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- EMDB-13936: Cryo-EM structure of the ribosome from Encephalitozoon cuniculi -

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基本情報

登録情報
データベース: EMDB / ID: EMD-13936
タイトルCryo-EM structure of the ribosome from Encephalitozoon cuniculi
マップデータconsensus map
試料
  • 複合体: Ribosome from Encephalitozoon cuniculi
    • 複合体: large subunit
      • タンパク質・ペプチド: x 42種
      • RNA: x 1種
    • 複合体: small subunit
      • RNA: x 2種
      • タンパク質・ペプチド: x 31種
    • タンパク質・ペプチド: x 1種
  • リガンド: x 3種
機能・相同性
機能・相同性情報


rRNA processing / large ribosomal subunit / ribosomal small subunit assembly / small ribosomal subunit / 5S rRNA binding / cytosolic small ribosomal subunit / cytosolic large ribosomal subunit / rRNA binding / ribosome / structural constituent of ribosome ...rRNA processing / large ribosomal subunit / ribosomal small subunit assembly / small ribosomal subunit / 5S rRNA binding / cytosolic small ribosomal subunit / cytosolic large ribosomal subunit / rRNA binding / ribosome / structural constituent of ribosome / translation / nucleolus / RNA binding / nucleus / metal ion binding / cytoplasm
類似検索 - 分子機能
CXXC motif containing zinc binding protein, eukaryotic / CXXC motif containing zinc binding protein, eukaryotic / Ribosomal protein L30e / Ribosomal L15/L27a, N-terminal / Ribosomal protein S26e / Ribosomal protein S26e superfamily / Ribosomal protein S26e / Ribosomal protein S12e / Ribosomal protein S5, eukaryotic/archaeal / Ribosomal protein S2, eukaryotic ...CXXC motif containing zinc binding protein, eukaryotic / CXXC motif containing zinc binding protein, eukaryotic / Ribosomal protein L30e / Ribosomal L15/L27a, N-terminal / Ribosomal protein S26e / Ribosomal protein S26e superfamily / Ribosomal protein S26e / Ribosomal protein S12e / Ribosomal protein S5, eukaryotic/archaeal / Ribosomal protein S2, eukaryotic / Ribosomal protein S21e / Ribosomal protein S21e superfamily / Ribosomal protein S21e / Ribosomal protein L29e / Ribosomal L29e protein family / S27a-like superfamily / Plectin/S10, N-terminal / Plectin/S10 domain / Ribosomal protein S25 / S25 ribosomal protein / Ribosomal protein L22e / Ribosomal protein L22e superfamily / Ribosomal L22e protein family / Ribosomal protein L1 / Ribosomal protein S2, eukaryotic/archaeal / Ribosomal protein L10e, conserved site / Ribosomal protein L10e signature. / Ribosomal protein S3, eukaryotic/archaeal / Ribosomal protein L10e / Ribosomal protein L13e / Ribosomal protein L13e / Ribosomal protein L19, eukaryotic / Ribosomal protein S19e / Ribosomal protein S19e / Ribosomal_S19e / 60S ribosomal protein L18a/ L20, eukaryotes / Ribosomal protein S19A/S15e / Ribosomal protein L44e / Ribosomal protein L44 / Ribosomal protein L34e, conserved site / Ribosomal protein L34e signature. / Ribosomal protein L5 eukaryotic, C-terminal / Ribosomal L18 C-terminal region / Ribosomal protein S17e / Ribosomal protein S17e-like superfamily / Ribosomal S17 / 50S ribosomal protein L18Ae/60S ribosomal protein L20 and L18a / Ribosomal L40e family / Ribosomal protein 50S-L18Ae/60S-L20/60S-L18A / Ribosomal proteins 50S-L18Ae/60S-L20/60S-L18A / Ribosomal protein S6, eukaryotic / 40S ribosomal protein S1/3, eukaryotes / Ribosomal protein S4e, N-terminal / RS4NT (NUC023) domain / Ribosomal_L40e / Ribosomal protein L40e / Ribosomal protein L40e superfamily / Eukaryotic Ribosomal Protein L27, KOW domain / 40S ribosomal protein S11, N-terminal / Ribosomal_S17 N-terminal / Ribosomal protein L1, 3-layer alpha/beta-sandwich / Ribosomal protein 60S L18 and 50S L18e / Ribosomal protein L27e / Ribosomal protein L27e superfamily / Ribosomal L27e protein family / Ribosomal protein L39e, conserved site / Ribosomal protein L39e signature. / Ribosomal protein S4e / Ribosomal protein S4e, central region / Ribosomal protein S4e, central domain superfamily / Ribosomal family S4e / Ribosomal protein S27, zinc-binding domain superfamily / Ribosomal protein L34Ae / Ribosomal protein L34e / Ribosomal protein S24e / Ribosomal protein S23, eukaryotic/archaeal / 60S ribosomal protein L19 / Ribosomal protein S24e / Ribosomal protein S6/S6e/A/B/2, conserved site / Ribosomal protein S6e signature. / Ribosomal protein S27 / Ribosomal protein L30/YlxQ / Ribosomal protein S27 / Ribosomal Protein L6, KOW domain / Ribosomal protein S8e / Ribosomal protein L13, eukaryotic/archaeal / Ribosomal protein L7A/L8 / Ribosomal protein S3Ae / Ribosomal S3Ae family / Ribosomal S3Ae family / Ribosomal protein L6e / Ribosomal protein S28e / Ribosomal protein S28e / 60S ribosomal protein L6E / Ribosomal protein S6e / Ribosomal protein L18e / Ribosomal protein S5/S7, eukaryotic/archaeal / Ribosomal protein S6e / Ribosomal protein S6e / Ribosomal protein L37ae
類似検索 - ドメイン・相同性
ECU06_1135 protein / 60S ribosomal protein L29 / ECU06_1215 protein / ECU11_0225 protein / Guanine nucleotide binding protein beta subunit / 60S ribosomal protein L27a / 60S ribosomal protein L3 / 40S RIBOSOMAL PROTEIN S15A (S22 in yeast) / 40S RIBOSOMAL PROTEIN S28 / 40S ribosomal protein S3 ...ECU06_1135 protein / 60S ribosomal protein L29 / ECU06_1215 protein / ECU11_0225 protein / Guanine nucleotide binding protein beta subunit / 60S ribosomal protein L27a / 60S ribosomal protein L3 / 40S RIBOSOMAL PROTEIN S15A (S22 in yeast) / 40S RIBOSOMAL PROTEIN S28 / 40S ribosomal protein S3 / 60S ribosomal protein L39 / 40S ribosomal protein S19 / Ribosomal protein L15 / 40S ribosomal protein S7 / 40S RIBOSOMAL PROTEIN S20 / 40S RIBOSOMAL PROTEIN S24 / 60S ribosomal protein L44 / 40S ribosomal protein S23 / 60S RIBOSOMAL PROTEIN L23A / 60S RIBOSOMAL PROTEIN L6 / 60S ribosomal protein L10 / 60S ribosomal protein L23 / 40S ribosomal protein S13 / 40S ribosomal protein S4 / 60S RIBOSOMAL PROTEIN L4 / 60S ribosomal protein L20 / 60S RIBOSOMAL PROTEIN L26 / RIBOSOMAL PROTEIN S15 / 40S RIBOSOMAL PROTEIN S2 / 60S ribosomal protein L37 / 60S RIBOSOMAL PROTEIN L17 / UBIQUITIN/ L40 RIBOSOMAL PROTEIN FUSION / 60S RIBOSOMAL PROTEIN L37A (L43) / 40S ribosomal protein S26 / 60S ribosomal protein L36 / 40S ribosomal protein S18 / 60S RIBOSOMAL PROTEIN L19 / 60S RIBOSOMAL PROTEIN L5 / 60S RIBOSOMAL PROTEIN L30 / 40S ribosomal protein S9 / 60S ribosomal protein L21 / 40S ribosomal protein S6 / 60S ribosomal protein L1 / 40S ribosomal protein S1 / 60S RIBOSOMAL PROTEIN L13A (L16) / 40S RIBOSOMAL PROTEIN S10 / 60S ribosomal protein L32 / 40S RIBOSOMAL PROTEIN S27 / 60S ribosomal protein L22 / 40S RIBOSOMAL PROTEIN S11 / 40S ribosomal protein S0 / 60S RIBOSOMAL PROTEIN L27 / 40S ribosomal protein S5 / 60S RIBOSOMAL PROTEIN L18 / 60S ribosomal protein L7 / 60S ribosomal protein L34 / 40S ribosomal protein S14 / 60S RIBOSOMAL PROTEIN L13 / 40S RIBOSOMAL PROTEIN S16 / 60S ribosomal protein L31 / 60S RIBOSOMAL PROTEIN L35A (L33) / 60S RIBOSOMAL PROTEIN L9 / 40S ribosomal protein S17 / 60S ribosomal protein L7a / 60S ribosomal protein L11 / 40S RIBOSOMAL PROTEIN S12 / 60S ribosomal protein L8 / 60S ribosomal protein L35-1 / 40S ribosomal protein S25 / Similarity to 60S RIBOSOMAL PROTEIN L24 / Similarity to monoubiquitin/carboxy-extension protein fusion / 40S ribosomal protein S8 / Uncharacterized protein ECU01_0250
類似検索 - 構成要素
生物種Encephalitozoon cuniculi (ウサギエンケファリトゾーン) / Encephalitozoon cuniculi GB-M1 (ウサギエンケファリトゾーン)
手法単粒子再構成法 / クライオ電子顕微鏡法 / 解像度: 2.7 Å
データ登録者Nicholson D / Ranson NA / Melnikov SV
資金援助 英国, 6件
OrganizationGrant number国
Wellcome Trust203743/Z/16/Z 英国
Medical Research Council (MRC, United Kingdom)G0901526 英国
Medical Research Council (MRC, United Kingdom)MR/N009738/1 英国
H2020 Marie Curie Actions of the European Commission97617 英国
H2020 Marie Curie Actions of the European Commission895166 英国
Wellcome Trust108466/Z/15/Z 英国
引用ジャーナル: Nat Commun / 年: 2022
タイトル: Adaptation to genome decay in the structure of the smallest eukaryotic ribosome.
著者: David Nicholson / Marco Salamina / Johan Panek / Karla Helena-Bueno / Charlotte R Brown / Robert P Hirt / Neil A Ranson / Sergey V Melnikov /
要旨: The evolution of microbial parasites involves the counterplay between natural selection forcing parasites to improve and genetic drifts forcing parasites to lose genes and accumulate deleterious ...The evolution of microbial parasites involves the counterplay between natural selection forcing parasites to improve and genetic drifts forcing parasites to lose genes and accumulate deleterious mutations. Here, to understand how this counterplay occurs at the scale of individual macromolecules, we describe cryo-EM structure of ribosomes from Encephalitozoon cuniculi, a eukaryote with one of the smallest genomes in nature. The extreme rRNA reduction in E. cuniculi ribosomes is accompanied with unparalleled structural changes, such as the evolution of previously unknown molten rRNA linkers and bulgeless rRNA. Furthermore, E. cuniculi ribosomes withstand the loss of rRNA and protein segments by evolving an ability to use small molecules as structural mimics of degenerated rRNA and protein segments. Overall, we show that the molecular structures long viewed as reduced, degenerated, and suffering from debilitating mutations possess an array of compensatory mechanisms that allow them to remain active despite the extreme molecular reduction.
履歴
登録2021年12月3日-
ヘッダ(付随情報) 公開2022年2月9日-
マップ公開2022年2月9日-
更新2022年2月9日-
現状2022年2月9日処理サイト: PDBe / 状態: 公開

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構造の表示

ムービー
  • 表面図（断面を密度値に従い着色）
  • 表面レベル: 0.05
  • UCSF Chimeraによる作画
  • ダウンロード
  • 表面図（高さに従い着色）
  • 表面レベル: 0.05
  • UCSF Chimeraによる作画
  • ダウンロード
  • あてはめたモデルとの重ね合わせ
  • 原子モデル: PDB-7qep
  • 表面レベル: 0.05
  • UCSF Chimeraによる作画
  • ダウンロード
ムービービューア
構造ビューアEMマップ:
SurfViewMolmilJmol/JSmol
添付画像

emd_13936.png

ダウンロードとリンク

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マップ

ファイルダウンロード / ファイル: emd_13936.map.gz / 形式: CCP4 / 大きさ: 512 MB / タイプ: IMAGE STORED AS FLOATING POINT NUMBER (4 BYTES)
注釈consensus map
投影像・断面図

