ChemComp-VLO: [[(2~{R},3~{R},4~{R},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-1~{H}-pur...

基本情報

• 登録情報: データベース: PDB化学物質要素 / ID: VLO
• 名称: 名称: [[(2~{R},3~{R},4~{R},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-1~{H}-purin-9-yl)-4-[[(2~{R},3~{S},4~{R},5~{R})-3,4-bis(oxidanyl)-5-(6-oxidanylidene-1~{H}-purin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl]oxy-3-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate

Chemical information

組成

組成式: C₂₀H₂₇N₉O₂₁P₄ / 原子数: 81 / 化学式量: 853.371 / 形式電荷: 0

その他

8eae

タイプ: non-polymer / PDB分類: HETAIN / 3文字コード: VLO / 理論座標の詳細: Corina / モデル座標のPDB-ID: 8EAE

履歴

作成	2022年8月30日
公開	2023年10月25日

• 外部リンク: UniChem / ChemSpider / PubChem / Wikipedia search / Google search

詳細

SMILES

• CACTVS 3.385: NC1=Nc2n(cnc2C(=O)N1)[CH]3O[CH](CO[P](O)(=O)O[P](O)(=O)O[P](O)(O)=O)[CH](O)[CH]3O[P](O)(=O)OC[CH]4O[CH]([CH](O)[CH]4O)n5cnc6C(=O)NC=Nc56
• OpenEye OEToolkits 2.0.7: c1nc2c(n1C3C(C(C(O3)COP(=O)(O)OC4C(C(OC4n5cnc6c5N=C(NC6=O)N)COP(=O)(O)OP(=O)(O)OP(=O)(O)O)O)O)O)N=CNC2=O

SMILES CANONICAL

• CACTVS 3.385: NC1=Nc2n(cnc2C(=O)N1)[C@@H]3O[C@H](CO[P](O)(=O)O[P](O)(=O)O[P](O)(O)=O)[C@@H](O)[C@H]3O[P](O)(=O)OC[C@H]4O[C@H]([C@H](O)[C@@H]4O)n5cnc6C(=O)NC=Nc56
• OpenEye OEToolkits 2.0.7: c1nc2c(n1[C@H]3[C@@H]([C@@H]([C@H](O3)COP(=O)(O)O[C@@H]4[C@@H]([C@H](O[C@H]4n5cnc6c5N=C(NC6=O)N)COP(=O)(O)OP(=O)(O)OP(=O)(O)O)O)O)O)N=CNC2=O

InChI

• InChI 1.06: InChI=1S/C20H27N9O21P4/c21-20-26-15-9(17(34)27-20)25-5-29(15)19-13(11(31)7(47-19)2-45-53(40,41)50-54(42,43)49-51(35,36)37)48-52(38,39)44-1-6-10(30)12(32)18(46-6)28-4-24-8-14(28)22-3-23-16(8)33/h3-7,10-13,18-19,30-32H,1-2H2,(H,38,39)(H,40,41)(H,42,43)(H,22,23,33)(H2,35,36,37)(H3,21,26,27,34)/t6-,7-,10-,11-,12-,13-,18-,19-/m1/s1

InChIKey

• InChI 1.06: QIEFBLFMZQEZSF-INFSMZHSSA-N

PDBエントリ

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PDB-8eae:
Structure of Ternary Complex of cGAS with dsDNA and Bound 5-pppG(2,5)pI