ChemComp-UD9: (2R,3S,4R,5S,6R)-3-acetamido-4,5-dihydroxy-6-(hydroxymethyl)oxan-...

基本情報

• 登録情報: データベース: PDB化学物質要素 / ID: UD9
• 名称: 名称: (2R,3S,4R,5S,6R)-3-acetamido-4,5-dihydroxy-6-(hydroxymethyl)oxan-2-yl [(2R,3S,4R,5R)-5-(2,4-dioxo-3,4-dihydropyrimidin-1(2H)-yl)-3,4-dihydroxyoxolan-2-yl]methyl dihydrogen diphosphate (non-preferred name); 別称: UDP-N-acetyl-alpha-D-mannosamine / 日化辞名称: UDP-ManNAc

Chemical information

組成

組成式: C₁₇H₂₇N₃O₁₇P₂ / 原子数: 66 / 化学式量: 607.354 / 形式電荷: 0

その他

7n41

タイプ: non-polymer / PDB分類: HETAIN / 3文字コード: UD9 / 理論座標の詳細: Corina / モデル座標のPDB-ID: 7N41

履歴

作成	2021年6月3日
公開	2021年12月29日

• 外部リンク: UniChem / ChemSpider / Brenda / ChEBI / KEGG_Ligand / 日化辞 / PubChem / ZINC / Wikipedia search / Google search

詳細

SMILES

• ACDLabs 12.01: O=C1C=CN(C(=O)N1)C1OC(COP(=O)(O)OP(=O)(O)OC2OC(CO)C(O)C(O)C2NC(C)=O)C(O)C1O
• CACTVS 3.385: CC(=O)N[CH]1[CH](O)[CH](O)[CH](CO)O[CH]1O[P](O)(=O)O[P](O)(=O)OC[CH]2O[CH]([CH](O)[CH]2O)N3C=CC(=O)NC3=O
• OpenEye OEToolkits 2.0.7: CC(=O)NC1C(C(C(OC1OP(=O)(O)OP(=O)(O)OCC2C(C(C(O2)N3C=CC(=O)NC3=O)O)O)CO)O)O

SMILES CANONICAL

• CACTVS 3.385: CC(=O)N[C@H]1[C@@H](O)[C@H](O)[C@@H](CO)O[C@@H]1O[P](O)(=O)O[P](O)(=O)OC[C@H]2O[C@H]([C@H](O)[C@@H]2O)N3C=CC(=O)NC3=O
• OpenEye OEToolkits 2.0.7: CC(=O)N[C@H]1[C@H]([C@@H]([C@H](O[C@@H]1OP(=O)(O)OP(=O)(O)OC[C@@H]2[C@H]([C@H]([C@@H](O2)N3C=CC(=O)NC3=O)O)O)CO)O)O

InChI

• InChI 1.03: InChI=1S/C17H27N3O17P2/c1-6(22)18-10-13(26)11(24)7(4-21)35-16(10)36-39(31,32)37-38(29,30)33-5-8-12(25)14(27)15(34-8)20-3-2-9(23)19-17(20)28/h2-3,7-8,10-16,21,24-27H,4-5H2,1H3,(H,18,22)(H,29,30)(H,31,32)(H,19,23,28)/t7-,8-,10+,11-,12-,13-,14-,15-,16-/m1/s1

InChIKey

• InChI 1.03: LFTYTUAZOPRMMI-ZYQOOJPVSA-N

SYSTEMATIC NAME

• ACDLabs 12.01: (2R,3S,4R,5S,6R)-3-acetamido-4,5-dihydroxy-6-(hydroxymethyl)oxan-2-yl [(2R,3S,4R,5R)-5-(2,4-dioxo-3,4-dihydropyrimidin-1(2H)-yl)-3,4-dihydroxyoxolan-2-yl]methyl dihydrogen diphosphate (non-preferred name)
• OpenEye OEToolkits 2.0.7: [(2~{R},3~{S},4~{R},5~{S},6~{R})-3-acetamido-6-(hydroxymethyl)-4,5-bis(oxidanyl)oxan-2-yl] [[(2~{R},3~{S},4~{R},5~{R})-5-[2,4-bis(oxidanylidene)pyrimidin-1-yl]-3,4-bis(oxidanyl)oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] hydrogen phosphate

PDBエントリ

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PDB-7n41:
Crystal structure of TagA with UDP-ManNAc