVNMLLLSSS GPIKTPVGAC ATAVESVDIG IETILSGKAK VVLVGGYDDF QEEGSYEFAN MNATSNSIEE FKHGRT PKE MSRPTTTTRN GFMEAQGSGI QVIMTADLAL KMGVPIHAVL AMTATATDKI GRSVPAPGKG ILTTAREHHG NLKYPSP LL NIEYRKRQLN KRLEQIKSWE ETELSYLQEE AELAKEEFGD EFSMHEFLKE RTEEVYRESK RQVSDAKKQW GNSFYKSD P RIAPLRGALA AFNLTIDDIG VASFHGTSTV ANDKNESATI NNMMKHLGRS EGNPVFGVFQ KYLTGHPKGA AGAWMLNGA IQILESGLVP GNRNADNVDK LLEQYEYVLY PSRSIQTDGI KAVSVTSFGF GQKGAQAVVV HPDYLFAVLD RSTYEEYATK VSARNKKTY RYMHNAITRN TMFVAKDKAP YSDELEQPVY LDPLARVEEN KKKLVFSDKT IQSSQSYVGE VAQKTAKALS T LNKSSKGV GVDVELLSAI NIDNETFIER NFTGNEVEYC LNTAHPQASF TGTWSAKEAV FKALGVESKG AGASLIDIEI TR DVNGAPK VILHGEAKKA AAKAGVKNVN ISISHDDFQA TAVALSEF UniProtKB: ![]() |
-分子 #2: Fatty acid synthase subunit beta
分子 | 名称: Fatty acid synthase subunit beta / タイプ: protein_or_peptide / ID: 2 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO / EC番号: fatty-acyl-CoA synthase system |
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由来(天然) | 生物種: ![]() ![]() |
分子量 | 理論値: 228.177609 KDa |
配列 | 文字列: MSTHRPFQLT HGSIEHTLLV PNDLFFNYSQ LKDEFIKTLP EPTEGFAGDD EPSSPAELYG KFIGFISNAQ FPQIVELSLK DFESRFLDN NNDNIHSFAV KLLDDETYPT TIAKVKENIV KNYYKAVKSI NKVESNLLYH CKHDAKLVAI FGGQGNTDDY F EELRELYT ...文字列: MSTHRPFQLT HGSIEHTLLV PNDLFFNYSQ LKDEFIKTLP EPTEGFAGDD EPSSPAELYG KFIGFISNAQ FPQIVELSLK DFESRFLDN NNDNIHSFAV KLLDDETYPT TIAKVKENIV KNYYKAVKSI NKVESNLLYH CKHDAKLVAI FGGQGNTDDY F EELRELYT LYQGLIEDLL VSIAEKLNQL HPSFDKIYTQ GLNILSWLKH PETTPDQDYL LSVPVSCPVI CVIQLCHYTI TC KVLGLTP GEFRNSLKWS TGHSQGLVTA VTIAASDSWD SFLKNSLTAV SLLLFIGSRC LSTYPRTSLP PTMLQDSLDN GEG RPSPML SVRDLSIKQV EKFIEQTNSH LPREKHIAIS LINGARNLVL SGPPESLYGF NLNLRNQKAP MGLDQSRVPF SERK LKCSN RFLPIFAPFH SHLLADATEL ILDDVKEHGL SFEGLKIPVY DTFDGSDFQA LKEPIIDRVV KLITELPVHW EEATN HKAT HILDFGPGGV SGLGVLTHRN KEGTGARIIL AGTLDSNPID DEYGFKHEIF QTSADKAIKW APDWLKELRP TLVKNS EGK IYVKTKFSQL LGRAPLMVAG MTPTTVNTDI VSASLNAGYH IELAGGGYFS PVMMTRAIDD IVSRIKPGYG LGINLIY VN PFMLQWGIPL IKDLREKGYP IQSLTIGAGV PSIEVATEYI EDLGLTHLGL KPGSVDAISQ VIAIAKAHPT FPIVLQWT G GRGGGHHSFE DFHQPIIQMY SKIRRCSNIV LVAGSGFGSD EDTYPYLSGY WSEKFNYPPM PFDGVLFGSR VMTSKESHT SLAAKKLIVE CKGVPDQQWE QTYKKPTGGI ITVRSEMGEP IHKIATRGVM FWKELDDTIF NLPKNKLLDA LNKKRDHIIK KLNNDFQKP WFGKNANGVC DLQEMTYKEV ANRLVELMYV KKSHRWIDVS LRNMYGDFLR RVEERFTSSA GTVSLLQNFN Q LNEPEQFT ADFFEKFPQA GKQLISEEDC DYFLMLAARP GQKPVPFVPV LDERFEFFFK KDSLWQSEDL ESVVDEDVQR TC ILHGPVA SQYTSKVDEP IGDILNSIHE GHIARLIKEE YAGDESKIPV VEYFGGKKPA SVSATSVNII DGNQVVYEID SEL PNKQEW LDLLAGTELN WLQAFISTDR IVQGSKHVSN PLHDILTPAK HSKVTIDKKT KKLTAFENIK GDLLPVVEIE LVKP NTIQL SLIEHRTADT NPVALPFLYK