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-基本情報
登録情報 | データベース: EMDB / ID: EMD-14480 | |||||||||||||||
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タイトル | Cryo-EM structure of the ribosome-associated RAC complex on the 80S ribosome - RAC-2 conformation | |||||||||||||||
マップデータ | ||||||||||||||||
試料 |
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機能・相同性 | 機能・相同性情報 RNA polymerase I core factor complex / 'de novo' cotranslational protein folding / dolichyl-diphosphooligosaccharide-protein glycotransferase / dolichyl-diphosphooligosaccharide-protein glycotransferase activity / RNA polymerase I core promoter sequence-specific DNA binding / protein glycosylation / 90S preribosome / regulation of translational fidelity / translation regulator activity / maturation of LSU-rRNA ...RNA polymerase I core factor complex / 'de novo' cotranslational protein folding / dolichyl-diphosphooligosaccharide-protein glycotransferase / dolichyl-diphosphooligosaccharide-protein glycotransferase activity / RNA polymerase I core promoter sequence-specific DNA binding / protein glycosylation / 90S preribosome / regulation of translational fidelity / translation regulator activity / maturation of LSU-rRNA / Hsp70 protein binding / maturation of LSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA) / rescue of stalled ribosome / maturation of SSU-rRNA / methyltransferase activity / small-subunit processome / protein kinase C binding / ATP-dependent protein folding chaperone / modification-dependent protein catabolic process / protein tag activity / rRNA processing / ribosomal small subunit biogenesis / small ribosomal subunit rRNA binding / large ribosomal subunit / ribosome biogenesis / ribosome binding / ribosomal small subunit assembly / small ribosomal subunit / 5S rRNA binding / large ribosomal subunit rRNA binding / cytosolic small ribosomal subunit / ribosomal large subunit assembly / cytoplasmic translation / cytosolic large ribosomal subunit / methylation / negative regulation of translation / rRNA binding / ribosome / protein ubiquitination / structural constituent of ribosome / positive regulation of protein phosphorylation / ribonucleoprotein complex / translation / mRNA binding / ubiquitin protein ligase binding / nucleolus / RNA binding / ATP binding / membrane / nucleus / metal ion binding / cytosol / cytoplasm 類似検索 - 分子機能 : / Ribosome-associated complex head domain / Ribosome-associated complex head domain superfamily / J-protein Zuotin/DnaJC2 / : / Ribosome-associated complex head domain / Zuotin-like, zuotin homology domain / Gcn1, N-terminal / Generalcontrol nonderepressible 1 (Gcn1) N-terminal / Transcription initiation factor Rrn7, Zinc-finger ...: / Ribosome-associated complex head domain / Ribosome-associated complex head domain superfamily / J-protein Zuotin/DnaJC2 / : / Ribosome-associated complex head domain / Zuotin-like, zuotin homology domain / Gcn1, N-terminal / Generalcontrol nonderepressible 1 (Gcn1) N-terminal / Transcription initiation factor Rrn7, Zinc-finger / RNA polymerase I transcription initiation factor TAF1B/Rrn7 / : / : / Hyaluronan / mRNA binding family / Zinc-finger of RNA-polymerase I-specific TFIIB, Rrn7 / Rrn7/TAF1B, N-terminal cyclin domain / Rrn7/TAF1B, C-terminal cyclin domain / Centromere-binding protein ParB, C-terminal / Centromere-binding protein ParB C-terminal / E-Z type HEAT repeats / PBS lyase HEAT-like repeat / Centrosomal protein CEP104-like, TOG domain / RNA binding protein HABP4/SERBP1 / : / STT3/PglB/AglB core domain / Parkin co-regulated protein / Parkin co-regulated protein / Stm1-like, N-terminal / Stm1 / TOG domain / TOG / : / Oligosaccharyl transferase, STT3 subunit / Oligosaccharyl transferase STT3, N-terminal / Hyaluronan/mRNA-binding protein / Hyaluronan / mRNA binding family / HEAT-like repeat / DnaJ domain / HEAT repeat profile. / HEAT, type 2 / DnaJ molecular chaperone homology domain / dnaJ domain profile. / 60s Acidic ribosomal protein / Chaperone J-domain superfamily / DnaJ domain / 60S acidic ribosomal protein P0 / : / Heat shock protein 70 family / Hsp70 protein / Ribosomal protein L30e / Ribosomal protein L28e / 50S ribosomal protein L10, insertion domain superfamily / Ribosomal protein L18/L18-A/B/e, conserved site / Ribosomal protein L18e signature. / : / Ribosomal L28e/Mak16 / Ribosomal L28e protein family / 60S ribosomal protein L10P, insertion domain / Insertion domain in 60S ribosomal protein L10P / Ribosomal protein L18e / Ribosomal protein 60S L18 and 50S L18e / : / Ribosomal protein S26e signature. / Ribosomal protein S26e / Ribosomal protein S21e, conserved site / Ribosomal protein S26e superfamily / Ribosomal protein S26e / Ribosomal protein S21e signature. / : / Ribosomal protein S12e signature. / Ribosomal protein S12e / Ribosomal protein S5, eukaryotic/archaeal / Ribosomal protein L13e, conserved site / Ribosomal protein L13e signature. / Ribosomal protein S21e / Ribosomal protein S21e superfamily / Ribosomal protein S21e / Ribosomal protein S2, eukaryotic / Small (40S) ribosomal subunit Asc1/RACK1 / S27a-like superfamily / Ribosomal protein L22e / Ribosomal protein L22e superfamily / Ribosomal L22e protein family / 40S Ribosomal protein S10 / Ribosomal protein S10, eukaryotic/archaeal / Ribosomal protein L27e, conserved site / Ribosomal protein L27e signature. / Ribosomal protein L44e signature. / Plectin/S10, N-terminal / Plectin/S10 domain / Ribosomal protein L10e, conserved site / Ribosomal protein L10e signature. / Ribosomal protein S25 / S25 ribosomal protein / Ribosomal protein L10e / Ribosomal protein L13e / Ribosomal protein S27a / Ribosomal protein L13e / Ribosomal protein S27a / Ribosomal protein S27a 類似検索 - ドメイン・相同性 60S ribosomal protein L3-like protein / 40S ribosomal protein s23-like protein / 40S ribosomal protein S6 / 40S ribosomal protein S8 / Putative ribosome associated protein / Small ribosomal subunit protein uS2 / 60S ribosomal protein L26-like protein / Ribosomal protein L15 / 40S ribosomal protein s10-like protein / 60S ribosomal protein L27 ...60S ribosomal protein L3-like protein / 40S ribosomal protein s23-like protein / 40S ribosomal protein S6 / 40S ribosomal protein S8 / Putative ribosome associated protein / Small ribosomal subunit protein uS2 / 60S ribosomal protein L26-like protein / Ribosomal protein L15 / 40S ribosomal protein s10-like protein / 60S ribosomal protein L27 / 40S ribosomal protein S13-like protein / Putative heat shock protein / 40S ribosomal protein s15-like protein / 60S ribosomal protein L6 / dolichyl-diphosphooligosaccharide--protein glycotransferase / 60S ribosomal protein l21-like protein / 40S ribosomal protein s9-like protein / Ribosomal protein L37 / 40S ribosomal protein S4 / Putative plasmid related protein / Ribosomal protein s27-like protein / 40S ribosomal protein S25 / 40S ribosomal protein s5-like protein / 40S ribosomal protein S26 / 40S ribosomal protein S27a-like protein / 40S ribosomal protein S20-like protein / Hyaluronan/mRNA-binding protein domain-containing protein / 60S ribosomal protein L2-like protein / 60S ribosomal protein L25-like protein / 60S ribosomal protein L43-like protein / 40S ribosomal protein S3 / Putative ribosomal protein / 60S ribosomal protein L32-like protein / Small ribosomal subunit protein eS1 / 40S ribosomal protein S17-like protein / 40S ribosomal protein S7 / Putative ribosomal protein / 60S ribosomal protein L13 / Ribosomal protein L18-like protein / 40S ribosomal protein S28-like protein / Ribosomal protein L19 / Putative guanine nucleotide-binding protein / 60S ribosomal protein L8 / 40S ribosomal protein S2-like protein / 60S ribosomal protein L36 / 40S ribosomal protein S16-like protein / 60S ribosomal protein L44-like protein / 60S ribosomal protein L20 / 60S ribosomal protein l33-like protein / Putative 60S ribosomal protein / 60S ribosomal protein L22-like protein / 60S ribosomal protein l5-like protein / 60S ribosomal protein l30-like protein / 60S ribosomal protein L10-like protein / 40S ribosomal protein S11-like protein / 60S ribosomal protein L4-like protein / 40S ribosomal protein S19-like protein / 60S ribosomal protein l7-like protein / 40S ribosomal protein S14-like protein / Ribosomal protein l34-like protein / 60S ribosomal protein L12-like protein / 60S acidic ribosomal protein P0 / 60S ribosomal protein l17-like protein / 60S ribosomal protein L16-like protein / 40S ribosomal protein S12 / 40S ribosomal protein S22-like protein / Large ribosomal subunit protein eL28 / Putative ribosomal protein / 40S ribosomal protein S21-like protein / 60S ribosomal protein l23-like protein / Small ribosomal subunit protein eS24 類似検索 - 構成要素 | |||||||||||||||
生物種 | Chaetomium thermophilum var. thermophilum DSM 1495 (菌類) / Thermochaetoides thermophila DSM 1495 (菌類) | |||||||||||||||
手法 | 単粒子再構成法 / クライオ電子顕微鏡法 / 解像度: 3.3 Å | |||||||||||||||
データ登録者 | Kisonaite M / Wild K / Sinning I | |||||||||||||||
資金援助 | ドイツ, 1件
