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- EMDB-17457: Spraguea lophii ribosome dimer -

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基本情報

登録情報
データベース: EMDB / ID: EMD-17457
タイトルSpraguea lophii ribosome dimer
マップデータ
試料
  • 複合体: Ribosome
    • RNA: x 3種
    • タンパク質・ペプチド: x 72種
  • リガンド: x 1種
キーワードMicrosporidia / RIBOSOME
機能・相同性
機能・相同性情報


90S preribosome / translation regulator activity / maturation of LSU-rRNA / maturation of LSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA) / rescue of stalled ribosome / ribosomal large subunit biogenesis / maturation of SSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA) / protein kinase C binding / modification-dependent protein catabolic process / protein tag activity ...90S preribosome / translation regulator activity / maturation of LSU-rRNA / maturation of LSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA) / rescue of stalled ribosome / ribosomal large subunit biogenesis / maturation of SSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA) / protein kinase C binding / modification-dependent protein catabolic process / protein tag activity / ribosomal small subunit biogenesis / small ribosomal subunit rRNA binding / ribosome binding / ribosomal small subunit assembly / small ribosomal subunit / 5S rRNA binding / large ribosomal subunit rRNA binding / cytosolic small ribosomal subunit / ribosomal large subunit assembly / cytoplasmic translation / cytosolic large ribosomal subunit / negative regulation of translation / rRNA binding / ribosome / protein ubiquitination / structural constituent of ribosome / ribonucleoprotein complex / positive regulation of protein phosphorylation / translation / mRNA binding / ubiquitin protein ligase binding / nucleolus / RNA binding / zinc ion binding / membrane / nucleus / cytosol / cytoplasm
類似検索 - 分子機能
CXXC motif containing zinc binding protein, eukaryotic / CXXC motif containing zinc binding protein, eukaryotic / Ribosomal protein L18e / Ribosomal protein 60S L18 and 50S L18e / Ribosomal protein S26e / Ribosomal protein S26e superfamily / Ribosomal protein S26e / Ribosomal protein S5, eukaryotic/archaeal / Ribosomal protein S21e / Ribosomal protein S21e superfamily ...CXXC motif containing zinc binding protein, eukaryotic / CXXC motif containing zinc binding protein, eukaryotic / Ribosomal protein L18e / Ribosomal protein 60S L18 and 50S L18e / Ribosomal protein S26e / Ribosomal protein S26e superfamily / Ribosomal protein S26e / Ribosomal protein S5, eukaryotic/archaeal / Ribosomal protein S21e / Ribosomal protein S21e superfamily / Ribosomal protein S21e / Small (40S) ribosomal subunit Asc1/RACK1 / Ribosomal protein L22e / Ribosomal protein L22e superfamily / S27a-like superfamily / Ribosomal L22e protein family / 40S Ribosomal protein S10 / Ribosomal protein L44e signature. / Plectin/S10, N-terminal / Ribosomal protein L10e, conserved site / Plectin/S10 domain / Ribosomal protein L10e signature. / Ribosomal protein S25 / S25 ribosomal protein / Ribosomal protein L10e / Ribosomal protein L13e / Ribosomal protein L13e / Ribosomal protein S27a / Ribosomal protein S27a / Ribosomal protein S27a / Ribosomal protein S2, eukaryotic/archaeal / 60S ribosomal protein L18a/ L20, eukaryotes / 40S ribosomal protein S29/30S ribosomal protein S14 type Z / : / Ribosomal protein L44e / Ribosomal protein L44 / Ribosomal protein L34e, conserved site / Ribosomal protein L34e signature. / Ribosomal protein L5 eukaryotic, C-terminal / Ribosomal L18 C-terminal region / 50S ribosomal protein L18Ae/60S ribosomal protein L20 and L18a / Ribosomal protein S19e / Ribosomal protein S19e / Ribosomal_S19e / Ribosomal protein 50S-L18Ae/60S-L20/60S-L18A / Ribosomal L40e family / Ribosomal proteins 50S-L18Ae/60S-L20/60S-L18A / Ribosomal protein S4e, N-terminal, conserved site / Ribosomal protein S4e signature. / Ribosomal_L40e / Ribosomal protein L40e / 40S ribosomal protein S4, C-terminal domain / Ribosomal protein L40e superfamily / 40S ribosomal protein S4 C-terminus / Ribosomal protein S19A/S15e / Ribosomal protein L27e / Ribosomal protein L27e superfamily / Ribosomal L27e protein family / : / Ribosomal protein L34Ae / Ribosomal protein L34e / 60S ribosomal protein L19 / Ribosomal protein S4e, N-terminal / Ribosomal protein L30/YlxQ / RS4NT (NUC023) domain / Ribosomal protein L7A/L8 / Ribosomal protein L13, eukaryotic/archaeal / 40S ribosomal protein S11, N-terminal / Ribosomal_S17 N-terminal / Ribosomal protein S7e / Ribosomal protein S7e / Ribosomal protein S4, KOW domain / Ribosomal protein S4e / Ribosomal protein S4e, central region / Ribosomal protein S4e, central domain superfamily / Ribosomal family S4e / 60S ribosomal protein L6E / Ribosomal protein S24e / Ribosomal protein S24e / Ribosomal_L19e / Ribosomal protein L19/L19e / Ribosomal protein L19/L19e, domain 1 / Ribosomal protein L19/L19e superfamily / Ribosomal protein L19e / Ribosomal protein L36e / Ribosomal protein L36e domain superfamily / Ribosomal protein L36e / Ribosomal protein S8e / Ribosomal protein L39e / Ribosomal protein L39e domain superfamily / Ribosomal L39 protein / Ribosomal protein L35A / Ribosomal protein L35Ae / Ribosomal protein L5 eukaryotic/L18 archaeal / Ribosomal large subunit proteins 60S L5, and 50S L18 / Ribosomal protein L35A superfamily / Ribosomal protein L32e, conserved site / Ribosomal protein L32e signature. / Ribosomal protein S5/S7, eukaryotic/archaeal / Ribosomal protein S13/S15, N-terminal
類似検索 - ドメイン・相同性
40S ribosomal protein S5 / Uncharacterized protein / 60S ribosomal protein L6 / 60S ribosomal protein L35a / 40S ribosomal protein S14 / Ribosomal protein L15 / Ribosomal protein L34 / 40S ribosomal protein S12 / 40S Ribosomal protein S19 / 40S ribosomal protein S2 ...40S ribosomal protein S5 / Uncharacterized protein / 60S ribosomal protein L6 / 60S ribosomal protein L35a / 40S ribosomal protein S14 / Ribosomal protein L15 / Ribosomal protein L34 / 40S ribosomal protein S12 / 40S Ribosomal protein S19 / 40S ribosomal protein S2 / 60S ribosomal protein L26 / 40S ribosomal protein S9 / 60s ribosomal protein L21 / 40s ribosomal protein s24 / 40S ribosomal protein S11 / 40S ribosomal protein S0 / 60S ribosomal protein L7 / Large ribosomal subunit protein eL22 / 40S ribosomal protein S20 / 40S ribosomal protein S26 / Ubiquitin/40s ribosomal protein S27a fusion / Ribosomal protein S21E / 60S ribosomal protein L20 / 60S ribosomal protein L18 / 40S ribosomal protein S25 / 40S ribosomal protein S3 / 60S ribosomal protein L3 / 60S ribosomal protein L11 / S60 ribosomal protein L10 / 60S ribosomal protein L19 / 60S ribosomal protein L4 / 60S ribosomal protein L17 / 40S ribosomal protein S16 / 60S ribosomal protein L36 / 60S ribosomal protein L3 / 60S ribosomal protein L23a / 40S ribosomal protein S4 / 40S ribosomal protein S8 / 60S ribosomal protein L5 / 40S ribosomal protein S18 / 40S ribosomal protein S29 / 40S ribosomal protein S15A / 60S ribosomal protein L32 / Ribosomal protein S19 / 60S ribosomal protein L44 / Ribosomal protein L23 / 60S ribosomal protein L9 / Ubiquitin / Ribosomal protein L24E / 60S ribosomal protein L39 / 60S ribosomal protein L27 / 40S ribosomal protein S10 / 60S ribosomal protein L8 / Ribosomal protein L13A / 40S ribosomal protein S7 / Guanine nucleotide binding protein beta subunit / 60S ribosomal protein L13 / Uncharacterized protein / 40S ribosomal protein S13 / 60S ribosomal protein L31
類似検索 - 構成要素
生物種Spraguea lophii 42_110 (菌類)
手法サブトモグラム平均法 / クライオ電子顕微鏡法 / 解像度: 14.3 Å
データ登録者Gil Diez P / McLaren M / Isupov MN / Daum B / Conners R / Williams B
資金援助 英国, 1件
OrganizationGrant number国
Wellcome Trust212439/Z/18/Z 英国
引用ジャーナル: Nat Microbiol / 年: 2023
タイトル: CryoEM reveals that ribosomes in microsporidian spores are locked in a dimeric hibernating state.
著者: Mathew McLaren / Rebecca Conners / Michail N Isupov / Patricia Gil-Díez / Lavinia Gambelli / Vicki A M Gold / Andreas Walter / Sean R Connell / Bryony Williams / Bertram Daum /
要旨: Translational control is an essential process for the cell to adapt to varying physiological or environmental conditions. To survive adverse conditions such as low nutrient levels, translation can be ...Translational control is an essential process for the cell to adapt to varying physiological or environmental conditions. To survive adverse conditions such as low nutrient levels, translation can be shut down almost entirely by inhibiting ribosomal function. Here we investigated eukaryotic hibernating ribosomes from the microsporidian parasite Spraguea lophii in situ by a combination of electron cryo-tomography and single-particle electron cryo-microscopy. We show that microsporidian spores contain hibernating ribosomes that are locked in a dimeric (100S) state, which is formed by a unique dimerization mechanism involving the beak region. The ribosomes within the dimer are fully assembled, suggesting that they are ready to be activated once the host cell is invaded. This study provides structural evidence for dimerization acting as a mechanism for ribosomal hibernation in microsporidia, and therefore demonstrates that eukaryotes utilize this mechanism in translational control.
履歴
登録2023年5月24日-
ヘッダ(付随情報) 公開2023年6月21日-
マップ公開2023年6月21日-
置き換え2023年8月2日ID: EMD-14020
更新2023年12月20日-
現状2023年12月20日処理サイト: PDBe / 状態: 公開

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構造の表示

添付画像

emd_17457.png

ダウンロードとリンク

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マップ

ファイルダウンロード / ファイル: emd_17457.map.gz / 形式: CCP4 / 大きさ: 18.1 MB / タイプ: IMAGE STORED AS FLOATING POINT NUMBER (4 BYTES)
投影像・断面図

画像のコントロール

大きさ
明度
コントラスト
その他
軸Z (Sec.)Y (Row.)X (Col.)
4.6 Å/pix.
x 168 pix.
= 772.8 Å		4.6 Å/pix.
x 168 pix.
= 772.8 Å		4.6 Å/pix.
x 168 pix.
= 772.8 Å

表面

投影像

断面 (1/3)

断面 (1/2)

断面 (2/3)

画像は Spider により作成

ボクセルのサイズX=Y=Z: 4.6 Å
密度

ヒストグラム

ヒストグラム (対数)
表面レベル登録者による: 0.58
最小 - 最大-1.2114499 - 1.8496487
平均 (標準偏差)0.0068838005 (±0.11798258)
対称性空間群: 1
詳細

EMDB XML:

マップ形状
Axis orderXYZ
Origin000
サイズ168168168
Spacing168168168
セルA=B=C: 772.8 Å
α=β=γ: 90.0 °

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添付データ

-
ハーフマップ: #1

ファイルemd_17457_half_map_1.map
投影像・断面図
軸ZYX

投影像

断面 (1/2)
密度ヒストグラム

ヒストグラム

ヒストグラム (対数)