画像のコントロール

大きさ
明度
コントラスト
その他
軸Z (Sec.)Y (Row.)X (Col.)
0.86 Å/pix.
x 512 pix.
= 440.832 Å		0.86 Å/pix.
x 512 pix.
= 440.832 Å		0.86 Å/pix.
x 512 pix.
= 440.832 Å

表面

投影像

断面 (1/3)

断面 (1/2)

断面 (2/3)

画像は Spider により作成

ボクセルのサイズX=Y=Z: 0.861 Å
密度

ヒストグラム

ヒストグラム (対数)
表面レベル登録者による: 0.05 / ムービー #1: 0.05
最小 - 最大-0.41054884 - 0.92765087
平均 (標準偏差)0.00022292779 (±0.016516855)
対称性空間群: 1
詳細

EMDB XML:

マップ形状
Axis orderXYZ
Origin000
サイズ512512512
Spacing512512512
セルA=B=C: 440.832 Å
α=β=γ: 90.0 °

CCP4マップ ヘッダ情報:

modeImage stored as Reals
Å/pix. X/Y/Z0.8610.8610.861
M x/y/z512512512
origin x/y/z0.0000.0000.000
length x/y/z440.832440.832440.832
α/β/γ90.00090.00090.000
MAP C/R/S123
start NC/NR/NS000
NC/NR/NS512512512
D min/max/mean-0.4110.9280.000

-
添付データ

-
マスク #1

ファイルemd_13936_msk_1.map
投影像・断面図
軸ZYX

投影像

断面 (1/2)
密度ヒストグラム

ヒストグラム

ヒストグラム (対数)

-
追加マップ: small subunit body map

ファイルemd_13936_additional_1.map
注釈small subunit body map
投影像・断面図
軸ZYX

投影像

断面 (1/2)
密度ヒストグラム

ヒストグラム

ヒストグラム (対数)

-
追加マップ: small subunit head map

ファイルemd_13936_additional_2.map
注釈small subunit head map
投影像・断面図
軸ZYX

投影像

断面 (1/2)
密度ヒストグラム

ヒストグラム

ヒストグラム (対数)

-
ハーフマップ: consensus half map 1

ファイルemd_13936_half_map_1.map
注釈consensus half map 1
投影像・断面図
軸ZYX

投影像

断面 (1/2)
密度ヒストグラム

ヒストグラム

ヒストグラム (対数)

-
ハーフマップ: consensus half map 2

ファイルemd_13936_half_map_2.map
注釈consensus half map 2
投影像・断面図
軸ZYX

投影像

断面 (1/2)
密度ヒストグラム

ヒストグラム

ヒストグラム (対数)

-
試料の構成要素

+
全体 : Ribosome from Encephalitozoon cuniculi

全体名称: Ribosome from Encephalitozoon cuniculi
要素
  • 複合体: Ribosome from Encephalitozoon cuniculi
    • 複合体: large subunit
      • タンパク質・ペプチド: Guanine nucleotide binding protein beta subunit
      • RNA: 5.8S-23S ribosomal RNA
      • タンパク質・ペプチド: Similarity to monoubiquitin/carboxy-extension protein fusion
      • タンパク質・ペプチド: 60S ribosomal protein L1
      • タンパク質・ペプチド: 60S ribosomal protein L8
      • タンパク質・ペプチド: 60S ribosomal protein L3
      • タンパク質・ペプチド: 60S RIBOSOMAL PROTEIN L4
      • タンパク質・ペプチド: 60S RIBOSOMAL PROTEIN L5
      • タンパク質・ペプチド: 60S RIBOSOMAL PROTEIN L6
      • タンパク質・ペプチド: 60S ribosomal protein L7
      • タンパク質・ペプチド: 60S ribosomal protein L7a
      • タンパク質・ペプチド: 60S RIBOSOMAL PROTEIN L9
      • タンパク質・ペプチド: 60S ribosomal protein L10
      • タンパク質・ペプチド: 60S ribosomal protein L11
      • タンパク質・ペプチド: 60S RIBOSOMAL PROTEIN L13
      • タンパク質・ペプチド: ECU06_1215 protein
      • タンパク質・ペプチド: Ribosomal protein L15
      • タンパク質・ペプチド: 60S RIBOSOMAL PROTEIN L13A (L16)
      • タンパク質・ペプチド: 60S RIBOSOMAL PROTEIN L17
      • タンパク質・ペプチド: 60S RIBOSOMAL PROTEIN L18
      • タンパク質・ペプチド: Uncharacterized protein ECU01_0250
      • タンパク質・ペプチド: ECU06_1135 protein
      • タンパク質・ペプチド: 60S ribosomal protein L20
      • タンパク質・ペプチド: 60S ribosomal protein L21
      • タンパク質・ペプチド: 60S ribosomal protein L22
      • タンパク質・ペプチド: 60S ribosomal protein L23
      • タンパク質・ペプチド: Similarity to 60S RIBOSOMAL PROTEIN L24
      • タンパク質・ペプチド: 60S RIBOSOMAL PROTEIN L23A
      • タンパク質・ペプチド: 60S RIBOSOMAL PROTEIN L26
      • タンパク質・ペプチド: 60S RIBOSOMAL PROTEIN L27
      • タンパク質・ペプチド: 60S ribosomal protein L27a
      • タンパク質・ペプチド: 60S ribosomal protein L29
      • タンパク質・ペプチド: 60S RIBOSOMAL PROTEIN L30
      • タンパク質・ペプチド: 60S ribosomal protein L31
      • タンパク質・ペプチド: 60S ribosomal protein L32
      • タンパク質・ペプチド: 60S RIBOSOMAL PROTEIN L35A (L33)
      • タンパク質・ペプチド: 60S ribosomal protein L34
      • タンパク質・ペプチド: 60S ribosomal protein L35-1
      • タンパク質・ペプチド: 60S ribosomal protein L36
      • タンパク質・ペプチド: 60S ribosomal protein L37
      • タンパク質・ペプチド: 60S ribosomal protein L39
      • タンパク質・ペプチド: UBIQUITIN/ L40 RIBOSOMAL PROTEIN FUSION
      • タンパク質・ペプチド: 60S ribosomal protein L44
    • 複合体: small subunit
      • RNA: 5S ribosomal RNA
      • RNA: 18S ribosomal RNA
      • タンパク質・ペプチド: 40S RIBOSOMAL PROTEIN S10
      • タンパク質・ペプチド: 40S RIBOSOMAL PROTEIN S11
      • タンパク質・ペプチド: 40S RIBOSOMAL PROTEIN S12
      • タンパク質・ペプチド: 40S ribosomal protein S13
      • タンパク質・ペプチド: 40S ribosomal protein S14
      • タンパク質・ペプチド: RIBOSOMAL PROTEIN S15
      • タンパク質・ペプチド: 40S RIBOSOMAL PROTEIN S16
      • タンパク質・ペプチド: 40S ribosomal protein S17
      • タンパク質・ペプチド: 40S ribosomal protein S18
      • タンパク質・ペプチド: 40S ribosomal protein S19
      • タンパク質・ペプチド: 40S RIBOSOMAL PROTEIN S20
      • タンパク質・ペプチド: ECU11_0225 protein
      • タンパク質・ペプチド: 40S RIBOSOMAL PROTEIN S15A (S22 in yeast)
      • タンパク質・ペプチド: 40S ribosomal protein S23
      • タンパク質・ペプチド: 40S RIBOSOMAL PROTEIN S24
      • タンパク質・ペプチド: 40S ribosomal protein S25
      • タンパク質・ペプチド: 40S ribosomal protein S26
      • タンパク質・ペプチド: 40S RIBOSOMAL PROTEIN S27
      • タンパク質・ペプチド: 40S RIBOSOMAL PROTEIN S28
      • タンパク質・ペプチド: 40S ribosomal protein S29
      • タンパク質・ペプチド: 60S RIBOSOMAL PROTEIN L37A (L43)
      • タンパク質・ペプチド: 40S ribosomal protein S0
      • タンパク質・ペプチド: 40S ribosomal protein S1
      • タンパク質・ペプチド: 40S RIBOSOMAL PROTEIN S2
      • タンパク質・ペプチド: 40S ribosomal protein S3
      • タンパク質・ペプチド: 40S ribosomal protein S4
      • タンパク質・ペプチド: 40S ribosomal protein S5
      • タンパク質・ペプチド: 40S ribosomal protein S6
      • タンパク質・ペプチド: 40S ribosomal protein S7
      • タンパク質・ペプチド: 40S ribosomal protein S8
      • タンパク質・ペプチド: 40S ribosomal protein S9
    • タンパク質・ペプチド: 60S RIBOSOMAL PROTEIN L19
  • リガンド: ZINC ION
  • リガンド: ADENOSINE MONOPHOSPHATE
  • リガンド: SPERMIDINE

+
超分子 #1: Ribosome from Encephalitozoon cuniculi

超分子名称: Ribosome from Encephalitozoon cuniculi / タイプ: complex / キメラ: Yes / ID: 1 / 親要素: 0 / 含まれる分子: #1-#77
由来(天然)生物種: Encephalitozoon cuniculi (ウサギエンケファリトゾーン)
株: strain II

+
超分子 #2: large subunit

超分子名称: large subunit / タイプ: complex / キメラ: Yes / ID: 2 / 親要素: 1 / 含まれる分子: #1-#2, #25-#42, #44-#66
由来(天然)生物種: Encephalitozoon cuniculi (ウサギエンケファリトゾーン)
株: strain II

+
超分子 #3: small subunit

超分子名称: small subunit / タイプ: complex / キメラ: Yes / ID: 3 / 親要素: 1 / 含まれる分子: #3-#24, #67-#77
由来(天然)生物種: Encephalitozoon cuniculi (ウサギエンケファリトゾーン)
株: strain II

+
分子 #1: Guanine nucleotide binding protein beta subunit

分子名称: Guanine nucleotide binding protein beta subunit / タイプ: protein_or_peptide / ID: 1 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Encephalitozoon cuniculi GB-M1 (ウサギエンケファリトゾーン)
株: GB-M1
分子量理論値: 36.828836 KDa
配列文字列: MSSAELEVLE YLNGHKDEVK GLKIVRVSGR EILYSSSRDK KVFSWDLHSK IDSEFGKILK LYDGGHSKRI NGLDVSKDGN MMVTVGSDG IGRIWDTESK KSILLEGHSR DVLCVSINSN DTKIVTGSVD RTMNLYNTKG DLVLKMGRDM EMMHRGWINC V TFHPTEES ...文字列:
MSSAELEVLE YLNGHKDEVK GLKIVRVSGR EILYSSSRDK KVFSWDLHSK IDSEFGKILK LYDGGHSKRI NGLDVSKDGN MMVTVGSDG IGRIWDTESK KSILLEGHSR DVLCVSINSN DTKIVTGSVD RTMNLYNTKG DLVLKMGRDM EMMHRGWINC V TFHPTEES ILASGSADGT VKIWDLDTQE HLQTYLGGAY VDYEKAKEKK TSPVDYDESK SVTAMAFSKD GSILTYGEKS GK MYLVKVD SKECIQSFDA IVPVRSIAVG ETEPVIALGT DESVIIWETI SSRVIASYNL KEIGNGVRCL SLAFSGSTLY CGL STGAIV PLELRKSD

+
分子 #5: 40S RIBOSOMAL PROTEIN S10

分子名称: 40S RIBOSOMAL PROTEIN S10 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 5 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Encephalitozoon cuniculi GB-M1 (ウサギエンケファリトゾーン)
株: GB-M1
分子量理論値: 11.167082 KDa
配列文字列:
MLVPTANKYK IKRRLLEKKA LLLEDTVLGN HRDLEIPNLH LKIFMKTMIS YGYVQRIHVW RHSYFLLTPL GESRLREELV FTDEGVASQ EAPAVSA

+
分子 #6: 40S RIBOSOMAL PROTEIN S11

分子名称: 40S RIBOSOMAL PROTEIN S11 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 6 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Encephalitozoon cuniculi GB-M1 (ウサギエンケファリトゾーン)
株: GB-M1
分子量理論値: 17.78891 KDa
配列文字列:
MEEVRKLKVF PRQTGVCAKP YASHEEQPKR RVNAEVCGFK APETAYTRQY IDKKCPFTGD VNVRGRLFKG VVKKMKAEKT IVVVANYVH YSKKYKRYSR RHTNFSVHMS PCFEGMINVG DTVICGETRP LSKTKSSVVL GYIKKALPGS FKVLESI