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引用 | ジャーナル: Nat Struct Mol Biol / 年: 2023 タイトル: Structural inventory of cotranslational protein folding by the eukaryotic RAC complex. 著者: Miglė Kišonaitė / Klemens Wild / Karine Lapouge / Genís Valentín Gesé / Nikola Kellner / Ed Hurt / Irmgard Sinning / 要旨: The challenge of nascent chain folding at the ribosome is met by the conserved ribosome-associated complex (RAC), which forms a chaperone triad with the Hsp70 protein Ssb in fungi, and consists of ...The challenge of nascent chain folding at the ribosome is met by the conserved ribosome-associated complex (RAC), which forms a chaperone triad with the Hsp70 protein Ssb in fungi, and consists of the non-canonical Hsp70 Ssz1 and the J domain protein Zuotin (Zuo1). Here we determine cryo-EM structures of Chaetomium thermophilum RAC bound to 80S ribosomes. RAC adopts two distinct conformations accommodating continuous ribosomal rotation by a flexible lever arm. It is held together by a tight interaction between the Ssz1 substrate-binding domain and the Zuo1 N terminus, and additional contacts between the Ssz1 nucleotide-binding domain and Zuo1 J- and Zuo1 homology domains, which form a rigid unit. The Zuo1 HPD motif conserved in J-proteins is masked in a non-canonical interaction by the Ssz1 nucleotide-binding domain, and allows the positioning of Ssb for activation by Zuo1. Overall, we provide the basis for understanding how RAC cooperates with Ssb in a dynamic nascent chain interaction and protein folding. | |||||||||||||||
履歴 |
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-構造の表示
添付画像 |
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-ダウンロードとリンク
-EMDBアーカイブ
マップデータ | emd_14480.map.gz | 404.1 MB | EMDBマップデータ形式 | |
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ヘッダ (付随情報) | emd-14480-v30.xml emd-14480.xml | 101.2 KB 101.2 KB | 表示 表示 | EMDBヘッダ |
FSC (解像度算出) | emd_14480_fsc.xml | 22.2 KB | 表示 | FSCデータファイル |
画像 | emd_14480.png | 153.3 KB | ||
アーカイブディレクトリ | http://ftp.pdbj.org/pub/emdb/structures/EMD-14480 ftp://ftp.pdbj.org/pub/emdb/structures/EMD-14480 | HTTPS FTP |
-検証レポート
文書・要旨 | emd_14480_validation.pdf.gz | 608 KB | 表示 | EMDB検証レポート |
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文書・詳細版 | emd_14480_full_validation.pdf.gz | 607.6 KB | 表示 | |
XML形式データ | emd_14480_validation.xml.gz | 16.2 KB | 表示 | |
CIF形式データ | emd_14480_validation.cif.gz | 22.2 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | https://ftp.pdbj.org/pub/emdb/validation_reports/EMD-14480 ftp://ftp.pdbj.org/pub/emdb/validation_reports/EMD-14480 | HTTPS FTP |
-関連構造データ
-リンク
EMDBのページ | EMDB (EBI/PDBe) / EMDataResource |
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「今月の分子」の関連する項目 |
-マップ
ファイル | ダウンロード / ファイル: emd_14480.map.gz / 形式: CCP4 / 大きさ: 437.9 MB / タイプ: IMAGE STORED AS FLOATING POINT NUMBER (4 BYTES) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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投影像・断面図 | 画像のコントロール
画像は Spider により作成 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
ボクセルのサイズ | X=Y=Z: 1.1 Å | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
密度 |
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対称性 | 空間群: 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
詳細 | EMDB XML:
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-添付データ
-試料の構成要素
+全体 : Chaetomium thermophilum RAC on 80S ribosome
全体 | 名称: Chaetomium thermophilum RAC on 80S ribosome |
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要素 |
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+超分子 #1: Chaetomium thermophilum RAC on 80S ribosome
超分子 | 名称: Chaetomium thermophilum RAC on 80S ribosome / タイプ: complex / ID: 1 / 親要素: 0 / 含まれる分子: #1-#85 |
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由来(天然) | 生物種: Chaetomium thermophilum var. thermophilum DSM 1495 (菌類) |
+分子 #1: 26S rRNA
分子 | 名称: 26S rRNA / タイプ: rna / ID: 1 / コピー数: 1 |
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由来(天然) | 生物種: Thermochaetoides thermophila DSM 1495 (菌類) / 株: DSM 1495 / CBS 144.50 / IMI 039719 |
分子量 | 理論値: 1.0787301249999999 MDa |
配列 | 文字列: AGGUUGACCU CGGAUCAGGU AGGAGGACCC GCUGAACUUA AGCAUAUCAA UAAGCGGAGG AAAAGAAACC AACAGGGAUU GCCCUAGUA ACGGCGAGUG AAGCGGCAAC AGCUCAAAUU UGAAAGCUGG CUUCGGCCCG CGUUGUAAUU UGGAGAGGAU G CUUUGGGC ...文字列: AGGUUGACCU CGGAUCAGGU AGGAGGACCC GCUGAACUUA AGCAUAUCAA UAAGCGGAGG AAAAGAAACC AACAGGGAUU GCCCUAGUA ACGGCGAGUG AAGCGGCAAC AGCUCAAAUU UGAAAGCUGG CUUCGGCCCG CGUUGUAAUU UGGAGAGGAU G CUUUGGGC GAGGCUCCUU CUGAGUUCCC UGGAACGGGA CGCCACAGAG GGUGAGAGCC CCGUAUAGUU GGAAGCCAAG CC UGUGUAA AGCUCCUUCG ACGAGUCGAG UAGUUUGGGA AUGCUGCUCA AAAUGGGAGG UAAAUUUCUU CUAAAGCUAA AUA CCGGCC AGAGACCGAU AGCGCACAAG UAGAGUGAUC GAAAGAUGAA AAGCACUUUG AAAAGAGGGU UAAAUAGCAC GUGA AAUUG UUGAAAGGGA AGCGCUUGUG ACCAGACUUG CGCCCGGCGG AUCAUCCGGU GUUCUCACCG GUGCACUCCG CCGGG CUCA GGCCAGCAUC GGUUCUGGCG GGGGGAUAAA GGCCCAGGGA AUGUGGCUCC UCCGGGAGUG UUAUAGCCCU GGGUGU AAU ACCCUCGCCG GGACCGAGGA CCGCGCUCUG CAAGGAUGCU GGCGUAAUGG UCACCAGCGA CCCGUCUUGA AACACGG AC CAAGGAGUCA AGGUUUUGCG CGAGUGUUUG GGUGUAAAAC CCGCACGCGU AAUGAAAGUG AACGUAGGUG AGAGCUUC G GCGCAUCAUC GACCGAUCCU GAUGUAUUCG GAUGGAUUUG AGUAGGAGCG UUAAGCCUUG GACCCGAAAG AUGGUGAAC UAUGCUUGGA UAGGGUGAAG CCAGAGGAAA CUCUGGUGGA GGCUCGCAGC GGUUCUGACG UGCAAAUCGA UCGUCAAAUC UGAGCAUGG GGGCGAAAGA CUAAUCGAAC CAUCUAGUAG CUGGUUACCG CCGAAGUUUC CCUCAGGAUA GCAGUGUCGA C CUUCAGUU UUAUGAGGUA AAGCGAAUGA UUAGGGACUC GGGGGCGAUU UUUAGCCUUC AUCCAUUCUC AAACUUUAAA UA UGUAAGA AGCCCUUGUU ACUUAACUGA ACGUGGGCAU UCGAAUGUAU CGACACUAGU GGGCCAUUUU UGGUAAGCAG AAC UGGCGA UGCGGGAUGA ACCGAACGCG GGGUUAAGGU GCCGGAGUGG ACGCUCAUCA GACACCACAA AAGGCGUUAG UACA UCUUG ACAGCAGGAC GGUGGCCAUG GAAGUCGGAA UCCGCUAAGG ACUGUGUAAC AACUCACCUG CCGAAUGUAC UAGCC CUGA AAAUGGAUGG CGCUCAAGCG UCCCACCCAU ACCCCGCCCU CAGGGUAGAA ACGAUGCCCU GAGGAGUAGG CGGCCG UGG AGGUCAGUGA CGAAGCCUAG GGCGUGAGCC CGGGUCGAAC GGCCUCUAGU GCAGAUCUUG GUGGUAGUAG CAAAUAC UU CAAUGAGAAC UUGAAGGACC GAAGUGGGGA AAGGUUCCAU GUGAACAGCG GUUGGACAUG GGUUAGUCGA UCCUAAGC C AUAGGGAAGU UCCGUUUCAA AGGGGCACUC GUGCCCCGUG UGGCGAAAGG GAAGCCGGUU AAUAUUCCGG CACCUGGAU GUGGGUUUUG CGCGGCAACG CAACUGAACG CGGAGACGAC GGCGGGGGCC CCGGGCAGAG UUCUCUUUUC UUCUUAACGG UCUAUCACC CUGGAAACAG UUUGUCUGGA GAUAGGGUUU AAUGGCCGGA AGAGCCCGAC ACUUCUGUCG GGUCCGGUGC G CUCUCGAC GUCCCUUGAA AAUCCGCGGG AGGGAAUAAU UCUCACGCCA GGUCGUACUC AUAACCGCAG CAGGUCCCCA AG GUGAACA GCCUCUGGUU GAUAGAACAA UGUAGAUAAG GGAAGUCGGC AAAAUAGAUC CGUAACUUCG GGAAAAGGAU UGG CUCUAA GGGUUGGGCA CGUUGGGCUU UGGGCGGACG CCCUGGGAGC AGAGGGCCUC UAGCCGGGCA ACCGGCCGGC GGCC CUCAG CACCCGGGGU UGAAGCCCUU AGCAGGCUUC GGCCGUCCGG CGUGCGGUUA ACAACCAACU UAGAACUGGU ACGGA CAGG GGGAAUCUGA CUGUCUAAUU AAAACAUAGC AUUGCGAUGG CCAGAAAGUG GUGUUGACGC AAUGUGAUUU CUGCCC AGU GCUCUGAAUG UCAAAGUGAA GAAAUUCAAC CAAGCGCGGG UAAACGGCGG GAGUAACUAU GACUCUCUUA AGGUAGC CA AAUGCCUCGU CAUCUAAUUA GUGACGCGCA UGAAUGGAUU AACGAGAUUC CCACUGUCCC UAUCUACUAU CUAGCGAA A CCACAGCCAA GGGAACGGGC UUGGCAAAAU CAGCGGGGAA AGAAGACCCU GUUGAGCUUG ACUCUAGUUU GACAUUGUG AAAAGACAUA GGAGGUGUAG AAUAGGUGGG AGCUUCGGCG CCAGUGAAAU ACCACUACUC CUAUUGUUUU UUUACUUAUU CAAUGAAGC GGGGCUGGAC UUGCGUCCAA CUUCUGGAGU UAAGGUCCUU CGCGGGCCGA CCCGGGUUGA AGACAUUGUC A GGUGGGGA GUUUGGCUG(OMG) GGCGGCACAU CUGUUAAACC AUAACGCAGG UGUCCUAAGG GGGGCUCAUG GAGAACAG A AAUCUCCAGU AGAACAAAAG GGUAAAAGUC CCCUUGAUUU UGAUUUUCAG UGUGAAUACA AACCAUGAAA GUGUGGCCU AUCGAUCCUU UAGUCCCUCG AAAUUUGAGG CUAGAGGUGC CAGAAAAGUU ACCACAGGGA UAACUGGCUU GUGGCGGCCA AGCGUUCAU AGCGACGUCG CUUUUUGAUC CUUCGAUGUC GGCUCUUCCU AUCAUACCGA AGCAGAAUUC GGUAAGCGUU G GAUUGUUC ACCCACUAAU AGGGAACGUG AGCUGGGUUU AGACCGUCGU GAGACAGGUU AGUUUUACCC UACUGAUGAA CU CGUCGCA AUGGUAAUUC AGCUUAGUAC GAGAGGAACC GCUGAUUCAG AUAAUUGGUU UUUGCGGUUG UCCGACCGGG CAG UGCCGC GAAGCUACCA UCUGCUGGAU AAUGGCUGAA CGCCUCUAAG UCAGAAUCCA UGCCAGAACG CGACGAUACU ACCC GCACG UUGUAGACGU AUAAGAAUAG GCUCCGGCCU CGUAUCCUAG CAGGCGAUUC CUCCGCCGGC CUCGAAGUGG CCGUC GGUA AUUCGCGUAU UGCAAUUUAG ACACGCGCGG GAUCAAAUCC UUUGCAGACG ACUUAGAUGU GCGAAAGGGU CCUGUA AGC AGUAGAGUAG CCUUGUUGUU ACGAUCUGCU GAGGGUAAGC CCUCCUUCGC CUAGAUUU |
+分子 #2: 18S rRNA
分子 | 名称: 18S rRNA / タイプ: rna / ID: 2 / コピー数: 1 |
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由来(天然) | 生物種: Thermochaetoides thermophila DSM 1495 (菌類) / 株: DSM 1495 / CBS 144.50 / IMI 039719 |
分子量 | 理論値: 578.7725 KDa |
