ChemComp-VPA: 2-phenyl-N-(6-O-beta-D-xylopyranosyl-beta-D-glucopyranosyl)ethyla...

基本情報

• 登録情報: データベース: PDB化学物質要素 / ID: VPA
• 名称: 名称: 2-phenyl-N-(6-O-beta-D-xylopyranosyl-beta-D-glucopyranosyl)ethylamidine; 別称: 2-phenyl-N-[(2R,3R,4S,5S,6R)-3,4,5-tris(oxidanyl)-6-[[(2S,3R,4S,5R)-3,4,5-tris(oxidanyl)oxan-2-yl]oxymethyl]oxan-2-yl]e

Chemical information

組成

組成式: C₁₉H₂₈N₂O₉ / 原子数: 58 / 化学式量: 428.434 / 形式電荷: 0

その他

3wq5

タイプ: NON-POLYMER / PDB分類: HETAIN / 3文字コード: VPA / 理論座標の詳細: Corina / モデル座標のPDB-ID: 3WQ5

履歴

作成	2014年1月31日
Modify name	2014年2月18日
Modify synonyms	2014年2月18日
公開	2014年4月23日
Modify synonyms	2020年6月5日

• 外部リンク: UniChem / Brenda / PubChem / ZINC / ChemSpider / Wikipedia search / Google search

詳細

SMILES

• ACDLabs 12.01: O(CC2OC(NC(=[N@H])Cc1ccccc1)C(O)C(O)C2O)C3OCC(O)C(O)C3O
• CACTVS 3.385: O[CH]1CO[CH](OC[CH]2O[CH](NC(=N)Cc3ccccc3)[CH](O)[CH](O)[CH]2O)[CH](O)[CH]1O
• OpenEye OEToolkits 1.7.6: c1ccc(cc1)CC(=N)NC2C(C(C(C(O2)COC3C(C(C(CO3)O)O)O)O)O)O

SMILES CANONICAL

• CACTVS 3.385: O[C@@H]1CO[C@@H](OC[C@H]2O[C@@H](NC(=N)Cc3ccccc3)[C@H](O)[C@@H](O)[C@@H]2O)[C@H](O)[C@H]1O
• OpenEye OEToolkits 1.7.6: [H]/N=C(\Cc1ccccc1)/N[C@H]2[C@@H]([C@H]([C@@H]([C@H](O2)CO[C@H]3[C@@H]([C@H]([C@@H](CO3)O)O)O)O)O)O

InChI

• InChI 1.03: InChI=1S/C19H28N2O9/c20-12(6-9-4-2-1-3-5-9)21-18-16(26)15(25)14(24)11(30-18)8-29-19-17(27)13(23)10(22)7-28-19/h1-5,10-11,13-19,22-27H,6-8H2,(H2,20,21)/t10-,11-,13+,14-,15+,16-,17-,18-,19+/m1/s1

InChIKey

• InChI 1.03: SKGTWJNDCFMXKU-GZDQRYBESA-N

SYSTEMATIC NAME

• ACDLabs 12.01: N-[(1E)-2-phenylethanimidoyl]-6-O-beta-D-xylopyranosyl-beta-D-glucopyranosylamine
• OpenEye OEToolkits 1.7.6: 2-phenyl-N-[(2R,3R,4S,5S,6R)-3,4,5-tris(oxidanyl)-6-[[(2S,3R,4S,5R)-3,4,5-tris(oxidanyl)oxan-2-yl]oxymethyl]oxan-2-yl]ethanimidamide

PDBエントリ

全1件を表示しています

PDB-3wq5:
beta-Primeverosidase in complex with disaccharide substrate-analog N-beta-primeverosylamidine, natural aglycone derivative