+
分子 #7: 40S RIBOSOMAL PROTEIN S12

分子名称: 40S RIBOSOMAL PROTEIN S12 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 7 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Encephalitozoon cuniculi GB-M1 (ウサギエンケファリトゾーン)
株: GB-M1
分子量理論値: 14.518135 KDa
配列文字列:
MSEMQEPMME PEMTLQEALS KVCKVSRTYC KLSRGAKETT KKMLADKMSF VMVAENAEPR ISKLVMALAK KKNIPVISIG SCLELGRIV GVENVSSSGK VRSKGCCVAG VQDYCEQTSE AGFVQAALLK GISSQ

+
分子 #8: 40S ribosomal protein S13

分子名称: 40S ribosomal protein S13 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 8 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Encephalitozoon cuniculi GB-M1 (ウサギエンケファリトゾーン)
株: GB-M1
分子量理論値: 16.858637 KDa
配列文字列:
MAKMHSSGKG RSGSVKPYAT AFPTWLTKSV DEIKSDVIQM GNKGVPAPDI GTRLRDEYGI GKASDVLGES ITRFLQRNGV VPKIPHDLE SLVHRANTLR SHLNIYRKDN SAKYRLILVS SRMYRVARYY KRKMRIPGNW KPKLVELNK

+
分子 #9: 40S ribosomal protein S14

分子名称: 40S ribosomal protein S14 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 9 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Encephalitozoon cuniculi GB-M1 (ウサギエンケファリトゾーン)
株: GB-M1
分子量理論値: 14.423893 KDa
配列文字列:
MTEQIESMEL AAVAHIKATK NDTFVHITDM TGSETIAKIT GGMRVKAQRD EGSPYAAMLA AQDVATKILG RGVKVLHFKL RGAGGVKPM ALGPGAQTAI RTLIRAGLRV GRIEDVTPVA RDRVRKRGGH RGRRV

+
分子 #10: RIBOSOMAL PROTEIN S15

分子名称: RIBOSOMAL PROTEIN S15 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 10 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Encephalitozoon cuniculi GB-M1 (ウサギエンケファリトゾーン)
株: GB-M1
分子量理論値: 16.383311 KDa
配列文字列:
MKGDNEVSKK KRTFRRYTYR GVPVEELEKM PFSEVAKLFP SRLRRRVRRG LSSREVELIK GCIAAKAACV SSSSKPEMVR THARSAIIW PAMIGALVGV HVGNGYLPVE IKPEMVGFVL SDFAPTRVTP KHGRPGIGAS SSSKFVPLK

+
分子 #11: 40S RIBOSOMAL PROTEIN S16

分子名称: 40S RIBOSOMAL PROTEIN S16 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 11 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Encephalitozoon cuniculi GB-M1 (ウサギエンケファリトゾーン)
株: GB-M1
分子量理論値: 16.602551 KDa
配列文字列:
MSRSVKSVTT QGKKKRAVAT CVCTQTGEFS IRINKVPFKL ITNTLMIAKL KEIICIVEQA NIKDLSFDIT CKIGGDVSRV YAVRMAFAK AILAFYGTYF DEWKKQEIQK RLLDFDRFSL VADSRKREPK KFGGPGARAR YQKSYR

+
分子 #12: 40S ribosomal protein S17

分子名称: 40S ribosomal protein S17 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 12 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Encephalitozoon cuniculi GB-M1 (ウサギエンケファリトゾーン)
株: GB-M1
分子量理論値: 14.057334 KDa
配列文字列:
MGCVRNKIVK RAARTIAEKY FQRLDSTFDH NLLVVQDVAV VQSKKLKNEI AGYLTSLYKK ILKGTYNKVY IKSHEEERER KENVIPKES MLDVDCVEVD DVTMEMIKRY GYEGNFKVYG M

+
分子 #13: 40S ribosomal protein S18

分子名称: 40S ribosomal protein S18 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 13 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Encephalitozoon cuniculi GB-M1 (ウサギエンケファリトゾーン)
株: GB-M1
分子量理論値: 17.43135 KDa
配列文字列:
MNYTYDPAEV QYIVRIHNTN IDGTKRIPFA LTKIRGIGIR IATAICKRLG IDLRKRAGEM GEDEMKRISD AILDPASVGI PESYMNHQR DIIDGTTSHL IGTRLDADLR MMIERGKKNK RIRAYRLDVG LKVRGQRTKS NGRRGRSMGV SRKK

+
分子 #14: 40S ribosomal protein S19

分子名称: 40S ribosomal protein S19 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 14 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Encephalitozoon cuniculi GB-M1 (ウサギエンケファリトゾーン)
株: GB-M1
分子量理論値: 15.806159 KDa
配列文字列:
MIEGIYEVMP EKFNEALKSY LKSTNEVVPL QDHDIMKTGE GREQAPIEED WYFTRMASIV RQISIKGAVT SEFLAKRYGS LKNRGCRPS KYVGAYPEIG ESVLENLKNM GWINEHPKDM LTEKGKTIVR EIIEKVRE

+
分子 #15: 40S RIBOSOMAL PROTEIN S20

分子名称: 40S RIBOSOMAL PROTEIN S20 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 15 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Encephalitozoon cuniculi GB-M1 (ウサギエンケファリトゾーン)
株: GB-M1
分子量理論値: 14.236458 KDa
配列文字列:
MDVEMKKQDI DVASTMETMK VCIDMASLEE KQINKVCREF YEYGKTFIDD LQRETVLPKK VESITTLRNP SGQGTKKWSR YKMIVHLRN FYLEATHQQL EKVVQFLRNF PHVEINLSIQ N

+
分子 #16: ECU11_0225 protein

分子名称: ECU11_0225 protein / タイプ: protein_or_peptide / ID: 16 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Encephalitozoon cuniculi GB-M1 (ウサギエンケファリトゾーン)
株: GB-M1
分子量理論値: 7.661769 KDa
配列文字列:
MTFERRICSL GKTPIASSDK ASVQIVLAVL DQYGQVTGET TIYDIGGTVR RAGMGDELLL EKIRMEEYGA

+
分子 #17: 40S RIBOSOMAL PROTEIN S15A (S22 in yeast)

分子名称: 40S RIBOSOMAL PROTEIN S15A (S22 in yeast) / タイプ: protein_or_peptide / ID: 17 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Encephalitozoon cuniculi GB-M1 (ウサギエンケファリトゾーン)
株: GB-M1
分子量理論値: 14.582005 KDa
配列文字列:
MSAALANMCK AINNASRAGK RQLLLRFSTE EMRMFLLQML RHGYISGFSY IHDKRSGKSI IDLNGRLNRC GAISPNYIVK RDGIEDFRT RLLPARQFGH VLFNTSKGIL DHKECLTENV GGKILGYFY

+
分子 #18: 40S ribosomal protein S23

分子名称: 40S ribosomal protein S23 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 18 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Encephalitozoon cuniculi GB-M1 (ウサギエンケファリトゾーン)
株: GB-M1
分子量理論値: 15.345015 KDa
配列文字列:
MPGLFSANNL IKSRKAKRLA DTAYRKRALG TKYKHSVLGR APQAKAIVLE KIGVEAKQPN SAIRKAVRCQ LIATGKKITA FVPYDGSVT YIESNDEVTV EGFGKKGRSV GDIPGIRFKV CKVQNVSLHA IFTGKKEKPS R

+
分子 #19: 40S RIBOSOMAL PROTEIN S24

分子名称: 40S RIBOSOMAL PROTEIN S24 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 19 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Encephalitozoon cuniculi GB-M1 (ウサギエンケファリトゾーン)
株: GB-M1
分子量理論値: 15.529335 KDa
配列文字列:
MSLELEIADL RDNRLLSRKE LDVVAYHPGM PIPSKEEIRE KISELYQTKK DNVVVMDLKN RYGTHRTTLK AKIYSSIEVL SNIEKKHIV AKLTGKEFHV TPRRVRKDER KKRYKIFGTL KRAMKKAERK NK

+
分子 #20: 40S ribosomal protein S25

分子名称: 40S ribosomal protein S25 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 20 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Encephalitozoon cuniculi GB-M1 (ウサギエンケファリトゾーン)
株: GB-M1
分子量理論値: 12.355396 KDa
配列文字列:
MVKKIQESKE KKALKAASGT RKDKKKWGDG RKKEEVRRAV TVSEELLAKV RKDVGRASVV TRYMIGSRYN LNLGVAENVL RHLSNEGVV QQVLGNRRMT IYAGCRAQEQ

+
分子 #21: 40S ribosomal protein S26

分子名称: 40S ribosomal protein S26 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 21 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Encephalitozoon cuniculi GB-M1 (ウサギエンケファリトゾーン)
株: GB-M1
分子量理論値: 11.902758 KDa
配列文字列:
MRRNHGRGKK NRGSAGSIQC DKCGSVTPKD KAIKRFRIQS LIEQASFDDL KQATIYDVFE VPRMGYKSQF CVSCACHAKI VRVRSSQAR KIRYGFNPNR VASAHN

+
分子 #22: 40S RIBOSOMAL PROTEIN S27

分子名称: 40S RIBOSOMAL PROTEIN S27 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 22 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Encephalitozoon cuniculi GB-M1 (ウサギエンケファリトゾーン)
株: GB-M1
分子量理論値: 9.434813 KDa
配列文字列:
MASDLAFPTR EKVGSTYKKD RLYREGNGFF MYVRCGGCRH TTCCYSHSQT NISCPGCGDI ILTSSGGRAV VSPNCEFKKI IRNID

+
分子 #23: 40S RIBOSOMAL PROTEIN S28

分子名称: 40S RIBOSOMAL PROTEIN S28 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 23 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Encephalitozoon cuniculi GB-M1 (ウサギエンケファリトゾーン)
株: GB-M1
分子量理論値: 7.459593 KDa
配列文字列:
MEEQQEFFGE VTHVLGRTGG SGLLTQVKME LMHNKRTIQR AVKGPVAVGD IIEILECERE HRRTR

+
分子 #24: 40S ribosomal protein S29

分子名称: 40S ribosomal protein S29 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 24 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Encephalitozoon cuniculi GB-M1 (ウサギエンケファリトゾーン)
株: GB-M1
分子量理論値: 7.637959 KDa
配列文字列:
MSFEVLFDVP VKKNEPSGPH SHRKPFGKGS RSCVSCYTFR GIIRKLMMCR RCFREYAGDI GFAIYD

+
分子 #25: Similarity to monoubiquitin/carboxy-extension protein fusion

分子名称: Similarity to monoubiquitin/carboxy-extension protein fusion
タイプ: protein_or_peptide / ID: 25 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Encephalitozoon cuniculi GB-M1 (ウサギエンケファリトゾーン)
株: GB-M1
分子量理論値: 17.141877 KDa
配列文字列:
MQIFVKTLTG KTITLEVEPG DTIDNVKAKI QDKEGIPPDQ QRLIFAGKQL EDGRTLSDYN IQKESTLHLV LRLRGGGAKK KKKDFSTPK KVKEPRKKRG LSWLDNFTVT DDKVKMNGVS CEVCGTEVFC GKIQSGFKCG RCYRVYDKDI ASH

+
分子 #26: 60S ribosomal protein L1

分子名称: 60S ribosomal protein L1 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 26 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Encephalitozoon cuniculi GB-M1 (ウサギエンケファリトゾーン)
株: GB-M1
分子量理論値: 24.752602 KDa
配列文字列: MSKQAEEEQL AFLDSGRIIG IINQLKESED PEKIVTIQIQ VNLKGFDPRK DNKVSKDMVL PYRVRSLDKT IVIADEAHVK VCIDANLPY VPIDEISGDD KKDIRESVLK KNKFFILCPG YNKIYQLKNI LRCGKTPHIL RNGDDINAVF ETGKKSCKLR I QDDFSVTS ...文字列:
MSKQAEEEQL AFLDSGRIIG IINQLKESED PEKIVTIQIQ VNLKGFDPRK DNKVSKDMVL PYRVRSLDKT IVIADEAHVK VCIDANLPY VPIDEISGDD KKDIRESVLK KNKFFILCPG YNKIYQLKNI LRCGKTPHIL RNGDDINAVF ETGKKSCKLR I QDDFSVTS FTVGHTGMDS EHIYENIKVG MGLLVSYLKN GSQNLKGVMI KTDQSPPVTL Y