配列 | 文字列: UACCUGGUUG AUUCUGCCAG UAGUCAUAUG CUUGUCUCAA AGAUUAAGCC AUGCAUGUCU AAGUAUAAGC AAUUAUACAG CGAAACUGC GAAUGGCUCA UUAAAUCAGU UAUCGUUUAU UUGAUAGUAC CUUACUACAU GGAUAACCGU GGUAAUUCUA G AGCUAAUA ...文字列: UACCUGGUUG AUUCUGCCAG UAGUCAUAUG CUUGUCUCAA AGAUUAAGCC AUGCAUGUCU AAGUAUAAGC AAUUAUACAG CGAAACUGC GAAUGGCUCA UUAAAUCAGU UAUCGUUUAU UUGAUAGUAC CUUACUACAU GGAUAACCGU GGUAAUUCUA G AGCUAAUA CAUGCUGAAA AUCCCGACUU CGGAAGGGAU GUAUUUAUUA GAUUAAAAAC CAAUGCCCUU CGGGGCUUUC UG GUGAUUC AUAAUAACUU CUCGAAUCGC ACGGCCUUGC GCCGGCGAUG GUUCAUUCAA AUUUCUGCCC UAUCAACUUU CGA CGGCUG GGUAUUGGCC AGCCGUGGUG ACAACGGGUA ACGGAGGGUU AGGGCUCGAC CCCGGAGAAG GAGCCUGAGA AACG GCUAC UACAUCCAAG GAAGGCAGCA GGCGCGCAAA UUACCCAAUC CCGACACGGG GAGGUAGUGA CAAUAAAUAC UGAUA CAGG GCUCUUUCGG GUCUUGUAAU UGGAAUGAGU ACAAUUUAAA UCCCUUAACG AGGAACAAUU GGAGGGCAAG UCUGGU GCC AGCAGCCGCG GUAAUUCCAG CUCCAAUAGC GUAUAUUAAA GUUGUUGAGG UUAAAAAGCU CGUAGUUGAA CCUUGGG CC UAGCCCGCCG GUCCGCCUCA CCGCGUGCAC UGGCUGGGCU GGGCCUUUCC UUCUGGAGAA CCGCAUGCCC UUCACUGG G UGUGUCGGGG AACCAGGACU UUUACUCUGA ACAAAUUAGA UCGCUUAAAG AAGGCCUAUG CUUGAAUACA UUAGCAUGG AAUAAUAGAA UAGGACGUGU GGUUCUAUUU UGUUGGUUUC UAGGACCGCC GUAAUGAUUA AUAGGGACAG UCGGGGGCGU CAGUAUUCA AUUGUCAGAG GUGAAAUUCU UGGAUUUAUU GAAGACUAAC AACUGCGAAA GCAUUCGCCA AGGAUGUUUU C AUUAAUCA GGAACGAAAG UUAGGGGAUC GAAGACGAUC AGAUACCGUC GUAGUCUUAA CCAUAAACUA UGCCGAUUAG GG AUCGGAC GGCGUUUAUU UUUGACCCGU UCGGCACCUU ACGAUAAAUC AAAAUGUUUG GGCUCCUGGG GGAGUAUGGU CGC AAGGCU GAAACUUAAA GAAAUUGACG GAAGGGCACC ACCAGGGGUG GAGCCUGCGG CUUAAUUUGA CUCAACACGG GGAA ACUCA CCAGGUCCAG ACACGAUGAG GAUUGACAGA UUGAGAGCUC UUUCUUGAUU UCGUGGGUGG UGGUGCAUGG CCGUU CUUA GUUGGUGGAG UGAUUUGUCU GCUUAAUUGC GAUAACGAAC GAGACCUUAA CCUGCUAAAU AGCCCGUAUU GCCUUG GCA GUACGCCGGC UUCUUAGAGG GACUAUCGGC UCAAGCCGAU GGAAGUUUGA GGCAAUAACA GGUCUGUGAU GCCCUUA GA UGUUCUGGGC CGCACGCGCG CUACACUGAC AGAGCCAGCG AGUACUCCCU UGGCCGAGAG GCCCGGGUAA UCUUGUUA A ACUCUGUCGU GCUGGGGAUA GAGCAUUGCA AUUAUUGCUC UUCAACGAGG AAUCCCUAGU AAGCGCAAGU CAUCAGCUU GCGUUGAUUA CGUCCCUGCC CUUUGUACAC ACCGCCCGUC GCUACUACCG AUUGAACGGC UCAGUGAGGC UUUCGGACUG GCCCAGAGA GGUCGGCAAC GACCACUCAG GGCCGGAAAG UUAUCCAAAC UCGGUCGUUU AGAGGAAGUA AAAGUCGUAA C AAGGUCUC CGUAGGUGAA CCUGCGGAGG GAUCAUUU |
+分子 #3: 5S rRNA
分子 | 名称: 5S rRNA / タイプ: rna / ID: 3 / コピー数: 1 |
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由来(天然) | 生物種: Thermochaetoides thermophila DSM 1495 (菌類) / 株: DSM 1495 / CBS 144.50 / IMI 039719 |
分子量 | 理論値: 38.596891 KDa |
配列 | 文字列: ACAUACGACC AUACCUAGUG GAAAACUCGG GAUCCCGUCC GCUCUCCCAU AGAUAAGCCA CUAAGGGCGG GGUUAGUACU CAGGUCGGU GACGACUGGG GAAUCCCCCG UGUUGUAUGU U |
+分子 #4: 5.8S rRNA
分子 | 名称: 5.8S rRNA / タイプ: rna / ID: 4 / コピー数: 1 |
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由来(天然) | 生物種: Thermochaetoides thermophila DSM 1495 (菌類) / 株: DSM 1495 / CBS 144.50 / IMI 039719 |
分子量 | 理論値: 50.147688 KDa |
配列 | 文字列: AAACUUUCAA CAACGGAUCU CUUGGUUCUG GCAUCGAUGA AGAACGCAGC GAAAUGCGAU AAGUAAUGUG AAUUGCAGAA UUCCGUGAA UCAUCGAAUC UUUGAACGCA CAUUGCGCCC GCCGGUAUUC CGGCGGGCAU GCCUGUUCGA GCGUCAU |
+分子 #5: Putative guanine nucleotide-binding protein
分子 | 名称: Putative guanine nucleotide-binding protein / タイプ: protein_or_peptide / ID: 5 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO |
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由来(天然) | 生物種: Thermochaetoides thermophila DSM 1495 (菌類) / 株: DSM 1495 / CBS 144.50 / IMI 039719 |
分子量 | 理論値: 35.149641 KDa |
配列 | 文字列: MAEQLILKGT LEGHNGWVTS LATSMENPNM LLSGSRDKTL IIWNLTRDET QYGYPKRRLH GHSHIVSDCV ISSDGAYALS ASWDKTLRL WELSTGTTTR RFVGHTGDVL SVSFSADNRQ IVSGSRDKTI KLWNTLGDCK YTITDKGHTE WVSCVRFSPN P QNPVIVSC ...文字列: MAEQLILKGT LEGHNGWVTS LATSMENPNM LLSGSRDKTL IIWNLTRDET QYGYPKRRLH GHSHIVSDCV ISSDGAYALS ASWDKTLRL WELSTGTTTR RFVGHTGDVL SVSFSADNRQ IVSGSRDKTI KLWNTLGDCK YTITDKGHTE WVSCVRFSPN P QNPVIVSC GWDKLVKVWD LQSCKLQTDH IGHTGYINTV TISPDGSLCA SGGKDGTTML WDLNESKHLY SLNANDEIHA LV FSPNRYW LCAATASSII IFDLEKKSKV DELKPEFQNV GKKSREPECV SLAWSADGQT LFAGYTDGII RAWGVMSRA |
+分子 #6: HABP4_PAI-RBP1 domain-containing protein
分子 | 名称: HABP4_PAI-RBP1 domain-containing protein / タイプ: protein_or_peptide / ID: 6 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO |
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由来(天然) | 生物種: Thermochaetoides thermophila DSM 1495 (菌類) / 株: DSM 1495 / CBS 144.50 / IMI 039719 |
分子量 | 理論値: 32.667918 KDa |
配列 | 文字列: MSVASKNPFD ILGNTEDETP VVPVKAVEKT STHTAKRNTD GLPPKGHAAG NRRGGANVSG NEAAFRDRNA GRDANRGKPT DEAAPRGGR RGGFRGRGKR EEGDRHPTRS APRSNSEKQA SQGWGATEGE AELKDEQAAE EIAQTEKKEA AEGEAAPEAE A KEEEPQEK ...文字列: MSVASKNPFD ILGNTEDETP VVPVKAVEKT STHTAKRNTD GLPPKGHAAG NRRGGANVSG NEAAFRDRNA GRDANRGKPT DEAAPRGGR RGGFRGRGKR EEGDRHPTRS APRSNSEKQA SQGWGATEGE AELKDEQAAE EIAQTEKKEA AEGEAAPEAE A KEEEPQEK VLTYDQYLAK LAEKKLALEQ ENALKVRKPN EGAEDKFKGL KPLTKNEDEA LFAPTVQKKE RQRERKTKQI IE IENRYVE ERPRGGRGGR GARDGARGGR GRGGAPRGGR GGAKENAAPA INTNDETAFP SLGSR |
+分子 #7: Putative ribosome associated protein
分子 | 名称: Putative ribosome associated protein / タイプ: protein_or_peptide / ID: 7 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO |
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由来(天然) | 生物種: Thermochaetoides thermophila DSM 1495 (菌類) / 株: DSM 1495 / CBS 144.50 / IMI 039719 |
分子量 | 理論値: 51.048594 KDa |
配列 | 文字列: MNATVVSLPL PTLPEGWAAE KDFKAIGKLT QEGSSMRTLE PVGPHFLAHA RRVRHKRTFS EDDRIQAQAK AKKIEQDSDS DISEEEDPM LLARDAKDWK TQDHYKVLGL SKYRWRATED QIKRAHRKKV LKHHPDKKAA AGRADDDNFF KCIQKAAEIL L DPVKRRQF ...文字列: MNATVVSLPL PTLPEGWAAE KDFKAIGKLT QEGSSMRTLE PVGPHFLAHA RRVRHKRTFS EDDRIQAQAK AKKIEQDSDS DISEEEDPM LLARDAKDWK TQDHYKVLGL SKYRWRATED QIKRAHRKKV LKHHPDKKAA AGRADDDNFF KCIQKAAEIL L DPVKRRQF DSVDEEADIP PPTKKQLAKG NYYELWGKVF ENEARFSKIQ PVPGFGNENS TREEVEAFYN FWYNFDSWRS FE YLDEDVP DDNENRDQKR HMERKNANAR KKKKAEDNAR LRKLVEEAQA GDERIKRFRQ EANAAKNKKR LEREAAERKA AEE ARLKKE AEERARKEAE EKAKAEREAA KKAKEAAKNA VKKNKRVLRG SVKEANYFVE GEASAATIDA VLNDVDLVIT KIDA DEIAA LAGKLNGLTV ADEIKNVWKE EVSRLVGAGK LKEGDIKALV A |
+分子 #8: Putative heat shock protein
分子 | 名称: Putative heat shock protein / タイプ: protein_or_peptide / ID: 8 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO |
---|---|
由来(天然) | 生物種: Thermochaetoides thermophila DSM 1495 (菌類) / 株: DSM 1495 / CBS 144.50 / IMI 039719 |
分子量 | 理論値: 62.449434 KDa |
配列 | 文字列: MAESASKAAP GERVVIGITF GNSNSSIAHT VDDKAEVIAN EDGDRQIPTI LSYVDGDEYY GQQAKNFLVR NPKNTVAYFR DILGQDFKS VDPTHNHASA HPQEAGDNVV FTIKDKAEED AEPSTLTVSE IATRYLRRLV GAASEYLGKK VTSAVITIPT N FTEKQKAA ...文字列: MAESASKAAP GERVVIGITF GNSNSSIAHT VDDKAEVIAN EDGDRQIPTI LSYVDGDEYY GQQAKNFLVR NPKNTVAYFR DILGQDFKS VDPTHNHASA HPQEAGDNVV FTIKDKAEED AEPSTLTVSE IATRYLRRLV GAASEYLGKK VTSAVITIPT N FTEKQKAA LIAAAAAADL EVLQLISEPA AAVLAYDARP EATISDKIIV VADLGGSRSD VTVLASRSGM YTILATVHDY EY HGIALDK VLIDHFSKEF LKKNPGAKDP RENPRSLAKL RLEAESTKRA LSRSTNASFS VESLIDGLDF ASTINRLRYE TIA RTVFEG FNRLVESAVK KAGLDPLDVD EVIMSGGTSN TPRIAANFRY IFPESTRILA PSTDPSALNP SELQARGAAL QASL IQEFE TEDIEQSTHA AVTTMPHVTN AIGVVSVSES GEEKFVPIIA PETAVPARRT VHLDAPKEGG DVLVKVVEGS THINV IKPE PKAKEDGETK EKTEDADDDG DFDDDDEEEE EEEEEEEKRE KVWKIGSTLA EAAVRGVKKG AKVEVTINVN TDLTVI VTA REVGGKGGVR GTLSA |
+分子 #9: 60S ribosomal protein L2-like protein
分子 | 名称: 60S ribosomal protein L2-like protein / タイプ: protein_or_peptide / ID: 9 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO |
---|---|
由来(天然) | 生物種: Thermochaetoides thermophila DSM 1495 (菌類) / 株: DSM 1495 / CBS 144.50 / IMI 039719 |
分子量 | 理論値: 27.598875 KDa |
配列 | 文字列: MGRVIRNQRK GRGSVFTAHT RLRKAPAKFR PLDYAERHGY IRGIVKEIIH DPGRGAPLAR VVFRSPYKYK QITETFIANE GMYTGQFIY AGKNAALTVG NILPLSSVPE GTVVSNVEEK PGDRGALGRT SGNYVTVVGH NPDEGKTRIK LPSGAKKVVP S SSRGMIGI ...文字列: MGRVIRNQRK GRGSVFTAHT RLRKAPAKFR PLDYAERHGY IRGIVKEIIH DPGRGAPLAR VVFRSPYKYK QITETFIANE GMYTGQFIY AGKNAALTVG NILPLSSVPE GTVVSNVEEK PGDRGALGRT SGNYVTVVGH NPDEGKTRIK LPSGAKKVVP S SSRGMIGI VAGGGRTDKP LLKASRAKHK FAVKRNRWPK TRGVAMNPVD HPHGGGNHQH IGKASTISRY AAQGQKAGLI AA RRTGLLR GTQKTKE |
+分子 #10: 60S ribosomal protein L3-like protein
分子 | 名称: 60S ribosomal protein L3-like protein / タイプ: protein_or_peptide / ID: 10 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO |
---|---|
由来(天然) | 生物種: Thermochaetoides thermophila DSM 1495 (菌類) / 株: DSM 1495 / CBS 144.50 / IMI 039719 |
分子量 | 理論値: 44.456855 KDa |
配列 | 文字列: MSHRKYEAPR HGSLAFLPRK RAARHRGRVK SFPKDDPKKP VHLTAAMGYK AGMTTIVRDL DRPGAKAHKK EVVEAVTIID CPPMVVVGL VGYIETPRGL RSLTTVWAEH LSDEVKRRFY KNWYKSKKKA FTKYAKKYAE NNGASITREL ERIKKYCTVV R VLAHTQIR ...文字列: MSHRKYEAPR HGSLAFLPRK RAARHRGRVK SFPKDDPKKP VHLTAAMGYK AGMTTIVRDL DRPGAKAHKK EVVEAVTIID CPPMVVVGL VGYIETPRGL RSLTTVWAEH LSDEVKRRFY KNWYKSKKKA FTKYAKKYAE NNGASITREL ERIKKYCTVV R VLAHTQIR KTPLKQKKAH LMEIQINGGS VADKVEFGRS LFEKPVTIDT IFEKDEMIDV IAVTKGHGFV GVTARWGTKK LP RKTHKGL RKVACIGAWH PSHVQWTVAR AGQMGYHHRT SVNHKIYRIG KGDDEANAST ETDLTKKKIT PMGGFVRYGE VNN DYVMIK GSVPGVKKRI MTLRKSLFTH TSRKALEKVE LKWIDTSSEF GHGAFQTAAE KKQFMGTLKK DLQTSA |
+分子 #11: 60S ribosomal protein L4-like protein
分子 | 名称: 60S ribosomal protein L4-like protein / タイプ: protein_or_peptide / ID: 11 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO |
---|---|
由来(天然) | 生物種: Thermochaetoides thermophila DSM 1495 (菌類) / 株: DSM 1495 / CBS 144.50 / IMI 039719 |
分子量 | 理論値: 39.439938 KDa |
配列 | 文字列: MASRPTVTVF GADGKPTGAT EVLPKVFSAP IRPDIVKHVH TGMAKNKRQP YAVSEKAGHQ TSAESWGTGR AVARIPRVSG GGTHRAGQG AFGNMCRSGR MFAPTKIWRK WHVKINQGQK RFATASALAA SAVAPLLMAR GHQVSTVPEV PLVVDSAAVA G DAVAKTAA ...文字列: MASRPTVTVF GADGKPTGAT EVLPKVFSAP IRPDIVKHVH TGMAKNKRQP YAVSEKAGHQ TSAESWGTGR AVARIPRVSG GGTHRAGQG AFGNMCRSGR MFAPTKIWRK WHVKINQGQK RFATASALAA SAVAPLLMAR GHQVSTVPEV PLVVDSAAVA G DAVAKTAA AYKLLKAIGA GPDVEKVKKS KKLRAGKGKM RGRRHRQRRG PLIVYSPEHD GKELVKGFRN IPGVETCPVD AL NLLQLAP GGHLGRFIVW TSAAIKQLDA VYESKKGFFL PANIVSQADL SRLINSTEIQ SVLRAPKGEA RTKRACVQKK NPL RNKQIM LRLNPYASTF AKEKLGEVKA EEGKPPKVPA SFKELLHEA |
