ChemComp-WSB: 5'-O-[(S)-hydroxy{[(S)-hydroxy(phosphonooxy)phosphoryl]methyl}pho...

基本情報

• 登録情報: データベース: PDB化学物質要素 / ID: WSB
• 名称: 名称: 5'-O-[(S)-hydroxy{[(S)-hydroxy(phosphonooxy)phosphoryl]methyl}phosphoryl]uridine

Chemical information

組成

組成式: C₁₀H₁₇N₂O₁₄P₃ / 原子数: 46 / 化学式量: 482.168 / 形式電荷: 0

その他

8sq9

タイプ: non-polymer / PDB分類: HETAIN / 3文字コード: WSB / 理論座標の詳細: Corina / モデル座標のPDB-ID: 8SQ9

履歴

作成	2023年5月17日
公開	2023年11月22日

• 外部リンク: UniChem / PubChem / ChemSpider / Wikipedia search / Google search

詳細

SMILES

• ACDLabs 12.01: O=P(O)(O)OP(=O)(O)CP(=O)(O)OCC1OC(N2C=CC(=O)NC2=O)C(O)C1O
• CACTVS 3.385: O[CH]1[CH](O)[CH](O[CH]1CO[P](O)(=O)C[P](O)(=O)O[P](O)(O)=O)N2C=CC(=O)NC2=O
• OpenEye OEToolkits 2.0.7: C1=CN(C(=O)NC1=O)C2C(C(C(O2)COP(=O)(CP(=O)(O)OP(=O)(O)O)O)O)O

SMILES CANONICAL

• CACTVS 3.385: O[C@H]1[C@@H](O)[C@@H](O[C@@H]1CO[P](O)(=O)C[P](O)(=O)O[P](O)(O)=O)N2C=CC(=O)NC2=O
• OpenEye OEToolkits 2.0.7: C1=CN(C(=O)NC1=O)[C@H]2[C@@H]([C@@H]([C@H](O2)COP(=O)(CP(=O)(O)OP(=O)(O)O)O)O)O

InChI

• InChI 1.06: InChI=1S/C10H17N2O14P3/c13-6-1-2-12(10(16)11-6)9-8(15)7(14)5(25-9)3-24-27(17,18)4-28(19,20)26-29(21,22)23/h1-2,5,7-9,14-15H,3-4H2,(H,17,18)(H,19,20)(H,11,13,16)(H2,21,22,23)/t5-,7-,8-,9-/m1/s1

InChIKey

• InChI 1.06: UJLGWNDCUWVLAK-ZOQUXTDFSA-N

SYSTEMATIC NAME

• ACDLabs 12.01: 5'-O-[(S)-hydroxy{[(S)-hydroxy(phosphonooxy)phosphoryl]methyl}phosphoryl]uridine
• OpenEye OEToolkits 2.0.7: [(2~{R},3~{S},4~{R},5~{R})-5-[2,4-bis(oxidanylidene)pyrimidin-1-yl]-3,4-bis(oxidanyl)oxolan-2-yl]methoxy-[[oxidanyl(phosphonooxy)phosphoryl]methyl]phosphinic acid

PDBエントリ

全1件を表示しています

PDB-8sq9:
SARS-CoV-2 replication-transcription complex bound to nsp9 and UMPCPP, as a pre-catalytic NMPylation intermediate