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基本情報
登録情報 | ![]() | |||||||||
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タイトル | Structure of the NCOA4 (Nuclear Receptor Coactivator 4)-FTH1 (H-Ferritin) complex | |||||||||
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![]() | Ferritinophagy / Iron homeostasis / NCOA4 / Ferritin heavy chain / METAL TRANSPORT | |||||||||
機能・相同性 | ![]() iron ion sequestering activity / : / autolysosome / Scavenging by Class A Receptors / Golgi Associated Vesicle Biogenesis / ferroxidase / intracellular sequestering of iron ion / ferroxidase activity / negative regulation of fibroblast proliferation / ferric iron binding ...iron ion sequestering activity / : / autolysosome / Scavenging by Class A Receptors / Golgi Associated Vesicle Biogenesis / ferroxidase / intracellular sequestering of iron ion / ferroxidase activity / negative regulation of fibroblast proliferation / ferric iron binding / Iron uptake and transport / ferrous iron binding / tertiary granule lumen / iron ion transport / intracellular iron ion homeostasis / ficolin-1-rich granule lumen / iron ion binding / immune response / negative regulation of cell population proliferation / Neutrophil degranulation / extracellular exosome / extracellular region / identical protein binding / membrane / nucleus / cytoplasm / cytosol 類似検索 - 分子機能 | |||||||||
生物種 | ![]() | |||||||||
手法 | 単粒子再構成法 / クライオ電子顕微鏡法 / 解像度: 2.88 Å | |||||||||
![]() | Hoelzgen F / Klukin E / Zalk R / Shahar A / Cohen-Schwartz S / Frank GA | |||||||||
資金援助 | ![]()
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![]() | ![]() タイトル: Structural basis for the intracellular regulation of ferritin degradation. 著者: Fabian Hoelzgen / Thuy T P Nguyen / Elina Klukin / Mohamed Boumaiza / Ayush K Srivastava / Elizabeth Y Kim / Ran Zalk / Anat Shahar / Sagit Cohen-Schwartz / Esther G Meyron-Holtz / Fadi Bou- ...著者: Fabian Hoelzgen / Thuy T P Nguyen / Elina Klukin / Mohamed Boumaiza / Ayush K Srivastava / Elizabeth Y Kim / Ran Zalk / Anat Shahar / Sagit Cohen-Schwartz / Esther G Meyron-Holtz / Fadi Bou-Abdallah / Joseph D Mancias / Gabriel A Frank / ![]() ![]() 要旨: The interaction between nuclear receptor coactivator 4 (NCOA4) and the iron storage protein ferritin is a crucial component of cellular iron homeostasis. The binding of NCOA4 to the FTH1 subunits of ...The interaction between nuclear receptor coactivator 4 (NCOA4) and the iron storage protein ferritin is a crucial component of cellular iron homeostasis. The binding of NCOA4 to the FTH1 subunits of ferritin initiates ferritinophagy-a ferritin-specific autophagic pathway leading to the release of the iron stored inside ferritin. The dysregulation of NCOA4 is associated with several diseases, including neurodegenerative disorders and cancer, highlighting the NCOA4-ferritin interface as a prime target for drug development. Here, we present the cryo-EM structure of the NCOA4-FTH1 interface, resolving 16 amino acids of NCOA4 that are crucial for the interaction. The characterization of mutants, designed to modulate the NCOA4-FTH1 interaction, is used to validate the significance of the different features of the binding site. Our results explain the role of the large solvent-exposed hydrophobic patch found on the surface of FTH1 and pave the way for the rational development of ferritinophagy modulators. | |||||||||
履歴 |
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構造の表示
添付画像 |
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ダウンロードとリンク
-EMDBアーカイブ
マップデータ | ![]() | 10.6 MB | ![]() | |
