ChemComp-V2J: 5'-O-[(S)-[(3S)-3-carboxypyrrolidin-1-yl](hydroxy)phosphoryl]adenosine

基本情報

• 登録情報: データベース: PDB化学物質要素 / ID: V2J
• 名称: 名称: 5'-O-[(S)-[(3S)-3-carboxypyrrolidin-1-yl](hydroxy)phosphoryl]adenosine

Chemical information

組成

組成式: C₁₅H₂₁N₆O₈P / 原子数: 51 / 化学式量: 444.336 / 形式電荷: 0

その他

6xhe

タイプ: non-polymer / PDB分類: HETAIN / 3文字コード: V2J / 理論座標の詳細: Corina / モデル座標のPDB-ID: 6XHE

履歴

作成	2020年6月19日
公開	2021年3月17日

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詳細

SMILES

• ACDLabs 12.01: c21n(cnc1c(ncn2)N)C4C(C(C(COP(=O)(O)N3CC(CC3)C(=O)O)O4)O)O
• CACTVS 3.385: Nc1ncnc2n(cnc12)[CH]3O[CH](CO[P](O)(=O)N4CC[CH](C4)C(O)=O)[CH](O)[CH]3O
• OpenEye OEToolkits 2.0.7: c1nc(c2c(n1)n(cn2)C3C(C(C(O3)COP(=O)(N4CCC(C4)C(=O)O)O)O)O)N

SMILES CANONICAL

• CACTVS 3.385: Nc1ncnc2n(cnc12)[C@@H]3O[C@H](CO[P](O)(=O)N4CC[C@@H](C4)C(O)=O)[C@@H](O)[C@H]3O
• OpenEye OEToolkits 2.0.7: c1nc(c2c(n1)n(cn2)[C@H]3[C@@H]([C@@H]([C@H](O3)COP(=O)(N4CC[C@@H](C4)C(=O)O)O)O)O)N

InChI

• InChI 1.03: InChI=1S/C15H21N6O8P/c16-12-9-13(18-5-17-12)21(6-19-9)14-11(23)10(22)8(29-14)4-28-30(26,27)20-2-1-7(3-20)15(24)25/h5-8,10-11,14,22-23H,1-4H2,(H,24,25)(H,26,27)(H2,16,17,18)/t7-,8+,10+,11+,14+/m0/s1

InChIKey

• InChI 1.03: XUGWBNVYRBVAFE-TWBCTODHSA-N

SYSTEMATIC NAME

• ACDLabs 12.01: 5'-O-[(S)-[(3S)-3-carboxypyrrolidin-1-yl](hydroxy)phosphoryl]adenosine
• OpenEye OEToolkits 2.0.7: (3~{S})-1-[[(2~{R},3~{S},4~{R},5~{R})-5-(6-aminopurin-9-yl)-3,4-bis(oxidanyl)oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl]pyrrolidine-3-carboxylic acid

PDBエントリ

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PDB-6xhe:
Structure of beta-prolinyl 5'-O-adenosine phosphoramidate