ChemComp-XRF: 1-{2-deoxy-5-O-[(S)-hydroxy{[(S)-hydroxy(phosphonooxy)phosphoryl]...

基本情報

• 登録情報: データベース: PDB化学物質要素 / ID: XRF
• 名称: 名称: 1-{2-deoxy-5-O-[(S)-hydroxy{[(S)-hydroxy(phosphonooxy)phosphoryl]oxy}phosphoryl]-beta-L-erythro-pentofuranosyl}-5-methylpyrimidine-2,4(1H,3H)-dione; 日化辞名称: 1-[5-O-[[[(ホスホノオキシ)ホスホニル]オキシ]ホスホニル]-2-デオキシ-β-L-リボフラノシル]チミン

Chemical information

組成

組成式: C₁₀H₁₇N₂O₁₄P₃ / 原子数: 46 / 化学式量: 482.168 / 形式電荷: 0

その他

7lsk

タイプ: non-polymer / PDB分類: HETAIN / 3文字コード: XRF / 理論座標の詳細: Corina / モデル座標のPDB-ID: 7LSK

履歴

作成	2021年3月9日
公開	2022年2月23日

• 外部リンク: UniChem / ChemSpider / Brenda / ChEMBL / 日化辞 / PubChem / PubChem_TPharma / ZINC / Wikipedia search / Google search

詳細

SMILES

• ACDLabs 12.01: O=P(O)(O)OP(=O)(O)OP(=O)(O)OCC1OC(CC1O)N1C=C(C)C(=O)NC1=O
• CACTVS 3.385: CC1=CN([CH]2C[CH](O)[CH](CO[P](O)(=O)O[P](O)(=O)O[P](O)(O)=O)O2)C(=O)NC1=O
• OpenEye OEToolkits 2.0.7: CC1=CN(C(=O)NC1=O)C2CC(C(O2)COP(=O)(O)OP(=O)(O)OP(=O)(O)O)O

SMILES CANONICAL

• CACTVS 3.385: CC1=CN([C@@H]2C[C@@H](O)[C@H](CO[P](O)(=O)O[P](O)(=O)O[P](O)(O)=O)O2)C(=O)NC1=O
• OpenEye OEToolkits 2.0.7: CC1=CN(C(=O)NC1=O)[C@@H]2C[C@H]([C@@H](O2)COP(=O)(O)OP(=O)(O)OP(=O)(O)O)O

InChI

• InChI 1.03: InChI=1S/C10H17N2O14P3/c1-5-3-12(10(15)11-9(5)14)8-2-6(13)7(24-8)4-23-28(19,20)26-29(21,22)25-27(16,17)18/h3,6-8,13H,2,4H2,1H3,(H,19,20)(H,21,22)(H,11,14,15)(H2,16,17,18)/t6-,7+,8+/m1/s1

InChIKey

• InChI 1.03: NHVNXKFIZYSCEB-CSMHCCOUSA-N

SYSTEMATIC NAME

• ACDLabs 12.01: 1-{2-deoxy-5-O-[(S)-hydroxy{[(S)-hydroxy(phosphonooxy)phosphoryl]oxy}phosphoryl]-beta-L-erythro-pentofuranosyl}-5-methylpyrimidine-2,4(1H,3H)-dione
• OpenEye OEToolkits 2.0.7: [[(2~{S},3~{R},5~{S})-5-[5-methyl-2,4-bis(oxidanylidene)pyrimidin-1-yl]-3-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate

PDBエントリ

全1件を表示しています

PDB-7lsk:
Structure of HIV-1 Reverse Transcriptase in complex with DNA, L-dTTP, and CA(2+) ion