-
ハーフマップ: #2

ファイルemd_17457_half_map_2.map
投影像・断面図
軸ZYX

投影像

断面 (1/2)
密度ヒストグラム

ヒストグラム

ヒストグラム (対数)

-
試料の構成要素

+
全体 : Ribosome

全体名称: Ribosome
要素
  • 複合体: Ribosome
    • RNA: RNA 28S
    • RNA: RNA 5S
    • タンパク質・ペプチド: 60S ribosomal protein L8
    • タンパク質・ペプチド: Ribosomal protein L18e/L15P
    • タンパク質・ペプチド: 60S ribosomal protein L3
    • タンパク質・ペプチド: 60S ribosomal protein L4
    • タンパク質・ペプチド: 60S ribosomal protein L3
    • タンパク質・ペプチド: 60S ribosomal protein L5
    • タンパク質・ペプチド: 60S ribosomal protein L31
    • タンパク質・ペプチド: 60S ribosomal protein L6
    • タンパク質・ペプチド: 60S ribosomal protein L32
    • タンパク質・ペプチド: 60S ribosomal protein L7
    • タンパク質・ペプチド: 60S ribosomal protein L35a
    • タンパク質・ペプチド: 60S ribosomal protein L8
    • タンパク質・ペプチド: Ribosomal protein L34
    • タンパク質・ペプチド: 60S ribosomal protein L9
    • タンパク質・ペプチド: Ribosomal L29 protein
    • タンパク質・ペプチド: S60 ribosomal protein L10
    • タンパク質・ペプチド: 60S ribosomal protein L36
    • タンパク質・ペプチド: 60S ribosomal protein L11
    • タンパク質・ペプチド: 60S ribosomal protein L37
    • タンパク質・ペプチド: 60S ribosomal protein L13
    • タンパク質・ペプチド: 60S ribosomal protein L39
    • タンパク質・ペプチド: Transposase
    • タンパク質・ペプチド: Ubiquitin
    • タンパク質・ペプチド: Ribosomal protein L15
    • タンパク質・ペプチド: Ribosomal protein L13A
    • タンパク質・ペプチド: 60S ribosomal protein L44
    • タンパク質・ペプチド: 60S ribosomal protein L17
    • タンパク質・ペプチド: 60S ribosomal protein L37a
    • タンパク質・ペプチド: 60S ribosomal protein L18
    • タンパク質・ペプチド: 60S ribosomal protein L19
    • タンパク質・ペプチド: 60S ribosomal protein L20
    • タンパク質・ペプチド: 60s ribosomal protein L21
    • タンパク質・ペプチド: 60S ribosomal protein L22
    • タンパク質・ペプチド: Ribosomal protein L23
    • タンパク質・ペプチド: Ribosomal protein L24E
    • タンパク質・ペプチド: 60S ribosomal protein L23a
    • タンパク質・ペプチド: 60S ribosomal protein L26
    • タンパク質・ペプチド: 60S ribosomal protein L27
    • タンパク質・ペプチド: DNL-type domain-containing protein
    • RNA: RNA 16S
    • タンパク質・ペプチド: 40S ribosomal protein S0
    • タンパク質・ペプチド: 40S ribosomal protein S26
    • タンパク質・ペプチド: 40S ribosomal protein S1
    • タンパク質・ペプチド: 40S ribosomal protein S27
    • タンパク質・ペプチド: 40S ribosomal protein S2
    • タンパク質・ペプチド: 40S ribosomal protein S28
    • タンパク質・ペプチド: 40S ribosomal protein S3
    • タンパク質・ペプチド: 40S ribosomal protein S29
    • タンパク質・ペプチド: 40S ribosomal protein S4
    • タンパク質・ペプチド: 40S ribosomal protein S30
    • タンパク質・ペプチド: 40S ribosomal protein S5
    • タンパク質・ペプチド: Ubiquitin/40s ribosomal protein S27a fusion
    • タンパク質・ペプチド: 40S ribosomal protein S6
    • タンパク質・ペプチド: Guanine nucleotide binding protein beta subunit
    • タンパク質・ペプチド: 40S ribosomal protein S7
    • タンパク質・ペプチド: 40S ribosomal protein S8
    • タンパク質・ペプチド: 40S ribosomal protein S9
    • タンパク質・ペプチド: 40S ribosomal protein S10
    • タンパク質・ペプチド: 40S ribosomal protein S11
    • タンパク質・ペプチド: 40S ribosomal protein S12
    • タンパク質・ペプチド: 40S ribosomal protein S13
    • タンパク質・ペプチド: 40S ribosomal protein S14
    • タンパク質・ペプチド: 40S ribosomal protein S16
    • タンパク質・ペプチド: 40S ribosomal protein S17
    • タンパク質・ペプチド: 40S ribosomal protein S18
    • タンパク質・ペプチド: 40S Ribosomal protein S19
    • タンパク質・ペプチド: 40S ribosomal protein S20
    • タンパク質・ペプチド: Ribosomal protein S21E
    • タンパク質・ペプチド: 40S ribosomal protein S15A
    • タンパク質・ペプチド: Ribosomal protein S12/S23
    • タンパク質・ペプチド: 40s ribosomal protein s24
    • タンパク質・ペプチド: 40S ribosomal protein S25
    • タンパク質・ペプチド: Ribosomal protein S19
  • リガンド: ZINC ION

+
超分子 #1: Ribosome

超分子名称: Ribosome / タイプ: complex / ID: 1 / 親要素: 0 / 含まれる分子: #1-#75
由来(天然)生物種: Spraguea lophii 42_110 (菌類)