YNPADGFAPI LEIMEDRNER IKEFYWKLWF GSSVPYSNDI NVEKAILGDE ITISS QTIS EFTHAIGNKC DAFVDRPGKA TLAPMDFAIV IGWKAIIKAI FPKSVDGDLL KLVHLSNGYK MITGAAPLKK GDVVST KAE IKAVLNQPSG KLVEVVGTIY REGKPVMEVT SQFLYRGEYN DYCNTFQKVT ETPVQVAFKS AKDLAVLRSK EWFHLEK DV QFDVLTFRCE STYKFKSANV YSSIKTTGQV LLELPTKEVI QVGSVDYEAG TSYGNPVTDY LSRNGKTIEE SVIFENAI P LSSGEELTSK APGTNEPYAI VSGDYNPIHV SRVFAAYAKL PGTITHGMYS SASIRALVEE WAANNVAARV RAFKCDFVG MVLPNDTLQT TMEHVGMING RKIIKVETRN VETELPVLIG EAEIEQPTTT YVFTGQGSQE QGMGMELYNS SEVAREVWDK ADRHFVNNY GFSILDIVQN NPNELTIHFG GAKGRAIRDN YIGMMFETIG EDGALKSEKI FKDIDETTTS YTFVSPTGLL S ATQFTQPA LTLMEKAAYE DIKSKGLIPS DIMFAGHSLG EYSALSSLAN VMPIESLVDV VFYRGMTMQV AVPRDELGRS NY GMVAVNP SRVSATFDDS ALRFVVDEVA NKTKWLLEIV NYNVENQQYV AAGDLRALDT LTNVLNVLKI NKIDIVKLQE QMS IEKVKE HLYEIVDEVA AKSLAKPQPI DLERGFAVIP LKGISVPFHS SYLMSGVKPF QRFLCKKIPK SSVKPQDLIG KYIP NLTAK PFELTKEYFQ SVYDLTKSEK IKSILDNWEQ YE UniProtKB: ![]() |
-分子 #3: FLAVIN MONONUCLEOTIDE
分子 | 名称: FLAVIN MONONUCLEOTIDE / タイプ: ligand / ID: 3 / コピー数: 1 / 式: FMN |
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分子量 | 理論値: 456.344 Da |
Chemical component information | ![]() ChemComp-FMN: |
-実験情報
-構造解析
手法 | ![]() |
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![]() | ![]() |
試料の集合状態 | particle |
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試料調製
濃度 | 2 mg/mL |
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緩衝液 | pH: 7.4 |
グリッド | モデル: Quantifoil R2/2 / 材質: COPPER/RHODIUM / メッシュ: 400 / 支持フィルム - 材質: GOLD / 支持フィルム - トポロジー: HOLEY / 支持フィルム - Film thickness: 30 / 前処理 - タイプ: GLOW DISCHARGE / 前処理 - 時間: 25 sec. / 前処理 - 雰囲気: AIR |
凍結 | 凍結剤: ETHANE / チャンバー内湿度: 100 % / チャンバー内温度: 278 K / 装置: FEI VITROBOT MARK IV |
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電子顕微鏡法
顕微鏡 | FEI TITAN KRIOS |
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電子線 | 加速電圧: 300 kV / 電子線源: ![]() |
電子光学系 | 照射モード: FLOOD BEAM / 撮影モード: BRIGHT FIELD![]() |
試料ステージ | 試料ホルダーモデル: FEI TITAN KRIOS AUTOGRID HOLDER ホルダー冷却材: NITROGEN |
撮影 | フィルム・検出器のモデル: FEI FALCON IV (4k x 4k) 撮影したグリッド数: 1 / 平均電子線量: 50.0 e/Å2 |
実験機器 | ![]() モデル: Titan Krios / 画像提供: FEI Company |
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画像解析
初期モデル | モデルのタイプ: PDB ENTRY PDBモデル - PDB ID: |
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初期 角度割当 | タイプ: MAXIMUM LIKELIHOOD / ソフトウェア - 名称: cryoSPARC |
最終 角度割当 | タイプ: MAXIMUM LIKELIHOOD / ソフトウェア - 名称: cryoSPARC |
最終 再構成 | 想定した対称性 - 点群: D3 (2回x3回 2面回転対称![]() 解像度のタイプ: BY AUTHOR / 解像度: 2.66 Å / 解像度の算出法: FSC 0.143 CUT-OFF / ソフトウェア - 名称: cryoSPARC (ver. 3) / 使用した粒子像数: 252339 |