ChemComp-WZO: [(2~{R},3~{R},4~{R},5~{R})-5-(2-azanyl-7-methyl-6-oxidanylidene-1...

基本情報

• 登録情報: データベース: PDB化学物質要素 / ID: WZO
• 名称: 名称: [(2~{R},3~{R},4~{R},5~{R})-5-(2-azanyl-7-methyl-6-oxidanylidene-1~{H}-purin-7-ium-9-yl)-4-methoxy-3-oxidanyl-oxolan-2-yl]methyl [phosphonooxy(sulfanyl)phosphoryl] hydrogen phosphate

Chemical information

組成

組成式: C₁₂H₂₁N₅O₁₃P₃S / 原子数: 55 / 化学式量: 568.307 / 形式電荷: 1

その他

5m7v

タイプ: NON-POLYMER / PDB分類: HETAIN / 3文字コード: WZO / 理論座標の詳細: Corina / モデル座標のPDB-ID: 5M7V

履歴

作成	2016年10月28日
公開	2017年12月20日

• 外部リンク: UniChem / ChemSpider / Wikipedia search / Google search

詳細

SMILES

• CACTVS 3.385: CO[CH]1[CH](O)[CH](CO[P](O)(=O)O[P](S)(=O)O[P](O)(O)=O)O[CH]1n2c[n+](C)c3C(=O)NC(=Nc23)N
• OpenEye OEToolkits 2.0.6: C[n+]1cn(c2c1C(=O)NC(=N2)N)C3C(C(C(O3)COP(=O)(O)OP(=O)(OP(=O)(O)O)S)O)OC

SMILES CANONICAL

• CACTVS 3.385: CO[C@@H]1[C@H](O)[C@@H](CO[P](O)(=O)O[P@@](S)(=O)O[P](O)(O)=O)O[C@H]1n2c[n+](C)c3C(=O)NC(=Nc23)N
• OpenEye OEToolkits 2.0.6: C[n+]1cn(c2c1C(=O)NC(=N2)N)[C@H]3[C@@H]([C@@H]([C@H](O3)COP(=O)(O)O[P@@](=O)(OP(=O)(O)O)S)O)OC

InChI

• InChI 1.03: InChI=1S/C12H20N5O13P3S/c1-16-4-17(9-6(16)10(19)15-12(13)14-9)11-8(26-2)7(18)5(28-11)3-27-32(23,24)30-33(25,34)29-31(20,21)22/h4-5,7-8,11,18H,3H2,1-2H3,(H6-,13,14,15,19,20,21,22,23,24,25,34)/p+1/t5-,7-,8-,11-,33-/m1/s1

InChIKey

• InChI 1.03: NSORGZXNYGWJBQ-ZRDSBRMSSA-O

SYSTEMATIC NAME

• OpenEye OEToolkits 2.0.6: [(2~{R},3~{R},4~{R},5~{R})-5-(2-azanyl-7-methyl-6-oxidanylidene-1~{H}-purin-7-ium-9-yl)-4-methoxy-3-oxidanyl-oxolan-2-yl]methyl [phosphonooxy(sulfanyl)phosphoryl] hydrogen phosphate

PDBエントリ

全3件を表示しています

PDB-5m7v:
Translation initiation factor 4E in complex with (RP)-m2(7,2'O)GppSpG mRNA 5' cap analog (beta-S-ARCA D1)

PDB-5m7w:
Translation initiation factor 4E in complex with (SP)-m2(7,2'O)GppSpG mRNA 5' cap analog (beta-S-ARCA D2)

PDB-6gkk:
Translation initiation factor 4E in complex with beta-phosphorothioate trinucleotide mRNA 5' cap diastereomer 1 (m7GppSpApG D1)