+
分子 #1: RNA 28S

分子名称: RNA 28S / タイプ: rna / ID: 1
詳細: ...詳細: CCACACACAAGGGAUCGUUUGGCUCCUGGGACGAGGAAGGGCGCAGCAGAGAGCGAUAUGUGUGGGAGCAGCAAGCAAUGACCACACGUCCCCGAAUACAGCAUAGUGCUGGAGUACUCCUUGGAAUUAAGCAUAUGAGUAAAGGAAGGAAAAGAAACUAACGAGGAUUCCCGUAGUAGCGGCGAGUGAACAGGGAACAGUCCAACAGUGUAAUUCUCAAAUGAGAAGUUGUCAAAAGGAAGAAGAUGUGAAUCAGAAAGAAAAGCUGAACGAUACAGGGUGAUAGUCCCGUAGUGUCUUCUUACAUACGGUGAGUAGCUGUGCUCGGUAAUGCACAGUGAAGAGGUGGCAGUGUGCAUCUAAGACUAAAUACAACAGGAGACCGAUAGCAAAGAAGUAGGUUGACCGAAAACAUCUAAGUGAAAUUGUGUGUGGACCCGAAUGGAUCGGGCCCGUCUUGAAACACGGACCAAGGAGUGCACAUACACUGCAAGUUGAGCAGAGGAAGUCUGUGAGGCGUAGUGAAGACGGAAAGCAGUGUGAGUGCGACCCGAUAGACUUGUGAACUAUACCUUGUUGCUGUGAAGGCUGGCGAAAGCCAGCUGGAGGCGGCAAGCCGUAUUGAUCUGCAAAUCAUUGGCGUAAGCAGGGUAUAGGGGCGAAAGACCAAUCGAACAGUCUAGUUGCUGGUUCCCUCCGAAAUGUCUAUCAGGACAGCGCGCACGCAGAGAGAAGCAAGGUAGAGCAUGGGCCGGUAUCCUUAAGGAGACGGACGAACUGCGAAUGUGCUUUUCUUCUAUGCAAGCGUAGUGGGCGAGUUCUGGUAAGCAGGACUGGCGAAGAGGAAUGAACCUGGCACUGUGCUAAGGAACCCAAUGUCUGGACAGAGACCGAAAGAGGUAGGUGAAUAAGGACGGUAGGGCGGUAGCCAUGGAAGUCGGCAUCCGGUAAGAAACGUGUUACAACGUACCUACGGAAUUCAUCUGCUCUGAAAAUUGAUGGCGCUUACCAGACAUCCGAUGCACAGUUAGCAGGUAGGAGGGCGUGUGUCUACUGGCGAAGGUACCGAGUGAUCGGUGGUGGAGGUAGAUGCAGAGCAGAUCUUGGUGGUAGUAGCGAUAAUUUGUCUUCAGCGGCAAAGACUGAGGAGGAGAAGGGUUUCUUCUCAUAAGAAGAGUGAGCCGGGUCUAAGCGAGUGUGUAGAAGCAUGAGCGAAGGAGAAACAGGUUGAUAUUCCUGUGCCUGUGCUGUCGUACGGCAACGUGUAUUAGCUUGUCGACACGAACAUCUAGACAAAGCAGAAACACCUUUUCUGUUCAAGGGGAAAAAGACCACUGAGACGGAUCAUCUGGCGACGUGGUUUUAUAUCUGUGACCAGGCCUGAGCCUGGUUUGUUGAGGAUGGUCGUCCAUGAAAAGACAACUAUAUGGCAGCACAGUCCGUACCAACCGUAUCAGGACUCCAAGGUGAAGAGCCUCUAGUGGAUGUUUUACACAUGUAAGGGAAUUCGGCAAAAUGGAUGCGUAACUUCGGGAGAAGUAUUGGUUCAAUUGUGAACUCAUUGUGACAAGGGGAAUCUGACUGUUUAGUAAAAACAUAGCUUCAUGAAGAGAGAUGAAGUGAGUUCUGCCCGGUGCUCGGUCGUGACACGGAGGAAAUGCCAGAAAGCACGGGUUAACGGCGGGAGUAACUAUGACUCUCUUAAGGUAGCCAAACGCCUCGUCAUUUAAAUGGUGACGCGCAUGAAUGGAAUGACGAGAUUCCCACUGUCCCUACAUGUAGACUAGCGAACCCAUUUCCAGGGGAACGGGCCUGGACGGCCAGCGGGGAAAGAAGACCCUGUUGAGCUUGACUCUAGUGUGGCCAAGUUGUGACGAUUGAGGCGAUGUAGGAAGGUGGAGAGCGCAAGCAGAAGUGAAAGACCACUGCGCCAUGAUCAUCACGACACACUUGUUUAAGGACAAAGGCCAGAUGGGGAGUUUGGCUGGGGCGGUACGACCACAGAAUCAGAACGUGGUCGACCGAAGGUACUCACAGCGAGACGAGAACACUCGUGUAGAGCAUAAGGACUAAAGAGUGCCUGAGUGUGAGCACUACUGCUUGCAUGAGGGGAAACCCGGGCCUAGCGAUCCUACGCAUACGAGACACUUGUGGCGUGGGUGUCAGAAAAGUUACCACAGGGAUAACUGGCUUGUGGCCGCCGAGCGUAGAAAGCGACGCGGCUUUUUGAUUCUUCGAUGUCGGCUCUUCCUAGCAUGGCCAUGCAGCCGUGGCGAAGUGUUGGAUUGUUCACCCACUAACAGGGAACGUGAGCUGGGUUUAGACCGUCGUGAGACAGGUUAGUUUUAUCCUACUGUCCAAACAGUUGAAGGGAGUGUGGAUUAGUACGAAAGGAAACCCACACGUGACCUCUGGUGCAGCGGGUGUGCGGAAGUGCAACUGCCAUGCUACGUCUCCUCAAGCAUAGCUGGAAGCCUCUAAGCUAGAAAUGAGUCCUGACUCUGGAAGACGGCCGGGAAGACGACCCGUAGUUAACAGCGGUGUUGUACGAUAUGAGCUUUCUAUUUGUGUAGUAGCGAGUAUUUGAGACACUGGUUGUUACCACCGUCGUUUAUU
コピー数: 2
由来(天然)生物種: Spraguea lophii 42_110 (菌類)
分子量理論値: 849.039812 KDa
配列文字列: AUACCACACA CAAGGGAUCG UUUGGCUCCU GGGACGAGGA AGGGCGCAGC AGAGAGCGAU AUGUGUGGGA GCAGCAGCAA UGACCACAC GUCCCCGAAU ACAGCAUAGU GCUGGAGUAC UCCUUGGAAU UAAGCAUAUG AGUAAAGGAA GGAAAAGAAA C UAACGAGG ...文字列:
AUACCACACA CAAGGGAUCG UUUGGCUCCU GGGACGAGGA AGGGCGCAGC AGAGAGCGAU AUGUGUGGGA GCAGCAGCAA UGACCACAC GUCCCCGAAU ACAGCAUAGU GCUGGAGUAC UCCUUGGAAU UAAGCAUAUG AGUAAAGGAA GGAAAAGAAA C UAACGAGG AUUCCCGUAG UAGCGGCGAG UGAACAGGGA ACAGUCCAAC AGUGUAAUUC UCAAAUGAGA AGUUGUCAAA AG GAAGAAG AUGUGAAUCA GAAAGAAAAG CUGAACGAUA CAGGGUGAUA GUCCCGUAGU GUCUUCUUAC AUACGGUGAG UAG CUGUGC UCGGUAAUGC ACAGUGAAGA GGUGGCAGUG UGCAUCUAAG ACUAAAUACA ACAGGAGACC GAUAGCAAAG AAGU AGGUU GACCGAAAAC AUCUAAGUGA AAUUGUGUGU GGACCCGAAU GGAUCGGGCC CGUCUUGAAA CACGGACCAA GGAGU GCAC AUACACUGCA AGUUGAGCAG AGGAAGUCUG UGAGGCGUAG UGAAGACGGA AAGCAGUGUG AGUGCGACCC GAUAGA CUU GUGAACUAUA CCUUGUUGCU GUGAAGGCUG GCGAAAGCCA GCUGGAGGCG GCAAGCCGUA UUGAUCUGCA AAUCAUU GG CGUAAGCAGG GUAUAGGGGC GAAAGACCAA UCGAACAGUC UAGUUGCUGG UUCCCUCCGA AAUGUCUAUC AGGACAGC G CGCACGCAGA GAGAAGCAAG GUAGAGCAUG GGCCGGUAUC CUUAAGGAGA CGGACGAACU GCGAAUGUGC UUUUCUUCU AUGCAAGCGU AGUGGGCGAG UUCUGGUAAG CAGGACUGGC GAAGAGGAAU GAACCUGGCA CUGUGCUAAG GAACCCAAUG UCUGGACAG AGACCGAAAG AGGUAGGUGA AUAAGGACGG UAGGGCGGUA GCCAUGGAAG UCGGCAUCCG GUAAGAAACG U GUUACAAC GUACCUACGG AAUUCAUCUG CUCUGAAAAU UGAUGGCGCU UACCAGACAU CCGAUGCACA GUUAGCAGGU AG GAGGGCG UGUGUCUACU GGCGAAGGUA CCGAGUGAUC GGUGGUGGAG GUAGAUGCAG AGCAGAUCUU GGUGGUAGUA GCG AUAAUU UGUCUUCAGC GGCAAAGACU GAGGAGGAGA AGGGUUUCUU CUCAUAAGAA GAGUGAGCCG GGUCUAAGCG AGUG UGUAG AAGCAUGAGC GAAGGAGAAA CAGGUUGAUA UUCCUGUGCC UGUGCUGUCG UACGGCAACG UGUAUUAGCU UGUCG ACAC GAACAUCUAG ACAAAGCAGA AACACCUUUU CUGUUCAAGG GGAAAAAGAC CACUGAGACG GAUCAUCUGG CGACGU GGU UUUAUAUCUG UGACCAGGCC UGAGCCUGGU UUGUUGAGGA UGGUCGUCCA UGAAAAGACA ACUAUAUGGC AGCACAG UC CGUACCAACC GUAUCAGGAC UCCAAGGUGA AGAGCCUCUA GUGGAUGUUU UACACAUGUA AGGGAAUUCG GCAAAAUG G AUGCGUAACU UCGGGAGAAG UAUUGGUUCA AUUGUGAACU CAUUGUGACA AGGGGAAUCU GACUGUUUAG UAAAAACAU AGCUUCAUGA AGAGAGAUGA AGUGAGUUCU GCCCGGUGCU CGGUCGUGAC ACGGAGGAAA UGCCAGAAAG CACGGGUUAA CGGCGGGAG UAACUAUGAC UCUCUUAAGG UAGCCAAACG CCUCGUCAUU UAAAUGGUGA CGCGCAUGAA UGGAAUGACG A GAUUCCCA CUGUCCCUAC AUGUAGACUA GCGAACCCAU UUCCAGGGGA ACGGGCCUGG ACGGCCAGCG GGGAAAGAAG AC CCUGUUG AGCUUGACUC UAGUGUGGCC AAGUUGUGAC GAUUGAGGCG AUGUAGGAAG GUGGAGAGCG CAAGCAGAAG UGA AAGACC ACUGCGCCAU GAUCAUCACG ACACACUUGU UUAAGGACAA AGGCCAGAUG GGGAGUUUGG CUGGGGCGGU ACGA CCACA GAAUCAGAAC GUGGUCGACC GAAGGUACUC ACAGCGAGAC GAGAACACUC GUGUAGAGCA UAAGGACUAA AGAGU GCCU GAGUGUGAGC ACUACUGCUU GCAUGAGGGG AAACCCGGGC CUAGCGAUCC UACGCAUACG AGACACUUGU GGCGUG GGU GUCAGAAAAG UUACCACAGG GAUAACUGGC UUGUGGCCGC CGAGCGUAGA AAGCGACGCG GCUUUUUGAU UCUUCGA UG UCGGCUCUUC CUAGCAUGGC CAUGCAGCCG UGGCGAAGUG UUGGAUUGUU CACCCACUAA CAGGGAACGU GAGCUGGG U UUAGACCGUC GUGAGACAGG UUAGUUUUAU CCUACUGUCC AAACAGUUGA AGGGAGUGUG GAUUAGUACG AAAGGAAAC CCACACGUGA CCUCUGGUGC AGCGGGUGUG CGGAAGUGCA ACUGCCAUGC UACGUCUCCU CAAGCAUAGC UGGAAGCCUC UAAGCUAGA AAUGAGUCCU GACUCUGGAA GACGGCCGGG AAGACGACCC GUAGUUAACA GCGGUGUUGU ACGAUAUGAG C UUUCUAUU UGUGUAGUAG CGAGUAUUUG AGACACUGGU UGUUACCACC GUCGUUUAUU

+
分子 #2: RNA 5S

分子名称: RNA 5S / タイプ: rna / ID: 2 / コピー数: 2
由来(天然)生物種: Spraguea lophii 42_110 (菌類)
分子量理論値: 38.356801 KDa
配列文字列:
AGUUACGGCC AUAUCUACUG AAAAACACCG GAUCCCGUCC GAUCUCCGAA GUUAAGCCAA UAAGAGCCAU GCGAGUAUUA AGGUGGGCG ACUACUUGAG AAAGCGUGGU GCUGUAGUUU

+
分子 #42: RNA 16S

分子名称: RNA 16S / タイプ: rna / ID: 42 / コピー数: 2
由来(天然)生物種: Spraguea lophii 42_110 (菌類)
分子量理論値: 444.812531 KDa
配列文字列: ACCAGGUUGA UUCUGCCUGA CGUGGAUGCU AGUCUCAUAG AUUUAGCCAU GCAUGUGUAA GCGAAGCGAU UAGUGAAGCG GCGGAAGGC UCAGUAACGG GCGAGUAUUU AAUCUCUAGA ACCGGACAAC CUCAGGAAAC AGAGGGGAAA ACGGAGUAAG A GCAUGUGU ...文字列:
ACCAGGUUGA UUCUGCCUGA CGUGGAUGCU AGUCUCAUAG AUUUAGCCAU GCAUGUGUAA GCGAAGCGAU UAGUGAAGCG GCGGAAGGC UCAGUAACGG GCGAGUAUUU AAUCUCUAGA ACCGGACAAC CUCAGGAAAC AGAGGGGAAA ACGGAGUAAG A GCAUGUGU UGUUAGCAUG UGAUGAGAAC AACAGUGCAG GAGAGUAAGA AGCCAUCCCA UCAGUUAGUA AGUAGGGUAA GG GCCUAUU UAGACGUAGA CGGGUACGGG GGAUUAGGGU UUGAUUCCGG AGAGGGAGCC UGAGAGACGG CUACCAGGUC CAA GGACAG CAGCAGGCGC GAAAAUUACC GAAGCCUCCA AGAGGGCGGU AGUGAAGAGA CGUGAAAACA AGUGUGUGUA AAAA CCACA UGAGUAACUG GAGGUCAAGG CUGGUGCCAG CAUCCGCGGU AAUACCAGCU CCAGGAGUGU CUAUGAUGAU UGCUG CGAU UAAAAGGUCC GUAGUCGAAG AACAGUACUU GUUUGUAAUG UGGCUUAUCG AGAGCCGAAU AGAACGAGAA GAGUUC AGA GUAAGGAGCG AAGGAGGGCU AGAUUAUUGA GCAGCGAGAG GUGAAAUUUG AUGACCUGCU UAGGAGUAAC AGAGGCG AA AGCGCUAGUC AAGAACGAAU CCGAUGAUCA AGGACGUAGG CUGGAGGAUC GAAGACGAUU AGAGACCGUA GUAGUUCC A GCAGUAAACG AUGCCUACGC UGUUGUGGUU AUGAGCACGG CAGAAGAGAA AUCUAGUAGG GCUUUGGGGA GAGUACGCG CGCAAGCGAU AAAUUUAAAG GAAAUUGACG GAAGAACACC ACAAGGAGUG GAGUGUGCGG CUUAAUUUGA CUCAACGCGG GACAGCUUA CCAUACCCGA UGGCCGUGUG AGCGUAGUAC GCGAUAGGUC AGAGAGUGGU GCAUGGCCGU UAACGACGAG U GGGGUGAC CUUUGGGUUA AGUCCGCGAA GUAGUGAGAU CCCUAGGAUA CGAAAGUUAU CGACAGGUGU UAAAAACACA GG AAGGAAG GGGCAAGAAC AGGUCAGUGA UGCCCUUAGA UGGUAUGGGC UGCACGCGCA CUACAGUGGU CACAGCAGAA ACA AAUAGA AGUAAAUGUG AUCGAGAGGG AAUGAGCACU GUAAUGUGCA CAGGAACGAG GAAUUGCUAG UAAUCGUUAU CUCA UUAAG AAGCGAUGAA UGUGUCCCUG UUCUUUGUAC ACACCGCCCG UCGUUAUCGA AGAUGGAACC AGGUGCGAAC AAGUG AAAG CGAGUGAGUG CAGGGUUCUA GAUCUGAUAC AAGUCGUAAC AAGGCAGCUG UAGGAGAACC UGUAGCUGGA UCAACU AGU UAAUU

+
分子 #3: 60S ribosomal protein L8

分子名称: 60S ribosomal protein L8 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 3 / コピー数: 2 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Spraguea lophii 42_110 (菌類)
分子量理論値: 27.0055 KDa
配列文字列: MGKVIRTLRL QKEHWKRKHH KSKGIVGFPT LKNCEATVEK IVHESGRPAP LAIINYKKEE KNTKGLLVAI EGIYEGQKIQ IGENASLEL GNVCPIKEIP EGSLVSMVEK KPKDGGKYVK SPGCYATIVY HNKLTNQTTI KLPSGERVRV TGESRALLGI I AGGGKDDK ...文字列:
MGKVIRTLRL QKEHWKRKHH KSKGIVGFPT LKNCEATVEK IVHESGRPAP LAIINYKKEE KNTKGLLVAI EGIYEGQKIQ IGENASLEL GNVCPIKEIP EGSLVSMVEK KPKDGGKYVK SPGCYATIVY HNKLTNQTTI KLPSGERVRV TGESRALLGI I AGGGKDDK PLLKAVNAYY KYKTKGKPWP RVRGVAMNPV DHPHGGGNHQ HVGHPTTVSR NAPVNGRVGL VAARRTGRKK GS RKITVN