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ヘッダ (付随情報) | ![]() ![]() | 15.6 KB 15.6 KB | 表示 表示 | ![]() |
FSC (解像度算出) | ![]() | 9.1 KB | 表示 | ![]() |
画像 | ![]() | 139.4 KB | ||
Filedesc metadata | ![]() | 5.5 KB | ||
その他 | ![]() ![]() | 45.9 MB 46 MB | ||
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-関連構造データ
関連構造データ | ![]() 8qu9MC M: このマップから作成された原子モデル C: 同じ文献を引用 ( |
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類似構造データ | 類似検索 - 機能・相同性 ![]() |
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リンク
EMDBのページ | ![]() ![]() |
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「今月の分子」の関連する項目 |
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マップ
ファイル | ![]() | ||||||||||||||||||||
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ボクセルのサイズ | X=Y=Z: 0.89 Å | ||||||||||||||||||||
密度 |
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対称性 | 空間群: 1 | ||||||||||||||||||||
詳細 | EMDB XML:
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-添付データ
-ハーフマップ: #2
ファイル | emd_18658_half_map_1.map | ||||||||||||
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投影像・断面図 |
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密度ヒストグラム |
-ハーフマップ: #1
ファイル | emd_18658_half_map_2.map | ||||||||||||
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投影像・断面図 |
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密度ヒストグラム |
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試料の構成要素
-全体 : FTH1 NCOA4 complex
全体 | 名称: FTH1 NCOA4 complex |
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要素 |
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-超分子 #1: FTH1 NCOA4 complex
超分子 | 名称: FTH1 NCOA4 complex / タイプ: complex / ID: 1 / 親要素: 0 / 含まれる分子: #1-#2 |
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由来(天然) | 生物種: ![]() |
-分子 #1: Ferritin heavy chain
分子 | 名称: Ferritin heavy chain / タイプ: protein_or_peptide / ID: 1 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO |
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由来(天然) | 生物種: ![]() |
分子量 | 理論値: 20.764098 KDa |
組換発現 | 生物種: ![]() ![]() |
配列 | 文字列: TSQVRQNYHQ DSEAAINRQI NLELYASYVY LSMSYYFDRD DVALKNFAKY FLHQSHEERE HAEKLMKLQN QRGGRIFLQD IKKPDCDDW ESGLNAMECA LHLEKNVNQS LLELHKLATD KNDPHLCDFI ETHYLNEQVK AIKELGDHVT NLRKMGAPES G LAEYLFDK HTLGDSDNES UniProtKB: Ferritin heavy chain |
-分子 #2: NCOA4 (Nuclear Receptor Coactivator 4)
分子 | 名称: NCOA4 (Nuclear Receptor Coactivator 4) / タイプ: protein_or_peptide / ID: 2 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO |
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由来(天然) | 生物種: ![]() |
分子量 | 理論値: 1.877122 KDa |
組換発現 | 生物種: ![]() ![]() |
配列 | 文字列: DSFQVIKNSP LSEWLI |
-分子 #3: FE (III) ION
分子 | 名称: FE (III) ION / タイプ: ligand / ID: 3 / コピー数: 2 / 式: FE |
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分子量 | 理論値: 55.845 Da |
-分子 #4: water
分子 | 名称: water / タイプ: ligand / ID: 4 / コピー数: 1 / 式: HOH |
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分子量 | 理論値: 18.015 Da |
Chemical component information | ![]() ChemComp-HOH: |
-実験情報
-構造解析
手法 | クライオ電子顕微鏡法 |
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![]() | 単粒子再構成法 |
試料の集合状態 | particle |
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試料調製
緩衝液 | pH: 7.5 |
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凍結 | 凍結剤: ETHANE |
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電子顕微鏡法
顕微鏡 | TFS GLACIOS |
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撮影 | フィルム・検出器のモデル: FEI FALCON IV (4k x 4k) 平均電子線量: 30.0 e/Å2 |
電子線 | 加速電圧: 200 kV / 電子線源: ![]() |
電子光学系 | 照射モード: FLOOD BEAM / 撮影モード: BRIGHT FIELD / 最大 デフォーカス(公称値): 2.0 µm / 最小 デフォーカス(公称値): 0.5 µm / 倍率(公称値): 130000 |
試料ステージ | ホルダー冷却材: NITROGEN |