BIRD-PRD_001068: beta-Hairpin Peptidomimetic Antibiotic TWLKKRRWKKAK(DPR)P

基本情報

• 登録情報: データベース: 生物学的重要分子辞書 (BIRD) / ID: PRD_001068
• 状態: 状態: REF ONLY
• 名称: beta-Hairpin Peptidomimetic Antibiotic TWLKKRRWKKAK(DPR)P

BIRD information

• タイプ: 環状ペプチド / 抗生剤
• ダウンロード: Molecular definition / Chemical definition

Chemical information

組成

組成式: C₈₇H₁₄₈N₂₇O₁₅ / 化学式量: 1812.278

• その他: タイプ: peptide-like

履歴

• 外部リンク: UniChem / ChemSpider / Wikipedia search / Google search

詳細

SMILES

• CACTVS 3.370: CC(C)C[CH]1NC(=O)[CH](Cc2c[nH]c3ccccc23)NC(=O)[CH](NC(=O)[CH]4CCCN4C(=O)[CH]5CCCN5C(=O)[CH](CCCC[NH3+])NC(=O)[CH](C)NC(=O)[CH](CCCC[NH3+])NC(=O)[CH](CCCC[NH3+])NC(=O)[CH](Cc6c[nH]c7ccccc67)NC(=O)[CH](CCCNC(N)=[NH2+])NC(=O)[CH](CCCNC(N)=[NH2+])NC(=O)[CH](CCCC[NH3+])NC(=O)[CH](CCCC[NH3+])NC1=O)[CH](C)O
• OpenEye OEToolkits 1.7.6: CC1C(=O)NC(C(=O)N2CCCC2C(=O)N3CCCC3C(=O)NC(C(=O)NC(C(=O)NC(C(=O)NC(C(=O)NC(C(=O)NC(C(=O)NC(C(=O)NC(C(=O)NC(C(=O)NC(C(=O)N1)CCCC[NH3+])CCCC[NH3+])Cc4c[nH]c5c4cccc5)CCCNC(=[NH2+])N)CCCNC(=[NH2+])N)CCCC[NH3+])CCCC[NH3+])CC(C)C)Cc6c[nH]c7c6cccc7)C(C)O)CCCC[NH3+]

SMILES CANONICAL

• CACTVS 3.370: CC(C)C[C@@H]1NC(=O)[C@H](Cc2c[nH]c3ccccc23)NC(=O)[C@@H](NC(=O)[C@@H]4CCCN4C(=O)[C@H]5CCCN5C(=O)[C@H](CCCC[NH3+])NC(=O)[C@H](C)NC(=O)[C@H](CCCC[NH3+])NC(=O)[C@H](CCCC[NH3+])NC(=O)[C@H](Cc6c[nH]c7ccccc67)NC(=O)[C@H](CCCNC(N)=[NH2+])NC(=O)[C@H](CCCNC(N)=[NH2+])NC(=O)[C@H](CCCC[NH3+])NC(=O)[C@H](CCCC[NH3+])NC1=O)[C@@H](C)O
• OpenEye OEToolkits 1.7.6: C[C@H]1C(=O)N[C@H](C(=O)N2CCC[C@@H]2C(=O)N3CCC[C@H]3C(=O)N[C@H](C(=O)N[C@H](C(=O)N[C@H](C(=O)N[C@H](C(=O)N[C@H](C(=O)N[C@H](C(=O)N[C@H](C(=O)N[C@H](C(=O)N[C@H](C(=O)N[C@H](C(=O)N1)CCCC[NH3+])CCCC[NH3+])Cc4c[nH]c5c4cccc5)CCCNC(=[NH2+])N)CCCNC(=[NH2+])N)CCCC[NH3+])CCCC[NH3+])CC(C)C)Cc6c[nH]c7c6cccc7)[C@@H](C)O)CCCC[NH3+]

InChI

• InChI 1.03: InChI=1S/C87H141N27O15/c1-50(2)45-66-79(123)106-61(29-11-16-38-90)76(120)103-60(28-10-15-37-89)74(118)104-63(32-19-41-97-86(93)94)77(121)105-64(33-20-42-98-87(95)96)78(122)110-67(46-53-48-99-57-25-7-5-23-55(53)57)80(124)107-62(30-12-17-39-91)75(119)102-59(27-9-14-36-88)73(117)101-51(3)72(116)108-65(31-13-18-40-92)84(128)114-44-22-35-70(114)85(129)113-43-21-34-69(113)82(126)112-71(52(4)115)83(127)111-68(81(125)109-66)47-54-49-100-58-26-8-6-24-56(54)58/h5-8,23-26,48-52,59-71,99-100,115H,9-22,27-47,88-92H2,1-4H3,(H,101,117)(H,102,119)(H,103,120)(H,104,118)(H,105,121)(H,106,123)(H,107,124)(H,108,116)(H,109,125)(H,110,122)(H,111,127)(H,112,126)(H4,93,94,97)(H4,95,96,98)/p+7/t51-,52+,59-,60-,61-,62-,63-,64-,65-,66-,67-,68-,69-,70+,71-/m0/s1

InChIKey

• InChI 1.03: NGDPXIDFYKFHOM-PWANQUNESA-U

PDBエントリ

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PDB-2m7j:
Solution Structure of a Beta-Hairpin Peptidomimetic antibiotic that target LptD in Pseudomonas sp.