+
分子 #4: Ribosomal protein L18e/L15P

分子名称: Ribosomal protein L18e/L15P / タイプ: protein_or_peptide / ID: 4 / コピー数: 2 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Spraguea lophii 42_110 (菌類)
分子量理論値: 16.609498 KDa
配列文字列:
MFNKKSKSRK LRGHVSHGYG RVGKHRKHPA GRGKSGGLKH LRSLFQRYHP DHFRKLGIVM FHRNKNADFT RTVNVSNLWG LMKLEEQMK FKSSAEVPVV DCRNYGYLKV LGGGDLSVKK PIVVIARQFT KDAEEKINAV GGKCVVAA

+
分子 #5: 60S ribosomal protein L3

分子名称: 60S ribosomal protein L3 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 5 / コピー数: 2 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Spraguea lophii 42_110 (菌類)
分子量理論値: 44.320641 KDa
配列文字列: MSCRNYSAPR HGSLAYCPKK RAKTTKPAIK SFPKDDASKP VHLTGYLAYK VGMTHVVRLS TRRSKTERVL KETQKEVLDA VTILEVPAM RIFGMVGYKS TVNGLKAIKT VYAEHLDEQV LARLRKRNSR SSKLMFKLYP QKYENGDIKR DYELLKRESD V VRVLAHTQ ...文字列:
MSCRNYSAPR HGSLAYCPKK RAKTTKPAIK SFPKDDASKP VHLTGYLAYK VGMTHVVRLS TRRSKTERVL KETQKEVLDA VTILEVPAM RIFGMVGYKS TVNGLKAIKT VYAEHLDEQV LARLRKRNSR SSKLMFKLYP QKYENGDIKR DYELLKRESD V VRVLAHTQ VSKIPSLNLK KAHILEIQLN GGTIEEKIEW AIERLEKEIP VSEVFSQQDL IDVIGVTKGK GKEGTTKRFG TT ILQHKSR KGKRKVACIG AWHPANVRRT VARAGQLGFH RRTAQNKKIY MMGNGKTPFS TEYDLTSKTI NPMGGFLRYG NVK SDFIMV KGGIQGPSKR VLALRKAFAP SNLGKDNEEI VLKFVDASSK KGYGRFQTTE EKKAYFGIKK AEVVEQ

UniProtKB: 60S ribosomal protein L3

+
分子 #6: 60S ribosomal protein L4

分子名称: 60S ribosomal protein L4 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 6 / コピー数: 2 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Spraguea lophii 42_110 (菌類)
分子量理論値: 37.241633 KDa
配列文字列: MSRQVNIIEQ DGTSSRTTSV PAVFNLNVRQ DLISFTHKNV AMNSRQPYAV KPGAGMRHSA KSWGTGRAMA RVPRVRAGGT RRAGQGANA NFCRGGRMFA PTNVNRRWNR KTLLSIRRYA SAMAVAATSI PAYVEGRGHR IEQIENIPLV LSNKIDTEKT K EGIKILYN ...文字列:
MSRQVNIIEQ DGTSSRTTSV PAVFNLNVRQ DLISFTHKNV AMNSRQPYAV KPGAGMRHSA KSWGTGRAMA RVPRVRAGGT RRAGQGANA NFCRGGRMFA PTNVNRRWNR KTLLSIRRYA SAMAVAATSI PAYVEGRGHR IEQIENIPLV LSNKIDTEKT K EGIKILYN LGLKEELDKV EESKNIRAGK GKWRNRRYVL KKGPLFVYTS ETSFTKAIRN IPGVDTERVE NLSILDLAPG GQ AGRLIIW MEDAFEKLTE IYGEMNEESK FKKGYTMGMD VAENIDVENI FYSDEVQEFI DIPNFIKKDK MVMEKNKLAE IQQ YVEIEE RI

UniProtKB: 60S ribosomal protein L4

+
分子 #7: 60S ribosomal protein L3

分子名称: 60S ribosomal protein L3 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 7 / コピー数: 2 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Spraguea lophii 42_110 (菌類)
分子量理論値: 12.484438 KDa
配列文字列:
MSRKRSKREE SFVDKLPLAL KTGKVNLGFK ESLKSLVEKK TKLLILTSNF SPIKRKTLEY YAAISNNTPI YYYDGSNNDL SKNCGKYFR IGVISIQDFG EADLMNAMAQ A

UniProtKB: 60S ribosomal protein L3

+
分子 #8: 60S ribosomal protein L5

分子名称: 60S ribosomal protein L5 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 8 / コピー数: 2 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Spraguea lophii 42_110 (菌類)
分子量理論値: 33.89225 KDa
配列文字列: MVSNSINFQS DNKSKKSYFQ RFQTKKRRRR LCKTNYRRRT KLIKLDQKNV GEDKSRLVVR ITNSKVICQV VKSHLGGDMV VAQATSAEL KEFGLKVGFT NYSAAYATGL LCARKILRME KLDNIYKPKF CTDVDVVEDI EGEKNAYRCY LDIGLSRNSK G AKVFAAMK ...文字列:
MVSNSINFQS DNKSKKSYFQ RFQTKKRRRR LCKTNYRRRT KLIKLDQKNV GEDKSRLVVR ITNSKVICQV VKSHLGGDMV VAQATSAEL KEFGLKVGFT NYSAAYATGL LCARKILRME KLDNIYKPKF CTDVDVVEDI EGEKNAYRCY LDIGLSRNSK G AKVFAAMK GASDGGIKIP YSPKIFPGYN KDEEFDQQKL RDRIFGKEVA NYMQLLKKED ETKFKKQFSE YIKQNINAED LE KMYENLF NSIVTKEISK KEKKDYSALK KYKVMKLTKE ERDARVQQKL VENN

UniProtKB: 60S ribosomal protein L5

+
分子 #9: 60S ribosomal protein L31

分子名称: 60S ribosomal protein L31 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 9 / コピー数: 2 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Spraguea lophii 42_110 (菌類)
分子量理論値: 12.854213 KDa
配列文字列:
MAFKDDKAIE LTIPMGKITI DVSKRWKCRI GIRRLKKFIT KTFHDKEAEV QISPDLNKFL WERGMRNVPK RVRVRVNQEP YPKDPSKKV YKLSHVVVST FKGLGTEAIA E

UniProtKB: 60S ribosomal protein L31

+
分子 #10: 60S ribosomal protein L6

分子名称: 60S ribosomal protein L6 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 10 / コピー数: 2 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Spraguea lophii 42_110 (菌類)
分子量理論値: 20.220115 KDa
配列文字列:
MQSERQQRLN ISNIKNYYTA DDIPAFAEKL LELHKPAPIE LRTDLVQGNV VVVLEGEYAS YRVVYLSRTE DNKALCMGLP SINGIGLFE IDERFLLRTS IVLDIRLDKK YRAKESKRSF KKFNTKEKVL TKEENDIEEL LLKEIENEKF MKKYFETPYE I NNTVDFYE INH

UniProtKB: 60S ribosomal protein L6

+
分子 #11: 60S ribosomal protein L32

分子名称: 60S ribosomal protein L32 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 11 / コピー数: 2 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Spraguea lophii 42_110 (菌類)
分子量理論値: 16.075998 KDa
配列文字列:
MDIVNPSLSK VIDIINKGKS KKQFKRFQSW RVKRVSESWR KPRGIDNRMR RKFGGAPDMP GIGYKKPNAI RFLLPNGYRK IMVACVKDL EALISLNSFY CAEIRHAVGS KKRIEILERA EELGILVINK EGKLVKEEEE

UniProtKB: 60S ribosomal protein L32

+
分子 #12: 60S ribosomal protein L7

分子名称: 60S ribosomal protein L7 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 12 / コピー数: 2 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Spraguea lophii 42_110 (菌類)
分子量理論値: 27.935564 KDa
配列文字列: MSNVDLIAKK EQYNLRMEEL QKKQQEQHLK RVEENKKYAE KRTVELLETY KKIALEQQLS EERMQKENKI YAPKDPHFYA VVLIKSPLR ASNKIKKTLE LFRLKHINNC VLVKNNESSR QMLQKIRNFV AYGELKLKTL RELIYKRGSC HIFSEKLNIT N ETLEDAFK ...文字列:
MSNVDLIAKK EQYNLRMEEL QKKQQEQHLK RVEENKKYAE KRTVELLETY KKIALEQQLS EERMQKENKI YAPKDPHFYA VVLIKSPLR ASNKIKKTLE LFRLKHINNC VLVKNNESSR QMLQKIRNFV AYGELKLKTL RELIYKRGSC HIFSEKLNIT N ETLEDAFK NIRCIEEFIY ELYFNDERFK ELNNFLNPFK LTPPKGGYKG RKAKDIIEGG AVGNHQDKIG ELIKKMI

UniProtKB: 60S ribosomal protein L7

+
分子 #13: 60S ribosomal protein L35a

分子名称: 60S ribosomal protein L35a / タイプ: protein_or_peptide / ID: 13 / コピー数: 2 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Spraguea lophii 42_110 (菌類)
分子量理論値: 12.757991 KDa
配列文字列:
MEVIKKIELK ERVCAKGTLY SHKRSKKNIY PRYSLITIEN VKTREAAMKY VGNAVELFKP ESTKEESIHG IIKAVHGRSG AVRAKFSRN ISPVEMGSKV YIKLYKMNED EI

UniProtKB: 60S ribosomal protein L35a

+
分子 #14: 60S ribosomal protein L8

分子名称: 60S ribosomal protein L8 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 14 / コピー数: 2 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Spraguea lophii 42_110 (菌類)
分子量理論値: 23.60499 KDa
配列文字列: MSDIQLTKKQ LLSMNPRKLT NKAQMDTRKE VIATRKEALV NAIKLPPALN QFTNYLSEED LKEVSDILSK FRPETRKERK QRLQNERKG PKPIIVKQGI KHVTKLIEEK KAKFVLIACD VDPIEVVLYL PTLCVKMGIP YALVKTKEDL GKIIKKKPTT C LCLCDVSS ...文字列:
MSDIQLTKKQ LLSMNPRKLT NKAQMDTRKE VIATRKEALV NAIKLPPALN QFTNYLSEED LKEVSDILSK FRPETRKERK QRLQNERKG PKPIIVKQGI KHVTKLIEEK KAKFVLIACD VDPIEVVLYL PTLCVKMGIP YALVKTKEDL GKIIKKKPTT C LCLCDVSS DIKSKFENVI AKCNGQFKDN YESAMKVWGS PKEKVKEE

UniProtKB: 60S ribosomal protein L8

+
分子 #15: Ribosomal protein L34

分子名称: Ribosomal protein L34 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 15 / コピー数: 2 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Spraguea lophii 42_110 (菌類)
分子量理論値: 12.020348 KDa
配列文字列:
MVERQVVRRG STFNTRSNKR KKVRTPGNRL VFQDVKKKGK GPKCGQCGIK LAGVKEARPA AFSRMRKSCR KVNRILGGVQ CAKCVQEKV LDAFLNAEEK RMKELEV

UniProtKB: Ribosomal protein L34

+
分子 #16: 60S ribosomal protein L9

分子名称: 60S ribosomal protein L9 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 16 / コピー数: 2 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Spraguea lophii 42_110 (菌類)
分子量理論値: 21.53823 KDa
配列文字列:
MVYVYVEEKV QIPEGCKVEV VNKKVTVTGP KGTVSKDFSH IFVFIDIHEE NVRCRLWNCR KQERSKLITC SKLIKNMIDG SMSGYFYEL KAAYKHFPIT FEIKENGKLL IVKNFLGQKW AREFKMIGDT IIKQGVTKDH LILEGISKED VSQTAGLIQN N CLPKNLDR RIFQDGVYIA TKGLIEEVK

