ChemComp-VA7: 2'-deoxy-5'-O-[(R)-{[(R)-[dichloro(phosphono)methyl](hydroxy)phos...

基本情報

• 登録情報: データベース: PDB化学物質要素 / ID: VA7
• 名称: 名称: 2'-deoxy-5'-O-[(R)-{[(R)-[dichloro(phosphono)methyl](hydroxy)phosphoryl]oxy}(hydroxy)phosphoryl]adenosine

Chemical information

組成

組成式: C₁₁H₁₆Cl₂N₅O₁₁P₃ / 原子数: 48 / 化学式量: 558.099 / 形式電荷: 0

その他

6crc

タイプ: NON-POLYMER / PDB分類: HETAIN / 3文字コード: VA7 / 理論座標の詳細: Corina / モデル座標のPDB-ID: 6CRC

履歴

作成	2018年3月22日
公開	2018年7月25日

• 外部リンク: UniChem / ChemSpider / PubChem / Wikipedia search / Google search

詳細

SMILES

• ACDLabs 12.01: n1c(c2c(nc1)n(cn2)C3OC(C(C3)O)COP(=O)(O)OP(O)(C(P(O)(O)=O)(Cl)Cl)=O)N
• CACTVS 3.385: Nc1ncnc2n(cnc12)[CH]3C[CH](O)[CH](CO[P](O)(=O)O[P](O)(=O)C(Cl)(Cl)[P](O)(O)=O)O3
• OpenEye OEToolkits 2.0.6: c1nc(c2c(n1)n(cn2)C3CC(C(O3)COP(=O)(O)OP(=O)(C(P(=O)(O)O)(Cl)Cl)O)O)N

SMILES CANONICAL

• CACTVS 3.385: Nc1ncnc2n(cnc12)[C@H]3C[C@H](O)[C@@H](CO[P](O)(=O)O[P](O)(=O)C(Cl)(Cl)[P](O)(O)=O)O3
• OpenEye OEToolkits 2.0.6: c1nc(c2c(n1)n(cn2)[C@H]3C[C@@H]([C@H](O3)COP(=O)(O)OP(=O)(C(P(=O)(O)O)(Cl)Cl)O)O)N

InChI

• InChI 1.03: InChI=1S/C11H16Cl2N5O11P3/c12-11(13,30(20,21)22)31(23,24)29-32(25,26)27-2-6-5(19)1-7(28-6)18-4-17-8-9(14)15-3-16-10(8)18/h3-7,19H,1-2H2,(H,23,24)(H,25,26)(H2,14,15,16)(H2,20,21,22)/t5-,6+,7+/m0/s1

InChIKey

• InChI 1.03: AQFODBPFKZIBHW-RRKCRQDMSA-N

SYSTEMATIC NAME

• ACDLabs 12.01: 2'-deoxy-5'-O-[(R)-{[(R)-[dichloro(phosphono)methyl](hydroxy)phosphoryl]oxy}(hydroxy)phosphoryl]adenosine
• OpenEye OEToolkits 2.0.6: [[[[(2~{R},3~{S},5~{R})-5-(6-aminopurin-9-yl)-3-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl]oxy-oxidanyl-phosphoryl]-bis(chloranyl)methyl]phosphonic acid

PDBエントリ

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PDB-6crc:
Ternary complex crystal structure of DNA polymerase Beta with a dideoxy terminated primer with CCL2, beta, gamma dATP analogue