ChemComp-WMP: [(1R,5R,6R,8S)-6-(6-aminopurin-9-yl)-3'-[(R)-oxidanyl(phenyl)meth...

基本情報

• 登録情報: データベース: PDB化学物質要素 / ID: WMP
• 名称: 名称: [(1R,5R,6R,8S)-6-(6-aminopurin-9-yl)-3'-[(R)-oxidanyl(phenyl)methyl]spiro[2,4,7-trioxa-3-boranuidabicyclo[3.3.0]octane-3,9'-8-oxa-9-boranuidabicyclo[4.3.0]nona-1,3,5-triene]-8-yl]methyl dihydrogen phosphate

Chemical information

組成

組成式: C₂₄H₂₄BN₅O₉P / 原子数: 64 / 化学式量: 568.26 / 形式電荷: -1

その他

4k47

タイプ: NON-POLYMER / PDB分類: HETAIN / 3文字コード: WMP / 理論座標の詳細: Corina / モデル座標のPDB-ID: 4K47

履歴

作成	2013年5月10日
Modify atom id	2013年6月20日
公開	2013年9月4日

• 外部リンク: UniChem / ChemSpider / ZINC / Wikipedia search / Google search

詳細

SMILES

• CACTVS 3.370: Nc1ncnc2n(cnc12)[CH]3O[CH](CO[P](O)(O)=O)[CH]4O[B-]5(OCc6ccc(cc56)[CH](O)c7ccccc7)O[CH]34
• OpenEye OEToolkits 1.7.6: [B-]12(c3cc(ccc3CO1)C(c4ccccc4)O)OC5C(OC(C5O2)n6cnc7c6ncnc7N)COP(=O)(O)O

SMILES CANONICAL

• CACTVS 3.370: Nc1ncnc2n(cnc12)[C@@H]3O[C@@H](CO[P](O)(O)=O)[C@@H]4O[B-]5(OCc6ccc(cc56)[C@H](O)c7ccccc7)O[C@@H]34
• OpenEye OEToolkits 1.7.6: [B-]12(c3cc(ccc3CO1)[C@@H](c4ccccc4)O)O[C@H]5[C@@H](O[C@H]([C@@H]5O2)n6cnc7c6ncnc7N)COP(=O)(O)O

InChI

• InChI 1.03: InChI=1S/C24H24BN5O9P/c26-22-18-23(28-11-27-22)30(12-29-18)24-21-20(17(37-24)10-36-40(32,33)34)38-25(39-21)16-8-14(6-7-15(16)9-35-25)19(31)13-4-2-1-3-5-13/h1-8,11-12,17,19-21,24,31H,9-10H2,(H2,26,27,28)(H2,32,33,34)/q-1/t17-,19+,20-,21+,24+,25-/m0/s1

InChIKey

• InChI 1.03: XRLFSRQDERUGQF-ZZEVEECHSA-N

SYSTEMATIC NAME

• OpenEye OEToolkits 1.7.6: [(1R,5R,6R,8S)-6-(6-aminopurin-9-yl)-3'-[(R)-oxidanyl(phenyl)methyl]spiro[2,4,7-trioxa-3-boranuidabicyclo[3.3.0]octane-3,9'-8-oxa-9-boranuidabicyclo[4.3.0]nona-1,3,5-triene]-8-yl]methyl dihydrogen phosphate

PDBエントリ

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PDB-4k47:
Structure of the Streptococcus pneumoniae leucyl-tRNA synthetase editing domain bound to a benzoxaborole-AMP adduct