UniProtKB: 60S ribosomal protein L9

+
分子 #17: Ribosomal L29 protein

分子名称: Ribosomal L29 protein / タイプ: protein_or_peptide / ID: 17 / コピー数: 2 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Spraguea lophii 42_110 (菌類)
分子量理論値: 14.183866 KDa
配列文字列:
MKLLAKDLRN NSIEELEKNL VDAKSEMLQI RQKKQSAILK PNELRNGRRN VAVILTIIRE KKYQQLLEKY KDADNIPKEL KPRMNRRKR QELTKKQKKI SKVGKTKLYT KGNKLIYAFE

+
分子 #18: S60 ribosomal protein L10

分子名称: S60 ribosomal protein L10 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 18 / コピー数: 2 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Spraguea lophii 42_110 (菌類)
分子量理論値: 25.142328 KDa
配列文字列: MGRRPGRCYR YCKNKPYIKS RFCRGVPDPK IRIHDLGNKN APCVDLPLNV NLISYSKEQL SSESLESARI AVNKYMMVNA GKDNYHVRI NVHPYHILRI NKMLSCAGAD RLQTGMRLAY GKPYGTAARV RFGQRIISIR TKDSNLKMAM EALRRARYKF P GKYEVQKS ...文字列:
MGRRPGRCYR YCKNKPYIKS RFCRGVPDPK IRIHDLGNKN APCVDLPLNV NLISYSKEQL SSESLESARI AVNKYMMVNA GKDNYHVRI NVHPYHILRI NKMLSCAGAD RLQTGMRLAY GKPYGTAARV RFGQRIISIR TKDSNLKMAM EALRRARYKF P GKYEVQKS NEYGFSGIER SQFEELKNNG KLINMGDHVK IIKEKGTVER YVKLCENAIQ

UniProtKB: S60 ribosomal protein L10

+
分子 #19: 60S ribosomal protein L36

分子名称: 60S ribosomal protein L36 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 19 / コピー数: 2 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Spraguea lophii 42_110 (菌類)
分子量理論値: 11.350697 KDa
配列文字列:
MKINKLNNAS KALSYPVKKL AKTEKAPLTE KQQRSKELKK FAMSIAREVG GLAPYELRAT ELLRRDEDKR CKKFMKKRLG SLKMAKKKI ELLAEEMRA

UniProtKB: 60S ribosomal protein L36

+
分子 #20: 60S ribosomal protein L11

分子名称: 60S ribosomal protein L11 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 20 / コピー数: 2 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Spraguea lophii 42_110 (菌類)
分子量理論値: 19.484965 KDa
配列文字列:
MAEENPMNKI KIQKLCLNIC TGGGEILNKA SKVLEQLTGQ KPRLSKSRLT IRSFGIRRNE KIACHVTVRG EKAMEILEKG IKIKEYELI DSNFSTQGSF GFGIKEHIDM GIKYEPDVGI FGMNFYVVLE KPGIRVSKRK RVKSRVGNKQ RVTKDEAKNW F VKKYEGIV LGK

UniProtKB: 60S ribosomal protein L11

+
分子 #21: 60S ribosomal protein L37

分子名称: 60S ribosomal protein L37 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 21 / コピー数: 2 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Spraguea lophii 42_110 (菌類)
分子量理論値: 10.517657 KDa
配列文字列:
MSKGTPSNGK KNKRNHTTCC RCGSVSFHKQ KGKCSSCAYP EKKMKKMQNR KAMLKKTTGT GKMRHMKKER ISRRAGYPGN PILKEIRNK IKS

+
分子 #22: 60S ribosomal protein L13

分子名称: 60S ribosomal protein L13 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 22 / コピー数: 2 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Spraguea lophii 42_110 (菌類)
分子量理論値: 19.513141 KDa
配列文字列:
MRGNQMLPNN HFNKGSMKFK NWFNQPMRAL KRKEVREQKS KICYPNPLKK LRPVVRCCSM RYNKKVRLGR GFTKMEIEKA GMDIKYAIS VGIAVDLRRK NKNEEGLEEN VKRLMDYKNK LKFFTTVREA RDNKIEQYKG EIMKPVNIIP EVKGIKVEEI A TIYGN

UniProtKB: 60S ribosomal protein L13

+
分子 #23: 60S ribosomal protein L39

分子名称: 60S ribosomal protein L39 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 23 / コピー数: 2 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Spraguea lophii 42_110 (菌類)
分子量理論値: 6.227581 KDa
配列文字列:
MGSIKTRRIK VQLVSALKKN RCIPQWKRAC PGFKQQYNFT KRSWKRKTLK AC

UniProtKB: 60S ribosomal protein L39

+
分子 #24: Transposase

分子名称: Transposase / タイプ: protein_or_peptide / ID: 24
詳細: MYFIKPGCLIKKKFSIYTSIVISVIDNNSVVIQSYDKSDNGDVISIDREVINVSKIVPIGNIDIKNKSKKEIDGILVEENRNLKNKDDVLLMNDFERFKEQLKKEVEDMVIEEMA
コピー数: 2 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Spraguea lophii 42_110 (菌類)
分子量理論値: 13.258343 KDa
配列文字列:
MYFIKPGCLI KKKFSIYTSI VISVIDNNSV VIQSYDKSDN GDVISIDREV INVSKIVPIG NIDIKNKSKK EIDGILVEEN RNLKNKDDV LLMNDFERFK EQLKKEVEDM VIEEMA

UniProtKB: Uncharacterized protein

+
分子 #25: Ubiquitin

分子名称: Ubiquitin / タイプ: protein_or_peptide / ID: 25 / コピー数: 2 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Spraguea lophii 42_110 (菌類)
分子量理論値: 14.563868 KDa
配列文字列:
MQLFLKSPNG TSTIDLALEN TLENVLTNEG VSTENNRFIY NGKQMDTNRC LFEYGFKGLE TIYVTGRICG GKLTDDDKVL AITKFEKQV CRKCYARLPI RATHCRKRAC GYSSKLRGKK KRRDESKK

UniProtKB: Ubiquitin

+
分子 #26: Ribosomal protein L15

分子名称: Ribosomal protein L15 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 26 / コピー数: 2 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Spraguea lophii 42_110 (菌類)
分子量理論値: 24.200426 KDa
配列文字列: MGYLQYLKEI RRDKQSSVMR YLLRVRCWEY RQNTAIHRAS GPTYLDKARM LGYRNIPGMC IFRARVRRGA RPKKVLKGNT HGKPSKSGV YQRKPAKRLQ AFAEIRVGRK CSNMRVFNSY WVGQDRVYKY FEVIMVDPYC DRIKNDKKIN WLCKPVMKHR E ARGLTNGT ...文字列:
MGYLQYLKEI RRDKQSSVMR YLLRVRCWEY RQNTAIHRAS GPTYLDKARM LGYRNIPGMC IFRARVRRGA RPKKVLKGNT HGKPSKSGV YQRKPAKRLQ AFAEIRVGRK CSNMRVFNSY WVGQDRVYKY FEVIMVDPYC DRIKNDKKIN WLCKPVMKHR E ARGLTNGT KTSRGLGKGI RYNQTKGGSK RAAWRNRNTQ SLRRYR

UniProtKB: Ribosomal protein L15

+
分子 #27: Ribosomal protein L13A

分子名称: Ribosomal protein L13A / タイプ: protein_or_peptide / ID: 27 / コピー数: 2 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Spraguea lophii 42_110 (菌類)
分子量理論値: 22.885139 KDa
配列文字列: MIGKRIVIDA IGHVAGKLAG HIAKELMCGI EVVIVHAENV MFTGPIKRGV GKFNSHLNKS CSYNPLRGPF HLRSPSMHLM KVIKRKLPH RKSKGQIALK RLQVFDGCPT EYLSVEKMVC PRDKLEYTTS PIRKSYKLGD LMIKFGWKYE SVVEKMNQNE E QFKIEETE ...文字列:
MIGKRIVIDA IGHVAGKLAG HIAKELMCGI EVVIVHAENV MFTGPIKRGV GKFNSHLNKS CSYNPLRGPF HLRSPSMHLM KVIKRKLPH RKSKGQIALK RLQVFDGCPT EYLSVEKMVC PRDKLEYTTS PIRKSYKLGD LMIKFGWKYE SVVEKMNQNE E QFKIEETE KQKVKEQKIE ELKKSNKFQQ RVEEIMVQMA

UniProtKB: Ribosomal protein L13A

+
分子 #28: 60S ribosomal protein L44

分子名称: 60S ribosomal protein L44 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 28 / コピー数: 2 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Spraguea lophii 42_110 (菌類)
分子量理論値: 11.99051 KDa
配列文字列:
MVNIPKTRRT YCIKCAYHTE FKVGLLKKGK DSPRKQGARR YARKQRGVHG QTKPILKRKA KTTKKVILKI ECTKCKSSQL KVRGRAKHV EFGAEKKVKG EALIY

UniProtKB: 60S ribosomal protein L44

+
分子 #29: 60S ribosomal protein L17

分子名称: 60S ribosomal protein L17 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 29 / コピー数: 2 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Spraguea lophii 42_110 (菌類)
分子量理論値: 19.11449 KDa
配列文字列:
MAHKYSCDIS EATSVRSQYN NIKIKFKNTR EVCNIIKTME LNKAIAYLND VLRFKKCIPV FRFAKKCGRT PQAKEFGTDK GKWPVKSVA FVKKMLEDLL VEAEKKGLGT SELVIKHIQV NQAPKIYGRK HGAFGRIKPY NKSPSHIEVI AVKREHNIKE G DVVEVKE

UniProtKB: 60S ribosomal protein L17

+
分子 #30: 60S ribosomal protein L37a

分子名称: 60S ribosomal protein L37a / タイプ: protein_or_peptide / ID: 30 / コピー数: 2 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Spraguea lophii 42_110 (菌類)
分子量理論値: 10.151127 KDa
配列文字列:
MSRKTKKVGI TGKYGSRYGS SLKRRAMICM NAQSKRYCCS FCGKTTVKRE VIGIWSCRFC GKKVSGGAYV PITNQQVEYK QVINRMKME

+
分子 #31: 60S ribosomal protein L18

分子名称: 60S ribosomal protein L18 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 31 / コピー数: 2 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Spraguea lophii 42_110 (菌類)
分子量理論値: 21.378133 KDa
配列文字列:
MLKQKMFEHY KKKAILFDES RVPRTKNVFY QSLFSLYKKV CENTENEIVH KITKRLTMSR TERHPLKLSN IIEQANGKEI VVFVGKVLD DDKILEIPKI TIVALKISKQ AKEKLTLNGG EFYTLDKLFY ISKDLKDVAL VKGDKNNRKC TRYFGASGDK G SETYPRTR KGARRGERRI KNKKK

UniProtKB: 60S ribosomal protein L18

+
分子 #32: 60S ribosomal protein L19

分子名称: 60S ribosomal protein L19 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 32 / コピー数: 2 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Spraguea lophii 42_110 (菌類)
分子量理論値: 19.549994 KDa
配列文字列:
MKLPRVKELS ADILKCGVRR IYLDTFEPSK LSAATSRDDI RKLIKDGLIV RKAQKIHSRY HANKLMREKE KGRHSGPGKV KGSKNARMP EKDKWIKRIR DLRNTLKELR DKGEITKTEH KMYYQKTKGN GYKNSAALMG AIKQKHDDER RMKEIEEQAK A LKIAASEK