+
分子 #27: 60S ribosomal protein L8

分子名称: 60S ribosomal protein L8 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 27 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Encephalitozoon cuniculi GB-M1 (ウサギエンケファリトゾーン)
株: GB-M1
分子量理論値: 25.911061 KDa
配列文字列: MGKITRRTRE AKKKQRQPIV KVCLSYPIIP QVEEGEVIDI VHERSRGAPV AIISFKEDDC MVPASEGMYT GQKILIGDDA PIDIGNITK IKNVPEGMAV NSVESVYGDG GTFAMVNGSY SLVVNHRKET NETVIKIPSG KKLTVSSECR CIVGVVAGGG I HDKPLLKA ...文字列:
MGKITRRTRE AKKKQRQPIV KVCLSYPIIP QVEEGEVIDI VHERSRGAPV AIISFKEDDC MVPASEGMYT GQKILIGDDA PIDIGNITK IKNVPEGMAV NSVESVYGDG GTFAMVNGSY SLVVNHRKET NETVIKIPSG KKLTVSSECR CIVGVVAGGG I HDKPLLKA SVAHYKAKAR GHVFPRVRGV AMNPVEHIHG GGNHQHVGKP TTVSKKDISQ EQKIGLVGAR RTGYRVGSRK L

+
分子 #28: 60S ribosomal protein L3

分子名称: 60S ribosomal protein L3 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 28 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Encephalitozoon cuniculi GB-M1 (ウサギエンケファリトゾーン)
株: GB-M1
分子量理論値: 42.555711 KDa
配列文字列: MSCRKFNAPR HGSLQFCPRK RSKTIRPAAG AFPADDRSQP VHLTGFMAYK AGMTHVVRTK TQVAKNKQLS REIMDAVTVL EAPPMVVYG IVGYEKTVTG LRRLPIVTAA YVSDGVLRRM FGNRYASKES AGQFCKGSVC ESRVEMIKER AHCVRVLVQT Q PTLIKGLG ...文字列:
MSCRKFNAPR HGSLQFCPRK RSKTIRPAAG AFPADDRSQP VHLTGFMAYK AGMTHVVRTK TQVAKNKQLS REIMDAVTVL EAPPMVVYG IVGYEKTVTG LRRLPIVTAA YVSDGVLRRM FGNRYASKES AGQFCKGSVC ESRVEMIKER AHCVRVLVQT Q PTLIKGLG LKKAHIAEIQ VNGGSISEKV EWALGRLEKE IAIGEVFGVN ENIDTIGVTK GKGFQGTVKR FGVRKQPRKS RK GIRKVAC IGAWHPSRVM YSIARAGQMG FHRRTEKNKR VYMIGNGSSN IKTEFDLTEK PISPMGGFPH YGEVRNDFIM VKG AVVGAR KRVVTLRKSL LRQRAGEELV IKFVDTSSKI GHGRFQTSAE KKAFYGARKA DIAAEIH

+
分子 #29: 60S RIBOSOMAL PROTEIN L4

分子名称: 60S RIBOSOMAL PROTEIN L4 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 29 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Encephalitozoon cuniculi GB-M1 (ウサギエンケファリトゾーン)
株: GB-M1
分子量理論値: 37.767617 KDa
配列文字列: MKQQINCYEA DGVTVKKTLD LPEVFSVPIR QDLVLKTYSL YRMKTRQPYA VSKNAGMQHS AESWGTGRAI ARVPRVKGGG TRRAGQGAF ANFCRKGRMA HPTKTHRRWA RKVVENTKKI AEAMAVAASA QASLVEARGH RISDVKMLPI IVSDDIAKAR K TKDAVEIL ...文字列:
MKQQINCYEA DGVTVKKTLD LPEVFSVPIR QDLVLKTYSL YRMKTRQPYA VSKNAGMQHS AESWGTGRAI ARVPRVKGGG TRRAGQGAF ANFCRKGRMA HPTKTHRRWA RKVVENTKKI AEAMAVAASA QASLVEARGH RISDVKMLPI IVSDDIAKAR K TKDAVEIL RNLNMTEELK RVEKSRGVRC GKGKMRNRRY TQRKGILIVH GESSEMLGFR NIRGVDQMSI DSLDLLELAP GG VAGRLII WTESAFEKLD KIFGGVEREA ELTPGFKLPN RIVTHDDLEE LFYSDAVQAI LDEPLFVGRT SVKLDDEEME ERL RFIRKF DASAIRSTN

+
分子 #30: 60S RIBOSOMAL PROTEIN L5

分子名称: 60S RIBOSOMAL PROTEIN L5 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 30 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Encephalitozoon cuniculi GB-M1 (ウサギエンケファリトゾーン)
株: GB-M1
分子量理論値: 32.77025 KDa
配列文字列: MSNAKGTRNY HKNFQVKRRR RREGKTDYKH RTNMIRQDSN SCGSVKHRLV VRITGSRVIC QIVAAYMDGD RVMVYADSRE LERYGINFG ATNYSAAYAT GFLIGRRALT AMSLDEVYRP KEIDGTYSVT KDIDGEKKAP RVFLDIGLAR STRGARVFGA L KGASDAGL ...文字列:
MSNAKGTRNY HKNFQVKRRR RREGKTDYKH RTNMIRQDSN SCGSVKHRLV VRITGSRVIC QIVAAYMDGD RVMVYADSRE LERYGINFG ATNYSAAYAT GFLIGRRALT AMSLDEVYRP KEIDGTYSVT KDIDGEKKAP RVFLDIGLAR STRGARVFGA L KGASDAGL NVPHSAAKFY GHKPDGSFDA KELHDRIFGY NISEYMKQLR DGDPEKYKTQ FSSYIKKGID PEEIPRIYKS AF DKIAEDP TRKKKETKDY SGFKKYKQAR LTYEERAKRV QAKLSAAEGE

+
分子 #31: 60S RIBOSOMAL PROTEIN L6

分子名称: 60S RIBOSOMAL PROTEIN L6 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 31 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Encephalitozoon cuniculi GB-M1 (ウサギエンケファリトゾーン)
株: GB-M1
分子量理論値: 19.672766 KDa
配列文字列:
MLIKEVRVIP DDAGLYMPDD IPRFVEKYKA RTARKPRVRR TDLVKGMVVV VLEGVFASRR VVYLKGLEDN IALCAGPKSI NGIPLFRID ERYLLATSTV LDLNMDVDID GKDTVLTERD VYAVPMDVEM TDAERKIDEE IAKAARRVEY MKSYLSEPFE I DATRNFYS QKY

+
分子 #32: 60S ribosomal protein L7

分子名称: 60S ribosomal protein L7 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 32 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Encephalitozoon cuniculi GB-M1 (ウサギエンケファリトゾーン)
株: GB-M1
分子量理論値: 27.987592 KDa
配列文字列: MEGVMSEAPQ SSIRKKEYEA RMSRIRSRQE KEFRERKSAN ARYAEETTEK LLNKYYEQER EILEKKSSMK NGFYVPKEAE FFAVILIRS KCNCPPKVRK VLELFRLKRI NTCVLVRNNK STRKMLQIIK DHVAFGTIGM ELLRKLVYTK GSGRNGHVRV K LTNEFIED ...文字列:
MEGVMSEAPQ SSIRKKEYEA RMSRIRSRQE KEFRERKSAN ARYAEETTEK LLNKYYEQER EILEKKSSMK NGFYVPKEAE FFAVILIRS KCNCPPKVRK VLELFRLKRI NTCVLVRNNK STRKMLQIIK DHVAFGTIGM ELLRKLVYTK GSGRNGHVRV K LTNEFIED MFDGKIRCIE ELVHHIYNGT EMFKKVNSFL YPFHLSPPRG GFKGQKSKSF NDGGSVGNHQ DLLSNLLERM I

+
分子 #33: 60S ribosomal protein L7a

分子名称: 60S ribosomal protein L7a / タイプ: protein_or_peptide / ID: 33 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Encephalitozoon cuniculi GB-M1 (ウサギエンケファリトゾーン)
株: GB-M1
分子量理論値: 23.587896 KDa
配列文字列: MVLGKVKKIP VEEPRLTKEQ KIERDLLIKK KVSKLANSIR IPPAIYQFRT VLSEHDTKKF VELFMKYRPE NKQEKRIRLQ SEDPKKGPK PILVKFGLKH VTNLIETKKA KLVLISASVD PIEVVIFLPT LCRKMGVSYA IVENSTLLGK LVNLKTTSCV C LCDVRPED ...文字列:
MVLGKVKKIP VEEPRLTKEQ KIERDLLIKK KVSKLANSIR IPPAIYQFRT VLSEHDTKKF VELFMKYRPE NKQEKRIRLQ SEDPKKGPK PILVKFGLKH VTNLIETKKA KLVLISASVD PIEVVIFLPT LCRKMGVSYA IVENSTLLGK LVNLKTTSCV C LCDVRPED EGSFKEMLRT ADAIFLDNYE THLSTWGGLP QKEADEKQ

+
分子 #34: 60S RIBOSOMAL PROTEIN L9

分子名称: 60S RIBOSOMAL PROTEIN L9 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 34 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Encephalitozoon cuniculi GB-M1 (ウサギエンケファリトゾーン)
株: GB-M1
分子量理論値: 20.649123 KDa
配列文字列:
MRILVTRIVK VPEDCTATQE GKIFTFQGPK GSIVEDCTRH PLTFDIHEGN IRIRLWNGKR KAMALAITVE SLLRNAIKAV TVGFAYTMK AVYNHFSINM EIKEDGKILL VKNFLGEKNV KRFRMRGAAR VRLDERKDTI VIEGPSLSDV SQSAGTITNE C KAKNRDSR VFLDGIFVTE RGIMA

+
分子 #35: 60S ribosomal protein L10

分子名称: 60S ribosomal protein L10 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 35 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Encephalitozoon cuniculi GB-M1 (ウサギエンケファリトゾーン)
株: GB-M1
分子量理論値: 25.047074 KDa
配列文字列: MGRRPGRCYR YLSKKAYPKS RFNRGVPDSK IQIFDLGRRK AGVLEFPLLV NCISNERENL SAEALEAARI CANKYMVKHA GKDNFHLRI RVYPFHVLRI NKMLSCAGAD RLQTGMRGSF GKPYGRAARV VFNQPILSIR TKESFRDAAV EALRRAKNKF P GHQKIQVS ...文字列:
MGRRPGRCYR YLSKKAYPKS RFNRGVPDSK IQIFDLGRRK AGVLEFPLLV NCISNERENL SAEALEAARI CANKYMVKHA GKDNFHLRI RVYPFHVLRI NKMLSCAGAD RLQTGMRGSF GKPYGRAARV VFNQPILSIR TKESFRDAAV EALRRAKNKF P GHQKIQVS SKFGFTNMFS DEFNKLNESG RIILRGGSFS VIREKGSIDK FKRDLEYAAN N

+
分子 #36: 60S ribosomal protein L11

分子名称: 60S ribosomal protein L11 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 36 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Encephalitozoon cuniculi GB-M1 (ウサギエンケファリトゾーン)
株: GB-M1
分子量理論値: 19.733045 KDa
配列文字列:
MSSKKINPMR EISIKKLSIH ICARESGAKL DRAAKVLEQL TGQKPVTSKA RMTIRNFGIR RNEKIAVHVN VSGKKAYELL NTALRVKEY ELKESCFSNN GCFGFGIEEH IDLGLKYDPN IGIFGMDFFV ILARPGDRVS KRKRCKSRVG NKQRVYAEDA K KWFVENFE GVLVE

+
分子 #37: 60S RIBOSOMAL PROTEIN L13

分子名称: 60S RIBOSOMAL PROTEIN L13 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 37 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Encephalitozoon cuniculi GB-M1 (ウサギエンケファリトゾーン)
株: GB-M1
分子量理論値: 18.900148 KDa
配列文字列:
MKGNHALPNN HFRKTSLKIR IHHDPETKAR VMAEKKLRKA KALFPMPLKK LRPIVRCPTI KYNRNERLGR GFTAAECEKA GLDYRHARR LGIAVDLRRR DTNQEAFDKN VERIKTYLGK ITIYESVKEA RESGAKPYTK EIMPFVKPKP VVGSISREEV A SYE

+
分子 #38: ECU06_1215 protein

分子名称: ECU06_1215 protein / タイプ: protein_or_peptide / ID: 38 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Encephalitozoon cuniculi GB-M1 (ウサギエンケファリトゾーン)
株: GB-M1
分子量理論値: 12.275196 KDa
配列文字列:
MRTVRLGRIV TPALKERRHT YAIIVGIIDV TFVLLQRKDG EREICSVANL HLEDEAFDIK GLSAEEIGKL IPEDTYIEDT TNDFDRFKL KLRKRVEEEL LKEKGLA

