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-基本情報
登録情報 | データベース: EMDB / ID: EMD-19063 | |||||||||
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タイトル | cryo-EM structure of a dimerized human spliceosomal B complex | |||||||||
マップデータ | ||||||||||
試料 |
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キーワード | pre-mRNA splicing / pre-catalytic spliceosome / B complex / SPLICING | |||||||||
生物種 | Homo sapiens (ヒト) | |||||||||
手法 | 単粒子再構成法 / クライオ電子顕微鏡法 / 解像度: 15.0 Å | |||||||||
データ登録者 | Zhang Z / Kumar V / Dybkov O / Will CL / Urlaub H / Stark H / Luehrmann R | |||||||||
資金援助 | ドイツ, 1件
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引用 | ジャーナル: To Be Published タイトル: New insights into the functions of B complex proteins revealed by cryo-EM of dimerized spliceosomes 著者: Zhang Z / Kumar V / Dybkov O / Will CL / Urlaub H / Stark H / Luehrmann R | |||||||||
履歴 |
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-構造の表示
添付画像 |
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-ダウンロードとリンク
-EMDBアーカイブ
マップデータ | emd_19063.map.gz | 27 MB | EMDBマップデータ形式 | |
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ヘッダ (付随情報) | emd-19063-v30.xml emd-19063.xml | 11.1 KB 11.1 KB | 表示 表示 | EMDBヘッダ |
FSC (解像度算出) | emd_19063_fsc.xml | 7.2 KB | 表示 | FSCデータファイル |
画像 | emd_19063.png | 45.4 KB | ||
Filedesc metadata | emd-19063.cif.gz | 3.6 KB | ||
その他 | emd_19063_half_map_1.map.gz emd_19063_half_map_2.map.gz | 23 MB 23.1 MB | ||
アーカイブディレクトリ | http://ftp.pdbj.org/pub/emdb/structures/EMD-19063 ftp://ftp.pdbj.org/pub/emdb/structures/EMD-19063 | HTTPS FTP |
-関連構造データ
-リンク
EMDBのページ | EMDB (EBI/PDBe) / EMDataResource |
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-マップ
ファイル | ダウンロード / ファイル: emd_19063.map.gz / 形式: CCP4 / 大きさ: 30.5 MB / タイプ: IMAGE STORED AS FLOATING POINT NUMBER (4 BYTES) | ||||||||||||||||||||
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ボクセルのサイズ | X=Y=Z: 3.48 Å | ||||||||||||||||||||
密度 |
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対称性 | 空間群: 1 | ||||||||||||||||||||
詳細 | EMDB XML:
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-添付データ
-ハーフマップ: #1
ファイル | emd_19063_half_map_1.map | ||||||||||||
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投影像・断面図 |
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密度ヒストグラム |
-ハーフマップ: #2
ファイル | emd_19063_half_map_2.map | ||||||||||||
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投影像・断面図 |
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密度ヒストグラム |
-試料の構成要素
-全体 : human spliceosomal B complex
全体 | 名称: human spliceosomal B complex |
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要素 |
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-超分子 #1: human spliceosomal B complex
超分子 | 名称: human spliceosomal B complex / タイプ: complex / ID: 1 / 親要素: 0 |
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由来(天然) | 生物種: Homo sapiens (ヒト) |
-実験情報
-構造解析
手法 | クライオ電子顕微鏡法 |
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解析 | 単粒子再構成法 |
試料の集合状態 | particle |
-試料調製
緩衝液 | pH: 7.9 |
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凍結 | 凍結剤: ETHANE / チャンバー内湿度: 100 % |
-電子顕微鏡法
顕微鏡 | FEI TITAN KRIOS |
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電子線 | 加速電圧: 300 kV / 電子線源: FIELD EMISSION GUN |
電子光学系 | 照射モード: FLOOD BEAM / 撮影モード: BRIGHT FIELDBright-field microscopy / 最大 デフォーカス(公称値): 5.0 µm / 最小 デフォーカス(公称値): 1.5 µm |
撮影 | フィルム・検出器のモデル: FEI FALCON III (4k x 4k) 平均電子線量: 48.0 e/Å2 |
実験機器 | モデル: Titan Krios / 画像提供: FEI Company |