UniProtKB: 60S ribosomal protein L19

+
分子 #33: 60S ribosomal protein L20

分子名称: 60S ribosomal protein L20 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 33 / コピー数: 2 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Spraguea lophii 42_110 (菌類)
分子量理論値: 20.043385 KDa
配列文字列:
MAINEYKVYG IKIDDNGVVG DEVYAHIVFA TNELLAKSSF NKILKKQKKI KPKNTKVIKV EEIKEDNKDL DVKNYGIDYY YKSKRCDHK GYKEFRGVSR CHAVDKLLCD IGGRHSVKRN LIFIMKVKEL TVDEIKKDKI KIFAMEDVEY PAYRNVLRSN K LFVSENEK LFN

UniProtKB: 60S ribosomal protein L20

+
分子 #34: 60s ribosomal protein L21

分子名称: 60s ribosomal protein L21 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 34 / コピー数: 2 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Spraguea lophii 42_110 (菌類)
分子量理論値: 18.34442 KDa
配列文字列:
MVSSHGYRRQ TRNLFSQAFR KHGMPNTSTY LTQYAVGEYV DIKVNPAIHK GMPHKYYHGR TGIIKEVNRG SVIVLFNRIL ANKTVERKV IVGIEHIRKS KCQDEYLKRL EINKKIIEEA EKKGEVPVLF KRQPKGPKPA VEMLMNNIIE LSYDKVESQ

UniProtKB: 60s ribosomal protein L21

+
分子 #35: 60S ribosomal protein L22

分子名称: 60S ribosomal protein L22 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 35 / コピー数: 2 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Spraguea lophii 42_110 (菌類)
分子量理論値: 12.854773 KDa
配列文字列:
MSEAAVQDQS ITYTLDCTKC TEQSLFSTDD LKEYLLGNIK YNGKKGQLGK KVLLSNTGHA VDVFFAKKTS KRYLKYLIKK FLRAKGLSD WVRPIAGDKQ SYKFSFFSKQ AGEE

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein eL22

+
分子 #36: Ribosomal protein L23

分子名称: Ribosomal protein L23 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 36 / コピー数: 2 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Spraguea lophii 42_110 (菌類)
分子量理論値: 15.239987 KDa
配列文字列:
MPGKGKQPLD AIKNRYGFTR GIQVGTVLAC ADNSGAKMLK TIGVKGVSGR LNRLPAAGPG DVIVASVVKG RSDMRKKIVL AVIIRQKQM IRRKDGVRLQ FEESAAVIIS NKGDLKGTQI SGPVLREVCD IWPKISSQAG SIY

UniProtKB: Ribosomal protein L23

+
分子 #37: Ribosomal protein L24E

分子名称: Ribosomal protein L24E / タイプ: protein_or_peptide / ID: 37 / コピー数: 2 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Spraguea lophii 42_110 (菌類)
分子量理論値: 15.342161 KDa
配列文字列:
MFYEGTCVYS GYPVPRGKGT YFVSLDDKSS LFFSSKYKNF SDKKIKAKRV KQTLMSKQFC GKVESVHTEK KKKIVVQKIV RGFPALPKD AVEKIREQNK DYKKKIVDEK KVQHGKKVGK IEQKQMKQKQ KY

UniProtKB: Ribosomal protein L24E

+
分子 #38: 60S ribosomal protein L23a

分子名称: 60S ribosomal protein L23a / タイプ: protein_or_peptide / ID: 38 / コピー数: 2 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Spraguea lophii 42_110 (菌類)
分子量理論値: 12.557947 KDa
配列文字列:
MPKLNRHKAS RLDKKIKQKK LIEKPLGFSS LDIIKYGIGH EGAAKLIEEA GTLTFVVDQR ADKINVKKAF EEIYGEKVKK VNINNTMKG VKKAYIRLVE LGNAAVVATK AGIL

UniProtKB: 60S ribosomal protein L23a

+
分子 #39: 60S ribosomal protein L26

分子名称: 60S ribosomal protein L26 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 39 / コピー数: 2 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Spraguea lophii 42_110 (菌類)
分子量理論値: 15.026874 KDa
配列文字列:
MKFNKNVTAS RRKNRKAHFT SIGLERTKLM NAPLSKDLKE EYGIKRIAVR PGDMVKVVSG EFKKKEGVVM KVNRHDIKIE VEGCFVQKE DGKKINKGIH PSNLRIIKLS MEKDRAEIIN KKVEAMKSEV KA

UniProtKB: 60S ribosomal protein L26

+
分子 #40: 60S ribosomal protein L27

分子名称: 60S ribosomal protein L27 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 40 / コピー数: 2 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Spraguea lophii 42_110 (菌類)
分子量理論値: 18.247842 KDa
配列文字列:
MKPTFIIRIN LFFPFKKYFF LFHIFFLFFI FFCPMSETLF EKNMFVLLNR GRFAGNKGII VDTDLENNRI IIAGVSKIPK NKKRKTIVF LKKMNPMHIM ATTYKRDIGL SLDNLDSIFE DKVKKAVALN RVREIFNKNK NNEGFAWLYK KLEI

UniProtKB: 60S ribosomal protein L27

+
分子 #41: DNL-type domain-containing protein

分子名称: DNL-type domain-containing protein / タイプ: protein_or_peptide / ID: 41 / コピー数: 2 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Spraguea lophii 42_110 (菌類)
分子量理論値: 17.595088 KDa
配列文字列:
MKYNVYIEGT FSGIQSIMVE QVYPITIKCS GCNLVHKKDV ILSIDSINYT DKDEKVNLKV KCASCTRQMY ILIKSMATEL YEEKFYCAK KEDNRYLASQ LQGRGCYIEK IKDANIHVLS EKGRIYPDIV FDEGYWREED NMNNTSSIED FN

UniProtKB: Uncharacterized protein

+
分子 #43: 40S ribosomal protein S0

分子名称: 40S ribosomal protein S0 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 43 / コピー数: 2 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Spraguea lophii 42_110 (菌類)
分子量理論値: 26.201186 KDa
配列文字列: MAVRVVPLSD KVAKAMVQCC CHLGGVTSST SLKEYIFGKR EEDKVNIIDI KKMWEKLNLA ARMICSIPNP KDIVVVSSKD FGRKAVIKF AESIGATAVT GRFIPGSFSN YEIKGVREPR LVLVSDCFAD KQVVKEASYV NAPCIAFCNT DNDIEFVDMV I PMNNRSQS ...文字列:
MAVRVVPLSD KVAKAMVQCC CHLGGVTSST SLKEYIFGKR EEDKVNIIDI KKMWEKLNLA ARMICSIPNP KDIVVVSSKD FGRKAVIKF AESIGATAVT GRFIPGSFSN YEIKGVREPR LVLVSDCFAD KQVVKEASYV NAPCIAFCNT DNDIEFVDMV I PMNNRSQS AIGAGFCILS KLVNYMKGNI DKVEDKLRDH IELYTYRDSD ELEQLYQEQK IEEEADMVLK DESDE

UniProtKB: 40S ribosomal protein S0

+
分子 #44: 40S ribosomal protein S26

分子名称: 40S ribosomal protein S26 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 44 / コピー数: 2 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Spraguea lophii 42_110 (菌類)
分子量理論値: 11.974061 KDa
配列文字列:
MTKKRSNNGR SKKNRGHTRC VRCEHCSAMV PNDKAIKKFV VRSVIDAASL DDLKIATIYE EYEVPKSYYK LNYCVSCAVH IKLVRVRSR WERKIRKEQR VSA

UniProtKB: 40S ribosomal protein S26

+
分子 #45: 40S ribosomal protein S1

分子名称: 40S ribosomal protein S1 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 45 / コピー数: 2 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Spraguea lophii 42_110 (菌類)
分子量理論値: 25.934658 KDa
配列文字列: MAIKADNPKM RKGMKKGGKK KVEKDSFLKK EKYNLRIENF PVREVGATLV NKQSTVAALE KKLVGRVFEA NQGDITTSDS ANCYRKFSF KIDSLAGTNA HAIFNGMCLT SEKIKGMVKR GLTLIEGVKD VVTKEGITLR ILTIAQSKKE KNSTKKTAYA K TSVVKEVR ...文字列:
MAIKADNPKM RKGMKKGGKK KVEKDSFLKK EKYNLRIENF PVREVGATLV NKQSTVAALE KKLVGRVFEA NQGDITTSDS ANCYRKFSF KIDSLAGTNA HAIFNGMCLT SEKIKGMVKR GLTLIEGVKD VVTKEGITLR ILTIAQSKKE KNSTKKTAYA K TSVVKEVR KNIFRIVDNE LNGKDIEQIV KKLQMETVGK EIEKECQKII PLQNCHVLKV KVVKRPVKEE VE

+
分子 #46: 40S ribosomal protein S27

分子名称: 40S ribosomal protein S27 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 46 / コピー数: 2 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Spraguea lophii 42_110 (菌類)
分子量理論値: 9.189923 KDa
配列文字列:
MIAKNLLYPT VEEIKKNNKR KQLFQEVKGY FMEVKCAGCA TLNVCYSHSQ KTISCKGCSM VILRSTGGKA KISNECSYMV IS

+
分子 #47: 40S ribosomal protein S2

分子名称: 40S ribosomal protein S2 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 47 / コピー数: 2 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Spraguea lophii 42_110 (菌類)
分子量理論値: 27.241541 KDa
配列文字列: MNSEETTKTS SQEQRRPKRA PREEAEWFPK TSLGKLVKAG RITLDEIFGH SLCIREPEII DYFLKATLKE EVLVIKSVQK QTKAGQKTR MKVVLALGDH NNYIGIGSGV ARDVVSAINA AKVVAKCSMR PIKKGFWGNE IGEAHTVPVK ALGKCGSVKV Q VTPAPKGT ...文字列:
MNSEETTKTS SQEQRRPKRA PREEAEWFPK TSLGKLVKAG RITLDEIFGH SLCIREPEII DYFLKATLKE EVLVIKSVQK QTKAGQKTR MKVVLALGDH NNYIGIGSGV ARDVVSAINA AKVVAKCSMR PIKKGFWGNE IGEAHTVPVK ALGKCGSVKV Q VTPAPKGT GLVAGGVSKT IFKLAGIKDI FTSSKGQTCT TENFARASLY AITNSTNFNM PNVIEEKVVE LNPILKNAEF LI EQEQRDL R

UniProtKB: 40S ribosomal protein S2

+
分子 #48: 40S ribosomal protein S28

分子名称: 40S ribosomal protein S28 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 48 / コピー数: 2 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Spraguea lophii 42_110 (菌類)
分子量理論値: 7.288479 KDa
配列文字列:
MSEEVYIGEV LQTLEKTGPG GGLTMCQVQL KDQKRTLYRA IMGPIAVGDL VALLDCEREH RRGRF

+
分子 #49: 40S ribosomal protein S3

分子名称: 40S ribosomal protein S3 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 49 / コピー数: 2 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Spraguea lophii 42_110 (菌類)
分子量理論値: 27.516459 KDa
配列文字列: MQNKSIFPQL IFFNIFFQII FFTLMFNPEA SSIKNRFVER GCYYAEINEF LSKLLQKEGF SGLSLRLHER PIRVVIRLEK TTEVLKDNS VLLKQIKALI GKRLQEDVSN IDILIEMVKN KGLCPAIQAE FIRSKFEENI PYRRSVVSAI KNIKSAGGQG C VIEVSGKL ...文字列:
MQNKSIFPQL IFFNIFFQII FFTLMFNPEA SSIKNRFVER GCYYAEINEF LSKLLQKEGF SGLSLRLHER PIRVVIRLEK TTEVLKDNS VLLKQIKALI GKRLQEDVSN IDILIEMVKN KGLCPAIQAE FIRSKFEENI PYRRSVVSAI KNIKSAGGQG C VIEVSGKL KGQRARSVKT IDGKIIHAGQ PKEEFMRYAT TSVLLKQGII GIKVGIMLPQ DDEGIKGPVY DMVDKIKVLP IK EE