+
分子 #39: Ribosomal protein L15

分子名称: Ribosomal protein L15 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 39 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Encephalitozoon cuniculi GB-M1 (ウサギエンケファリトゾーン)
株: GB-M1
分子量理論値: 23.823924 KDa
配列文字列: MGAVNYLREI HRRKQSDVMR YLLRIRVCEY RQRGECFRVE KPTFLERART LGYKAKQGYV LYIARVKKGN MKRNYHNGNT RGKCVNAGI NQIKPSLRKQ ASAEMIAGKK CSNLGVLNSY WVGQDAAYKY YEVIMVDRDH QAIRNDPKIN WICKGTMKHR E CRGLTSAS ...文字列:
MGAVNYLREI HRRKQSDVMR YLLRIRVCEY RQRGECFRVE KPTFLERART LGYKAKQGYV LYIARVKKGN MKRNYHNGNT RGKCVNAGI NQIKPSLRKQ ASAEMIAGKK CSNLGVLNSY WVGQDAAYKY YEVIMVDRDH QAIRNDPKIN WICKGTMKHR E CRGLTSAS RKSRGLGKGV KFNKSKGGSI RSCWRRRNTL VLQKYR

+
分子 #40: 60S RIBOSOMAL PROTEIN L13A (L16)

分子名称: 60S RIBOSOMAL PROTEIN L13A (L16) / タイプ: protein_or_peptide / ID: 40 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Encephalitozoon cuniculi GB-M1 (ウサギエンケファリトゾーン)
株: GB-M1
分子量理論値: 22.724789 KDa
配列文字列: MEKKEHVIID ATGQVAGKLA AKVAKLLLEG VRVTVVCAEE AVFVGSLERA MDKFKQYLNK RCLVNPRRGP FHFREPRMHL AKIIRRMIS YKKPRGKAAM SRLATYEGIP RELEGQPRYK VTCAFVKYTG NPNRYVTLGK LLSMFGWKHA EAAKSLTDEL K ERESLASL ...文字列:
MEKKEHVIID ATGQVAGKLA AKVAKLLLEG VRVTVVCAEE AVFVGSLERA MDKFKQYLNK RCLVNPRRGP FHFREPRMHL AKIIRRMIS YKKPRGKAAM SRLATYEGIP RELEGQPRYK VTCAFVKYTG NPNRYVTLGK LLSMFGWKHA EAAKSLTDEL K ERESLASL QKKDLDKKIE ELKTDKNFEN EVNRRLAMLA

+
分子 #41: 60S RIBOSOMAL PROTEIN L17

分子名称: 60S RIBOSOMAL PROTEIN L17 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 41 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Encephalitozoon cuniculi GB-M1 (ウサギエンケファリトゾーン)
株: GB-M1
分子量理論値: 20.885357 KDa
配列文字列:
MGIKYSYEIH DPSKAVKAKI DNAKVSFKKT REASCTLRRR KVLDAIQYLK NVIAKTECVP FRRYNRGCGQ THQARKFSIP RREIVKANG EKKIKKGHVQ TRGRWPKKSA EFLISVLENI KENAETKGLD PKDLVITHVQ VSKAPKIFGR TFRAHGRVNP F NKSPCHIQ MVAEVLGSND VSIED

+
分子 #42: 60S RIBOSOMAL PROTEIN L18

分子名称: 60S RIBOSOMAL PROTEIN L18 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 42 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Encephalitozoon cuniculi GB-M1 (ウサギエンケファリトゾーン)
株: GB-M1
分子量理論値: 22.655592 KDa
配列文字列: MYFTSAMKYT RLPPSATLSR KEPRSKNIYL RALSDFYTKV ASNSSVLAIK KISKRLKMSK SDRQPVKISK IVSEIGESKD KVAVVVAKV LDDDEVMVIP AVKVVALQWS KGVKEKIERY GGTIGTLDQL FELCPNMDDI CLVSTNKFSR RSAKFWGPAP G EKGSTTYP ...文字列:
MYFTSAMKYT RLPPSATLSR KEPRSKNIYL RALSDFYTKV ASNSSVLAIK KISKRLKMSK SDRQPVKISK IVSEIGESKD KVAVVVAKV LDDDEVMVIP AVKVVALQWS KGVKEKIERY GGTIGTLDQL FELCPNMDDI CLVSTNKFSR RSAKFWGPAP G EKGSTTYP RANQKCHNRE KRIMMRGRKS QHLKRQVVNK AT

+
分子 #43: 60S RIBOSOMAL PROTEIN L19

分子名称: 60S RIBOSOMAL PROTEIN L19 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 43 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Encephalitozoon cuniculi GB-M1 (ウサギエンケファリトゾーン)
株: GB-M1
分子量理論値: 20.198928 KDa
配列文字列:
MSNEERVRRL ASDILNCGKK KLWLDNNEIE RLNGASTREQ IKQLIKDNVI IMKQDKHTSR GRCRKRLEAK KKGRHMGTGK RFGTANARM PQKKIWMKKI RAMRAMLKEM RANGEITKED FRVFYKQAKG HLFKHRFHMK DCIIKRKADE QRAKELAEQA K ALNLSNRV ISS

+
分子 #44: Uncharacterized protein ECU01_0250

分子名称: Uncharacterized protein ECU01_0250 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 44 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Encephalitozoon cuniculi GB-M1 (ウサギエンケファリトゾーン)
株: GB-M1
分子量理論値: 19.453312 KDa
配列文字列:
MHFNIFVEGE FNNVKGVFID QSYPLRIQCT NCGSPHEKSV VLSEDSVGEG DFGEKVNLGI TCRCCRRIMT LKILKLKEGR EVKKHLLPT NFEDEFKEVW LSDMQKSRFL VSRIETNGAE VTSIESCILN LVSNQDVLFT NVNFEDRTVA KCNNLNMISS I IDFSLTVE LAK

+
分子 #45: ECU06_1135 protein

分子名称: ECU06_1135 protein / タイプ: protein_or_peptide / ID: 45 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Encephalitozoon cuniculi GB-M1 (ウサギエンケファリトゾーン)
株: GB-M1
分子量理論値: 9.0199 KDa
配列文字列:
MSKTYLKSWK EKKEKMPNAA LSFKQRLRIK QQKRVERSAL LSKIKILKTR KRNFLRERQK QREMKKQENM AKS

+
分子 #46: 60S ribosomal protein L20

分子名称: 60S ribosomal protein L20 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 46 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Encephalitozoon cuniculi GB-M1 (ウサギエンケファリトゾーン)
株: GB-M1
分子量理論値: 21.592184 KDa
配列文字列:
MKPETSRQAA FSKVNMTIPM TKEYRIHGSA MPTEDNPRPQ VFVGTIFTKN HVFAKAKFFK ILEKKYKIKA TKGLIIDCKE IPEPSFKEV QNYGIRFVYR SRSGVHNAYK ECRAISKCWA IDHVLRELAG RQKLKRSAVD IISVDVVPVE SLKRAKTIEF A DENVEFPI FTKIVNTKSL LIPSEYNPSD

+
分子 #47: 60S ribosomal protein L21

分子名称: 60S ribosomal protein L21 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 47 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Encephalitozoon cuniculi GB-M1 (ウサギエンケファリトゾーン)
株: GB-M1
分子量理論値: 18.621852 KDa
配列文字列:
MRSKGYRRGT RYLFSQDHRK HGVAHVSKYL EKYEIGDMVD ILVNPAMMKG MPHKYYHGRT GRVYDVKPRS LNVALYKRVR GKYVIKKII VRIEHVRKSR CSEESQKRIL MAAEMARDAE SRGVVLAPSK RKIEGPRKAV EVSLDNNQPI EVGYEPHVVI F

+
分子 #48: 60S ribosomal protein L22

分子名称: 60S ribosomal protein L22 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 48 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Encephalitozoon cuniculi GB-M1 (ウサギエンケファリトゾーン)
株: GB-M1
分子量理論値: 12.598611 KDa
配列文字列:
MTAASEKTTR RFTIDCTKPA SDSLISPSDL GAFLQQKIKC YTGKKEKLLH INANGNIVEV DVTGGFIGKQ GLKWQIGRFL HMKKLRAFI KIFAQGLDGF ELRYINVEEG KEE

+
分子 #49: 60S ribosomal protein L23

分子名称: 60S ribosomal protein L23 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 49 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Encephalitozoon cuniculi GB-M1 (ウサギエンケファリトゾーン)
株: GB-M1
分子量理論値: 16.383464 KDa
配列文字列:
MAAEKKTEVL EKKISIKPRY KMTRGIQVET LMKCADNSGA KILRCIGVKR YRGRLNRLPA AAPGDICVVS VKKGKPELRK KVHYAILIR QKKIWRRTDG SHIMFEDNAA VLINNKGELR GAQIAGPVPR EVADMWPKIS SQASSIN

+
分子 #50: Similarity to 60S RIBOSOMAL PROTEIN L24

分子名称: Similarity to 60S RIBOSOMAL PROTEIN L24 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 50 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Encephalitozoon cuniculi GB-M1 (ウサギエンケファリトゾーン)
株: GB-M1
分子量理論値: 11.350204 KDa
配列文字列:
MIQGVSMFSG RNIPKGSGIY EVMSDGRAVL TASNKERRLI ARKINPRDIR WTTSSREFFG KESQYVVEKM NVQKVKVVRG FRHISASSL ERAKEAGLPK K

+
分子 #51: 60S RIBOSOMAL PROTEIN L23A

分子名称: 60S RIBOSOMAL PROTEIN L23A / タイプ: protein_or_peptide / ID: 51 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Encephalitozoon cuniculi GB-M1 (ウサギエンケファリトゾーン)
株: GB-M1
分子量理論値: 11.839871 KDa
配列文字列:
MESPRKNFKH PRNLVTKMPR NTPNDIILHA LTTEKAARCM EQFNTLVFYV EKTSTKPEIK KAITELYGSK VKKVNTLINK HGKKAYVSF ADEGAALEIA AKIGTI

+
分子 #52: 60S RIBOSOMAL PROTEIN L26

分子名称: 60S RIBOSOMAL PROTEIN L26 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 52 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Encephalitozoon cuniculi GB-M1 (ウサギエンケファリトゾーン)
株: GB-M1
分子量理論値: 16.811482 KDa
配列文字列:
MKNLRKQKTS SRRKQRKAHF ACNDGEKRIR SSARLSRELR KEYGFRTFPL RTGDTVVVKG GKFDGKEGVI SKINYRDYKV YIEGCFVTK NDGTNALVPI YPSKLTITKF FLENGRKEQL ERKKRAREHG MEILRKRQEE VVSN

+
分子 #53: 60S RIBOSOMAL PROTEIN L27

分子名称: 60S RIBOSOMAL PROTEIN L27 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 53 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Encephalitozoon cuniculi GB-M1 (ウサギエンケファリトゾーン)
株: GB-M1
分子量理論値: 14.508162 KDa
配列文字列:
MFFVPNMIVV VTSGKNAGKK AVVIKQIDER YVLTACVVRI PKEPEDHQPK WIKRRNAKFY IILKKYNIAH LIATRYKADL GLATIDYSG IEDNAETKKV LTNKTKDAMM KAWKENKAKF LFSSLSF

+
分子 #54: 60S ribosomal protein L27a

分子名称: 60S ribosomal protein L27a / タイプ: protein_or_peptide / ID: 54 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Encephalitozoon cuniculi GB-M1 (ウサギエンケファリトゾーン)
株: GB-M1
分子量理論値: 17.066785 KDa
配列文字列:
MTDRVKKTRK LRGHVSHGYG RVGKHRKHSG GRGLAGGFSH MKTFFTRFHP DYHGKRGMRV YHRKENSDYA RPISSARLWG MIPKEQRYD FLDNPEKVPV IDVREFGYHV VVGGKLSLER PIVVKARYFT PSAKEEITKV GGKWIITY

+
分子 #55: 60S ribosomal protein L29

分子名称: 60S ribosomal protein L29 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 55 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Encephalitozoon cuniculi GB-M1 (ウサギエンケファリトゾーン)
株: GB-M1
分子量理論値: 6.565641 KDa
配列文字列:
MAKRKNHTNH NQNRKDHRGG IKKPKMPKFS EFLGLHPATL ARLEEAGKLW NAATSRK

+
分子 #56: 60S RIBOSOMAL PROTEIN L30

分子名称: 60S RIBOSOMAL PROTEIN L30 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 56 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Encephalitozoon cuniculi GB-M1 (ウサギエンケファリトゾーン)
株: GB-M1
分子量理論値: 11.785833 KDa
配列文字列:
MRGKSNKGDN VTSSLLLAMR TGKYIVGFKR AIKSVIMKKA KCLVISSNFP STKRKLLEYY SVLAGGLPII FHSANNEELG SITERGHRL GCISIIDQGE AELIPAKGE

