ジャーナル: ISME J / 年: 2024 タイトル: Distinct life cycle stages of an ectosymbiotic DPANN archaeon. 著者: Vasil A Gaisin / Marleen van Wolferen / Sonja-Verena Albers / Martin Pilhofer / 要旨: DPANN archaea are a diverse group of microorganisms that are thought to rely on an ectosymbiotic lifestyle; however, the cell biology of these cell-cell interactions remains largely unknown. We ...DPANN archaea are a diverse group of microorganisms that are thought to rely on an ectosymbiotic lifestyle; however, the cell biology of these cell-cell interactions remains largely unknown. We applied live-cell imaging and cryo-electron tomography to the DPANN archaeon Nanobdella aerobiophila and its host, revealing two distinct life cycle stages. Free cells possess archaella and are motile. Ectobiotic cells are intimately linked with the host through an elaborate attachment organelle. Our data suggest that free cells may actively seek a new host, while the ectobiotic state is adapted to mediate intricate interaction with the host.
ダウンロード / ファイル: emd_19889.map.gz / 形式: CCP4 / 大きさ: 1.1 GB / タイプ: IMAGE STORED AS SIGNED INTEGER (2 BYTES)
注釈
Cryo-electron tomogram of the Nanobdella aerobiophila cell attached to a host cell (Metallosphaera sedula). Supplementary Data
ボクセルのサイズ
X=Y=Z: 10.71 Å
密度
最小 - 最大
-716.0 - 552.0
平均 (標準偏差)
4.3762794 (±15.266014)
対称性
空間群: 1
詳細
EMDB XML:
マップ形状
Axis order
X
Y
Z
Origin
-209
208
-200
サイズ
1440
1024
400
Spacing
1024
1440
400
セル
A: 10967.04 Å / B: 15422.4 Å / C: 4284.0 Å α=β=γ: 90.0 °
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添付データ
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試料の構成要素
-
全体 : Free single cell of Nanobdella aerobiophila MJ1
全体
名称: Free single cell of Nanobdella aerobiophila MJ1
要素
細胞: Free single cell of Nanobdella aerobiophila MJ1
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超分子 #1: Free single cell of Nanobdella aerobiophila MJ1
超分子
名称: Free single cell of Nanobdella aerobiophila MJ1 / タイプ: cell / ID: 1 / 親要素: 0 詳細: Cryo-electron tomogram of ectosymbiotic DPANN archaeon Nanobdella aerobiophila MJ1. A single cell without the host.
由来(天然)
生物種: Nanobdella aerobiophila (古細菌) / 株: MJ1
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実験情報
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構造解析
手法
クライオ電子顕微鏡法
解析
電子線トモグラフィー法
試料の集合状態
cell
-
試料調製
緩衝液
pH: 2.5
凍結
凍結剤: ETHANE-PROPANE / チャンバー内湿度: 80 % / チャンバー内温度: 295.15 K / 装置: FEI VITROBOT MARK IV
切片作成
その他: NO SECTIONING
位置合わせマーカー
Manufacturer: Cytodiagnostics / 直径: 10 nm
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電子顕微鏡法
顕微鏡
FEI TITAN KRIOS
撮影
フィルム・検出器のモデル: GATAN K3 BIOCONTINUUM (6k x 4k) 平均露光時間: 1.1 sec. / 平均電子線量: 2.574 e/Å2