UniProtKB: 40S ribosomal protein S3

+
分子 #50: 40S ribosomal protein S29

分子名称: 40S ribosomal protein S29 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 50 / コピー数: 2 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Spraguea lophii 42_110 (菌類)
分子量理論値: 7.891175 KDa
配列文字列:
MNKQMIKYNA DLETTFTVER KDFGRTNRRC RACFAYNGVI RKYDLMICRR CFREYAGDIG FKIYD

UniProtKB: 40S ribosomal protein S29

+
分子 #51: 40S ribosomal protein S4

分子名称: 40S ribosomal protein S4 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 51 / コピー数: 2 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Spraguea lophii 42_110 (菌類)
分子量理論値: 31.442154 KDa
配列文字列: MVRGPRKHLK RLNAPKSWSL DKNGGVFAPR TSTGPHSMQE SIPLCLLLTR ILKVASNNKE IKHIMKNRLI TVNGNIRTDS RYPVGIMDV LSIKKTNEHY RLLYNIAGKF VLHKITEEEA QYRIAKVTNK KVVKGNIPHT YTSCGGSFKY ADPSISIGDS V KIDIKTSK ...文字列:
MVRGPRKHLK RLNAPKSWSL DKNGGVFAPR TSTGPHSMQE SIPLCLLLTR ILKVASNNKE IKHIMKNRLI TVNGNIRTDS RYPVGIMDV LSIKKTNEHY RLLYNIAGKF VLHKITEEEA QYRIAKVTNK KVVKGNIPHT YTSCGGSFKY ADPSISIGDS V KIDIKTSK IVENSSLEVG KVVYLIKGKN IGCLGVITGI EKREGTHDIV NIVDKVGRNF STIFSNILVV GADDNPWVTF TK DEGIKYS EYEQSIKEYG PMNEEKEEES IPEVVETSEV ETR

UniProtKB: 40S ribosomal protein S4

+
分子 #52: 40S ribosomal protein S30

分子名称: 40S ribosomal protein S30 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 52 / コピー数: 2 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Spraguea lophii 42_110 (菌類)
分子量理論値: 6.81601 KDa
配列文字列:
MAKAISLNKA GKVRGQTPKV EKSEKEKALT GRAAWRAKFK RRQELFTGVG KFKFNKQGDF

+
分子 #53: 40S ribosomal protein S5

分子名称: 40S ribosomal protein S5 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 53 / コピー数: 2 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Spraguea lophii 42_110 (菌類)
分子量理論値: 21.982785 KDa
配列文字列: MRYTETSGDI KLFGRYPYTD LEVKDITLEK YINVASKVIL PHTSSRLNTK KFGRTKIPVV ERFVNAMMRK GRNNGKKTLA MRIVKDAFF IIEGVTGQNP IQILVDAICN SGPREDSARI GKGGVMKRSS VDVSPLRRIN IAIFLLAKGV RNSTFKDIKM L PEIIAEEL ...文字列:
MRYTETSGDI KLFGRYPYTD LEVKDITLEK YINVASKVIL PHTSSRLNTK KFGRTKIPVV ERFVNAMMRK GRNNGKKTLA MRIVKDAFF IIEGVTGQNP IQILVDAICN SGPREDSARI GKGGVMKRSS VDVSPLRRIN IAIFLLAKGV RNSTFKDIKM L PEIIAEEL INAAKNTQSS FAVKKKEEIE RIAKSNR

UniProtKB: 40S ribosomal protein S5

+
分子 #54: Ubiquitin/40s ribosomal protein S27a fusion

分子名称: Ubiquitin/40s ribosomal protein S27a fusion / タイプ: protein_or_peptide / ID: 54 / コピー数: 2 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Spraguea lophii 42_110 (菌類)
分子量理論値: 16.937791 KDa
配列文字列:
MQIFVKTLTG KTITLEVEST DSIENVKAKI QDKEGIPPDQ QRLIFAGKQL EDGRTLSDYN IQKESTLHLV LRLRGGKKKK KKKSYTTPK KVKKPKQDIK QIILTQFSVN KDGECKPLRN SCSTCGPSVF LGRSGNKEYC GRCYTVAILN K

UniProtKB: Ubiquitin/40s ribosomal protein S27a fusion

+
分子 #55: 40S ribosomal protein S6

分子名称: 40S ribosomal protein S6 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 55 / コピー数: 2 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Spraguea lophii 42_110 (菌類)
分子量理論値: 26.194869 KDa
配列文字列: MKLNISYPTN GTHKTFKLDF KAEQRLYGKK TLDTFDGSII KPEWEGLQFQ ITGGSDVQGF PMIKTLLTDK RKKLLLKKGD KGFKPVNRK GLRKRKTVRG SIIASDISMV CVSLIDAKEV AIEGLTDVVV GATHWPKRFN KLKAKAGFSE DADVTAEQVL K VIKDAILE ...文字列:
MKLNISYPTN GTHKTFKLDF KAEQRLYGKK TLDTFDGSII KPEWEGLQFQ ITGGSDVQGF PMIKTLLTDK RKKLLLKKGD KGFKPVNRK GLRKRKTVRG SIIASDISMV CVSLIDAKEV AIEGLTDVVV GATHWPKRFN KLKAKAGFSE DADVTAEQVL K VIKDAILE VNAGGIKKLP KLKVSRYQTE KQKERKAEKI KLIEERKKKS EKERADFLKK YPDWQKKFAT KA

+
分子 #56: Guanine nucleotide binding protein beta subunit

分子名称: Guanine nucleotide binding protein beta subunit / タイプ: protein_or_peptide / ID: 56 / コピー数: 2 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Spraguea lophii 42_110 (菌類)
分子量理論値: 36.182824 KDa
配列文字列: MISLNEKGSQ YVHKQMVTCL EVPNEGNSDI LYTASRDKKI YSILLKPEED KVGKYIKSYE GHSGFVNCIT TNSSNDKIIS GSSDNTARI FDVESQKSVV LKGHTRDITS ISINTEDNKI ITGSVDGKIM LWNTQGKCAE VFDGECQNTH TSWINCVAFR P FNSNIVVS ...文字列:
MISLNEKGSQ YVHKQMVTCL EVPNEGNSDI LYTASRDKKI YSILLKPEED KVGKYIKSYE GHSGFVNCIT TNSSNDKIIS GSSDNTARI FDVESQKSVV LKGHTRDITS ISINTEDNKI ITGSVDGKIM LWNTQGKCAE VFDGECQNTH TSWINCVAFR P FNSNIVVS GSEDGTLKIW DIEEKRVMET FINGFSVTEI KEKGIEIERK SAVTSLSMSP DGSLCAYGSK NSMVYVFKFD DN KCVINFD AGSTVKALAF GLTDVSIACA TESEIILWDI LKNVRIARID YSSYGNGVYC TSLVWAKDML LAGFSDGRIT AYE RTIIEE

UniProtKB: Guanine nucleotide binding protein beta subunit

+
分子 #57: 40S ribosomal protein S7

分子名称: 40S ribosomal protein S7 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 57 / コピー数: 2 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Spraguea lophii 42_110 (菌類)
分子量理論値: 19.132023 KDa
配列文字列:
MSQSQSEMQV AEVIKKVCGS VIKDSLQSAL KTLRIKLISD SDGSNIMVIT LPLPLLDAIQ QYFSEIQNKL QKQFSEFQIF FIREAVYNP NNTLNKKLQE NWLKDLCFPS VVNQRMTVVK EGGNIKEEKV FVERKSEFTE EEFYSMKLVF KELTGRDVEY G LRYY

UniProtKB: 40S ribosomal protein S7

+
分子 #58: 40S ribosomal protein S8

分子名称: 40S ribosomal protein S8 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 58 / コピー数: 2 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Spraguea lophii 42_110 (菌類)
分子量理論値: 19.912068 KDa
配列文字列:
MGISRSNRHK RKETGGKKGL HEKKRKNNCG RPPSNTRIGE RRVKQVRVRG GNIKHRALRL DTGNIACKTH NFTLNTSIQN VMYHPSNNE FMRTNILTKS AVVKINGQPF KHELEKDQQF ESKDPVLFDN LRKGNCYAII TSRPGQVGMA DGYLLQGEEL K FYMEKFKK KSVKV

UniProtKB: 40S ribosomal protein S8

+
分子 #59: 40S ribosomal protein S9

分子名称: 40S ribosomal protein S9 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 59 / コピー数: 2 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Spraguea lophii 42_110 (菌類)
分子量理論値: 21.365959 KDa
配列文字列:
MKFFSTLMVK SKGIKKIVVP HRPFERERLV SEMYIVGKYG LRNKRELWTI QKMCDSFKLR AKDLLITPDE KEFTLSSRRL LKKLAEWGV FMEDVDYNNK QSLTNNLEKL LDLAPTSFLE RRLQHRIFDL GLASSVHQAR AFIHARRVKI NGSVVNKPGY L VKDGEDGF IEVVESKRSA LVAAEE

UniProtKB: 40S ribosomal protein S9

+
分子 #60: 40S ribosomal protein S10

分子名称: 40S ribosomal protein S10 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 60 / コピー数: 2 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Spraguea lophii 42_110 (菌類)
分子量理論値: 12.702538 KDa
配列文字列:
MQLSREDQVA IRKYLFRESI CLVKDKDNGN HPELNINNKQ VMKFLRSYVS RGLVEKVFVW QHAYFLLKSE GVDVLREELY LDETEVPLT YMRETYEAPK AEVGKVQE

UniProtKB: 40S ribosomal protein S10

+
分子 #61: 40S ribosomal protein S11

分子名称: 40S ribosomal protein S11 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 61 / コピー数: 2 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Spraguea lophii 42_110 (菌類)
分子量理論値: 18.109406 KDa
配列文字列:
MLNEISVSKV FPKQAGVFNN PYEKDSKRRV KDVSEIYKAP ESARNSTYID KNCPFTGEIK IKNNFMKGEV LKMKQPTTIV VVKRYLHYV KKYKRYERRY KNVSVHLSPC FKGLVNVGDT VICGETRPLS KTKRFVVVGF EKKEIKEKKL KMLSEI

UniProtKB: 40S ribosomal protein S11

+
分子 #62: 40S ribosomal protein S12

分子名称: 40S ribosomal protein S12 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 62 / コピー数: 2 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Spraguea lophii 42_110 (菌類)
分子量理論値: 14.343721 KDa
配列文字列:
MSEIVVPMGS EELTLDQALY QVCRISNANN RMVKGIRQVS KKLLDSNLKL VLLSNEIDER SANIIISLAK KTNIPLIKVD DSITLGRYA GFEKRTISDE IKVAKCGCAG IVDYVQPSQG QVFLMNAIKQ G

UniProtKB: 40S ribosomal protein S12

+
分子 #63: 40S ribosomal protein S13

分子名称: 40S ribosomal protein S13 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 63 / コピー数: 2 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Spraguea lophii 42_110 (菌類)
分子量理論値: 16.19199 KDa
配列文字列:
MARMYSNGKG QSKSVTPYNL TYPTYIKHSK EEIVDVILNL ARKGTPPSQI GNILRDNYGV GKSFAVTKTK ILTLLKIAGL KPVIPEDLN NIVKKCVNIK AHLAKYTNDK SSKYQLIQMQ SCLYRVARYY KSKNELPAGW KPPF

UniProtKB: 40S ribosomal protein S13

+
分子 #64: 40S ribosomal protein S14

分子名称: 40S ribosomal protein S14 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 64 / コピー数: 2 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Spraguea lophii 42_110 (菌類)
分子量理論値: 14.708 KDa
配列文字列:
MSEPMVEQRL NFALLFIKAT KNDTIIHATD LTGAETLAKS SGGSKVKAHR DERDPYAAML ATQDVAAVLK EKGYNAVHIK IRGKGGNQS KIIGPGGSTV IRTMMRSEFK LGRVEDVTPV ATDSTRKKGG RRGRRL