+
分子 #57: 60S ribosomal protein L31

分子名称: 60S ribosomal protein L31 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 57 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Encephalitozoon cuniculi GB-M1 (ウサギエンケファリトゾーン)
株: GB-M1
分子量理論値: 13.035338 KDa
配列文字列:
MWSKIEENQT VEMTVNLRRI CSRLPWTKKA SKVVRMLKRE IQKHFREEIG VVVTNDLNNF LYSRGIKKIP NKVRVRVTKE TSLKNAEEN VLKTDLVVVG SFKNLKEVIV DQ

+
分子 #58: 60S ribosomal protein L32

分子名称: 60S ribosomal protein L32 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 58 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Encephalitozoon cuniculi GB-M1 (ウサギエンケファリトゾーン)
株: GB-M1
分子量理論値: 16.376375 KDa
配列文字列:
MSSELFDPKP LVEIKEAYRK NKKFIRHHSD RYKRVKPSWR RPHGIDSKVR KRCKGEREMP SIKYKKPKEI RHLLPNGLRK VRIFNINDL TPLTSLNRFY CGEIAHAVGA RKRIAIVNRA KELGICLLNG NARLIPEIEE

+
分子 #59: 60S RIBOSOMAL PROTEIN L35A (L33)

分子名称: 60S RIBOSOMAL PROTEIN L35A (L33) / タイプ: protein_or_peptide / ID: 59 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Encephalitozoon cuniculi GB-M1 (ウサギエンケファリトゾーン)
株: GB-M1
分子量理論値: 12.832846 KDa
配列文字列:
MTGVMMNEEV LSRTTIPATF VSFKRGQRRL HPRHVLLKIR NVTSKDEASS YVGNGVVCYK KNNEGERYPV HGVITRIHGN SGAVRARFT RNLDPKLLGT HVFVKLYKVE ADEI

+
分子 #60: 60S ribosomal protein L34

分子名称: 60S ribosomal protein L34 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 60 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Encephalitozoon cuniculi GB-M1 (ウサギエンケファリトゾーン)
株: GB-M1
分子量理論値: 12.463718 KDa
配列文字列:
MKNVLIHKGA TYKTRSNRRR KVRTPSGKLV NRRVKKHSKK HRCHECNAIL GSIARMRPAE FSRQKVSARR VNRPYGATTC GRCVREKII SAFLGNEERI VMEKTGAAAG G

+
分子 #61: 60S ribosomal protein L35-1

分子名称: 60S ribosomal protein L35-1 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 61 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Encephalitozoon cuniculi GB-M1 (ウサギエンケファリトゾーン)
株: GB-M1
分子量理論値: 14.128682 KDa
配列文字列:
MKIEASALRQ LGIKQIEERA AEIKADLAAL RQKKNSGDVG ANDIKTAKKN LARALTVRRE KILEELVEAY RGTPVSKLPK ELRPKLNRS KRRALTKTQL RRKTRRQRAR MSKFPRVIFA YNE

+
分子 #62: 60S ribosomal protein L36

分子名称: 60S ribosomal protein L36 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 62 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Encephalitozoon cuniculi GB-M1 (ウサギエンケファリトゾーン)
株: GB-M1
分子量理論値: 10.776858 KDa
配列文字列:
MKNAYKKVRV RYPVKRPDVK RKQRGPRAET QESRFLAAAV ADEISGLSPL EKKAISLLEA KNNNKAQKLL RKRLGSHKRA VAKVEKLAR MLLEK

+
分子 #63: 60S ribosomal protein L37

分子名称: 60S ribosomal protein L37 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 63 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Encephalitozoon cuniculi GB-M1 (ウサギエンケファリトゾーン)
株: GB-M1
分子量理論値: 10.416252 KDa
配列文字列:
MSKGTASFGK KNKRNTEMCR RCGRQSYHKQ KNSCSSCGYP NPKMRNPGSI KARRRRTIGT GRMRYMKREL RAAKNGHKGD PILRTLWAK N

+
分子 #64: 60S ribosomal protein L39

分子名称: 60S ribosomal protein L39 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 64 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Encephalitozoon cuniculi GB-M1 (ウサギエンケファリトゾーン)
株: GB-M1
分子量理論値: 6.517931 KDa
配列文字列:
MGSRKTALVK TRLMRALKRN REIPAWKRMM KEHKGEYNRA RRHWRSKKLK IY

+
分子 #65: UBIQUITIN/ L40 RIBOSOMAL PROTEIN FUSION

分子名称: UBIQUITIN/ L40 RIBOSOMAL PROTEIN FUSION / タイプ: protein_or_peptide / ID: 65 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Encephalitozoon cuniculi GB-M1 (ウサギエンケファリトゾーン)
株: GB-M1
分子量理論値: 14.312952 KDa
配列文字列:
MQIGVRFCGK TSFVQAEPSQ SVLSLKALVG RACGLDSSVM VLQHNSRILE DSGTMAGYGM RTLDTITAYP KLLGGGGNMS DNDAAMAMK EKNDCLICRR CYARSGKAAE KCRKCFSKDL RLKKPLKAMK KK

+
分子 #66: 60S ribosomal protein L44

分子名称: 60S ribosomal protein L44 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 66 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Encephalitozoon cuniculi GB-M1 (ウサギエンケファリトゾーン)
株: GB-M1
分子量理論値: 12.035392 KDa
配列文字列:
MVNIPKTRNT FCKKCKGYSA HKVSQAKKSK DNPRAQGNRR YARKQRGYGG QTKPILRRKA KVTKKLVLNL ECTKCKFSHQ KPLKRAKHV IFGGERKRKG EALVY

+
分子 #67: 60S RIBOSOMAL PROTEIN L37A (L43)

分子名称: 60S RIBOSOMAL PROTEIN L37A (L43) / タイプ: protein_or_peptide / ID: 67 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Encephalitozoon cuniculi GB-M1 (ウサギエンケファリトゾーン)
株: GB-M1
分子量理論値: 9.849786 KDa
配列文字列:
MGKGTKKVGI AGSFGARYGS TLRKRMKAVL ETQRAKYICE ACGKKTVKRE AVGIWKCRSC RRVFAGGSYA KTTPAGKIFI NMVKQYNTK

+
分子 #68: 40S ribosomal protein S0

分子名称: 40S ribosomal protein S0 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 68 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Encephalitozoon cuniculi GB-M1 (ウサギエンケファリトゾーン)
株: GB-M1
分子量理論値: 27.899887 KDa
配列文字列: MPQDNTRISD SIKIPDEFVK LLIVSQSHLG GTSTNKSFAR YLYGTRPRDR INIIDINATW EKLIIAARAF CGIKHPSSIA VVSTKTFGR KPVVKFCEAV GATPITGRFI PGSFTNSEVK RVYDPRVLIV SDTYADKQAI LESQYCNLPT IAFVNTDNSL V GVDIAIPM ...文字列:
MPQDNTRISD SIKIPDEFVK LLIVSQSHLG GTSTNKSFAR YLYGTRPRDR INIIDINATW EKLIIAARAF CGIKHPSSIA VVSTKTFGR KPVVKFCEAV GATPITGRFI PGSFTNSEVK RVYDPRVLIV SDTYADKQAI LESQYCNLPT IAFVNTDNSL V GVDIAIPM NNRSPSAIAA GFFILSRLIN YMKTGAELVR DMKEVELFLF RDSVELEQLV EEQLLETTDS ILNVGKEGIL SG IGTGNAD EWNSF

+
分子 #69: 40S ribosomal protein S1

分子名称: 40S ribosomal protein S1 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 69 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Encephalitozoon cuniculi GB-M1 (ウサギエンケファリトゾーン)
株: GB-M1
分子量理論値: 26.98535 KDa
配列文字列: MAIQPPGSYP QGNKKGKAKK KSGQNAFARK EWYTLRSPSI FPNNINGKTL MTKSAGKNSY MNMIGRRYDV NQADLTGNND VGHRKFIFK IGDIKGSECV GFFDGMELTS DKHKAMIKKW HTLIEAQKDI VAKDGSVFRV FVMGVTRRHP GYVKKTCYVK H SDEKKIRK ...文字列:
MAIQPPGSYP QGNKKGKAKK KSGQNAFARK EWYTLRSPSI FPNNINGKTL MTKSAGKNSY MNMIGRRYDV NQADLTGNND VGHRKFIFK IGDIKGSECV GFFDGMELTS DKHKAMIKKW HTLIEAQKDI VAKDGSVFRV FVMGVTRRHP GYVKKTCYVK H SDEKKIRK IMFDVIEEEL SGCDVQKIMK KLANETVGKR IEELGSEIFP LQNCCVRKVK TIKSHQTASV GQQEAIDAIT N

+
分子 #70: 40S RIBOSOMAL PROTEIN S2

分子名称: 40S RIBOSOMAL PROTEIN S2 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 70 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Encephalitozoon cuniculi GB-M1 (ウサギエンケファリトゾーン)
株: GB-M1
分子量理論値: 26.270578 KDa
配列文字列: MEGTERRNPG KPFPRKEESE WIPKTAVGRL VKMLKITSLE QIFKFSHVIR EPEIVDLLCG NSIKEEVLSI KSVQKQTRAG QKTRIKAVV VVGDRKGHVG IGTKASKEAA SAIRGAIARA KCAIRPVRLG LWDGAQGKPH TVSCKGSGKC GTSVVQVIPA P RGTGIISG ...文字列:
MEGTERRNPG KPFPRKEESE WIPKTAVGRL VKMLKITSLE QIFKFSHVIR EPEIVDLLCG NSIKEEVLSI KSVQKQTRAG QKTRIKAVV VVGDRKGHVG IGTKASKEAA SAIRGAIARA KCAIRPVRLG LWDGAQGKPH TVSCKGSGKC GTSVVQVIPA P RGTGIISG SVNKKIFELA GIKDLYTLSF GATSTTENFA KASIAALEAT SSMILPDQWE EKPRTLNPLL EFADILNQLD KS RV

+
分子 #71: 40S ribosomal protein S3

分子名称: 40S ribosomal protein S3 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 71 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Encephalitozoon cuniculi GB-M1 (ウサギエンケファリトゾーン)
株: GB-M1
分子量理論値: 24.318387 KDa
配列文字列: MSSDQVLERF MKNGLMNAEL KEFFEKALVN EGFSTMELRM QETPIKIILK VAKPHEAIGE KKFRLRQFQH LAAQRLEVPD ESVEIVVEK VHEKGLCALI QANFIREKIL GGVQYRRAVN MALKTARHAK AQGCQIIVSG KLKGQRAKSV KFQDGVLIHS G DAVKDYIN ...文字列:
MSSDQVLERF MKNGLMNAEL KEFFEKALVN EGFSTMELRM QETPIKIILK VAKPHEAIGE KKFRLRQFQH LAAQRLEVPD ESVEIVVEK VHEKGLCALI QANFIREKIL GGVQYRRAVN MALKTARHAK AQGCQIIVSG KLKGQRAKSV KFQDGVLIHS G DAVKDYIN TGYATVETKQ GVIGIQVRIM LPYDPEGVLG PNYPLPDRIT ILEPSEIQ

+
分子 #72: 40S ribosomal protein S4

分子名称: 40S ribosomal protein S4 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 72 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Encephalitozoon cuniculi GB-M1 (ウサギエンケファリトゾーン)
株: GB-M1
分子量理論値: 30.090691 KDa
配列文字列: MPTGHRDHLK RKTAPKSWML DKQGGTFALM PASGPHKKTE CIPLGYLISR FLRYASNFKE LSIILAEKNI KVNGRVRTNS HFPVGLFDV VSIEKTGEHF RVLYNVHKKF HLHRISSEEA SYRLTKVTKK YENQGIPYIV SSCGLSIRFC DPAIDLGYTI K ISNETSKV ...文字列:
MPTGHRDHLK RKTAPKSWML DKQGGTFALM PASGPHKKTE CIPLGYLISR FLRYASNFKE LSIILAEKNI KVNGRVRTNS HFPVGLFDV VSIEKTGEHF RVLYNVHKKF HLHRISSEEA SYRLTKVTKK YENQGIPYIV SSCGLSIRFC DPAIDLGYTI K ISNETSKV IEYIVPGPDK VIFVSRGKAR GRVGVINTIS TQGKETVYGM TDFAGNTFSC TSKSCILIGE SSENIWITLP KE RGIRQSE LEKINAQLGE MIDTEVAEVS E

