ChemComp-VC6: 4-amino-1-{5-O-[(R)-{[(R)-[(S)-chloro(fluoro)phosphonomethyl](hyd...

基本情報

• 登録情報: データベース: PDB化学物質要素 / ID: VC6
• 名称: 名称: 4-amino-1-{5-O-[(R)-{[(R)-[(S)-chloro(fluoro)phosphonomethyl](hydroxy)phosphoryl]oxy}(hydroxy)phosphoryl]-2-deoxy-alpha-L-threo-pentofuranosyl}pyrimidin-2(1H)-one

Chemical information

組成

組成式: C₁₀H₁₆ClFN₃O₁₂P₃ / 原子数: 46 / 化学式量: 517.62 / 形式電荷: 0

その他

6ctu

タイプ: NON-POLYMER / PDB分類: HETAIN / 3文字コード: VC6 / 理論座標の詳細: Corina / モデル座標のPDB-ID: 6CTU

履歴

作成	2018年3月26日
公開	2018年6月20日

• 外部リンク: UniChem / ChemSpider / PubChem / Wikipedia search / Google search

詳細

SMILES

• ACDLabs 12.01: C=1(N)C=CN(C(N=1)=O)C2OC(C(C2)O)COP(=O)(O)OP(O)(C(Cl)(P(O)(O)=O)F)=O
• CACTVS 3.385: NC1=NC(=O)N(C=C1)[CH]2C[CH](O)[CH](CO[P](O)(=O)O[P](O)(=O)[C](F)(Cl)[P](O)(O)=O)O2
• OpenEye OEToolkits 2.0.6: C1C(C(OC1N2C=CC(=NC2=O)N)COP(=O)(O)OP(=O)(C(F)(P(=O)(O)O)Cl)O)O

SMILES CANONICAL

• CACTVS 3.385: NC1=NC(=O)N(C=C1)[C@H]2C[C@H](O)[C@H](CO[P](O)(=O)O[P](O)(=O)[C@@](F)(Cl)[P](O)(O)=O)O2
• OpenEye OEToolkits 2.0.6: C1[C@@H]([C@@H](O[C@H]1N2C=CC(=NC2=O)N)COP(=O)(O)OP(=O)([C@](F)(P(=O)(O)O)Cl)O)O

InChI

• InChI 1.03: InChI=1S/C10H16ClFN3O12P3/c11-10(12,28(18,19)20)29(21,22)27-30(23,24)25-4-6-5(16)3-8(26-6)15-2-1-7(13)14-9(15)17/h1-2,5-6,8,16H,3-4H2,(H,21,22)(H,23,24)(H2,13,14,17)(H2,18,19,20)/t5-,6-,8+,10+/m0/s1

InChIKey

• InChI 1.03: KEKPFSDJAHISFV-VBOXYBSHSA-N

SYSTEMATIC NAME

• ACDLabs 12.01: 4-amino-1-{5-O-[(R)-{[(R)-[(S)-chloro(fluoro)phosphonomethyl](hydroxy)phosphoryl]oxy}(hydroxy)phosphoryl]-2-deoxy-alpha-L-threo-pentofuranosyl}pyrimidin-2(1H)-one
• OpenEye OEToolkits 2.0.6: [(~{S})-[[[(2~{S},3~{S},5~{R})-5-(4-azanyl-2-oxidanylidene-pyrimidin-1-yl)-3-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl]oxy-oxidanyl-phosphoryl]-chloranyl-fluoranyl-methyl]phosphonic acid

PDBエントリ

全1件を表示しています

PDB-6ctu:
Ternary complex crystal structure of DNA polymerase Beta with a dideoxy terminated primer with CFCL, beta, gamma dCTP analogue