+分子 #12: 60S ribosomal protein l5-like protein
分子 | 名称: 60S ribosomal protein l5-like protein / タイプ: protein_or_peptide / ID: 12 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO |
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由来(天然) | 生物種: Thermochaetoides thermophila DSM 1495 (菌類) / 株: DSM 1495 / CBS 144.50 / IMI 039719 |
分子量 | 理論値: 35.034605 KDa |
配列 | 文字列: MAFHKLVKNS AYYSRFQTKF KRRRQGKTDY YARKRLITQA KNKYNAPKYR LVVRFTNRDI ITQMVTSEIN GDKIFAAAYS HELRAYGIN HGLTNWAAAY ATGLLLARRV LAKLGLDKTF TGVEEPNGEY TLTEAAETED GERRPFKAIL DVGLARTSTG A RVFGVMKG ...文字列: MAFHKLVKNS AYYSRFQTKF KRRRQGKTDY YARKRLITQA KNKYNAPKYR LVVRFTNRDI ITQMVTSEIN GDKIFAAAYS HELRAYGIN HGLTNWAAAY ATGLLLARRV LAKLGLDKTF TGVEEPNGEY TLTEAAETED GERRPFKAIL DVGLARTSTG A RVFGVMKG ASDGGIFIPH SENRFPGYDI ETEELDTEVL KKYIYGGHVA EYMETLADDD EERYKSQFVK YIEDDVEADS LE ELYAEAH KQIRADPFRK YVSDAPKKSK EEWKAESLKY KKAKLSREER KARVEAKIKQ LLAEQDE |
+分子 #13: 60S ribosomal protein L6
分子 | 名称: 60S ribosomal protein L6 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 13 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO |
---|---|
由来(天然) | 生物種: Thermochaetoides thermophila DSM 1495 (菌類) / 株: DSM 1495 / CBS 144.50 / IMI 039719 |
分子量 | 理論値: 22.132994 KDa |
配列 | 文字列: MSAAPTTKTF GKGTRTVPAP SEKAQKWYPA EDEAQPKKVR KAVRPWTPRK SLQPGTVLIL LAGRFRGKRV VLLKCLDQGV LLVTGPFKI NGVPLRRVNA RYVIATSVKV DLTGVDQAKI DEVAQPKYFT AEKAKEKASE EAFFKQGEKP QKKPVSSTRA A DQKAIDKA ...文字列: MSAAPTTKTF GKGTRTVPAP SEKAQKWYPA EDEAQPKKVR KAVRPWTPRK SLQPGTVLIL LAGRFRGKRV VLLKCLDQGV LLVTGPFKI NGVPLRRVNA RYVIATSVKV DLTGVDQAKI DEVAQPKYFT AEKAKEKASE EAFFKQGEKP QKKPVSSTRA A DQKAIDKA LIANIKKVDM LASYLASSFS LRKGDKPHLM KF |
+分子 #14: 60S ribosomal protein l7-like protein
分子 | 名称: 60S ribosomal protein l7-like protein / タイプ: protein_or_peptide / ID: 14 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO |
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由来(天然) | 生物種: Thermochaetoides thermophila DSM 1495 (菌類) / 株: DSM 1495 / CBS 144.50 / IMI 039719 |
分子量 | 理論値: 28.821816 KDa |
配列 | 文字列: MSSTTVPTQN DILVPETLLK KRKSQEKARA ERAAALEKRK QANKEKRQVI FKRAEKYVKE YREQEREKIR LARIAKQQGS FHIPAEAKL VFVIRIKGIN KIPPKPRKIL QLLRLRQINN GVFVKVTKAT AEMIKIVEPW VAYGYPNLKS VRELIYKRGY G KVNGQRIP ...文字列: MSSTTVPTQN DILVPETLLK KRKSQEKARA ERAAALEKRK QANKEKRQVI FKRAEKYVKE YREQEREKIR LARIAKQQGS FHIPAEAKL VFVIRIKGIN KIPPKPRKIL QLLRLRQINN GVFVKVTKAT AEMIKIVEPW VAYGYPNLKS VRELIYKRGY G KVNGQRIP LTDNAIIEEN LGKYGIICIE DLIHEIFTVG PNFKQAANFL WPFKLSNPNG GFRPRKFKHF IEGGDLGNRE EH INALIRA MN |
+分子 #15: 60S ribosomal protein L8
分子 | 名称: 60S ribosomal protein L8 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 15 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO |
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由来(天然) | 生物種: Thermochaetoides thermophila DSM 1495 (菌類) / 株: DSM 1495 / CBS 144.50 / IMI 039719 |
分子量 | 理論値: 29.74449 KDa |
配列 | 文字列: MPPKSGKKVA PAPFPQGKAG AKKAPKNPLL EKRPRNFGIG QDIQPKRNLS RMVKWPEYIR LQRQKKILRM RLKVPPAIAQ FQYTLDKNL AAQAFKLLNK YRPETKQEKK ERLLREATAI KEGKKKEDVS KKPYTVKYGL NHVVGLIENK KASLVLIAND V DPIELVVF ...文字列: MPPKSGKKVA PAPFPQGKAG AKKAPKNPLL EKRPRNFGIG QDIQPKRNLS RMVKWPEYIR LQRQKKILRM RLKVPPAIAQ FQYTLDKNL AAQAFKLLNK YRPETKQEKK ERLLREATAI KEGKKKEDVS KKPYTVKYGL NHVVGLIENK KASLVLIAND V DPIELVVF LPALCRKMGI PYAIIKGKAR LGTLVHKKTA AVVAITEVRS EDKNELAKLI SAVKEGYLEK VEDTRKRWGG GI MGFKAQK REEKRKKSLE TAIKV |
+分子 #16: uL6
分子 | 名称: uL6 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 16 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO |
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由来(天然) | 生物種: Thermochaetoides thermophila DSM 1495 (菌類) / 株: DSM 1495 / CBS 144.50 / IMI 039719 |
分子量 | 理論値: 21.582133 KDa |
配列 | 文字列: MRYIHSEETI PVPENLKVSI KSRLVTVEGP RGKLQKDLSH IAVNFSVVKK GVIGLEIHHG SRKDVAALRT VRTIINNMII GVTKGFKYK MRYVYAHFPI NVNVEKNAET GCYEVEIRNF IGEKIVRKVV MAPGVEVEIS KAQKDELILS GNSLEAVSQS A ADIQQICK ...文字列: MRYIHSEETI PVPENLKVSI KSRLVTVEGP RGKLQKDLSH IAVNFSVVKK GVIGLEIHHG SRKDVAALRT VRTIINNMII GVTKGFKYK MRYVYAHFPI NVNVEKNAET GCYEVEIRNF IGEKIVRKVV MAPGVEVEIS KAQKDELILS GNSLEAVSQS A ADIQQICK VRNKDIRKFL DGIYVSEKGN IVED |
+分子 #17: 60S ribosomal protein L10-like protein
分子 | 名称: 60S ribosomal protein L10-like protein / タイプ: protein_or_peptide / ID: 17 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO |
---|---|
由来(天然) | 生物種: Thermochaetoides thermophila DSM 1495 (菌類) / 株: DSM 1495 / CBS 144.50 / IMI 039719 |
分子量 | 理論値: 25.255373 KDa |
配列 | 文字列: MARRPARCYR YCKNKPYPKS RFNRGVPDPK IKIYDLGRKR ATVDDFPLCV HLVSNEYEQL SSEALEAARI CANKYLVKYA GKEGFHLRV RAHPYHVIRI NKMLSCAGAD RLQTGMRGAF GKPQGTVARV DIGQILISVR TRDSNRAIAL EALRRCQYKF P GRQKIIVS ...文字列: MARRPARCYR YCKNKPYPKS RFNRGVPDPK IKIYDLGRKR ATVDDFPLCV HLVSNEYEQL SSEALEAARI CANKYLVKYA GKEGFHLRV RAHPYHVIRI NKMLSCAGAD RLQTGMRGAF GKPQGTVARV DIGQILISVR TRDSNRAIAL EALRRCQYKF P GRQKIIVS KNWGFTPLRR EEYLEKKAAG RVRVDGAYVQ FLTNHGNLEE NMRRFPDAFK A |
+分子 #18: Putative ribosomal protein
分子 | 名称: Putative ribosomal protein / タイプ: protein_or_peptide / ID: 18 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO |
---|---|
由来(天然) | 生物種: Thermochaetoides thermophila DSM 1495 (菌類) / 株: DSM 1495 / CBS 144.50 / IMI 039719 |
分子量 | 理論値: 20.119275 KDa |
配列 | 文字列: MSSEKAQNPM RELRIQKLVL NISVGESGDR LTRAAKVLEQ LSGQTPVYSK ARYTVRQFGI RRNEKIAVHV TVRGPKAEEI LERGLKVKE YELRRRNFSE TGNFGFGISE HIDLGIKYDP SIGIYGMDFY CCMTRPGERV AKRRRCKSRI GASHRITREE T IRWFKQRF DGIVR |
+分子 #19: 60S ribosomal protein L12-like protein
分子 | 名称: 60S ribosomal protein L12-like protein / タイプ: protein_or_peptide / ID: 19 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO |
---|---|
由来(天然) | 生物種: Thermochaetoides thermophila DSM 1495 (菌類) / 株: DSM 1495 / CBS 144.50 / IMI 039719 |
分子量 | 理論値: 17.802676 KDa |
配列 | 文字列: MPPKFDPNEI KIIHLRATGG EVGASSALAP KIGPLGLSPK KVGEDIAKAT ADWKGLRVTV RLTIQNRQAQ VSVVPTASAL IIRALKEPP RDRKKEKNIK HNKSVSLDEI IEIARTMRFK SFSKDLKGGV KEILGTAFSV GCQVDGKSPK AISDAIEAGE I DIPDE |
+分子 #20: 60S ribosomal protein L13
分子 | 名称: 60S ribosomal protein L13 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 20 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO |
---|---|
由来(天然) | 生物種: Thermochaetoides thermophila DSM 1495 (菌類) / 株: DSM 1495 / CBS 144.50 / IMI 039719 |
分子量 | 理論値: 24.19118 KDa |
配列 | 文字列: MAIKHNQQIP NNHFRKHWQR RVRCHFDQPG KKVTRRLARR AKAAALAPRP VDKLRPIVRC PTVKYNRRTR LGRGFTLEEL KAAGIPRLL APTIGIAVDH RRKNLSEESL AANVQRLKDY KARLILFPRK SNKPKKADTP KDQQTAETTT SLRTSFGVEQ P LAPGFTEI ...文字列: MAIKHNQQIP NNHFRKHWQR RVRCHFDQPG KKVTRRLARR AKAAALAPRP VDKLRPIVRC PTVKYNRRTR LGRGFTLEEL KAAGIPRLL APTIGIAVDH RRKNLSEESL AANVQRLKDY KARLILFPRK SNKPKKADTP KDQQTAETTT SLRTSFGVEQ P LAPGFTEI SKSEIPAGIE GGAYRALRKA RSDARLVGVR EKRAKEKAEA EANKK |
+分子 #21: 60S ribosomal protein L14-like protein
分子 | 名称: 60S ribosomal protein L14-like protein / タイプ: protein_or_peptide / ID: 21 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO |
---|---|
由来(天然) | 生物種: Thermochaetoides thermophila DSM 1495 (菌類) / 株: DSM 1495 / CBS 144.50 / IMI 039719 |
分子量 | 理論値: 16.111901 KDa |
配列 | 文字列: MAEINVEATS WRRVEVGRVL KLENGSLAAI VEIIDHKRVL ADGPSSDPKL ATPRGIVPLS RALLTPIVIP KLPRGARTGA VKKAWEAYG VDAKWKETNW AKKQLQQERR QSLTDFDRFK VMRLKKQRRF EERKALAKIK AAA |
+分子 #22: Ribosomal protein L15
分子 | 名称: Ribosomal protein L15 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 22 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO |
---|---|
由来(天然) | 生物種: Thermochaetoides thermophila DSM 1495 (菌類) / 株: DSM 1495 / CBS 144.50 / IMI 039719 |
分子量 | 理論値: 24.307287 KDa |
配列 | 文字列: MGALKYLEEL SKKKQSDVVR FLLRVRCWEY RQLNVIHRAS RPSRPDKARR LGYKAKQGYV IYRVRVRRGG RKRPVPKGAT YGKPTNQGV NQLKYQRSLR ATAEERVGRR CSNLRVLNSY WVNQDSTYKY YEVILVDPNH KAIRRDPRIN WICNPVHKHR E CRGLTSTG ...文字列: MGALKYLEEL SKKKQSDVVR FLLRVRCWEY RQLNVIHRAS RPSRPDKARR LGYKAKQGYV IYRVRVRRGG RKRPVPKGAT YGKPTNQGV NQLKYQRSLR ATAEERVGRR CSNLRVLNSY WVNQDSTYKY YEVILVDPNH KAIRRDPRIN WICNPVHKHR E CRGLTSTG KKSRGLNKGH RFNKTRAGRR KTWKRHNTLS LWRYR |
+分子 #23: 60S ribosomal protein L16-like protein
分子 | 名称: 60S ribosomal protein L16-like protein / タイプ: protein_or_peptide / ID: 23 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO |
---|---|
由来(天然) | 生物種: Thermochaetoides thermophila DSM 1495 (菌類) / 株: DSM 1495 / CBS 144.50 / IMI 039719 |
分子量 | 理論値: 23.03523 KDa |
配列 | 文字列: M(SAC)SFESVVVI DGKGHLLGRL ASIVAKQLLS GQKIVVVRCE ALNISGEFFR AKLKYHAYLR KMTRYNPTRG GPFHFR APS RIFYKAVRGM IPHKTARGAA ALERLKVFEG VPPPYDKKKK MVVPQALRVL RLQPGRKYCT VGRLSHEVGW KYQDVVA RL ...文字列: M(SAC)SFESVVVI DGKGHLLGRL ASIVAKQLLS GQKIVVVRCE ALNISGEFFR AKLKYHAYLR KMTRYNPTRG GPFHFR APS RIFYKAVRGM IPHKTARGAA ALERLKVFEG VPPPYDKKKK MVVPQALRVL RLQPGRKYCT VGRLSHEVGW KYQDVVA RL EERRKAKGAA YYERKKLAAR QLSEAKKAAA AKVDPKVSEA LAAYGY |
+分子 #24: 60S ribosomal protein l17-like protein
分子 | 名称: 60S ribosomal protein l17-like protein / タイプ: protein_or_peptide / ID: 24 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO |
---|---|
由来(天然) | 生物種: Thermochaetoides thermophila DSM 1495 (菌類) / 株: DSM 1495 / CBS 144.50 / IMI 039719 |
分子量 | 理論値: 21.072207 KDa |
