BIRD-PRD_001214: PKIDN(DPR) peptide

基本情報

• 登録情報: データベース: 生物学的重要分子辞書 (BIRD) / ID: PRD_001214
• 状態: 状態: REF ONLY
• 名称: PKIDN(DPR) peptide

BIRD information

• タイプ: 環状ペプチド / 阻害剤
• ダウンロード: Molecular definition / Chemical definition

Chemical information

組成

組成式: C₃₀H₄₉N₈O₉ / 化学式量: 665.758

• その他: タイプ: peptide-like

履歴

• 外部リンク: UniChem / ChemSpider / Wikipedia search / Google search

詳細

SMILES

• ACDLabs 12.01: O=C(O)CC1C(=O)NC(C(=O)N3C(C(=O)N2C(C(=O)NC(C(=O)NC(C(=O)N1)C(C)CC)CCCC[NH3+])CCC2)CCC3)CC(=O)N
• CACTVS 3.385: CC[CH](C)[CH]1NC(=O)[CH](CCCC[NH3+])NC(=O)[CH]2CCCN2C(=O)[CH]3CCCN3C(=O)[CH](CC(N)=O)NC(=O)[CH](CC(O)=O)NC1=O
• OpenEye OEToolkits 1.7.6: CCC(C)C1C(=O)NC(C(=O)NC(C(=O)N2CCCC2C(=O)N3CCCC3C(=O)NC(C(=O)N1)CCCC[NH3+])CC(=O)N)CC(=O)O

SMILES CANONICAL

• CACTVS 3.385: CC[C@H](C)[C@@H]1NC(=O)[C@H](CCCC[NH3+])NC(=O)[C@@H]2CCCN2C(=O)[C@H]3CCCN3C(=O)[C@H](CC(N)=O)NC(=O)[C@H](CC(O)=O)NC1=O
• OpenEye OEToolkits 1.7.6: CC[C@H](C)[C@H]1C(=O)N[C@H](C(=O)N[C@H](C(=O)N2CCC[C@@H]2C(=O)N3CCC[C@H]3C(=O)N[C@H](C(=O)N1)CCCC[NH3+])CC(=O)N)CC(=O)O

InChI

• InChI 1.03: InChI=1S/C30H48N8O9/c1-3-16(2)24-28(45)34-18(15-23(40)41)26(43)35-19(14-22(32)39)29(46)38-13-7-10-21(38)30(47)37-12-6-9-20(37)27(44)33-17(25(42)36-24)8-4-5-11-31/h16-21,24H,3-15,31H2,1-2H3,(H2,32,39)(H,33,44)(H,34,45)(H,35,43)(H,36,42)(H,40,41)/p+1/t16-,17-,18+,19+,20?,21+,24?/m1/s1

InChIKey

• InChI 1.03: KIAFWZKFKYWNTN-LLZGDSCHSA-O

SYSTEMATIC NAME

• ACDLabs 12.01: cyclo(L-alpha-aspartyl-L-asparaginyl-D-prolyl-L-prolyl-6-ammonio-L-norleucyl-L-isoleucyl) #

PDBエントリ

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PDB-3wng:
Cyclic hexapeptide PKIDNp in complex with HIV-1 integrase