ChemComp-ZOD: [(2R,3R,4R,5R)-5-[[[[(2R,3S,4R,5R)-5-(6-aminopurin-9-yl)-3,4-bis(...

基本情報

• 登録情報: データベース: PDB化学物質要素 / ID: ZOD
• 名称: 名称: [(2R,3R,4R,5R)-5-[[[[(2R,3S,4R,5R)-5-(6-aminopurin-9-yl)-3,4-bis(oxidanyl)oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl]oxy-oxidanyl-phosphoryl]oxymethyl]-2,4-bis(oxidanyl)oxolan-3-yl] ethanoate; 日化辞名称: アデノシン5′-二りん酸β-(2-O-アセチル-5-デオキシ-β-D-リボフラノ-ス-5-イル)

Chemical information

組成

組成式: C₁₇H₂₅N₅O₁₅P₂ / 原子数: 64 / 化学式量: 601.352 / 形式電荷: 0

その他

5cb5

タイプ: NON-POLYMER / PDB分類: HETAIN / 3文字コード: ZOD / 理論座標の詳細: Corina / モデル座標のPDB-ID: 5CB5

履歴

作成	2015年7月7日
公開	2015年11月4日

• 外部リンク: UniChem / ChemSpider / Brenda / CompTox / 日化辞 / PubChem / PubChem_TPharma / ZINC / Wikipedia search / Google search

詳細

SMILES

• ACDLabs 12.01: CC(=O)OC1C(O)OC(C1O)COP(OP(O)(=O)OCC4OC(n2cnc3c(N)ncnc23)C(O)C4O)(=O)O
• CACTVS 3.385: CC(=O)O[CH]1[CH](O)O[CH](CO[P](O)(=O)O[P](O)(=O)OC[CH]2O[CH]([CH](O)[CH]2O)n3cnc4c(N)ncnc34)[CH]1O
• OpenEye OEToolkits 1.9.2: CC(=O)OC1C(C(OC1O)COP(=O)(O)OP(=O)(O)OCC2C(C(C(O2)n3cnc4c3ncnc4N)O)O)O

SMILES CANONICAL

• CACTVS 3.385: CC(=O)O[C@H]1[C@H](O)O[C@H](CO[P](O)(=O)O[P](O)(=O)OC[C@H]2O[C@H]([C@H](O)[C@@H]2O)n3cnc4c(N)ncnc34)[C@H]1O
• OpenEye OEToolkits 1.9.2: CC(=O)O[C@@H]1[C@@H]([C@H](O[C@H]1O)COP(=O)(O)OP(=O)(O)OC[C@@H]2[C@H]([C@H]([C@@H](O2)n3cnc4c3ncnc4N)O)O)O

InChI

• InChI 1.03: InChI=1S/C17H25N5O15P2/c1-6(23)34-13-11(25)8(36-17(13)27)3-33-39(30,31)37-38(28,29)32-2-7-10(24)12(26)16(35-7)22-5-21-9-14(18)19-4-20-15(9)22/h4-5,7-8,10-13,16-17,24-27H,2-3H2,1H3,(H,28,29)(H,30,31)(H2,18,19,20)/t7-,8-,10-,11-,12-,13-,16-,17-/m1/s1

InChIKey

• InChI 1.03: BFNOPXRXIQJDHO-QJWJOKBXSA-N

SYSTEMATIC NAME

• ACDLabs 12.01: (2R,3R,4R,5R)-5-({[(R)-{[(R)-{[(2R,3S,4R,5R)-5-(6-amino-9H-purin-9-yl)-3,4-dihydroxytetrahydrofuran-2-yl]methoxy}(hydroxy)phosphoryl]oxy}(hydroxy)phosphoryl]oxy}methyl)-2,4-dihydroxytetrahydrofuran-3-yl acetate (non-preferred name)
• OpenEye OEToolkits 1.9.2: [(2R,3R,4R,5R)-5-[[[[(2R,3S,4R,5R)-5-(6-aminopurin-9-yl)-3,4-bis(oxidanyl)oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl]oxy-oxidanyl-phosphoryl]oxymethyl]-2,4-bis(oxidanyl)oxolan-3-yl] ethanoate

PDBエントリ

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PDB-5cb5:
Structural Insights into the Mechanism of Escherichia coli Ymdb