UniProtKB: 40S ribosomal protein S14

+
分子 #65: 40S ribosomal protein S16

分子名称: 40S ribosomal protein S16 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 65 / コピー数: 2 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Spraguea lophii 42_110 (菌類)
分子量理論値: 16.415074 KDa
配列文字列:
MSIAQVITKG TRKTAISKCV CSESNEFQLM VDNMTLDVHH DNFLVAKIKE IMKIIGYEHL ENLKFELTTR GGGPISRAYA IRQAFAKAV ISYFGKYYDE QRKQDIKEQI MKFDRAALVA DPRRVEPKKY GGPAARAKYT KSYR

UniProtKB: 40S ribosomal protein S16

+
分子 #66: 40S ribosomal protein S17

分子名称: 40S ribosomal protein S17 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 66 / コピー数: 2 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Spraguea lophii 42_110 (菌類)
分子量理論値: 14.055251 KDa
配列文字列:
MGQIKGKSVR TASKVIVERY FNRLTNDFYD NRNVVIDVAE IRSKKLRNKV SGCVTKLYKR VKKNGVPGLY IKEHEEEREK KESFIPKIS ILDEDKVEVD EVTMEMINQY EINGDYVLAK K

+
分子 #67: 40S ribosomal protein S18

分子名称: 40S ribosomal protein S18 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 67 / コピー数: 2 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Spraguea lophii 42_110 (菌類)
分子量理論値: 18.171129 KDa
配列文字列:
MQAKESKLVF NNNPLPIQAM IRMFNTNIDG KKQIIKALTT IRGIGDRLSL AILRRAKIPT DKRAGELTED ELNEINEVIL NPQKYDIPE WMLNHQNDPI DGTTKHLIGN QIEGTIRLWN ERGKKIGLVR AFRTSLGLKV RGQRTKSNGR GGRTMGVSRK K

UniProtKB: 40S ribosomal protein S18

+
分子 #68: 40S Ribosomal protein S19

分子名称: 40S Ribosomal protein S19 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 68 / コピー数: 2 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Spraguea lophii 42_110 (菌類)
分子量理論値: 16.603318 KDa
配列文字列:
MNTEIFKVRH DTFIPALSEY LRTNKTVVPI KNFDIIKTSR GKETSPLDIN WYYTRAASII RKLLISKAKN EKPLSIVRFS SEYGCAKDR GNRPNKHVRA SKGIIIKILN DLQEKGWVEK KENGWTLKKE AEEVSKQLIE KLIN

UniProtKB: 40S Ribosomal protein S19

+
分子 #69: 40S ribosomal protein S20

分子名称: 40S ribosomal protein S20 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 69 / コピー数: 2 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Spraguea lophii 42_110 (菌類)
分子量理論値: 13.777075 KDa
配列文字列:
MNDVEKKYDI ETPVPEKLIN VELRLLCSNK KLLSDLSNRY YNYLFQNSPT AKKPRVLQPF ICDVTTRKSP CGQGTATWSK YKMIIHGRM FALQMTHQML KDSAAFLQNT DVEVRLTLKG

UniProtKB: 40S ribosomal protein S20

+
分子 #70: Ribosomal protein S21E

分子名称: Ribosomal protein S21E / タイプ: protein_or_peptide / ID: 70 / コピー数: 2 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Spraguea lophii 42_110 (菌類)
分子量理論値: 7.768887 KDa
配列文字列:
MNSFQRVCDF SLKPISSQDR SSVQINMVQL DERGRATKDL MIFNVSGTVR KNGKIDSMLY ERINEME

UniProtKB: Ribosomal protein S21E

+
分子 #71: 40S ribosomal protein S15A

分子名称: 40S ribosomal protein S15A / タイプ: protein_or_peptide / ID: 71 / コピー数: 2 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Spraguea lophii 42_110 (菌類)
分子量理論値: 14.620056 KDa
配列文字列:
MMDKLANLCI TINNANRAQK RSVVIRRISK VCRLFLESMQ KHGYITDIVY IDDHREGKAV VGLSGRLNRC GAICPRYDVE LKDVERYRA NLLPSRGFGH LIVTSSKGLI DHRECIQHNT GGKILGYFY

UniProtKB: 40S ribosomal protein S15A

+
分子 #72: Ribosomal protein S12/S23

分子名称: Ribosomal protein S12/S23 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 72 / コピー数: 2 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Spraguea lophii 42_110 (菌類)
分子量理論値: 15.822722 KDa
配列文字列:
MYGLLAARNL KKNRHKRRYA DKDFAKKARG DIYQNAVGYS APHAKGIVTE KLGVEAKQPN SAIRKCVRVH IVRLNKKVIA YVPHDGGLN QIEINDEVIV EGLGKKGCRS KGDIPGVRFR VCKVQKVSLK ALVTKKKERP AR

+
分子 #73: 40s ribosomal protein s24

分子名称: 40s ribosomal protein s24 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 73 / コピー数: 2 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Spraguea lophii 42_110 (菌類)
分子量理論値: 17.189895 KDa
配列文字列:
MVSSFSNFQS FSIEILSRYD NELLHRSEVD LNISHENAMT PSRSDVAQKL AQLFNTGVNN IVIRGTKTFF GSGNSKVKVK VYNNMDQLK KIEHFCELKR IAEKSKTEMQ LVEKLPRRTR KDNRKKRNKM WGTEKRRMKK AEKKNSR

UniProtKB: 40s ribosomal protein s24

+
分子 #74: 40S ribosomal protein S25

分子名称: 40S ribosomal protein S25 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 74 / コピー数: 2 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Spraguea lophii 42_110 (菌類)
分子量理論値: 14.777071 KDa
配列文字列:
MAKKVLESKT SKAEKISNST KSKKKWSSGK VAEAVKRHER VEDDIFNKIV KDVKNMRILT RTTLSERYNL SLNISIKLLR FLEENQIIK LISSHRGSKI YAGSKYEPLK VVEQPKEVEA TVDNDQEWA

UniProtKB: 40S ribosomal protein S25

+
分子 #75: Ribosomal protein S19

分子名称: Ribosomal protein S19 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 75 / コピー数: 2 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Spraguea lophii 42_110 (菌類)
分子量理論値: 18.514629 KDa
配列文字列:
MAKKQNFQKK KKSVAVESMG DASARSKRTF KEFSYKGVNL ETLTSMSISE FKELLPSKLR RSINRGFSAA ERDFIKKCIK ARSENTGLE RPEQINTNTR NLPILPTMIG LQIGVYSGRD FMPMVIKEEM LGRRLRDYVE TRKLCTHGRP GVGATSSSKF V PLK

UniProtKB: Ribosomal protein S19

+
分子 #76: ZINC ION

分子名称: ZINC ION / タイプ: ligand / ID: 76 / コピー数: 18 / 式: ZN
分子量理論値: 65.409 Da

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実験情報

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構造解析

手法クライオ電子顕微鏡法
解析サブトモグラム平均法
試料の集合状態particle

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試料調製

緩衝液pH: 7.5
グリッドモデル: Quantifoil / 材質: COPPER / メッシュ: 300 / 支持フィルム - 材質: CARBON / 支持フィルム - トポロジー: CONTINUOUS / 支持フィルム - Film thickness: 2 / 詳細: 20 mA, Carbon coated grid
凍結凍結剤: ETHANE / チャンバー内湿度: 100 % / チャンバー内温度: 288.15 K / 装置: FEI VITROBOT MARK IV / 詳細: blot force -1 and blot time 4 s.

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電子顕微鏡法

顕微鏡FEI TITAN KRIOS
撮影#0 - Image recording ID: 1
#0 - フィルム・検出器のモデル: GATAN K2 SUMMIT (4k x 4k)
#0 - 検出モード: COUNTING / #0 - 平均電子線量: 1.98 e/Å2 / #1 - Image recording ID: 2
#1 - フィルム・検出器のモデル: GATAN K3 BIOQUANTUM (6k x 4k)
#1 - 平均電子線量: 1.98 e/Å2
電子線加速電圧: 300 kV / 電子線源: FIELD EMISSION GUN
電子光学系照射モード: FLOOD BEAM / 撮影モード: BRIGHT FIELD / Cs: 2.7 mm / 最大 デフォーカス（公称値）: 6.0 µm / 最小 デフォーカス（公称値）: 2.5 µm
試料ステージ試料ホルダーモデル: FEI TITAN KRIOS AUTOGRID HOLDER
ホルダー冷却材: NITROGEN
実験機器
モデル: Titan Krios / 画像提供: FEI Company

+
画像解析

Image recording ID2
最終 再構成想定した対称性 - 点群: C2 (2回回転対称) / 解像度のタイプ: BY AUTHOR / 解像度: 14.3 Å / 解像度の算出法: FSC 0.143 CUT-OFF
ソフトウェア: (名称: RELION (ver. 3.1), Warp (ver. 1.1.0))
使用したサブトモグラム数: 1344
抽出トモグラム数: 20 / 使用した粒子像数: 6505
ソフトウェア: (名称: IMOD (ver. 4.12.10), Warp (ver. 1.1.0))
最終 角度割当タイプ: MAXIMUM LIKELIHOOD / ソフトウェア - 名称: RELION (ver. 3.1)
FSC曲線 (解像度の算出)

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原子モデル構築 1

精密化空間: RECIPROCAL / プロトコル: RIGID BODY FIT
得られたモデル

PDB-8p60:
Spraguea lophii ribosome dimer

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万見について

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お知らせ

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2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

  • EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
  • これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

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2020年8月12日: 新型コロナ情報

新型コロナ情報

URL: https://pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

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2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

新型コロナウイルスの構造データ

関連情報:万見生物種 / 2020年8月12日: 新型コロナ情報

外部リンク:COVID-19特集ページ - PDBj / 今月の分子2020年2月：コロナウイルスプロテーアーゼ

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2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

EMDBのIDの桁数の変更

  • EMDBエントリに付与されているアクセスコード(EMDB-ID)は4桁の数字(例、EMD-1234)でしたが、間もなく枯渇します。これまでの4桁のID番号は4桁のまま変更されませんが、4桁の数字を使い切った後に発行されるIDは5桁以上の数字(例、EMD-12345)になります。5桁のIDは2019年の春頃から発行される見通しです。
  • EM Navigator/万見では、接頭語「EMD-」は省略されています。

関連情報:Q: 「EMD」とは何ですか？ / 万見/EM NavigatorにおけるID/アクセスコードの表記

外部リンク:EMDB Accession Codes are Changing Soon! / PDBjへお問い合わせ

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2017年7月12日: PDB大規模アップデート

PDB大規模アップデート

  • 新バージョンのPDBx/mmCIF辞書形式に基づくデータがリリースされました。
  • 今回の更新はバージョン番号が4から5になる大規模なもので、全エントリデータの書き換えが行われる「Remediation」というアップデートに該当します。
  • このバージョンアップで、電子顕微鏡の実験手法に関する多くの項目の書式が改定されました(例：em_softwareなど)。
  • EM NavigatorとYorodumiでも、この改定に基づいた表示内容になります。

外部リンク:wwPDB Remediation / OneDepデータ基準に準拠した、より強化された内容のモデル構造ファイルが、PDBアーカイブで公開されました。

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万見 (Yorodumi)

幾万の構造データを、幾万の視点から

  • 万見(Yorodumi)は、EMDB/PDB/SASBDBなどの構造データを閲覧するためのページです。
  • EM Navigatorの詳細ページの後継、Omokage検索のフロントエンドも兼ねています。

関連情報:EMDB / PDB / SASBDB / 3つのデータバンクの比較 / 万見検索 / 2016年8月31日: 新しいEM Navigatorと万見 / 万見文献 / Jmol/JSmol / 機能・相同性情報 / 新しいEM Navigatorと万見の変更点

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