配列 | 文字列: MVRYAATEIA PTKSARARGS YLRVSFKNTR ETAQAINGWK LQRALTFLQN VIDKKEAVPM RRYAGSTGRT AQGKQWGVSR ARWPVKSAQ FLIGLLKNAE ANADAKGLDT GNLIIKHIQV NQAPKQRRRT YRAHGRINPY MSNPCHIELI LTEAEETVQK S EAVVRDVE SHLSSRQRGV RIRRALTAA |
+分子 #25: Ribosomal protein L18-like protein
分子 | 名称: Ribosomal protein L18-like protein / タイプ: protein_or_peptide / ID: 25 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO |
---|---|
由来(天然) | 生物種: Thermochaetoides thermophila DSM 1495 (菌類) / 株: DSM 1495 / CBS 144.50 / IMI 039719 |
分子量 | 理論値: 24.195535 KDa |
配列 | 文字列: MDLVCAFIGP LFAPGARRLN LEEIAAESSS GIDLRWKHVR SSHRKAPKSD NVYLKLLVKL YRFLARRTEA PFNKVVLRRL FMSRINRPP VSLSRIARNL KNGNEKKTVV VVATVTDDNR LLQVPKMEVA ALRFTAKARA RIEAAGGRTL TLDQLALEKP T GANTLLLR ...文字列: MDLVCAFIGP LFAPGARRLN LEEIAAESSS GIDLRWKHVR SSHRKAPKSD NVYLKLLVKL YRFLARRTEA PFNKVVLRRL FMSRINRPP VSLSRIARNL KNGNEKKTVV VVATVTDDNR LLQVPKMEVA ALRFTAKARA RIEAAGGRTL TLDQLALEKP T GANTLLLR GPKNAREAVK HFGFGPHKHK KPYVRSKGRK FERARGRRRS RGFKV |
+分子 #26: Ribosomal protein L19
分子 | 名称: Ribosomal protein L19 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 26 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO |
---|---|
由来(天然) | 生物種: Thermochaetoides thermophila DSM 1495 (菌類) / 株: DSM 1495 / CBS 144.50 / IMI 039719 |
分子量 | 理論値: 22.409201 KDa |
配列 | 文字列: MVNLRTQKRL AASVLGCGEG KVWLDPNEVS EISNANSRQS IRKLVADGLI IKKPVTMHSR SRARELNLAR RIGRHRGFGK RKGTADARM PQQVLWMRRQ RVLRRLLVKY RASGKIDKHL YHELYHLAKG NTFKHKRALV EHIHRAKAEK ARERQIKEEM D AKRARTKA ...文字列: MVNLRTQKRL AASVLGCGEG KVWLDPNEVS EISNANSRQS IRKLVADGLI IKKPVTMHSR SRARELNLAR RIGRHRGFGK RKGTADARM PQQVLWMRRQ RVLRRLLVKY RASGKIDKHL YHELYHLAKG NTFKHKRALV EHIHRAKAEK ARERQIKEEM D AKRARTKA ARERKQERQA AKRNALLGEE EESK |
+分子 #27: 60S ribosomal protein L20
分子 | 名称: 60S ribosomal protein L20 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 27 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO |
---|---|
由来(天然) | 生物種: Thermochaetoides thermophila DSM 1495 (菌類) / 株: DSM 1495 / CBS 144.50 / IMI 039719 |
分子量 | 理論値: 20.341893 KDa |
配列 | 文字列: MGRLQEYQVI GRHLPTEANP NPALYRMRIF APNEVVAKSR FWYFLRGLKK VKKATGEIVS VNVISEKHPL KVKNFGIWLR YDSRSGTHN MYKEYRETSR VAAVEAMYAD MAARHRARFR SIHILKVVEL EKTEDVKRPY IKQLVAKNLS FPLPHRVPKI S TKKIFSAK RPSTFS |
+分子 #28: 60S ribosomal protein l21-like protein
分子 | 名称: 60S ribosomal protein l21-like protein / タイプ: protein_or_peptide / ID: 28 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO |
---|---|
由来(天然) | 生物種: Thermochaetoides thermophila DSM 1495 (菌類) / 株: DSM 1495 / CBS 144.50 / IMI 039719 |
分子量 | 理論値: 18.159227 KDa |
配列 | 文字列: MGHAAGLRSG TRYAFSRGFR KHGQIPLSTY LRTYRVGDIV DIKVNGAVQK GMPHKFYHGK TGVVYNVTKS AVGVIVYKRV KHRYIEKRI NVRIEHVKPS RSREDFLRRV KENAELKKKA KAEGVPVQLK RQPAMPREAH TVSIADNKPV TLAPVAYETT I |
+分子 #29: 60S ribosomal protein L22-like protein
分子 | 名称: 60S ribosomal protein L22-like protein / タイプ: protein_or_peptide / ID: 29 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO |
---|---|
由来(天然) | 生物種: Thermochaetoides thermophila DSM 1495 (菌類) / 株: DSM 1495 / CBS 144.50 / IMI 039719 |
分子量 | 理論値: 14.302563 KDa |
配列 | 文字列: MAPVAKKSGA KGKGPKVTKK FIINASQPAS DKIFDVSAFE KFLNERIKVD GRVGNLGDVI KISQIGDGKV EIIAHNDLSG RYLKYLTKK FLKKMQLRDW LRVVATSKGV YELKFYNIVN DEAEEEED |
+分子 #30: 60S ribosomal protein l23-like protein
分子 | 名称: 60S ribosomal protein l23-like protein / タイプ: protein_or_peptide / ID: 30 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO |
---|---|
由来(天然) | 生物種: Thermochaetoides thermophila DSM 1495 (菌類) / 株: DSM 1495 / CBS 144.50 / IMI 039719 |
分子量 | 理論値: 14.674428 KDa |
配列 | 文字列: MAKQKRGAPG GKLKMTLGLP VGAIMNCADN SGARNLYIIA VKGAGARLNR LPAGGVGDMV MATVKKGKPE LRKKVHPAVI VRQAKPWKR FDGVFLYFED NAGVIVNPKG EMKGSAITGP VGKEAAELWP RIASNAGVVM |
+分子 #31: eL24
分子 | 名称: eL24 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 31 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO |
---|---|
由来(天然) | 生物種: Thermochaetoides thermophila DSM 1495 (菌類) / 株: DSM 1495 / CBS 144.50 / IMI 039719 |
分子量 | 理論値: 18.081076 KDa |
配列 | 文字列: MRTYEDTFSG QRIYPGKGKL YVRGDSKIFR FQNGKSESLF LQRKNPRRIA WTVLYRRQHR KGISEEVAKK RTRRTIKSQR AIVGASLEV IKERRSMRPE ARNAARLAAI KESKEKKAAA QAAKKAEKAK NAAAAAKGQP QGRVTSKQGA KGAPVKVAAK S R |
+分子 #32: 60S ribosomal protein L25-like protein
分子 | 名称: 60S ribosomal protein L25-like protein / タイプ: protein_or_peptide / ID: 32 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO |
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由来(天然) | 生物種: Thermochaetoides thermophila DSM 1495 (菌類) / 株: DSM 1495 / CBS 144.50 / IMI 039719 |
分子量 | 理論値: 17.175334 KDa |
配列 | 文字列: MAPKDVKKGG ASKAAKGAQA KKAAQAALKG VHSHKKTKVR KSTTFHRPKT LVLSRAPKYP RKSIPHEPRL DEHKIIIHPL NTEGALKKI EEQNTLVFIV DVKANKAQIK QALKKLYDID TVKINTLIRP DGTKKAFARL TPDVDALDIA ATKLGLV |
+分子 #33: 60S ribosomal protein L26-like protein
分子 | 名称: 60S ribosomal protein L26-like protein / タイプ: protein_or_peptide / ID: 33 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO |
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由来(天然) | 生物種: Thermochaetoides thermophila DSM 1495 (菌類) / 株: DSM 1495 / CBS 144.50 / IMI 039719 |
分子量 | 理論値: 15.565322 KDa |
配列 | 文字列: MKVRPTVSSS RRKARKAHFS APSSVRRVIM SAPLSKELRE KYNVRSIPIR KGDEVQIVRG AHKDKEGKVT SVYRLKYVIH VERVTREKA TGQTVPIGIH PSNVVITKLH LDKDRENILA RIKAGREQVA KAKGKKTAA |
+分子 #34: 60S ribosomal protein L27
分子 | 名称: 60S ribosomal protein L27 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 34 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO |
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由来(天然) | 生物種: Thermochaetoides thermophila DSM 1495 (菌類) / 株: DSM 1495 / CBS 144.50 / IMI 039719 |
分子量 | 理論値: 15.803652 KDa |
配列 | 文字列: MKFLKTSRVC LVTRGRYAGK KVVIIQPVDQ GTKSHPYGHA LVAGIERYPS KITRRMSKAR IEKRSKIKPF IKVINYNHLM PTRYTLELE GLKAVINADT FKEPSQREEA KKTVKKVLED RYNSGKNRWF FTPLRF |
+分子 #35: 60S ribosomal protein L28-like protein
分子 | 名称: 60S ribosomal protein L28-like protein / タイプ: protein_or_peptide / ID: 35 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO |
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由来(天然) | 生物種: Thermochaetoides thermophila DSM 1495 (菌類) / 株: DSM 1495 / CBS 144.50 / IMI 039719 |
分子量 | 理論値: 16.848539 KDa |
配列 | 文字列: MPTRFSKTRK HRGHVSAGKG RVGKHRKHPG GRGMAGGQHH HRTNLDKYHP GYFGKVGMRH FHLLRNHYWR PSINIDKLWS LVPSDVREQ YLSGQKKDTA PVIDLLSHGY AKLLGKGRLP EIPVVVRARY VSAEAERKVK EAGGVVELVA |
+分子 #36: 60S ribosomal protein L29
分子 | 名称: 60S ribosomal protein L29 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 36 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO |
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由来(天然) | 生物種: Thermochaetoides thermophila DSM 1495 (菌類) / 株: DSM 1495 / CBS 144.50 / IMI 039719 |
分子量 | 理論値: 7.529659 KDa |
配列 | 文字列: MAKSKNSSQH NQSRKAHRNG IKKPKTQRYP SLKGTDPKFR RNHRHALHGT AKALKEFKEG KRETA |
+分子 #37: 60S ribosomal protein l30-like protein
分子 | 名称: 60S ribosomal protein l30-like protein / タイプ: protein_or_peptide / ID: 37 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO |
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由来(天然) | 生物種: Thermochaetoides thermophila DSM 1495 (菌類) / 株: DSM 1495 / CBS 144.50 / IMI 039719 |
分子量 | 理論値: 11.602616 KDa |
配列 | 文字列: MAPKKSKSEA QSIGAKLALV IKSGKVVLGY RSTLKALRSG KAKLILIAAN TPPLRKSELE YYSMMSKTPV HHYSGTNIEL GTACGKLFR CSTMAILDAG DSDILADQQ |
+分子 #38: Putative 60S ribosomal protein
分子 | 名称: Putative 60S ribosomal protein / タイプ: protein_or_peptide / ID: 38 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO |
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由来(天然) | 生物種: Thermochaetoides thermophila DSM 1495 (菌類) / 株: DSM 1495 / CBS 144.50 / IMI 039719 |
分子量 | 理論値: 13.872177 KDa |
配列 | 文字列: MSSTQKKQRS AIADVVAREY TIHLHKRLHG VTFKKRAPRA IKEIKKFAQK AMGTSDVRLD PQLNKKVWEQ GIKGVPFRIR VRISRRRND EEGAKEKLYS YVQAVNVKNP KGLLTSVVEE E |
+分子 #39: 60S ribosomal protein L32-like protein
分子 | 名称: 60S ribosomal protein L32-like protein / タイプ: protein_or_peptide / ID: 39 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO |
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由来(天然) | 生物種: Thermochaetoides thermophila DSM 1495 (菌類) / 株: DSM 1495 / CBS 144.50 / IMI 039719 |
分子量 | 理論値: 15.095985 KDa |
配列 | 文字列: MVAAKKHVPI VKKRTKRFMR HQSDRFKCLD SAWRKPKGID NRVRRRFKGN LAMPSIGYGS NKKTKHMMPS GHKAFLVHNV KDVELLLMH NRTYAAEIAH NVSSRKRIDI ITRAKQLGVK VTNAKAKVTT EV |
+分子 #40: 60S ribosomal protein l33-like protein
分子 | 名称: 60S ribosomal protein l33-like protein / タイプ: protein_or_peptide / ID: 40 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO |
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由来(天然) | 生物種: Thermochaetoides thermophila DSM 1495 (菌類) / 株: DSM 1495 / CBS 144.50 / IMI 039719 |
分子量 | 理論値: 12.330337 KDa |
配列 | 文字列: MPSEAGHRLY VKGRHLSYQR GRRNTHPKTS LIKIEGVDDT AAANFYLGKR VAYVYRAQKE VRGTKIRVIW GKITRPHGNS GVVRAKFTH PLPARSFGAS VRIMLYPSSI |
+分子 #41: Ribosomal protein l34-like protein
分子 | 名称: Ribosomal protein l34-like protein / タイプ: protein_or_peptide / ID: 41 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO |
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由来(天然) | 生物種: Thermochaetoides thermophila DSM 1495 (菌類) / 株: DSM 1495 / CBS 144.50 / IMI 039719 |