+
分子 #73: 40S ribosomal protein S5

分子名称: 40S ribosomal protein S5 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 73 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Encephalitozoon cuniculi GB-M1 (ウサギエンケファリトゾーン)
株: GB-M1
分子量理論値: 20.987223 KDa
配列文字列: MAEINLFEKY SYEEVKVNNV SLRPYINLSR RGIVPHAATT ITKGTTGKAR IPIAERFVCS LMRHGRNSGK KRLAINIFED ACFIIHSMT KKNPLQVLVD AIVNSGPRED TARIGRAGSM RRTSVDVSPL KRISIAISNL SAGIRNASFR NRITLAEAIA N ELIAASTN ...文字列:
MAEINLFEKY SYEEVKVNNV SLRPYINLSR RGIVPHAATT ITKGTTGKAR IPIAERFVCS LMRHGRNSGK KRLAINIFED ACFIIHSMT KKNPLQVLVD AIVNSGPRED TARIGRAGSM RRTSVDVSPL KRISIAISNL SAGIRNASFR NRITLAEAIA N ELIAASTN SQNSYAVNKK KEIERIAQSN R

+
分子 #74: 40S ribosomal protein S6

分子名称: 40S ribosomal protein S6 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 74 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Encephalitozoon cuniculi GB-M1 (ウサギエンケファリトゾーン)
株: GB-M1
分子量理論値: 25.518744 KDa
配列文字列: MKLNIAYPTN GTQKMFEIER RNEVRLYDKK IGDQFDGGIL GEEFEGTIME ITGGDDYQGF PMVSGHLTKK RVRPLLSKGD AGYRCRRKG VRRRKSVRGS IVSEEICVLN LIILRPGEKE IDGLTNAVND VSHLPRKEKK LRKMFGVPDE EKNVVGYIRN I LKSECDDP ...文字列:
MKLNIAYPTN GTQKMFEIER RNEVRLYDKK IGDQFDGGIL GEEFEGTIME ITGGDDYQGF PMVSGHLTKK RVRPLLSKGD AGYRCRRKG VRRRKSVRGS IVSEEICVLN LIILRPGEKE IDGLTNAVND VSHLPRKEKK LRKMFGVPDE EKNVVGYIRN I LKSECDDP KKIPKIRHNG KRMKREQERR EQIMKIRLER KRILEEERKE YLEKYFNKA

+
分子 #75: 40S ribosomal protein S7

分子名称: 40S ribosomal protein S7 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 75 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Encephalitozoon cuniculi GB-M1 (ウサギエンケファリトゾーン)
株: GB-M1
分子量理論値: 19.032094 KDa
配列文字列:
MSTQTEAEMS IAGIIRKHAK DISAPPEVFD KISIQIIICD GGEKIMVVKV PRSILHGVQM NYSNIIKAAK QQFHDYYIMF VRNFEAEGG GKTMTKRKAK EVEEVWLANA CFPFLLTGTR TDVRGVDDMV VNVLLERRTS LSRAEMDAIG AALHGLLGKN Y IVDVNHHT KN

+
分子 #76: 40S ribosomal protein S8

分子名称: 40S ribosomal protein S8 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 76 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Encephalitozoon cuniculi GB-M1 (ウサギエンケファリトゾーン)
株: GB-M1
分子量理論値: 19.615764 KDa
配列文字列:
MGINHRGDHK RRKTGAKAVI SRKKRNNRAG SQPSSTKIGE RKVTPVRVRG GNRKYKALRL DMGHFKFITT GKFRMAKLLQ VVYHPSSNE LVRTNTLTKS SVVKISAEPF KNDIKDVARD VDPSLHESFE KGHLYAIITS RPGQVGMAQG HVLQGDELKF Y ADKFNKKS KEVRK

+
分子 #77: 40S ribosomal protein S9

分子名称: 40S ribosomal protein S9 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 77 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Encephalitozoon cuniculi GB-M1 (ウサギエンケファリトゾーン)
株: GB-M1
分子量理論値: 20.954518 KDa
配列文字列:
MAGKKGSKRA STPRDPFEKE RLIREAQLVG VYGLKNKHEL WVMEKIFAKD KERARILLTS TNPEDIPING RSLLRRLMKY GILGGIDLC DKQEVVNGLN KVLDLTINHY LERRLQFRVF AAGLAKSVHH ARLLIGGRCI SIKDQIVDVP GFMVRADKEP L IEYNPYSR YGDKGKKKAE AKVGEE

+
分子 #2: 5.8S-23S ribosomal RNA

分子名称: 5.8S-23S ribosomal RNA / タイプ: rna / ID: 2 / コピー数: 1
由来(天然)生物種: Encephalitozoon cuniculi GB-M1 (ウサギエンケファリトゾーン)
株: GB-M1
分子量理論値: 807.085 KDa
配列文字列: GUUUCUCUGU UCACGGGAUU GAUUGGCAUU AGCGGCGAUG AAGGACGUGC AGGAGGACGA UAUGCGUUGU UGUUGUGACG GUGUCUGAA UUGUGUGCGG UGUGCACGGG GACCCCUUGG ACUUAAGCAU AUCAGUAAAG GGAGGAGAAG AAACCAAAUG G GAUUGCCU ...文字列:
GUUUCUCUGU UCACGGGAUU GAUUGGCAUU AGCGGCGAUG AAGGACGUGC AGGAGGACGA UAUGCGUUGU UGUUGUGACG GUGUCUGAA UUGUGUGCGG UGUGCACGGG GACCCCUUGG ACUUAAGCAU AUCAGUAAAG GGAGGAGAAG AAACCAAAUG G GAUUGCCU GAGUAGCGGC GAGUGAAAUG GCAUGAGCCU GUGUGGUAAC UGCGUUUGGC GGGUUGUGUU UGUGGCAGCA GC GGCGAGU GCGAUUGAAU UCGGAUGCGG AGAGGGCGAU GUGCCUGUAG GCGCGGCGGC UUUUUUUGUG AGUAGUGUUG CUU GGUAGU GCAGCGCGAA UGCGGUGGUG GAUGCACCGA AGGCUAAAUA UGGCUGAUGA CCGAUAGCGG AUAAGUAGAG UGAU UGAAG UGUGAAAAGG AGGAUGAUGA GAAAUGAAAG UGAAUGGAGU GAAUGGGGGA UGUUCCCGCC CGUCUUGAAA CACGG ACCA AGGAGACGAC GGCAGGAUUG UUUUCCGAGA GGGGAUGGAU GCUGCGGUCG GACCCGAAAG AUGGUGAGCU AUGUGU GUG UUGAUUGAAG GGAUGCGAAA GUGUUCUGGA GGAUCUAAGC CGUUCUGACG UGCAACUCGA UGGCAUGACA UGUGCAU AG GGGCGAAAGA CCAAACGAAC CAUCUGGUAG CUGGUUCCCU CUGAAAUGUC UCUCAGGACA GCGGCGACGG GGAGUGUA A GAUGUUGUAA AGCACUAAUG CGCUUGCGUU AAACUUUGAA GAUGUCUUUU AAGUGUGUUG CCAGUGGGCA UACUGUGGU AAGCAUGGUG UGCGAGAAGG GAUGAACCUU UAAGCGGGCU AAGGAGUCUU AUGCAAGGUG AGUGAAUCCG GCGGCCUGAU UUUGACAGU UGGACGGUGG CCAUGGAGGU UGGCAUCCGC UAAGAAACGU GUUGCAACGU ACCUACCGAA UUGGGCGGCG G AGAAAAUG GAAGGGAUUG AAUUGCAUUC CGAUGCCUGC GGGGGAGUAU CUGAGUAAGG GGGCGGUAUC GUUCUGCUGA AG GUCCUGC GUGAGCGGGG GUGGAGGGGC GAUAUGUGCA GAUCUUGGUA GCAGUAACAA GGAAAUGAUU UGCGCUGUGG ACG AGGGUU CCCUGUGUGG CAGGGGUGAA UCGACUGUGG AUACGGAGGU GCAUUGAUAG UUGUGUGUAU UGCGGCUGGG AGGC GACUU GGCUGUGACG GAUGGGGGCG GCCCUGUCCA GGAUAGCAGA ACUGGAUGCU GUCUGCUGCG GAUUGUUAUG AUGCG AAGC AGCGAUUGUG GGCGAGCCUG UUCCGAUGAA AAAGAGGCUG CUUUGUCGUA CCUAGACCGC AUCUGGUGUC CACUGU UUG CCGCGGAAGU GUUUUGUGCA AGGGCCGUAA GGGAAGUCGG CAAGAUUGAU GUGUAACUUC GGGAGAAGGA UUGGCUC UA GCGUGCUAGA ACUGUUUGUU GUGGGGAAUC UGACUGUUUA CUAAAAACAU AGCUUUGUGU GUGGACGCAA AGUGAAUU C UGCCCAGUGC ACUUUUAGUU ACGGCCUGUG UGGGCUAAGC GAGUGUAAAC GGCGGGAGUA ACUAUGACUC UCUUAAGGU AGCCAAAUGC CUCGUCAUGU AAUUAGUGAC GCGCAUGAAU GGAGCAACGA GAUUCCCACU GUCCCUACGG CCUGUCUUGU GAACCUACA GCCAAGGGAA CGGGCUUGGG CUGAUCAGCG GGGAAAGAAG ACCCUGUUGA GCUUGACUCU AGCAUGUGUG A AGUGCUGG GUGUGGGCAU GCAGCGAGGU GGGGAUGAGU GCGAUACCAC UAUGUCUUCC GCCCAGUGCU UUGUGGAUGG AU GUGGGGA GUUUGGCUGG GGCGGCACGA CUGCUAAAGA CUAACGCAGA CGUCCUAAGG CGGGCUCAGC GGGGAAGGAA ACC ACGCGU GGAGCACAAG GGCACAAGCC UGCUUGAGAC UGUUCCUAUU GCGGGACUGU UUGGGGGAAA CCCUGGCCUA GAGA UCCCA UGUCCUAUUG UGCGUGGGAC AUGGGUGACA GAAAAGUUAC CACAGGGAUA ACUGGCUUGU AGCAGCCGAG CGACC AUAG CGACGCUGCU UUUUGAUUCU UCGAUGUCGG CUCUUCCUAU CAUCGCGAAG CAGAGAUUGC GAAGUGUUGG AUUGUU CAC CCACCAACAG GGAACGUGAG CUGGGUUUAG ACCGUCGUGA GACAGGUUAG UUUUACCCUA CUGUGUGGAC UGUGCAG CA GAUCUUGAUA GUACGAGAGG AACUCUUGAU UGCGACCUCU GGUGGAGCGG CGUGCCUGCU GGCUGCUGCG GAGCUACG U CGGGAGUAUA AUGGCUGAAG GCCUCUAAGC CUGAAGACCG ACUGCGCGGU GUGUGUGGCG GAAGACGACC GCUGUGUGU GCAAGCUGUG CGGAUGGAGG AGGAUUCCGA CAUUUUGAGG CUGUGCAUUU GCGCGAGUGU GUGUGGAGAG CUCUUAUUGC ACUGUG

+
分子 #3: 5S ribosomal RNA

分子名称: 5S ribosomal RNA / タイプ: rna / ID: 3 / コピー数: 1
由来(天然)生物種: Encephalitozoon cuniculi GB-M1 (ウサギエンケファリトゾーン)
株: GB-M1
分子量理論値: 38.478938 KDa
配列文字列:
AGUUGCGGCC AUAUCCACGG AAAAGCACCG GAACUCGUCA GAUCUCCGAA GUUAAGCCUG UGCGAGCCUG GGUAGUACUG AGAAGGGAG ACCACUCGGG AAUACCGGGU GCUGCAACUU

