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基本情報
登録情報 | ![]() | |||||||||
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タイトル | In situ tropomyosin decorated actin filament at focal adhesion | |||||||||
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![]() | focal adhesion / stress fiber / CELL ADHESION | |||||||||
生物種 | ![]() ![]() | |||||||||
手法 | サブトモグラム平均法 / クライオ電子顕微鏡法 / 解像度: 15.3 Å | |||||||||
![]() | Wen-Lu C / Ohad M | |||||||||
資金援助 | European Union, 1件
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![]() | ![]() タイトル: A mixed actin polarity network at focal adhesion 著者: Wen-Lu C / Ohad M | |||||||||
履歴 |
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構造の表示
添付画像 |
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ダウンロードとリンク
-EMDBアーカイブ
マップデータ | ![]() | 12 MB | ![]() | |
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ヘッダ (付随情報) | ![]() ![]() | 11 KB 11 KB | 表示 表示 | ![]() |
画像 | ![]() | 16.3 KB | ||
Filedesc metadata | ![]() | 3.6 KB | ||
その他 | ![]() ![]() | 12 MB 12 MB | ||
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-検証レポート
文書・要旨 | ![]() | 625.1 KB | 表示 | ![]() |
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文書・詳細版 | ![]() | 624.7 KB | 表示 | |
XML形式データ | ![]() | 9.7 KB | 表示 | |
CIF形式データ | ![]() | 11.3 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-関連構造データ
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リンク
EMDBのページ | ![]() ![]() |
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マップ
ファイル | ![]() | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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投影像・断面図 | 画像のコントロール
画像は Spider により作成 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
ボクセルのサイズ | X=Y=Z: 2.20651 Å | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
密度 |
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対称性 | 空間群: 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
詳細 | EMDB XML:
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-添付データ
-ハーフマップ: #2
ファイル | emd_17744_half_map_1.map | ||||||||||||
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投影像・断面図 |
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密度ヒストグラム |
-ハーフマップ: #1
ファイル | emd_17744_half_map_2.map | ||||||||||||
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投影像・断面図 |
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密度ヒストグラム |
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試料の構成要素
-全体 : Mouse embryonic fibroblast
全体 | 名称: Mouse embryonic fibroblast |
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要素 |
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-超分子 #1: Mouse embryonic fibroblast
超分子 | 名称: Mouse embryonic fibroblast / タイプ: cell / ID: 1 / 親要素: 0 |
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由来(天然) | 生物種: ![]() ![]() |
-実験情報
-構造解析
手法 | クライオ電子顕微鏡法 |
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![]() | サブトモグラム平均法 |
試料の集合状態 | cell |
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試料調製
緩衝液 | pH: 7.4 |
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凍結 | 凍結剤: ETHANE |
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電子顕微鏡法
顕微鏡 | FEI TITAN KRIOS |
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撮影 | フィルム・検出器のモデル: GATAN K2 SUMMIT (4k x 4k) 平均電子線量: 2.9 e/Å2 |
電子線 | 加速電圧: 300 kV / 電子線源: ![]() |
電子光学系 | 照射モード: FLOOD BEAM / 撮影モード: BRIGHT FIELD / 最大 デフォーカス(公称値): 5.0 µm / 最小 デフォーカス(公称値): 4.0 µm |
実験機器 | ![]() モデル: Titan Krios / 画像提供: FEI Company |
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画像解析
最終 再構成 | 想定した対称性 - らせんパラメータ - Δz: 28.0923 Å 想定した対称性 - らせんパラメータ - ΔΦ: -166.781 ° 想定した対称性 - らせんパラメータ - 軸対称性: C1 (非対称) 解像度のタイプ: BY AUTHOR / 解像度: 15.3 Å / 解像度の算出法: FSC 0.143 CUT-OFF / 使用したサブトモグラム数: 37330 |
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抽出 | トモグラム数: 189 / 使用した粒子像数: 38900 |
最終 角度割当 | タイプ: ANGULAR RECONSTITUTION |