分子量 | 理論値: 13.492993 KDa |
配列 | 文字列: MAPTRVTYRR RNPYNTTSNR TRVIKTPGGQ LRVLHIKKRG TAPKCGDCGI KLPGIPALRP REYATISKPK KTVQRAYGGS RCGNCVRDR IIRAFLIEEQ KIVKKVLKEQ SQAEKKASKK |
+分子 #42: Dolichyl-diphosphooligosaccharide--protein glycotransferase
分子 | 名称: Dolichyl-diphosphooligosaccharide--protein glycotransferase タイプ: protein_or_peptide / ID: 42 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO EC番号: dolichyl-diphosphooligosaccharide-protein glycotransferase |
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由来(天然) | 生物種: Thermochaetoides thermophila DSM 1495 (菌類) / 株: DSM 1495 / CBS 144.50 / IMI 039719 |
分子量 | 理論値: 14.643441 KDa |
配列 | 文字列: MSSNGKVKAG QLWSKNKEEL TKILGELKTE LSQLRIQKIS SSGAKLNKIH DLRKSIARVL TVINAKQRAQ LRLFYKNKKY LPLDLRPKL TRALRRRLSK EDASRVLEKT KKRLTHFPQR KYAVKAA |
+分子 #43: 60S ribosomal protein L36
分子 | 名称: 60S ribosomal protein L36 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 43 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO |
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由来(天然) | 生物種: Thermochaetoides thermophila DSM 1495 (菌類) / 株: DSM 1495 / CBS 144.50 / IMI 039719 |
分子量 | 理論値: 12.784053 KDa |
配列 | 文字列: MSEDATPKAP VERTGLIRGL NKGHKTTRRV LKERPSRRKG AQSKRTQFVR SLIREVAGLA PYERRVIELL RNGKDKRARK FSKKKLGTF GRAKRKCEEL QRIIAESRRA H |
+分子 #44: Ribosomal protein L37
分子 | 名称: Ribosomal protein L37 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 44 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO |
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由来(天然) | 生物種: Thermochaetoides thermophila DSM 1495 (菌類) / 株: DSM 1495 / CBS 144.50 / IMI 039719 |
分子量 | 理論値: 10.660455 KDa |
配列 | 文字列: MTKGTSSFGK RHNKTHGLCR RCGRRSLHNQ KKVCASCGYP AAKTRKYNWS EKAKRRKVTG TGRMRYLSTV PRRFKNGFRT GVPKGARGP AVSTSS |
+分子 #45: eL38
分子 | 名称: eL38 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 45 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO |
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由来(天然) | 生物種: Thermochaetoides thermophila DSM 1495 (菌類) / 株: DSM 1495 / CBS 144.50 / IMI 039719 |
分子量 | 理論値: 9.537339 KDa |
配列 | 文字列: MPQEVSDIKK FIEICRRKDA SSARIKKNPK TQQIKFKVRC QRFLYTLVLK DSDKAEKLKQ SLPPNLQIKD VPKRNKRKSS A |
+分子 #46: Ribosomal protein eL39
分子 | 名称: Ribosomal protein eL39 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 46 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO |
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由来(天然) | 生物種: Thermochaetoides thermophila DSM 1495 (菌類) / 株: DSM 1495 / CBS 144.50 / IMI 039719 |
分子量 | 理論値: 6.297535 KDa |
配列 | 文字列: MPSHKTFRIK QKLAKAQKQN RPIPQWIRLR TGNTIRYNAK RRHWRKTRLG L |
+分子 #47: Putative ribosomal protein
分子 | 名称: Putative ribosomal protein / タイプ: protein_or_peptide / ID: 47 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO |
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由来(天然) | 生物種: Thermochaetoides thermophila DSM 1495 (菌類) / 株: DSM 1495 / CBS 144.50 / IMI 039719 |
分子量 | 理論値: 14.609222 KDa |
配列 | 文字列: MQIFVKTLTG KTITLEVESS DTIENVKAKI QDKEGIPPDQ QRLIFAGKQL EDGRTLSDYN IQKESTLHLV LRLRGGIIEP SLKALASKF NCDKMICRKC YARLPPRATN CRKRKCGHSN QLRPKKKLK |
+分子 #48: 60S ribosomal protein L41-A
分子 | 名称: 60S ribosomal protein L41-A / タイプ: protein_or_peptide / ID: 48 / コピー数: 2 / 光学異性体: LEVO |
---|---|
由来(天然) | 生物種: Thermochaetoides thermophila DSM 1495 (菌類) / 株: DSM 1495 / CBS 144.50 / IMI 039719 |
分子量 | 理論値: 3.354243 KDa |
配列 | 文字列: MRAKWRKKRT RRLKRKRRKV RARSK |
+分子 #49: 60S ribosomal protein L44-like protein
分子 | 名称: 60S ribosomal protein L44-like protein / タイプ: protein_or_peptide / ID: 49 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO |
---|---|
由来(天然) | 生物種: Thermochaetoides thermophila DSM 1495 (菌類) / 株: DSM 1495 / CBS 144.50 / IMI 039719 |
分子量 | 理論値: 12.045451 KDa |
配列 | 文字列: MVNVPKTRKT FCKGKDCQKH TLHKVTQYKA GKASAFAQGK RRYDRKQSGY GGQTKPVFHK KAKTTKKIVL RLECSVCKTK KQLPLKRCK HFELGGDKKT KGAALVF |
+分子 #50: 60S ribosomal protein L43-like protein
分子 | 名称: 60S ribosomal protein L43-like protein / タイプ: protein_or_peptide / ID: 50 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO |
---|---|
由来(天然) | 生物種: Thermochaetoides thermophila DSM 1495 (菌類) / 株: DSM 1495 / CBS 144.50 / IMI 039719 |
分子量 | 理論値: 10.158977 KDa |
配列 | 文字列: MSKRTKKVGI SGKYGTRYGA SLRKLVKKQE VTQHARYTCT FCGKNSVRRT AVGIWSCKSC KKTMAGGAYT VSTPAAAAMR STLRRLREI TEA |
+分子 #51: Putative 60S ribosomal protein
分子 | 名称: Putative 60S ribosomal protein / タイプ: protein_or_peptide / ID: 51 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO |
---|---|
由来(天然) | 生物種: Thermochaetoides thermophila DSM 1495 (菌類) / 株: DSM 1495 / CBS 144.50 / IMI 039719 |
分子量 | 理論値: 15.960451 KDa |
配列 | 文字列: MSNVSADLIW EVSRNYNSFL VKQRTGTFSR DALNLTNQHS RKHAGFVNDK ALGIVPAEKG VKVIAKKVKA ANKPASSLYT VTYKSTARK AYKAIASQAA KHGYRADLRQ AAVARASAIL RSQRPVKPEP PKKLRGAAAR RAAAAGKQ |
+分子 #52: 60S acidic ribosomal protein P0
分子 | 名称: 60S acidic ribosomal protein P0 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 52 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO |
---|---|
由来(天然) | 生物種: Thermochaetoides thermophila DSM 1495 (菌類) / 株: DSM 1495 / CBS 144.50 / IMI 039719 |
分子量 | 理論値: 33.85359 KDa |
配列 | 文字列: MGGKSGNKAG YFDKLKGLLE EYPSIFVVSV DNVSSQQMHE IRKALRGQGV VLMGKNTMVR RALKTFMPDH PEYERLLPFV KGNVGFVFT NGDLKEVREK ILSNRIKAPA RAGAIAPVDV WVPAGNTGME PGKTSFFQAL GIPTKIARGT IEITTDIKLV E AGAKVGPS ...文字列: MGGKSGNKAG YFDKLKGLLE EYPSIFVVSV DNVSSQQMHE IRKALRGQGV VLMGKNTMVR RALKTFMPDH PEYERLLPFV KGNVGFVFT NGDLKEVREK ILSNRIKAPA RAGAIAPVDV WVPAGNTGME PGKTSFFQAL GIPTKIARGT IEITTDIKLV E AGAKVGPS EATLLNMLNI SPFTYGMGIA QVYDQGNTFP ASVLDVSEEQ LLKSFTSAIT TVASLSLALN YPTLPSVIHS LI NSYKKVL AVAVETEYSW PEIEELKDRI ANPEAYAVAA PAAAAAAPVE EKKEEKKEES EKEESDDEGF GGLFD |
+分子 #53: Nascent chain
分子 | 名称: Nascent chain / タイプ: protein_or_peptide / ID: 53 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO |
---|---|
由来(天然) | 生物種: Thermochaetoides thermophila DSM 1495 (菌類) / 株: DSM 1495 / CBS 144.50 / IMI 039719 |
分子量 | 理論値: 2.315846 KDa |
配列 | 文字列: (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) |
+分子 #54: 40S ribosomal protein S0
分子 | 名称: 40S ribosomal protein S0 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 54 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO |
---|---|
由来(天然) | 生物種: Thermochaetoides thermophila DSM 1495 (菌類) / 株: DSM 1495 / CBS 144.50 / IMI 039719 |
分子量 | 理論値: 31.158996 KDa |
配列 | 文字列: MAPANLPSIF NPTSADIEQL LAAQCHIGSK NLNVHMQPYV WKTRADGVNI INLGKTWEKL VLAARIIVAI DNPSDVCVIS SRPFGQRAV LKFAAHTGAQ AIAGRFTPGS FTNYITRSFK EPRLIVVTDP RTDAQAIKEA SYVNIPVIAL CDTDSPLEYV D VAIPTNNK ...文字列: MAPANLPSIF NPTSADIEQL LAAQCHIGSK NLNVHMQPYV WKTRADGVNI INLGKTWEKL VLAARIIVAI DNPSDVCVIS SRPFGQRAV LKFAAHTGAQ AIAGRFTPGS FTNYITRSFK EPRLIVVTDP RTDAQAIKEA SYVNIPVIAL CDTDSPLEYV D VAIPTNNK GRHSVGLIWW MLAREVLRLR GTIYNRETPW DVMPDLYFYR DPEAEAEEKI EEKELAVEEE VAAVDTGFAG AG DWEAAPG GFPAATEWSE AQAGSWEAGA AATSEWAAEP TKDASAGW |
+分子 #55: 40S ribosomal protein S1
分子 | 名称: 40S ribosomal protein S1 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 55 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO |
---|---|
由来(天然) | 生物種: Thermochaetoides thermophila DSM 1495 (菌類) / 株: DSM 1495 / CBS 144.50 / IMI 039719 |
分子量 | 理論値: 29.245158 KDa |
配列 | 文字列: MAVGKNKRLS KGKKGLKKKV QDPFTRKDWY NIKAPAPFAV RDVGKTLVNR TTGLKNANDA LKGRIFEVCL ADLQKDEDHA FRKIKLRVD EVQGKNCLTN FHGLDFTTDK LRSLVRKWQT LIEANVTVTT TDHYLLRLFA IAFTKRRPNQ IKKTTYAQSS Q IRAIRRKM ...文字列: MAVGKNKRLS KGKKGLKKKV QDPFTRKDWY NIKAPAPFAV RDVGKTLVNR TTGLKNANDA LKGRIFEVCL ADLQKDEDHA FRKIKLRVD EVQGKNCLTN FHGLDFTTDK LRSLVRKWQT LIEANVTVTT TDHYLLRLFA IAFTKRRPNQ IKKTTYAQSS Q IRAIRRKM VEIIQREAAS CTLHQLVSKL IPEVIGREIE KATQGIYPLQ NVHIRKVKLL KQPKFDLGAL MALHGESSEE AG QKVEREF REQVLESV |
+分子 #56: 40S ribosomal protein S2-like protein
分子 | 名称: 40S ribosomal protein S2-like protein / タイプ: protein_or_peptide / ID: 56 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO |
---|---|
由来(天然) | 生物種: Thermochaetoides thermophila DSM 1495 (菌類) / 株: DSM 1495 / CBS 144.50 / IMI 039719 |
分子量 | 理論値: 28.556115 KDa |
配列 | 文字列: MADRGTGARG GGFASRGGAD RGRGRGGPRR GRRGGGKGDE KEWQPVTKLG RLVKAGKIKS MEEIYLHSLP IKEYQIVDYF LPKLKDEVM KIKPVQKQTR AGQRTRFKAI VLIGDSDGHV GLGIKTSKEV ATAIRAAIII AKLSVIPVRR GYWGANLGRP H SLPVKQSG ...文字列: MADRGTGARG GGFASRGGAD RGRGRGGPRR GRRGGGKGDE KEWQPVTKLG RLVKAGKIKS MEEIYLHSLP IKEYQIVDYF LPKLKDEVM KIKPVQKQTR AGQRTRFKAI VLIGDSDGHV GLGIKTSKEV ATAIRAAIII AKLSVIPVRR GYWGANLGRP H SLPVKQSG KCGSVTVRLI PAPRGTSLVA SPAVKRLLQL AGIEDAYTSS SGSTKTLENT LKATFAAVAN TYGFLTPNLW KE TKLIRSP LEEYADTLRD GKRYAH |
+分子 #57: 40S ribosomal protein S3-like protein
分子 | 名称: 40S ribosomal protein S3-like protein / タイプ: protein_or_peptide / ID: 57 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO |
---|---|
由来(天然) | 生物種: Thermochaetoides thermophila DSM 1495 (菌類) / 株: DSM 1495 / CBS 144.50 / IMI 039719 |
分子量 | 理論値: 27.893035 KDa |