+
分子 #4: 18S ribosomal RNA

分子名称: 18S ribosomal RNA / タイプ: rna / ID: 4 / コピー数: 1
由来(天然)生物種: Encephalitozoon cuniculi GB-M1 (ウサギエンケファリトゾーン)
株: GB-M1
分子量理論値: 422.123406 KDa
配列文字列: CAUCAGGUUG AUUCUGCCUG ACGUGGAUGC UAUUCUCUGG GGCUAAGCCA UGCAUGCUUG UGAACUCUUU GUGGGGGAUU AGCGGACGG CUCAGUGAUA GCACGAUGAU UUGUUUGCGG GAUGAGCAGU AGCUGCGGGA AACUGCAGAU AGUGGUCUGC C CCUGUGGG ...文字列:
CAUCAGGUUG AUUCUGCCUG ACGUGGAUGC UAUUCUCUGG GGCUAAGCCA UGCAUGCUUG UGAACUCUUU GUGGGGGAUU AGCGGACGG CUCAGUGAUA GCACGAUGAU UUGUUUGCGG GAUGAGCAGU AGCUGCGGGA AACUGCAGAU AGUGGUCUGC C CCUGUGGG GGUUGGCAAG UAAGUUGUGG GCCUAUCAGC UGGUAGUUAG GGUAAUGGCC UAACUAGGCG CAGACGGGAU AC GGGGGAU CAGGGUUUGG UUCCGGAGAG GGAGCCUGAG AGAUGGCUAC UACGUCCAAG GAUGGCAGCA GGCGCGAAAC UUG CCUAAU CCUUUGGGGA GGCGGUUAUG AGAAGUGAUG UGUGUGCGAG UGCAAAGGGG UCGCAUGUGA UUGGAGGGCA AGUC GGGUG CCAGCAGCCG CGGUAAUACC UGCUCCAAUA GUGUCUAUGG UGGAUGCUGC AGUUAAAAUG UCCGUAGUCU GUUGU GUAU GUCUUUGUGU GUGAUGUUUG UGGUUGUGUG UGGAUGUAGU GAUGUGUGUG GCAGAGGACG AGGGGCACUG GAUAGU UGG GCGAGAGGUG AAAUGCGAAG ACCCUGACUG GACGAGCGGA AGCGAAGGCU GUGCUCUUGG ACUAAUGUUG CGAUGAA GG ACGAAGGCUA GAGGAUCGAA AUCGAUUAGA UACCGUUUUA GUUCUAGCAG UAAACGAUGC CGACUGGACG GGACAGUG U GUGUUGUCCA UGAGAAAUCU UGAGUAUGCG GGUUCUGGGG AUAGUAUGCU CGCAAGAGUG AAACUUGAAG AGAUUGACG GAAGGACACC ACAAGGAGUG GAGUGUGCGG CUUAAUUUGA CUCAACGCGG GGCAACUUAC CGGCUCUGAA GGAUGCCUGU GAGUGCAUG GCAUGAGGCA UGCGGCGGUG GUGCAUGGCC GUUUUAAAUG GAUGGCGUGA GCUUUGUCUU AAGUUGCGUA A GAUGUGAG ACCCUUUGAC GGUGUUCUAC GGAGCAAGGA GGGGAUGGAA GAGAACAGGU CCGUUAUGCC CUGAGAUGAG GC GGGCUGC ACGCGCACUA CGAUAGAUGG CGCUUCUGCC UGCUGUGAGG GAUGAAGCUG UGUAAGGGGC UUCUGAACGU GGA AUUCCU AGUAAUAGCG GCUGACGAAG CUGCUUUGAA UGUGUCCCUG UCCUUUGUAC ACACCGCCCG UCGCUAUCUA AGAU GACGC ACUGGACGAA GAUCGGAAGG UCUGAGUCCU GAGUGUUAGA UAAGAUAUAA GUCGUAACAU GGCUGCUGUU GGAGA ACCA GCAGCAGGAU CAGUAU

+
分子 #78: ZINC ION

分子名称: ZINC ION / タイプ: ligand / ID: 78 / コピー数: 8 / 式: ZN
分子量理論値: 65.409 Da

+
分子 #79: ADENOSINE MONOPHOSPHATE

分子名称: ADENOSINE MONOPHOSPHATE / タイプ: ligand / ID: 79 / コピー数: 1 / 式: AMP
分子量理論値: 347.221 Da
Chemical component information

ChemComp-AMP:
ADENOSINE MONOPHOSPHATE / AMP / AMP*YM

+
分子 #80: SPERMIDINE

分子名称: SPERMIDINE / タイプ: ligand / ID: 80 / コピー数: 1 / 式: SPD
分子量理論値: 145.246 Da
Chemical component information

ChemComp-SPD:
SPERMIDINE / スペルミジン

-
実験情報

-
構造解析

手法クライオ電子顕微鏡法
解析単粒子再構成法
試料の集合状態particle

-
試料調製

緩衝液pH: 7.5
構成要素:
濃度名称式
50.0 mMHEPES-KOH
25.0 mMmagnesium chlorideMgCl2
130.0 mMpotassium chlorideKCl
グリッドモデル: Quantifoil R1.2/1.3 / 材質: COPPER / メッシュ: 400 / 前処理 - タイプ: GLOW DISCHARGE / 前処理 - 雰囲気: AIR / 詳細: Quorum GloQube, 10 mA
凍結凍結剤: ETHANE / チャンバー内湿度: 100 % / チャンバー内温度: 277 K / 装置: FEI VITROBOT MARK IV
詳細: Quantifoil grids (R1.2/1.3, 400 mesh, copper) were glow discharged (10 mA, 30s, Quorum GloQube), and 3 microlitres of the crude sample of E. cuniculi ribosomes (300 nM) was pipetted onto a ...詳細: Quantifoil grids (R1.2/1.3, 400 mesh, copper) were glow discharged (10 mA, 30s, Quorum GloQube), and 3 microlitres of the crude sample of E. cuniculi ribosomes (300 nM) was pipetted onto a grid. Excess sample was immediately blotted off and vitrification was performed by plunging the grid into liquid nitrogen-cooled liquid ethane at 100% humidity and 4 degrees celsius using an FEI Vitrobot Mark IV (Thermo Fisher).

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電子顕微鏡法

顕微鏡FEI TITAN KRIOS
撮影フィルム・検出器のモデル: FEI FALCON III (4k x 4k)
検出モード: INTEGRATING / デジタル化 - サイズ - 横: 4096 pixel / デジタル化 - サイズ - 縦: 4096 pixel / 実像数: 2210 / 平均露光時間: 1.35 sec. / 平均電子線量: 60.0 e/Å2
電子線加速電圧: 300 kV / 電子線源: FIELD EMISSION GUN
電子光学系C2レンズ絞り径: 70.0 µm / 照射モード: FLOOD BEAM / 撮影モード: BRIGHT FIELD / Cs: 2.7 mm / 最大 デフォーカス（公称値）: 2.6 µm / 最小 デフォーカス（公称値）: 0.8 µm / 倍率（公称値）: 96000
試料ステージ試料ホルダーモデル: FEI TITAN KRIOS AUTOGRID HOLDER
ホルダー冷却材: NITROGEN
実験機器
モデル: Titan Krios / 画像提供: FEI Company

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画像解析

詳細Drift-corrected and dose-corrected averages of each movie were created using RELION 3.1s own implementation of motion correction and the contrast transfer functions estimated using CTFFIND-4.1
粒子像選択選択した数: 260895
詳細: Particles were picked using Laplacian-of-Gaussian autopicking and reference-free 2D classification used to generate templates for further autopicking. The resulting particles were extracted ...詳細: Particles were picked using Laplacian-of-Gaussian autopicking and reference-free 2D classification used to generate templates for further autopicking. The resulting particles were extracted with binning-by-4, and 2D and 3D classification performed to remove junk images
CTF補正ソフトウェア: (名称: RELION (ver. 3.1), CTFFIND (ver. 4.1))
初期モデルモデルのタイプ: INSILICO MODEL
In silico モデル: The 3D classification step was carried out using a 60 Angstroms low-passed filtered ab initio starting model made using a stochastic gradient descent procedure.
最終 再構成使用したクラス数: 1 / 想定した対称性 - 点群: C1 (非対称) / 解像度のタイプ: BY AUTHOR / 解像度: 2.7 Å / 解像度の算出法: FSC 0.143 CUT-OFF / ソフトウェア - 名称: RELION (ver. 3.1)
詳細: The remaining particles were re-extracted without binning and aligned and refined in 3D, again using a 60 Angstrom low-passed filtered ab initio starting model. Rounds of CTF refinement and ...詳細: The remaining particles were re-extracted without binning and aligned and refined in 3D, again using a 60 Angstrom low-passed filtered ab initio starting model. Rounds of CTF refinement and Bayesian polishing were performed until the map resolution stopped improving. 108,005 particles fed into the final 3D reconstruction of estimated resolution 2.7 Angstrom.
使用した粒子像数: 108005
初期 角度割当タイプ: MAXIMUM LIKELIHOOD / ソフトウェア - 名称: RELION (ver. 3.1)
最終 角度割当タイプ: MAXIMUM LIKELIHOOD / ソフトウェア - 名称: RELION (ver. 3.1)
最終 3次元分類クラス数: 4 / 平均メンバー数/クラス: 40493 / ソフトウェア - 名称: RELION (ver. 3.1)
FSC曲線 (解像度の算出)

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原子モデル構築 1

初期モデル(PDB ID:

4v88

,

6rm3

)
詳細The model was built using fragments of S. cerevisiae (pdb id 4v88) and V. necatrix ribosomes (pdb id 6rm3) as starting models that were edited using Coot using genomic sequences of the E. cuniculi strain GB-M1 to model rRNA and ribosomal proteins. For ribosomal proteins that are encoded by two alternative genes (with one gene coding for a zinc-coordinating protein and another gene coding for a zinc-free ribosomal protein), we used zinc-coordinating isoforms, because the cryo-EM map revealed the presence of these isoforms and not their zinc-free paralogs in the ribosome structure. The identity of protein msL2 in the ribosome structure was determined using the genomic sequence of the E. cuniculi strain GB-M1 and the cryo-EM map that revealed a unique combination of aromatic and bulky amino acids in its structure: the cryo-EM map showed that msL2 has a tyrosine residue at position 5, a tryptophan residue at position 9, and lysine or arginine residues at positions 10, 12 and 13. The only protein with this sequence was the hypothetical protein ECU06_1135, whose sequence and length were fully consistent with the cryo-EM map. The structure of E. cuniculi ribosomes was refined using Phenix real space refine and validated using MolProbity within Phenix and PDB OneDep. The parts of the model corresponding to the 60S, 40S body and 40S head were built and refined using the consensus map, 40S body multibody map and 40S head multibody map, respectively.
精密化空間: REAL / プロトコル: OTHER / 当てはまり具合の基準: correlation coefficient
得られたモデル

PDB-7qep:
Cryo-EM structure of the ribosome from Encephalitozoon cuniculi

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万見について

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お知らせ

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2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

  • EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
  • これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

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2020年8月12日: 新型コロナ情報

新型コロナ情報

URL: https://pdbjlvh1.pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

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2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

新型コロナウイルスの構造データ

関連情報:万見生物種 / 2020年8月12日: 新型コロナ情報

外部リンク:COVID-19特集ページ - PDBj / 今月の分子2020年2月：コロナウイルスプロテーアーゼ

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2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

EMDBのIDの桁数の変更

  • EMDBエントリに付与されているアクセスコード(EMDB-ID)は4桁の数字(例、EMD-1234)でしたが、間もなく枯渇します。これまでの4桁のID番号は4桁のまま変更されませんが、4桁の数字を使い切った後に発行されるIDは5桁以上の数字(例、EMD-12345)になります。5桁のIDは2019年の春頃から発行される見通しです。
  • EM Navigator/万見では、接頭語「EMD-」は省略されています。

関連情報:Q: 「EMD」とは何ですか？ / 万見/EM NavigatorにおけるID/アクセスコードの表記

外部リンク:EMDB Accession Codes are Changing Soon! / PDBjへお問い合わせ

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2017年7月12日: PDB大規模アップデート

PDB大規模アップデート

  • 新バージョンのPDBx/mmCIF辞書形式に基づくデータがリリースされました。
  • 今回の更新はバージョン番号が4から5になる大規模なもので、全エントリデータの書き換えが行われる「Remediation」というアップデートに該当します。
  • このバージョンアップで、電子顕微鏡の実験手法に関する多くの項目の書式が改定されました(例：em_softwareなど)。
  • EM NavigatorとYorodumiでも、この改定に基づいた表示内容になります。

外部リンク:wwPDB Remediation / OneDepデータ基準に準拠した、より強化された内容のモデル構造ファイルが、PDBアーカイブで公開されました。

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万見 (Yorodumi)

幾万の構造データを、幾万の視点から

  • 万見(Yorodumi)は、EMDB/PDB/SASBDBなどの構造データを閲覧するためのページです。
  • EM Navigatorの詳細ページの後継、Omokage検索のフロントエンドも兼ねています。

関連情報:EMDB / PDB / SASBDB / 3つのデータバンクの比較 / 万見検索 / 2016年8月31日: 新しいEM Navigatorと万見 / 万見文献 / Jmol/JSmol / 機能・相同性情報 / 新しいEM Navigatorと万見の変更点

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