BIRD-PRD_900132: Blood group A H type 2 antigen, beta anomer

基本情報

• 登録情報: データベース: 生物学的重要分子辞書 (BIRD) / ID: PRD_900132
• 状態: 状態: REF ONLY
• 名称: Blood group A H type 2 antigen, beta anomer

BIRD information

• タイプ: オリゴ糖 / 抗原

詳細

• oligosaccharide with branches

• ダウンロード: Molecular definition / Chemical definition

Chemical information

組成

組成式: C₂₈H₄₈N₂O₂₀ / 化学式量: 732.682

• その他: タイプ: saccharide

履歴

• 外部リンク: UniChem / ChemSpider / Wikipedia search / Google search

詳細

SMILES

• CACTVS 3.385: C[CH]1O[CH](O[CH]2[CH](O[CH](CO)[CH](O)[CH]2O[CH]3O[CH](CO)[CH](O)[CH](O)[CH]3NC(C)=O)O[CH]4[CH](O)[CH](NC(C)=O)[CH](O) O[CH]4CO)[CH](O)[CH](O)[CH]1O
• OpenEye OEToolkits 2.0.7: CC1C(C(C(C(O1)OC2C(C(C(OC2OC3C(OC(C(C3O)NC(=O)C)O)CO)CO)O)OC4C(C(C(C(O4)CO)O)O)NC(=O)C)O)O)O

SMILES CANONICAL

• CACTVS 3.385: C[C@@H]1O[C@@H](O[C@H]2[C@@H](O[C@H](CO)[C@H](O)[C@@H]2O[C@H]3O[C@H](CO)[C@H](O)[C@H](O)[C@H]3NC(C)=O)O[C@H]4[C@H](O)[C @@H](NC(C)=O)[C@H](O)O[C@@H]4CO)[C@@H](O)[C@H](O)[C@@H]1O
• OpenEye OEToolkits 2.0.7: C[C@H]1[C@H]([C@H]([C@@H]([C@H](O1)O[C@@H]2[C@H]([C@H]([C@H](O[C@H]2O[C@@H]3[C@H](O[C@H]([C@@H]([C@H]3O)NC(=O)C)O)CO)CO )O)O[C@@H]4[C@@H]([C@H]([C@@H]([C@H](O4)CO)O)O)NC(=O)C)O)O)O

SYSTEMATIC NAME

• OpenEye OEToolkits 2.0.7: ~{N}-[(2~{R},3~{R},4~{R},5~{S},6~{R})-5-[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{S},6~{R})-4-[(2~{R},3~{R},4~{R},5~{S},6~{R})-3-acetamido -6-(hydroxymethyl)-4,5-bis(oxidanyl)oxan-2-yl]oxy-6-(hydroxymethyl)-3-[(2~{R},3~{S},4~{R},5~{S},6~{S})-6-methyl-3,4,5-tr is(oxidanyl)oxan-2-yl]oxy-5-oxidanyl-oxan-2-yl]oxy-6-(hydroxymethyl)-2,4-bis(oxidanyl)oxan-3-yl]ethanamide #

PDBエントリ

全4件を表示しています

PDB-3wg3:
Crystal structure of Agrocybe cylindracea galectin with blood type A antigen tetraose

PDB-3wg4:
Crystal structure of Agrocybe cylindracea galectin mutant (N46A) with blood type A antigen tetraose

PDB-4ds0:
Cell attachment protein VP8* of a human rotavirus specifically interacts with A-type histo-blood group antigen

PDB-4p26:
Structure of the P domain from a GI.7 Norovirus variant in complex with A-type 2 HBGA