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基本情報
登録情報 | データベース: EMDB / ID: EMD-25155 | |||||||||
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タイトル | Non-contracted phage G sheath | |||||||||
![]() | Non-contracted phage G sheath | |||||||||
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生物種 | ![]() | |||||||||
手法 | らせん対称体再構成法 / クライオ電子顕微鏡法 / 解像度: 7.0 Å | |||||||||
![]() | Gonzalez B / Li D / Li K / Hardies SC / Wright ET / Thomas JA / Serwer P / Jiang W | |||||||||
資金援助 | ![]()
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![]() | ![]() タイトル: Structural Studies of the Phage G Tail Demonstrate an Atypical Tail Contraction 著者: Gonzalez B / Li D / Li K / Wright ET / Hardies SC / Thomas JA / Serwer P / Jiang W | |||||||||
履歴 |
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構造の表示
ムービー |
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構造ビューア | EMマップ: ![]() ![]() ![]() |
添付画像 |
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ダウンロードとリンク
-EMDBアーカイブ
マップデータ | ![]() | 4.1 MB | ![]() | |
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ヘッダ (付随情報) | ![]() ![]() | 8.8 KB 8.8 KB | 表示 表示 | ![]() |
画像 | ![]() | 90.2 KB | ||
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-検証レポート
文書・要旨 | ![]() | 332.9 KB | 表示 | ![]() |
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文書・詳細版 | ![]() | 332.5 KB | 表示 | |
XML形式データ | ![]() | 6.2 KB | 表示 | |
CIF形式データ | ![]() | 7.1 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-関連構造データ
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リンク
EMDBのページ | ![]() ![]() |
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マップ
ファイル | ![]() | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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注釈 | Non-contracted phage G sheath | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
ボクセルのサイズ | X=Y=Z: 3.484 Å | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
密度 |
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対称性 | 空間群: 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
詳細 | EMDB XML:
CCP4マップ ヘッダ情報:
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-添付データ
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試料の構成要素
-全体 : Bacillus virus G
全体 | 名称: ![]() |
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要素 |
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-超分子 #1: Bacillus virus G
超分子 | 名称: Bacillus virus G / タイプ: virus / ID: 1 / 親要素: 0 / NCBI-ID: 1084719 / 生物種: Bacillus virus G / ウイルスタイプ: VIRION / ウイルス・単離状態: SPECIES / ウイルス・エンベロープ: No / ウイルス・中空状態: No |
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-実験情報
-構造解析
手法 | クライオ電子顕微鏡法 |
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![]() | らせん対称体再構成法 |
試料の集合状態 | particle |
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試料調製
緩衝液 | pH: 7.4 |
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凍結 | 凍結剤: ETHANE |
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電子顕微鏡法
顕微鏡 | FEI TITAN KRIOS |
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撮影 | フィルム・検出器のモデル: GATAN K2 SUMMIT (4k x 4k) 検出モード: SUPER-RESOLUTION / 実像数: 375 / 平均電子線量: 14.5 e/Å2 |
電子線 | 加速電圧: 300 kV / 電子線源: ![]() |
電子光学系 | 照射モード: FLOOD BEAM / 撮影モード: BRIGHT FIELD |
実験機器 | ![]() モデル: Titan Krios / 画像提供: FEI Company |
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画像解析
最終 再構成 | 想定した対称性 - らせんパラメータ - Δz: 41.53 Å 想定した対称性 - らせんパラメータ - ΔΦ: 20.570 ° 想定した対称性 - らせんパラメータ - 軸対称性: C6 (6回回転対称) 解像度のタイプ: BY AUTHOR / 解像度: 7.0 Å / 解像度の算出法: FSC 0.143 CUT-OFF / 使用した粒子像数: 2099 |
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Segment selection | 選択した数: 22755 / ソフトウェア - 名称: RELION |
初期モデル | モデルのタイプ: NONE / 詳細: Ab-initio modeling using CryoSPARC |
最終 角度割当 | タイプ: NOT APPLICABLE |