配列 | 文字列: MAVPGTQISK KRKFVADGVF YAELNEFFQR ELAEEGYSGV EVRVTPTVTD IIIRATHTQE VLGEQGRRIR ELTSLIQKRF KFPENSVSL YAAKVQNRGL SAVAQCESLR YKLLNGLAVR RACYGVLRFI MESGAKGCEV VVSGKLRAAR AKSMKFTDGF M IHSGQPAR ...文字列: MAVPGTQISK KRKFVADGVF YAELNEFFQR ELAEEGYSGV EVRVTPTVTD IIIRATHTQE VLGEQGRRIR ELTSLIQKRF KFPENSVSL YAAKVQNRGL SAVAQCESLR YKLLNGLAVR RACYGVLRFI MESGAKGCEV VVSGKLRAAR AKSMKFTDGF M IHSGQPAR EFIDTATRHV LLRQGVLGIK VKIMRGSDPD GKSGPQKTLP DVVTVIEPKE ETPVVQPMSQ DYGAKAAAAA AA QEEPVEE EAAPAEQ |
+分子 #58: 40S ribosomal protein S4
分子 | 名称: 40S ribosomal protein S4 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 58 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO |
---|---|
由来(天然) | 生物種: Thermochaetoides thermophila DSM 1495 (菌類) / 株: DSM 1495 / CBS 144.50 / IMI 039719 |
分子量 | 理論値: 29.800764 KDa |
配列 | 文字列: MARGPKKHQK RLSAPSHWLL DKLSGAYAPR PSTGPHKLRD CMPLIVFVRN RLKYALNYRE TKAIMMQRLV KVDGKVRTDI TYPAGFMDV ITIEKTGENF RLIYDTKGRF TVHRITDEEA KYKLGKVKRV QLGRGGVPFL VTHDARTIRY PDPLIKVNDT V KIDLETGK ...文字列: MARGPKKHQK RLSAPSHWLL DKLSGAYAPR PSTGPHKLRD CMPLIVFVRN RLKYALNYRE TKAIMMQRLV KVDGKVRTDI TYPAGFMDV ITIEKTGENF RLIYDTKGRF TVHRITDEEA KYKLGKVKRV QLGRGGVPFL VTHDARTIRY PDPLIKVNDT V KIDLETGK ITDFIKFDTG ALAMITGGRN MGRVGVITHR ERHDGGFGIV HLKDALDNTF ATRESNVFVI GSEKPWISLP KG KGVKLTI AEERDQRRAR ALAAAGH |
+分子 #59: 40S ribosomal protein s5-like protein
分子 | 名称: 40S ribosomal protein s5-like protein / タイプ: protein_or_peptide / ID: 59 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO |
---|---|
由来(天然) | 生物種: Thermochaetoides thermophila DSM 1495 (菌類) / 株: DSM 1495 / CBS 144.50 / IMI 039719 |
分子量 | 理論値: 23.679225 KDa |
配列 | 文字列: MSEGEVEVAQ PQYDVLPKEV LAEVGSVKLF NRWSYDDIEI RDISLTDYIQ IRAPVYIPHS AGRYAVKRFR KANCPIIERL TNSLMMHGR NNGKKLMAVR IVAHAFEIIH LMTDQNPIQV AVDAIVNCGP REDSTRIGSA GTVRRQAVDV SPLRRVNQAI A LLTTGARE ...文字列: MSEGEVEVAQ PQYDVLPKEV LAEVGSVKLF NRWSYDDIEI RDISLTDYIQ IRAPVYIPHS AGRYAVKRFR KANCPIIERL TNSLMMHGR NNGKKLMAVR IVAHAFEIIH LMTDQNPIQV AVDAIVNCGP REDSTRIGSA GTVRRQAVDV SPLRRVNQAI A LLTTGARE AAFRNVKTIA ECLAEELINA AKGSSNSYAI KKKDELERVA KSNR |
+分子 #60: 40S ribosomal protein S6
分子 | 名称: 40S ribosomal protein S6 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 60 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO |
---|---|
由来(天然) | 生物種: Thermochaetoides thermophila DSM 1495 (菌類) / 株: DSM 1495 / CBS 144.50 / IMI 039719 |
分子量 | 理論値: 27.490139 KDa |
配列 | 文字列: MKLNISHPAN GSQKLIEVED ERKLRHFYDK RMGAEVAGDP LGPEWKGYIL RITGGNDKQG FPMKQGVIAP NRVRLLLSEG HSCYRPRRD GERKRKSVRG CIVGPDLSVL ALSIVKQGEQ DIPGLTDVVH PKRLGPKRAT KIRRFFSLSK DDDVRKYVIR R EVQPKGEG ...文字列: MKLNISHPAN GSQKLIEVED ERKLRHFYDK RMGAEVAGDP LGPEWKGYIL RITGGNDKQG FPMKQGVIAP NRVRLLLSEG HSCYRPRRD GERKRKSVRG CIVGPDLSVL ALSIVKQGEQ DIPGLTDVVH PKRLGPKRAT KIRRFFSLSK DDDVRKYVIR R EVQPKGEG KKPYTKAPRI QRLVTPQRLQ HKRHRIALKR RQQEKVKEEA AEYAQILAKR VAEAKAQKAD LRKRRASSLH K |
+分子 #61: 40S ribosomal protein S7
分子 | 名称: 40S ribosomal protein S7 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 61 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO |
---|---|
由来(天然) | 生物種: Thermochaetoides thermophila DSM 1495 (菌類) / 株: DSM 1495 / CBS 144.50 / IMI 039719 |
分子量 | 理論値: 23.08465 KDa |
配列 | 文字列: MSAPSLNKIA ANSPSRQNPS DLERAIAGAL YDLETNTADL KAALRPLQFV SAREIEVGHG KKAIVIFVPV PALQGFHRVQ QRLTRELEK KFSDRHVLIL AARRILPKPK RSARSRNTLK QKRPRSRTLT AVHDAILTDL VYPVEIVGKR LRTKEDGSKV L KVILDEKE ...文字列: MSAPSLNKIA ANSPSRQNPS DLERAIAGAL YDLETNTADL KAALRPLQFV SAREIEVGHG KKAIVIFVPV PALQGFHRVQ QRLTRELEK KFSDRHVLIL AARRILPKPK RSARSRNTLK QKRPRSRTLT AVHDAILTDL VYPVEIVGKR LRTKEDGSKV L KVILDEKE RGGVDYRLDT YSEVYRRLTG RNVTFEFPQT TITDY |
+分子 #62: 40S ribosomal protein S8
分子 | 名称: 40S ribosomal protein S8 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 62 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO |
---|---|
由来(天然) | 生物種: Thermochaetoides thermophila DSM 1495 (菌類) / 株: DSM 1495 / CBS 144.50 / IMI 039719 |
分子量 | 理論値: 23.102416 KDa |
配列 | 文字列: MGISRDSRHK RSHTGAKRAF YRKKRAFELG RQPANTRIGP KRIHIVRTRG GNHKYRALRL DSGNFAWGSE GCTRKTRIIG VVYHPSNNE LVRTNTLTKS AVVQIDAAPF RQWYEAHYGQ PLGRRRQQKQ GQVVEEVKKS KSVEKKQAAR FAAHGKVDPA L EKQFEAGR ...文字列: MGISRDSRHK RSHTGAKRAF YRKKRAFELG RQPANTRIGP KRIHIVRTRG GNHKYRALRL DSGNFAWGSE GCTRKTRIIG VVYHPSNNE LVRTNTLTKS AVVQIDAAPF RQWYEAHYGQ PLGRRRQQKQ GQVVEEVKKS KSVEKKQAAR FAAHGKVDPA L EKQFEAGR LYAIISSRPG QSGRADGYIL EGEELAFYQR KLHK |
+分子 #63: 40S ribosomal protein s9-like protein
分子 | 名称: 40S ribosomal protein s9-like protein / タイプ: protein_or_peptide / ID: 63 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO |
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由来(天然) | 生物種: Thermochaetoides thermophila DSM 1495 (菌類) / 株: DSM 1495 / CBS 144.50 / IMI 039719 |
分子量 | 理論値: 22.029836 KDa |
配列 | 文字列: MAPRKYSKTY KVPRRPYEAA RLDSELKLVG EYGLRNKREV WRVLLTLSKI RRAARILLTL DEKDPKRLFE GNALIRRLVR IGVLDESRM KLDYVLALKA EDFLERRLQT LVYKLGLAKS IHHARVLIRQ RHIRVGKQIV NVPSFMVRLD SQKHIDFALT S PFGGGRPG ...文字列: MAPRKYSKTY KVPRRPYEAA RLDSELKLVG EYGLRNKREV WRVLLTLSKI RRAARILLTL DEKDPKRLFE GNALIRRLVR IGVLDESRM KLDYVLALKA EDFLERRLQT LVYKLGLAKS IHHARVLIRQ RHIRVGKQIV NVPSFMVRLD SQKHIDFALT S PFGGGRPG RVRRKKAKAA EGGEGGEEEE EE |
+分子 #64: 40S ribosomal protein s10-like protein
分子 | 名称: 40S ribosomal protein s10-like protein / タイプ: protein_or_peptide / ID: 64 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO |
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由来(天然) | 生物種: Thermochaetoides thermophila DSM 1495 (菌類) / 株: DSM 1495 / CBS 144.50 / IMI 039719 |
分子量 | 理論値: 18.121471 KDa |
配列 | 文字列: MLIPKADRKA IHEYLFREGV MVAAKDYESM HEIGVRNLYV IKALQSLQSR GYVKTQFSWQ YYYYTLTPAG LDYLREWLHL PAEIVPATH IKQQRSHIPP RGMLGESERR FGGRGRGDRG DREGGYRRRE AGEGKEGAPS NFAPQFRGGF GRGRGDAPSS |
+分子 #65: 40S ribosomal protein S11-like protein
分子 | 名称: 40S ribosomal protein S11-like protein / タイプ: protein_or_peptide / ID: 65 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO |
---|---|
由来(天然) | 生物種: Thermochaetoides thermophila DSM 1495 (菌類) / 株: DSM 1495 / CBS 144.50 / IMI 039719 |
分子量 | 理論値: 18.698182 KDa |
配列 | 文字列: MATELTVQSE RAFLKQPHIF LNSKVKVKST RPGKGGRRWY KDVGLGFKTP KTAIEGHYID KKCPFTGMVS IRGRILTGRV VSTKMHRTI IIRREYLHYI PKYNRYEKRH KNLAAHVSPA FRVEEGDMVV VGQCRPLSKT VRFNVLRVLP RTGKSVKKFQ K F |
+分子 #66: 40S ribosomal protein S12
分子 | 名称: 40S ribosomal protein S12 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 66 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO |
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由来(天然) | 生物種: Thermochaetoides thermophila DSM 1495 (菌類) / 株: DSM 1495 / CBS 144.50 / IMI 039719 |
分子量 | 理論値: 15.961293 KDa |
配列 | 文字列: MSDVEETTAP QEVEVSAEAG KGQMSVLDAL KGVLKLSLMH DGLARGLREA SKALDRRQAH MCVLNESCEE EAYKKLVIAL CQEHKIPLI KVPDGKQLGE WAGLCVLDRE GNARKVVNCS CVVVKDWGEE SQERTVLLNY FQQEA |
+分子 #67: 40S ribosomal protein S13-like protein
分子 | 名称: 40S ribosomal protein S13-like protein / タイプ: protein_or_peptide / ID: 67 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO |
---|---|
由来(天然) | 生物種: Thermochaetoides thermophila DSM 1495 (菌類) / 株: DSM 1495 / CBS 144.50 / IMI 039719 |
分子量 | 理論値: 16.912891 KDa |
配列 | 文字列: MGRLHSKGKG ISASAIPYSR NPPAWLKTTP EQVVEQICKL ARKGATPSQI GVILRDSHGI AQVKVVTGNK ILRILKSNGL APDIPEDLY FLIKKAVAVR KHLERNRKDK DSKFRLILIE SRIHRLARYY KTVGVLPPTW KYESSTASTL VA |
+分子 #68: 40S ribosomal protein S14-like protein
分子 | 名称: 40S ribosomal protein S14-like protein / タイプ: protein_or_peptide / ID: 68 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO |
---|---|
由来(天然) | 生物種: Thermochaetoides thermophila DSM 1495 (菌類) / 株: DSM 1495 / CBS 144.50 / IMI 039719 |
分子量 | 理論値: 16.071464 KDa |
配列 | 文字列: MPPKKTTRPA QENISLGPQV REGELVFGVA RIFASFNDTF VHVTDLSGRE TICRVTGGMK VKADRDESSP YAAMLAAQDV AARCKELGI TALHIKIRAT GGNGTKTPGP GAQSALRALA RSGMKIGRIE DVTPTPSDST RRKGGRRGRR L |
+分子 #69: 40S ribosomal protein s15-like protein
分子 | 名称: 40S ribosomal protein s15-like protein / タイプ: protein_or_peptide / ID: 69 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO |
---|---|
由来(天然) | 生物種: Thermochaetoides thermophila DSM 1495 (菌類) / 株: DSM 1495 / CBS 144.50 / IMI 039719 |
分子量 | 理論値: 17.601604 KDa |
配列 | 文字列: MADTEYNAEE AAELKKKRTF RKFSYRGIDL EALLDLDSDE LRNVLHARAR RKINRGLKRR PLGLIKKLRK AKQEAKPNEK PELVKTHLR DMIVVPEMIG SVIGIYSGKE FNQVEIKPEM VGHYLGEFSI TYKPVKHGRP GIGATHSSRF IPLK |
+分子 #70: 40S ribosomal protein S16-like protein
分子 | 名称: 40S ribosomal protein S16-like protein / タイプ: protein_or_peptide / ID: 70 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO |
---|---|
由来(天然) | 生物種: Thermochaetoides thermophila DSM 1495 (菌類) / 株: DSM 1495 / CBS 144.50 / IMI 039719 |
分子量 | 理論値: 15.962771 KDa |
配列 | 文字列: MASVQAVQVF GKKKNATAVA RCVQGKGLIK VNGKPLKLFA PEILRAKLYE PILILGTDKF ADVDIRIRVA GGGHTSQVYA VRQAIAKSI VAYYAKYVDE HSKNLLKQEL IQFDRSLLVA DPRRCEPKKF GGRGARARFQ KSYR |
+分子 #71: 40S ribosomal protein S17-like protein
分子 | 名称: 40S ribosomal protein S17-like protein / タイプ: protein_or_peptide / ID: 71 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO |
---|---|
由来(天然) | 生物種: Thermochaetoides thermophila DSM 1495 (菌類) / 株: DSM 1495 / CBS 144.50 / IMI 039719 |
分子量 | 理論値: 16.72024 KDa |
配列 | 文字列: MGRVRTKTVK KSAKVIIEKY YPRLTLDFET NKRVCDEIAV ISSKRLRNKI AGYTTHLMKR IQRGPVRGIS FKLQEEERER KDQYVPEVS ALDFHQNSET GMLDIDQETK DLLKHLGFDS IPVNVIPVTQ SQPVERGRRY GRRD |
