ChemComp-ZEB: 4-HYDROXY-3,4-DIHYDRO-ZEBULARINE

基本情報

• 登録情報: データベース: PDB化学物質要素 / ID: ZEB
• 名称: 名称: 4-hydroxy-3,4-dihydro-zebularine; 日化辞名称: (4R)-1-(β-D-リボフラノシル)-4-ヒドロキシ-3,4-ジヒドロ-ピリミジン-2(1H)-オン

Chemical information

組成

組成式: C₉H₁₄N₂O₆ / 原子数: 31 / 化学式量: 246.217 / 形式電荷: 0

その他

1ctu

タイプ: NON-POLYMER / PDB分類: HETAIN / 3文字コード: ZEB / モデル座標のPDB-ID: 1CTU

履歴

作成	1999年7月8日
記述子を修正	2011年6月4日

• 外部リンク: UniChem / ChemSpider / 日化辞 / PubChem / ZINC / Wikipedia search / Google search

詳細

SMILES

• ACDLabs 10.04: O=C1NC(O)C=CN1C2OC(C(O)C2O)CO
• CACTVS 3.341: OC[CH]1O[CH]([CH](O)[CH]1O)N2C=C[CH](O)NC2=O
• OpenEye OEToolkits 1.5.0: C1=CN(C(=O)NC1O)C2C(C(C(O2)CO)O)O

SMILES CANONICAL

• CACTVS 3.341: OC[C@H]1O[C@H]([C@H](O)[C@@H]1O)N2C=C[C@@H](O)NC2=O
• OpenEye OEToolkits 1.5.0: C1=CN(C(=O)N[C@@H]1O)C2[C@@H]([C@@H]([C@H](O2)CO)O)O

InChI

• InChI 1.03: InChI=1S/C9H14N2O6/c12-3-4-6(14)7(15)8(17-4)11-2-1-5(13)10-9(11)16/h1-2,4-8,12-15H,3H2,(H,10,16)/t4-,5-,6-,7-,8-/m1/s1

InChIKey

• InChI 1.03: LUOTYVSEHPPZEM-FMDGEEDCSA-N

SYSTEMATIC NAME

• ACDLabs 10.04: (4R)-4-hydroxy-1-beta-D-ribofuranosyl-3,4-dihydropyrimidin-2(1H)-one
• OpenEye OEToolkits 1.5.0: (4R)-1-[(3R,4S,5R)-3,4-dihydroxy-5-(hydroxymethyl)oxolan-2-yl]-4-hydroxy-3,4-dihydropyrimidin-2-one

PDBエントリ

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PDB-1ctu:
TRANSITION-STATE SELECTIVITY FOR A SINGLE OH GROUP DURING CATALYSIS BY CYTIDINE DEAMINASE