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データを開く
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基本情報
登録情報 | ![]() | |||||||||
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タイトル | Recombinant Mayaro virus-like particle | |||||||||
![]() | Main map | |||||||||
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![]() | Mayaro virus / MAYV / vaccine candidate / immunogen / VIRUS LIKE PARTICLE | |||||||||
生物種 | ![]() | |||||||||
手法 | 単粒子再構成法 / クライオ電子顕微鏡法 / 解像度: 4.5 Å | |||||||||
![]() | Kim YC / Song X / Huiskonen JT | |||||||||
資金援助 | ![]()
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![]() | ![]() タイトル: Immunogenic recombinant Mayaro Virus-Like Particles present natively assembled glycoprotein 著者: Kim YC / Watanabe Y / Arlen-Celina L / Song X / Stass R / Azar SR / Rossi SL / Kuemmerer BM / Crispin M / Bowden TA / Huiskonen JT / Reyes-Sandoval A | |||||||||
履歴 |
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構造の表示
添付画像 |
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ダウンロードとリンク
-EMDBアーカイブ
マップデータ | ![]() | 1.8 GB | ![]() | |
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ヘッダ (付随情報) | ![]() ![]() | 12.8 KB 12.8 KB | 表示 表示 | ![]() |
FSC (解像度算出) | ![]() | 28.2 KB | 表示 | ![]() |
画像 | ![]() | 108.9 KB | ||
Filedesc metadata | ![]() | 4 KB | ||
その他 | ![]() ![]() | 1.5 GB 1.5 GB | ||
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-検証レポート
文書・要旨 | ![]() | 1.1 MB | 表示 | ![]() |
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文書・詳細版 | ![]() | 1.1 MB | 表示 | |
XML形式データ | ![]() | 35.2 KB | 表示 | |
CIF形式データ | ![]() | 47.9 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
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リンク
EMDBのページ | ![]() ![]() |
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マップ
ファイル | ![]() | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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注釈 | Main map | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
投影像・断面図 | 画像のコントロール
画像は Spider により作成 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
ボクセルのサイズ | X=Y=Z: 1.34 Å | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
密度 |
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対称性 | 空間群: 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
詳細 | EMDB XML:
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-添付データ
-ハーフマップ: Halfmap 2
ファイル | emd_15898_half_map_1.map | ||||||||||||
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注釈 | Halfmap 2 | ||||||||||||
投影像・断面図 |
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密度ヒストグラム |
-ハーフマップ: Halfmap 1
ファイル | emd_15898_half_map_2.map | ||||||||||||
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注釈 | Halfmap 1 | ||||||||||||
投影像・断面図 |
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密度ヒストグラム |
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試料の構成要素
-全体 : Virus-like particle of Mayaro virus
全体 | 名称: Virus-like particle of Mayaro virus |
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要素 |
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-超分子 #1: Virus-like particle of Mayaro virus
超分子 | 名称: Virus-like particle of Mayaro virus / タイプ: complex / ID: 1 / 親要素: 0 |
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由来(天然) | 生物種: ![]() |
-実験情報
-構造解析
手法 | クライオ電子顕微鏡法 |
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![]() | 単粒子再構成法 |
試料の集合状態 | particle |
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試料調製
濃度 | 1 mg/mL |
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緩衝液 | pH: 7 |
凍結 | 凍結剤: ETHANE |
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電子顕微鏡法
顕微鏡 | TFS KRIOS |
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特殊光学系 | エネルギーフィルター - 名称: GIF Quantum LS / エネルギーフィルター - スリット幅: 20 eV |
撮影 | フィルム・検出器のモデル: GATAN K2 SUMMIT (4k x 4k) 平均電子線量: 30.0 e/Å2 |
電子線 | 加速電圧: 300 kV / 電子線源: ![]() |
電子光学系 | 照射モード: FLOOD BEAM / 撮影モード: BRIGHT FIELD / 最大 デフォーカス(公称値): 3.0 µm / 最小 デフォーカス(公称値): 1.5 µm |
実験機器 | ![]() モデル: Titan Krios / 画像提供: FEI Company |