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基本情報
登録情報 | ![]() | |||||||||
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タイトル | Procapsid of bacteriophage lambda | |||||||||
![]() | Low resolution phage lambda procapsid map. | |||||||||
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生物種 | ![]() | |||||||||
手法 | 単粒子再構成法 / クライオ電子顕微鏡法 / 解像度: 8.0 Å | |||||||||
![]() | Maruthi K / Prokhorov NS / Morais MC | |||||||||
資金援助 | ![]()
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![]() | ![]() タイトル: Assembly Incompetent Major Capsid Protein Reveals Elementary and Transient Interactions with Scaffolding Chaparone that Nucleate Viral Shell Assembly 著者: Davis CR / Churchill ME / Backos D / Maruthi K / Prokhorov NS / Morais MC / Catalano CE | |||||||||
履歴 |
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構造の表示
添付画像 |
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ダウンロードとリンク
-EMDBアーカイブ
マップデータ | ![]() | 21.6 MB | ![]() | |
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ヘッダ (付随情報) | ![]() ![]() | 7.9 KB 7.9 KB | 表示 表示 | ![]() |
画像 | ![]() | 265.4 KB | ||
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-検証レポート
文書・要旨 | ![]() | 324.3 KB | 表示 | ![]() |
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文書・詳細版 | ![]() | 323.9 KB | 表示 | |
XML形式データ | ![]() | 7.1 KB | 表示 | |
CIF形式データ | ![]() | 8.2 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
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リンク
EMDBのページ | ![]() ![]() |
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マップ
ファイル | ![]() | ||||||||||||||||||||
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注釈 | Low resolution phage lambda procapsid map. | ||||||||||||||||||||
ボクセルのサイズ | X=Y=Z: 2.8 Å | ||||||||||||||||||||
密度 |
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対称性 | 空間群: 1 | ||||||||||||||||||||
詳細 | EMDB XML:
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-添付データ
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試料の構成要素
-全体 : Procapsid of bacteriophage lambda
全体 | 名称: Procapsid of bacteriophage lambda |
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要素 |
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-超分子 #1: Procapsid of bacteriophage lambda
超分子 | 名称: Procapsid of bacteriophage lambda / タイプ: complex / ID: 1 / 親要素: 0 / 含まれる分子: all |
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由来(天然) | 生物種: ![]() |
-分子 #1: Major Capsid Protein
分子 | 名称: Major Capsid Protein / タイプ: protein_or_peptide / ID: 1 / 光学異性体: DEXTRO |
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配列 | 文字列: MSMYTTAQLL AANEQKFKFD PLFLRLFFRE SYPFTTEKVY LSQIPGLVNM ALYVSPIVSG EVIRSRGGS TSEFTPGYVK PKHEVNPQMT LRRLPDEDPQ NLADPAYRRR RIIMQNMRDE E LAIAQVEE MQAVSAVLKG KYTMTGEAFD PVEVDMGRSE ENNITQSGGT ...文字列: MSMYTTAQLL AANEQKFKFD PLFLRLFFRE SYPFTTEKVY LSQIPGLVNM ALYVSPIVSG EVIRSRGGS TSEFTPGYVK PKHEVNPQMT LRRLPDEDPQ NLADPAYRRR RIIMQNMRDE E LAIAQVEE MQAVSAVLKG KYTMTGEAFD PVEVDMGRSE ENNITQSGGT EWSKRDKSTY DP TDDIEAY ALNASGVVNI IVFDPKGWAL FRSFKAVKEK LDTRRGSNSE LETAVKDLGK AVS YKGMYG DVAIVVYSGQ YVENGVKKNF LPDNTMVLGN TQARGLRTYG CIQDADAQRE GINA SARYP KNWVTTGDPA REFTMIQSAP LMLLADPDEF VSVQLA |
-実験情報
-構造解析
手法 | クライオ電子顕微鏡法 |
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![]() | 単粒子再構成法 |
試料の集合状態 | particle |
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試料調製
緩衝液 | pH: 8 |
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凍結 | 凍結剤: ETHANE |
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電子顕微鏡法
顕微鏡 | JEOL 2200FS |
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撮影 | フィルム・検出器のモデル: DIRECT ELECTRON DE-20 (5k x 3k) 平均電子線量: 30.0 e/Å2 |
電子線 | 加速電圧: 200 kV / 電子線源: ![]() |
電子光学系 | 照射モード: SPOT SCAN / 撮影モード: BRIGHT FIELD |
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画像解析
最終 再構成 | 解像度のタイプ: BY AUTHOR / 解像度: 8.0 Å / 解像度の算出法: FSC 0.143 CUT-OFF / 使用した粒子像数: 1253 |
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初期 角度割当 | タイプ: MAXIMUM LIKELIHOOD |
最終 角度割当 | タイプ: PROJECTION MATCHING |