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基本情報
登録情報 | ![]() | |||||||||
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タイトル | CryoDRGN Reconstruction of 80S Ribosome in Unrotated State from S.cerevisiae Prepared using Cryo-plasmaFIB Milling | |||||||||
![]() | TOMOMAN-STOPGAP-Warp-Relion-M CryoDRGN-ET 80S yeast unrotated | |||||||||
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![]() | yeast 80S / RIBOSOME | |||||||||
生物種 | ![]() ![]() | |||||||||
手法 | サブトモグラム平均法 / クライオ電子顕微鏡法 / 解像度: 4.5 Å | |||||||||
![]() | Rangan R / Khavnekar S / Lerer A / Johnston J / Kelley R / Obr M / Kotecha A / Zhong ED | |||||||||
資金援助 | ![]()
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![]() | ![]() タイトル: Deep reconstructing generative networks for visualizing dynamic biomolecules inside cells 著者: Rangan R / Khavnekar S / Lerer A / Johnston J / Kelley R / Obr M / Kotecha A / Zhong ED | |||||||||
履歴 |
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構造の表示
添付画像 |
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ダウンロードとリンク
-EMDBアーカイブ
マップデータ | ![]() | 59.4 MB | ![]() | |
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ヘッダ (付随情報) | ![]() ![]() | 12.7 KB 12.7 KB | 表示 表示 | ![]() |
FSC (解像度算出) | ![]() | 9.1 KB | 表示 | ![]() |
画像 | ![]() | 81.3 KB | ||
マスクデータ | ![]() | 64 MB | ![]() | |
その他 | ![]() ![]() | 59.3 MB 59.3 MB | ||
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-検証レポート
文書・要旨 | ![]() | 1.2 MB | 表示 | ![]() |
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文書・詳細版 | ![]() | 1.2 MB | 表示 | |
XML形式データ | ![]() | 15.5 KB | 表示 | |
CIF形式データ | ![]() | 20.3 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-関連構造データ
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リンク
EMDBのページ | ![]() ![]() |
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マップ
ファイル | ![]() | ||||||||||||||||||||
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注釈 | TOMOMAN-STOPGAP-Warp-Relion-M CryoDRGN-ET 80S yeast unrotated | ||||||||||||||||||||
ボクセルのサイズ | X=Y=Z: 1.96 Å | ||||||||||||||||||||
密度 |
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対称性 | 空間群: 1 | ||||||||||||||||||||
詳細 | EMDB XML:
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-添付データ
-マスク #1
ファイル | ![]() | ||||||||||||
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投影像・断面図 |
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密度ヒストグラム |
-ハーフマップ: TOMOMAN-STOPGAP-Warp-Relion-M CryoDRGN-ET 80S yeast unrotated
ファイル | emd_18232_half_map_1.map | ||||||||||||
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注釈 | TOMOMAN-STOPGAP-Warp-Relion-M CryoDRGN-ET 80S yeast unrotated | ||||||||||||
投影像・断面図 |
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密度ヒストグラム |
-ハーフマップ: TOMOMAN-STOPGAP-Warp-Relion-M CryoDRGN-ET 80S yeast unrotated
ファイル | emd_18232_half_map_2.map | ||||||||||||
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注釈 | TOMOMAN-STOPGAP-Warp-Relion-M CryoDRGN-ET 80S yeast unrotated | ||||||||||||
投影像・断面図 |
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密度ヒストグラム |
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試料の構成要素
-全体 : 80S S. cerevisiae
全体 | 名称: 80S S. cerevisiae |
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要素 |
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-超分子 #1: 80S S. cerevisiae
超分子 | 名称: 80S S. cerevisiae / タイプ: complex / ID: 1 / 親要素: 0 |
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由来(天然) | 生物種: ![]() ![]() |
-実験情報
-構造解析
手法 | クライオ電子顕微鏡法 |
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![]() | サブトモグラム平均法 |
試料の集合状態 | cell |
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試料調製
緩衝液 | pH: 7 |
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凍結 | 凍結剤: ETHANE |
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電子顕微鏡法
顕微鏡 | FEI TITAN KRIOS |
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撮影 | フィルム・検出器のモデル: FEI FALCON IV (4k x 4k) 平均電子線量: 3.5 e/Å2 |
電子線 | 加速電圧: 300 kV / 電子線源: ![]() |
電子光学系 | 照射モード: FLOOD BEAM / 撮影モード: BRIGHT FIELD / 最大 デフォーカス(公称値): 3.5 µm / 最小 デフォーカス(公称値): 1.0 µm |
実験機器 | ![]() モデル: Titan Krios / 画像提供: FEI Company |