+分子 #72: Putative ribosomal protein
分子 | 名称: Putative ribosomal protein / タイプ: protein_or_peptide / ID: 72 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO |
---|---|
由来(天然) | 生物種: Thermochaetoides thermophila DSM 1495 (菌類) / 株: DSM 1495 / CBS 144.50 / IMI 039719 |
分子量 | 理論値: 17.826707 KDa |
配列 | 文字列: MSLVSGEKTN FNHILRLLNT NVDGKQKVVY ALTQIKGVGR RYSNLVCKKA DVDLKKRAGE LTSEELERLV TIIQNPLAYK IPTWFLNRQ RDIVDGKDSQ ILANGVDSKL REDLERLKKI RAHRGLRHYW GLRVRGQHTK TTGRRGRTVG VSKKKGG |
+分子 #73: 40S ribosomal protein S19-like protein
分子 | 名称: 40S ribosomal protein S19-like protein / タイプ: protein_or_peptide / ID: 73 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO |
---|---|
由来(天然) | 生物種: Thermochaetoides thermophila DSM 1495 (菌類) / 株: DSM 1495 / CBS 144.50 / IMI 039719 |
分子量 | 理論値: 17.151332 KDa |
配列 | 文字列: MPGGVTVRDV DAHKFVAAYA AFLKRQGKLP VPGWVDTVKT GNAKELPPQD IDWWYIRAAS VARHVYLRKT VGVGRLRKVH GSAKNRGTR PSHHVDASGS VDRKIMQALE KIQVLEKDEE RGGRRITQQG QRDLDRIAQT VAEADQESEA EEEE |
+分子 #74: 40S ribosomal protein S20-like protein
分子 | 名称: 40S ribosomal protein S20-like protein / タイプ: protein_or_peptide / ID: 74 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO |
---|---|
由来(天然) | 生物種: Thermochaetoides thermophila DSM 1495 (菌類) / 株: DSM 1495 / CBS 144.50 / IMI 039719 |
分子量 | 理論値: 13.212567 KDa |
配列 | 文字列: MSYQKAEKDF GEAPKVHKIR ITLTSRKVQS LEKVCQELIE RAKNKDLRVK GPVRMPTKTL KITTRKTPCG EGSKTWDAYE MRIHKRLID LTAPTEIVKQ IIINIEAGVE VEVTIAA |
+分子 #75: 40S ribosomal protein S21-like protein
分子 | 名称: 40S ribosomal protein S21-like protein / タイプ: protein_or_peptide / ID: 75 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO |
---|---|
由来(天然) | 生物種: Thermochaetoides thermophila DSM 1495 (菌類) / 株: DSM 1495 / CBS 144.50 / IMI 039719 |
分子量 | 理論値: 10.961475 KDa |
配列 | 文字列: MENDRGEIVD LYVPRKCSAT GRIIKAKDHG SCQITIAKVD ENGRAIQGEN IIYAFSGFVR AMGESDDALN RLAQRDGLLK NVWSAQRCA FYDPTLLRI |
+分子 #76: 40S ribosomal protein S22-like protein
分子 | 名称: 40S ribosomal protein S22-like protein / タイプ: protein_or_peptide / ID: 76 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO |
---|---|
由来(天然) | 生物種: Thermochaetoides thermophila DSM 1495 (菌類) / 株: DSM 1495 / CBS 144.50 / IMI 039719 |
分子量 | 理論値: 14.905471 KDa |
配列 | 文字列: MVRTSVLHDA LNSINNAEKM GKRQVMIRPS SKVIVKFLQV MQRHGYIGEF EEVDNHRSGK IVVQLNGRLN KCGVISPRYN VRLAELEKW VTKLLPARQF GYVILTTSAG IMDHEEARRK HVAGKIIGFF Y |
+分子 #77: 40S ribosomal protein s23-like protein
分子 | 名称: 40S ribosomal protein s23-like protein / タイプ: protein_or_peptide / ID: 77 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO |
---|---|
由来(天然) | 生物種: Thermochaetoides thermophila DSM 1495 (菌類) / 株: DSM 1495 / CBS 144.50 / IMI 039719 |
分子量 | 理論値: 15.934653 KDa |
配列 | 文字列: MSGGKPRGLN AARKLRNNRR EQRWADLQYK KRALGTAYKS SPFGGSSHAK GIVLEKVGVE AKQPNSAIRK CVRVQLIKNG KKVTAFVPN DGCLNFVDEN DEVLLAGFGR KGKAKGDIPG VRFKVVKVSG VGLLALWKEK KEKPRS |
+分子 #78: 40S ribosomal protein S24
分子 | 名称: 40S ribosomal protein S24 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 78 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO |
---|---|
由来(天然) | 生物種: Thermochaetoides thermophila DSM 1495 (菌類) / 株: DSM 1495 / CBS 144.50 / IMI 039719 |
分子量 | 理論値: 15.535286 KDa |
配列 | 文字列: MADTDSPVTL RTRKFIRNPL LSRKQMVVDI LHPGRPNISK DELREKLATM YKAQKDQVSV FGLRTQYGGG KTTGFALIYD SPEALKKFE PRYRLVRAGL AAKVEKASRQ QRKQRKNRLK TLRGTAKVKG AKAKKEK |
+分子 #79: 40S ribosomal protein S25
分子 | 名称: 40S ribosomal protein S25 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 79 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO |
---|---|
由来(天然) | 生物種: Thermochaetoides thermophila DSM 1495 (菌類) / 株: DSM 1495 / CBS 144.50 / IMI 039719 |
分子量 | 理論値: 10.932943 KDa |
配列 | 文字列: MAPAAQSGAK KQKKKWSKGK VKDKAQHSVI LDKATSDKLY KDVQSYRLVT VATLVDRLKI NGALARKCLK DLEEKGLIRQ VVGHSKMKI YTRAVGAAAE |
+分子 #80: 40S ribosomal protein S26
分子 | 名称: 40S ribosomal protein S26 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 80 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO |
---|---|
由来(天然) | 生物種: Thermochaetoides thermophila DSM 1495 (菌類) / 株: DSM 1495 / CBS 144.50 / IMI 039719 |
分子量 | 理論値: 13.61618 KDa |
配列 | 文字列: MVKKRKNNGR NKKGRGHVKP IRCSNCARCT PKDKAIKRFT IRNMVESAAI RDISDASVFA EYTVPKMYLK LQYCVSCAIH GKIVRVRSR EGRRNRAPPP RVRYNKDGKK IVPTQAPKTA |
+分子 #81: Ribosomal protein s27-like protein
分子 | 名称: Ribosomal protein s27-like protein / タイプ: protein_or_peptide / ID: 81 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO |
---|---|
由来(天然) | 生物種: Thermochaetoides thermophila DSM 1495 (菌類) / 株: DSM 1495 / CBS 144.50 / IMI 039719 |
分子量 | 理論値: 8.923572 KDa |
配列 | 文字列: MVLAVDLLNP SPASEARKHK LKTLVPAPRS FFMDVKCPGC FTITTVFSHA QTVVICQGCT NVLCQPTGGK ARLTEGCSFR RK |
+分子 #82: 40S ribosomal protein S28-like protein
分子 | 名称: 40S ribosomal protein S28-like protein / タイプ: protein_or_peptide / ID: 82 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO |
---|---|
由来(天然) | 生物種: Thermochaetoides thermophila DSM 1495 (菌類) / 株: DSM 1495 / CBS 144.50 / IMI 039719 |
分子量 | 理論値: 7.74198 KDa |
配列 | 文字列: MDSSKAPVKF VKVTRVLGRT GSRGGVTQVR VEFMDDTTRS IIRNVKGPVR ENDILVLLES EREARRLR |
+分子 #83: Ribosomal protein uS14
分子 | 名称: Ribosomal protein uS14 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 83 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO |
---|---|
由来(天然) | 生物種: Thermochaetoides thermophila DSM 1495 (菌類) / 株: DSM 1495 / CBS 144.50 / IMI 039719 |
分子量 | 理論値: 6.504587 KDa |
配列 | 文字列: MAHESVWNSR PRTYGKGSRA CRVCTHQAGL IRKYGLNICR QCFREKAADI GFVKYR |
+分子 #84: 40S ribosomal protein S30
分子 | 名称: 40S ribosomal protein S30 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 84 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO |
---|---|
由来(天然) | 生物種: Thermochaetoides thermophila DSM 1495 (菌類) / 株: DSM 1495 / CBS 144.50 / IMI 039719 |
分子量 | 理論値: 6.910259 KDa |
配列 | 文字列: MGKVHGSLAR AGKVKSQTPK VEKQEKKKTP KGRAKKRLTY TRRFVNITLT GGKRKMNPNP GA |
+分子 #85: 40S ribosomal protein S27a-like protein
分子 | 名称: 40S ribosomal protein S27a-like protein / タイプ: protein_or_peptide / ID: 85 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO |
---|---|
由来(天然) | 生物種: Thermochaetoides thermophila DSM 1495 (菌類) / 株: DSM 1495 / CBS 144.50 / IMI 039719 |
分子量 | 理論値: 17.73176 KDa |
配列 | 文字列: MQIFVKTLTG KTITLEVEPS DTIDTVKSKI QDKEGIPPDQ QRLIFAGKQL EDGRTLSDYN IQKESTLHLV LRLRGGAKKR KKKVYTTPK KIKHKRKKVK LAVLKYYKVD SDGKIERLRR ECPNESCGAG VFMASMQDRQ YCGRCHLTYV FDKSS |
+分子 #86: MAGNESIUM ION
分子 | 名称: MAGNESIUM ION / タイプ: ligand / ID: 86 / コピー数: 472 / 式: MG |
---|---|
分子量 | 理論値: 24.305 Da |
+分子 #87: ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE
分子 | 名称: ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE / タイプ: ligand / ID: 87 / コピー数: 1 / 式: ATP |
---|---|
分子量 | 理論値: 507.181 Da |
Chemical component information | ChemComp-ATP: |
+分子 #88: ZINC ION
分子 | 名称: ZINC ION / タイプ: ligand / ID: 88 / コピー数: 8 / 式: ZN |
---|---|
分子量 | 理論値: 65.409 Da |
-実験情報
-構造解析
手法 | クライオ電子顕微鏡法 |
---|---|
解析 | 単粒子再構成法 |
試料の集合状態 | particle |
-試料調製
緩衝液 | pH: 7.5 |
---|---|
凍結 | 凍結剤: ETHANE |
-電子顕微鏡法
顕微鏡 | FEI TITAN KRIOS |
---|---|
撮影 | フィルム・検出器のモデル: GATAN K3 (6k x 4k) / 平均電子線量: 39.4 e/Å2 |
電子線 | 加速電圧: 300 kV / 電子線源: FIELD EMISSION GUN |
電子光学系 | 照射モード: FLOOD BEAM / 撮影モード: BRIGHT FIELD |
実験機器 | モデル: Titan Krios / 画像提供: FEI Company |
-画像解析
-原子モデル構築 1
+万見について
-お知らせ
-2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました
EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました
- EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
- これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。
関連情報:EMDBヘッダ
-2020年8月12日: 新型コロナ情報
新型コロナ情報
URL: https://pdbj.org/emnavi/covid19.php
新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。
関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ
+2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ
新型コロナウイルスの構造データ
- 国際ウイルス分類委員会(ICTV)は、新型コロナウイルス感染症(COVID-19)の病原ウイルスの略称を「SARS-CoV-2」と決定しました。
- 万見で扱っている構造データベースでは、"COVID-19 virus"、"2019-nCoV"といった別称・仮称でも登録されています。こちらでウイルスの詳細と構造データの一覧を見られます。
関連情報:万見生物種 / 2020年8月12日: 新型コロナ情報
+2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更
EMDBのIDの桁数の変更
- EMDBエントリに付与されているアクセスコード(EMDB-ID)は4桁の数字(例、EMD-1234)でしたが、間もなく枯渇します。これまでの4桁のID番号は4桁のまま変更されませんが、4桁の数字を使い切った後に発行されるIDは5桁以上の数字(例、EMD-12345)になります。5桁のIDは2019年の春頃から発行される見通しです。
- EM Navigator/万見では、接頭語「EMD-」は省略されています。
関連情報:Q: 「EMD」とは何ですか? / 万見/EM NavigatorにおけるID/アクセスコードの表記
+2017年7月12日: PDB大規模アップデート
PDB大規模アップデート
- 新バージョンのPDBx/mmCIF辞書形式に基づくデータがリリースされました。
- 今回の更新はバージョン番号が4から5になる大規模なもので、全エントリデータの書き換えが行われる「Remediation」というアップデートに該当します。
- このバージョンアップで、電子顕微鏡の実験手法に関する多くの項目の書式が改定されました(例:em_softwareなど)。
- EM NavigatorとYorodumiでも、この改定に基づいた表示内容になります。
外部リンク:wwPDB Remediation / OneDepデータ基準に準拠した、より強化された内容のモデル構造ファイルが、PDBアーカイブで公開されました。
-万見 (Yorodumi)
幾万の構造データを、幾万の視点から
- 万見(Yorodumi)は、EMDB/PDB/SASBDBなどの構造データを閲覧するためのページです。
- EM Navigatorの詳細ページの後継、Omokage検索のフロントエンドも兼ねています。
関連情報:EMDB / PDB / SASBDB / 3つのデータバンクの比較 / 万見検索 / 2016年8月31日: 新しいEM Navigatorと万見 / 万見文献 / Jmol/JSmol / 機能・相同性情報 / 新しいEM Navigatorと万見の変更点